Ignore:
Timestamp:
Mar 31, 2017, 11:31:38 AM (8 years ago)
Author:
emillour
Message:

All GCMs: set things up to enable pluging physics with dynamico

  • dyn3d
  • gcm.F90 : move I/O initialization (dates) to be done before physics

initialization

  • dyn3dpar
  • gcm.F : move I/O initialization (dates) to be done before physics

initialization

  • dynphy_lonlat:
  • inigeomphy_mod.F90 : add ind_cell_glo computation and transfer

to init_geometry

  • phy_common:
  • geometry_mod.F90 : add ind_cell_glo module variable to store global

column index

  • print_control_mod.F90 : make initialization occur via init_print_control_mod

to avoid circular module dependencies

  • init_print_control_mod.F90 : added to initialize print_control_mod module

variables

  • mod_phys_lmdz_mpi_data.F90 : use print_control_mod (rather than iniprint.h)
  • mod_phys_lmdz_para.F90 : use print_control_mod (rather than iniprint.h)
  • mod_phys_lmdz_omp_data.F90 : add is_omp_master (alias of is_omp_root) module

variable and use print_control_mod (rather than
iniprint.h)

  • physics_distribution_mod.F90 : add call to init_dimphy in

init_physics_distribution

  • xios_writefield.F90 : generic routine to output field with XIOS (for debug)
  • misc:
  • handle_err_m.F90 : call abort_physic, rather than abort_gcm
  • wxios.F90 : updates to enable unstructured grids

set module variable g_ctx_name to "LMDZ"
wxios_init(): remove call to wxios_context_init
wxios_context_init(): call xios_context_initialize with COMM_LMDZ_PHY
add routine wxios_set_context() to get handle and set context to XIOS
wxios_domain_param(): change arguments and generate the domain in-place
add wxios_domain_param_unstructured(): generate domain for unstructured case

NB: access is via "domain group" (whereas it is via "domain" in

wxios_domain_param)

  • dynphy_lonlat/phy[std|mars|venus|titan]:
  • iniphysiq_mod.F90 : Remove call to init_dimphy (which is now done in

phy_common/physics_distribution_mod.F90)

EM

Location:
trunk/LMDZ.MARS/libf/phy_common
Files:
3 added
6 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • trunk/LMDZ.MARS/libf/phy_common/geometry_mod.F90

    r1543 r1682  
    3030!$OMP THREADPRIVATE(cell_area)
    3131
     32  INTEGER,SAVE,ALLOCATABLE :: ind_cell_glo(:)      ! global index of a local cell
     33!$OMP THREADPRIVATE(ind_cell_glo)
    3234
    3335CONTAINS
    … …  
    3537  SUBROUTINE init_geometry(klon,longitude_,latitude_, &
    3638                           boundslon_,boundslat_, &
    37                            cell_area_,dx_,dy_)
     39                           cell_area_,ind_cell_glo_,dx_,dy_)
    3840  USE mod_grid_phy_lmdz, ONLY: nvertex
    3941  USE nrtype, ONLY : PI
    … …  
    4547    REAL,INTENT(IN) :: boundslat_(klon,nvertex)
    4648    REAL,INTENT(IN) :: cell_area_(klon)
     49    INTEGER,OPTIONAL,INTENT(IN) :: ind_cell_glo_(klon)
    4750    REAL,OPTIONAL,INTENT(IN) :: dx_(klon)
    4851    REAL,OPTIONAL,INTENT(IN) :: dy_(klon)
    … …  
    5558    ALLOCATE(boundslat(klon,nvertex))
    5659    ALLOCATE(cell_area(klon))
     60    IF (PRESENT(ind_cell_glo_)) ALLOCATE(ind_cell_glo(klon))
    5761    IF (PRESENT(dx_)) ALLOCATE(dx(klon))
    5862    IF (PRESENT(dy_))ALLOCATE(dy(klon))
    … …  
    6569    boundslat(:,:) = boundslat_(:,:)
    6670    cell_area(:) = cell_area_(:)
     71    IF (PRESENT(ind_cell_glo_)) ind_cell_glo(:) = ind_cell_glo_(:)
    6772    IF (PRESENT(dx_)) dx(:) = dx_(:)
    6873    IF (PRESENT(dy_)) dy(:) = dy_(:)

