Changeset 4956 for BOL/LMDZ_Setup_amaury/setup.sh

Timestamp:

Jun 3, 2024, 1:06:29 PM (4 months ago)

Author:

abarral

Message:

(WIP) continue refactoring setup.sh
fix env vars

File:

• BOL/LMDZ_Setup_amaury/setup.sh (modified) (4 diffs)

BOL/LMDZ_Setup_amaury/setup.sh

@@ -374 +374 @@
 
 function setup_simu {
+  SIMRUNTOPDIR="$SIMRUNBASEDIR/$(basename "$local")"
   SIMRUNDIR=$SIMRUNTOPDIR
   mkdir -p "$SIMRUNDIR"
@@ -437 +438 @@
   -e "s/cpus-per-task=.*.$/cpus-per-task=$omp/" \
   -e "s/nthreads=.*./nthreads=$omp/" \
-  -e "s/MAINDIR=.*.$/MAINDIR=$(basename "$SIMRUNTOPDIR")/" \
-  -e "s:STORED=.*.*:STORED=$SIMRESDIR:" \
-  -e "s:SCRATCHD=.*.*:SCRATCHD=$(dirname "$SIMRUNTOPDIR"):" \
+  -e "s/MAINDIR=.*.$/MAINDIR=$(basename "$local")/" \
+  -e "s:STORED=.*.*:STORED=$(dirname $local):" \
+  -e "s:SCRATCHD=.*.*:SCRATCHD=$SIMRUNBASEDIR:" \
   -e "s/stopsim=.*.$/stopsim=$stopsim/" \
   -e "s/^veget=.*.$/veget=$veget/" \
@@ -537 +538 @@
 function run_sim_or_init {
   cd "$local"
+
   if [[ $init = 1 ]]; then
     #####################################################################
@@ -634 +636 @@
 
 # ANCIEN MULTI STEP   interp )
-if [ $aerosols = clim ]; then
-cp $local/interp_aerosols.sh .; chmod +x interp_aerosols.sh
-# Les aerosols de l'annee 2000 ont ete remplaces par "9999" qui pointe vers un fichier moyen sur 1995-2014
-#for year in 2000 1850; do  ./interp_aerosols.sh \$year; done
-#mv aerosols.2000.nc aerosols.clim.nc; mv aerosols.1850.nc aerosols.nat.nc
-for year in 9999 1850; do ./interp_aerosols.sh \$year; done
-mv aerosols.9999.nc aerosols.clim.nc; mv aerosols.1850.nc aerosols.nat.nc
+if [[ $aerosols = clim ]]; then
+  cp $local/interp_aerosols.sh .; chmod +x interp_aerosols.sh
+  # Les aerosols de l'annee 2000 ont été remplacés par "9999" qui pointe vers un fichier moyen sur 1995-2014
+  #for year in 2000 1850; do  ./interp_aerosols.sh \$year; done
+  #mv aerosols.2000.nc aerosols.clim.nc; mv aerosols.1850.nc aerosols.nat.nc
+  for year in 9999 1850; do ./interp_aerosols.sh \$year; done
+  mv aerosols.9999.nc aerosols.clim.nc; mv aerosols.1850.nc aerosols.nat.nc
 fi