Changeset 4953 for BOL/LMDZ_Setup_amaury/lmdz_env.sh

Timestamp:

May 27, 2024, 10:46:07 AM (3 months ago)

Author:

abarral

Message:

(WIP) systematic call to install_lmdz.sh with -noclean
mild refactor & clean

File:

• BOL/LMDZ_Setup_amaury/lmdz_env.sh (modified) (1 diff)

BOL/LMDZ_Setup_amaury/lmdz_env.sh

@@ -4 +4 @@
 ##############################################################
 
-hostname=jean-zay-pp2
-echo lmdz_env $hostname 0:3 ${hostname:0:3}
+hostname=$(hostname)
+echo "Setting up lmdz_env on $hostname"
 
 case ${hostname:0:5} in
-
-        jean-) ARCH=X64_JEANZAY
-                module purge
-                compilo=19.0.4 # available 2013.0, 2017.2
-                module load intel-compilers/$compilo
-                #module load intel-mpi/$compilo
-                module load intel-mkl/$compilo
-                module load hdf5/1.10.5-mpi
-                module load netcdf/4.7.2-mpi
-                module load netcdf-fortran/4.5.2-mpi
-                module load subversion/1.9.7
-                #Pour module gcc, voir : https://trac.lmd.jussieu.fr/LMDZ/wiki/PortageJeanZay
-                #module load gcc/6.5.0
-                module load nco
-                module load cdo
-                # Imputation de la consommation sur le groupe (projet) actif par defaut,
-                #   idrproj indique le groupe (projet) actif par defaut
-                #   idrproj -d newproj   redefinit "newproj" en tant que  projet actif, 
-                #        alors $STORE, $WORK etc vont designer les espaces de "newproj")
-                groupe=`idrproj | grep active | awk '{ print $1}'`
-                submit="sbatch -A ${groupe}@cpu "
-                run="srun --label -n "
-                # Espaces suivants definis par defaut en fonction du groupe actif,
-                #  par exemple : SCRATCHD=$SCRATCH is /gpfsstore/rech/$groupe/$login
-                #    * On peut aussi ne pas installer les scripts a la racine de STORE, 
+  jean-)
+    ARCH="X64_JEANZAY"
+    module purge
+    compilo=19.0.4 # available 2013.0, 2017.2
+    module load intel-compilers/$compilo
+    #module load intel-mpi/$compilo
+    module load intel-mkl/$compilo
+    module load hdf5/1.10.5-mpi
+    module load netcdf/4.7.2-mpi
+    module load netcdf-fortran/4.5.2-mpi
+    module load subversion/1.9.7
+    #Pour module gcc, voir : https://trac.lmd.jussieu.fr/LMDZ/wiki/PortageJeanZay
+    #module load gcc/6.5.0
+    module load nco
+    module load cdo
+    # Imputation de la consommation sur le groupe (projet) actif par defaut,
+    #   idrproj indique le groupe (projet) actif par defaut
+    #   idrproj -d newproj   redefinit "newproj" en tant que  projet actif,
+    #        alors $STORE, $WORK etc vont designer les espaces de "newproj")
+    groupe=$(idrproj | grep active | awk '{ print $1}')
+    submit="sbatch -A ${groupe}@cpu "
+    run="srun --label -n "
+    # Espaces suivants definis par defaut en fonction du groupe actif,
+    #  par exemple : SCRATCHD=$SCRATCH is /gpfsstore/rech/$groupe/$login
+                #    * On peut aussi ne pas installer les scripts a la racine de STORE,
                 #        mais dans STORED=$STORE/your_folder
-                STORED=$STORE
-                SCRATCHD=$SCRATCH
-                LMDZD=$WORK
-                nb_mpi_max=2000
-                nb_omp_max=20
-                #LMDZ_Init sur le $STORE du $groupe
-                LMDZ_Init=$STORE/LMDZ_Init ;;
-        *) ARCH=
-                submit=". "
-                run="mpirun -np "
-                SCRATCHD=~/TMP/SCRATCH
-                STORED=~/TMP/
-                LMDZD=~/TMP
-                nb_mpi_max=2
-                nb_omp_max=2
-                LMDZ_Init=~/LMDZ/LMDZ_Init
+    STORED=$STORE
+    SCRATCHD=$SCRATCH
+    LMDZD=$WORK
+    NB_MPI_MAX=2000
+    NB_OMP_MAX=20
+    #LMDZ_Init sur le $STORE du $groupe
+    LMDZ_Init=$STORE/LMDZ_Init ;;
+  *)  # TODO mettre clairement dans ce paragraphe une doc de chaque param
+    ARCH="local-gfortran-parallel"
+#    submit=". "
+#    run="mpirun -np "
+#    SCRATCHD="/tmp/SCRATCH"
+#    STORED=~"/TMP/"
+    LMDZD="./LMDZD"
+    NB_MPI_MAX=999999
+    NB_OMP_MAX=999999
+#    LMDZ_Init=~"/LMDZ/LMDZ_Init"
 esac
 
 
-echo LMDZ_Init dans lmdz_env $LMDZ_Init
+#echo LMDZ_Init dans lmdz_env $LMDZ_Init