Changeset 3694 for BOL/Multi_atlas/install_multi_atlas.sh

Timestamp:

Jun 4, 2020, 11:31:02 AM (4 years ago)

Author:

idelkadi

Message:

Repository under svn of a first version of Multiatlas diagnostics for LMDZ. This version is adapted to be able to run a LMDZ multiatlas on an individual account on the ciclad machine of the IPSL. In this version, the parts to be modified are identified so as to subsequently adapt it to other machines.
Corrections.

File:

• BOL/Multi_atlas/install_multi_atlas.sh (modified) (4 diffs)

BOL/Multi_atlas/install_multi_atlas.sh

@@ -11 +11 @@
 # Definition des coleurs d'affichage
 noir='\e[0;30m' gris='\e[1;30m' rougefonce='\e[0;31m' rose='\e[1;31m' vertfonce='\e[0;32m' vertclair='\e[1;32m' orange='\e[0;33m' jaune='\e[1;33m' bleufonce='\e[0;34m' bleuclair='\e[1;34m' violetfonce='\e[0;35m' violetclair='\e[1;35m' cyanfonce='\e[0;36m' cyanclair='\e[1;36m' grisclair='\e[0;37m' blanc='\e[1;37m' neutre='\e[0;m'
+##
+##
 # AI avril 2020 : A FAIRE :
-# A FAIRE
 # Utiliser des fonctions entete, ...
 # A function pour definir l entete du job en fonction de la machine
 #function jobentete { #1er argument doit etre le nom de la machine 
 
+#set -x
+# Nom machine et compte
 hostname=`hostname`
 login=`whoami`
 
+# Definitions en fonction de la machine
 # CICLAD
 if [ ${hostname:0:5} = cicla ] ; then
+# chemin vers le rep dods de base
 DODSDIR=/prodigfs/ipslfs/dods
+# Rep ou sont stockes les multiatlas
+MULTIDIR=$DODSDIR/$login/lmdz/MultiSimu
+if [ ! -d $MULTIDIR ] ; then mkdir -p $MULTIDIR ; fi
+
+# Def entete des job 
 cat <<eod >> entete.sh
 #PBS -N atlas
@@ -41 +51 @@
 eod
 
+# Def env atlas
 cat <<eod >> defatlasenv.sh
-###########################################################################
+########################################################################################################
 # Environnement
 module list
 which python
 ulimit -s unlimited
-ATLAS_DIR=$DODSDIR/$login/lmdz/atlas/Atlas$$ ; mkdir -p $ATLAS_DIR
 export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/home/fabric/users/denvil/climaf
 export PATH=$PATH:/home/fabric/users/denvil/climaf/bin
@@ -54 +64 @@
 export CLIMAF_CACHE=$DODSDIR/$login/climafCache
 echo CLIMAF_CACHE $CLIMAF_CACHE
-MULTIDIR=$DODSDIR/ipslfs/dods/$login/lmdz/MultiSimu
-###########################################################################
+MULTIDIR=$MULTIDIR
+DIRATLAS=$DODSDIR/$login/lmdz/atlas
+ATLAS_DIR=$DODSDIR/$login/lmdz/atlas/Atlas$$ 
+if [ ! -d $DODSDIR/$login/lmdz/atlas/Atlas$$ ] ; then mkdir -p $DODSDIR/$login/lmdz/atlas/Atlas$$ ; fi
+########################################################################################################
 eod
 
@@ -141 +154 @@
 # Machines locales lmd
 
-MULTIDIR=$DODSDIR/ipslfs/dods/$login/lmdz/MultiSimu
-if [ ! -d $MULTIDIR ] ; then mkdir -p $MULTIDIR ; fi
-
 echo -e "${noir}%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% ${rougefonce} MULTIATLAS LMDZ ${noir}%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%"
 echo -e "${bleufonce}" To create your multi-atlas you needs :
 echo 1.  to create your multiatlas directory "example Multi01" :
-echo    - mkdir -p /prodigfs/ipslfs/dods/YourLoginName/lmdz/MultiSimu/Multi01
+echo    - mkdir -p /prodigfs/ipslfs/dods/$login/lmdz/MultiSimu/Multi01
 echo 2.  to define some characeristics of your multi-atlas "names, dates, description of simulations and atlas variables" :
-echo    - cp Utils/def.txt  Utils/atlas-def /prodigfs/ipslfs/dods/YourLoginName/lmdz/MultiSimu/Multi01/.
+echo    - cp Utils/def.txt  Utils/atlas-def /prodigfs/ipslfs/dods/$login/lmdz/MultiSimu/Multi01/.
 echo     define "names, date, description" of simulations in file :
-echo    - /prodigfs/ipslfs/dods/YourLoginName/lmdz/MultiSimu/Multi01/def.txt
+echo    - /prodigfs/ipslfs/dods/$login/lmdz/MultiSimu/Multi01/def.txt
 echo     define atlas variables in file
-echo    - /prodigfs/ipslfs/dods/YourLoginName/lmdz/MultiSimu/Multi01/atlas.def
+echo    - /prodigfs/ipslfs/dods/$login/lmdz/MultiSimu/Multi01/atlas.def
 
 rm -f job_multi.sh