Changeset 4955 for BOL/LMDZ_Setup_amaury/script_SIMU

Timestamp:

May 30, 2024, 2:36:54 PM (2 months ago)

Author:

abarral

Message:

(WIP) continue refactoring setup.sh

File:

• BOL/LMDZ_Setup_amaury/script_SIMU (modified) (4 diffs)

BOL/LMDZ_Setup_amaury/script_SIMU

@@ -1 +1 @@
 #!/bin/bash
-#
-#SBATCH --job-name=NOM_SIMU         # nom du job
-#SBATCH -A groupe@cpu
-# Nombre de processus MPI :
-#SBATCH --ntasks=8
-##### number of MPI processes per node : 40(procs/node on Jean-Zay) / cpus-per-task (ex : =5 for 8 OMP)
-####SBATCH --ntasks-per-node=5    # if specified, also add "#SBATCH --nodes= ..."  with nodes=ntasks/(ntasks-per-node)
-# nombre de threads OpenMP
-#SBATCH --cpus-per-task=8
-# de Slurm "multithread" fait bien reference a l'hyperthreading.
-#SBATCH --hint=nomultithread       # 1 thread par coeur physique (pas d'hyperthreading)
-#SBATCH --time=00:30:00            # Temps d execution maximum demande (HH:MM:SS)
-#SBATCH --output=outNOM_SIMU%j     # Nom du fichier de sortie
-#SBATCH --error=outNOM_SIMU%j      # Nom du fichier d'erreur (ici commun avec la sortie)
-#
-# To submit to test queue ; "time" (above) must be max 30 min
-# #SBATCH --qos=qos_cpu-dev
+## Headers managed by sed
+#@JZ#JeanZay
+#@JZ#SBATCH --job-name=NOM_SIMU         # nom du job
+#@JZ#SBATCH -A @@groupe@cpu
+#@JZ# Nombre de processus MPI :
+#@JZ#SBATCH --ntasks=8
+#@JZ##### number of MPI processes per node : 40(procs/node on Jean-Zay) / cpus-per-task (ex : =5 for 8 OMP)
+#@JZ####SBATCH --ntasks-per-node=5    # if specified, also add "#SBATCH --nodes= ..."  with nodes=ntasks/(ntasks-per-node)
+#@JZ# nombre de threads OpenMP
+#@JZ#SBATCH --cpus-per-task=8
+#@JZ# de Slurm "multithread" fait bien reference a l'hyperthreading.
+#@JZ#SBATCH --hint=nomultithread       # 1 thread par coeur physique (pas d'hyperthreading)
+#@JZ#SBATCH --time=00:30:00            # Temps d execution maximum demande (HH:MM:SS)
+#@JZ#SBATCH --output=outNOM_SIMU%j     # Nom du fichier de sortie
+#@JZ#SBATCH --error=outNOM_SIMU%j      # Nom du fichier d'erreur (ici commun avec la sortie)
+#@JZ# To submit to test queue ; "time" (above) must be max 30 min
+#@JZ#TESTQ#SBATCH --qos=qos_cpu-dev
 
 set -ex
@@ -42 +42 @@
 #veget=y
 veget=CMIP6
-if [ $veget = NONE ] ; then VEGET=n ; else VEGET=y ; fi 
+if [[ $veget = "none" ]] ; then VEGET=n ; else VEGET=y ; fi
 
 isotopes=n
@@ -52 +52 @@
 ok_guide=y   # y/n guidage ou non
 climato=1
-orchidee_rev=5004
 
 echo '##############################################################'
@@ -257 +256 @@
     if [ ! -f sechiba_rest_in.nc ] ; then
        echo '#########################################################'
-       echo Autoinitialisation d orchidee au besoin
+       echo "Autoinitialisation d'orchidee au besoin"
        echo '#########################################################'
        get="ln -s $LMDZ_Init/"