  • trunk/LMDZ.MARS/libf/phy_common/mod_phys_lmdz_mpi_data.F90

    r1543 r1682  
    11!
    2 !$Header$
     2!$Id$
    33!
    44MODULE mod_phys_lmdz_mpi_data
    5 !  USE mod_const_mpi
    65 
    76  INTEGER,SAVE :: ii_begin
    … …  
    3635  INTEGER,SAVE :: mpi_size
    3736  INTEGER,SAVE :: mpi_master
    38 !  INTEGER,SAVE :: mpi_root
    3937  LOGICAL,SAVE :: is_mpi_root
    4038  LOGICAL,SAVE :: is_using_mpi
    4139 
    4240 
    43   LOGICAL,SAVE :: is_north_pole
    44   LOGICAL,SAVE :: is_south_pole
     41  LOGICAL,SAVE :: is_north_pole_dyn
     42  LOGICAL,SAVE :: is_south_pole_dyn
    4543  INTEGER,SAVE :: COMM_LMDZ_PHY
    4644  INTEGER,SAVE :: MPI_REAL_LMDZ   ! MPI_REAL8
    … …  
    4846CONTAINS
    4947 
    50 !  SUBROUTINE Init_phys_lmdz_mpi_data(iim,jjp1,nb_proc,distrib)
    5148  SUBROUTINE init_phys_lmdz_mpi_data(nbp, nbp_lon, nbp_lat, communicator)
    52 !  USE mod_const_mpi, ONLY : COMM_LMDZ
    5349  IMPLICIT NONE
    5450#ifdef CPP_MPI
    5551    INCLUDE 'mpif.h'
    5652#endif
    57     INTEGER,INTENT(in) :: nbp
    58     INTEGER,INTENT(in) :: nbp_lon
    59     INTEGER,INTENT(in) :: nbp_lat
    60     INTEGER,INTENT(in) :: communicator
     53    INTEGER,INTENT(IN) :: nbp
     54    INTEGER,INTENT(IN) :: nbp_lon
     55    INTEGER,INTENT(IN) :: nbp_lat
     56    INTEGER,INTENT(IN) :: communicator
    6157   
    6258    INTEGER,ALLOCATABLE :: distrib(:)
    … …  
    109105   
    110106    IF (mpi_rank == 0) THEN
    111       is_north_pole = .TRUE.
    112     ELSE
    113       is_north_pole = .FALSE.
     107      is_north_pole_dyn = .TRUE.
     108    ELSE
     109      is_north_pole_dyn = .FALSE.
    114110    ENDIF
    115111   
    116112    IF (mpi_rank == mpi_size-1) THEN
    117       is_south_pole = .TRUE.
    118     ELSE
    119       is_south_pole = .FALSE.
     113      is_south_pole_dyn = .TRUE.
     114    ELSE
     115      is_south_pole_dyn = .FALSE.
    120116    ENDIF
    121117   
    … …  
    187183
    188184  SUBROUTINE print_module_data
    189 !  USE print_control_mod, ONLY: lunout
     185  USE print_control_mod, ONLY: lunout
    190186  IMPLICIT NONE
    191   INCLUDE "iniprint.h"
    192187 
    193188    WRITE(lunout,*) 'ii_begin =', ii_begin
    … …  
    217212    WRITE(lunout,*) 'mpi_master =', mpi_master
    218213    WRITE(lunout,*) 'is_mpi_root =', is_mpi_root
    219     WRITE(lunout,*) 'is_north_pole =', is_north_pole
    220     WRITE(lunout,*) 'is_south_pole =', is_south_pole
     214    WRITE(lunout,*) 'is_north_pole_dyn =', is_north_pole_dyn
     215    WRITE(lunout,*) 'is_south_pole_dyn =', is_south_pole_dyn
    221216    WRITE(lunout,*) 'COMM_LMDZ_PHY =', COMM_LMDZ_PHY
    222217 

  • trunk/LMDZ.MARS/libf/phy_common/mod_phys_lmdz_mpi_transfert.F90

    r1543 r1682  
    11!
    2 !$Header$
     2!$Id$
    33!
    44MODULE mod_phys_lmdz_mpi_transfert
    … …  
    16931693   
    16941694    offset=ii_begin
    1695     IF (is_north_pole) Offset=nbp_lon
     1695    IF (is_north_pole_dyn) Offset=nbp_lon
    16961696   
    16971697   
    … …  
    17031703   
    17041704   
    1705     IF (is_north_pole) THEN
     1705    IF (is_north_pole_dyn) THEN
    17061706      DO i=1,dimsize
    17071707        DO ij=1,nbp_lon
    … …  
    17111711    ENDIF
    17121712   
    1713     IF (is_south_pole) THEN
     1713    IF (is_south_pole_dyn) THEN
    17141714      DO i=1,dimsize
    17151715        DO ij=nbp_lon*(jj_nb-1)+1,nbp_lon*jj_nb
    … …  
    17371737   
    17381738    offset=ii_begin
    1739     IF (is_north_pole) Offset=nbp_lon
     1739    IF (is_north_pole_dyn) Offset=nbp_lon
    17401740   
    17411741   
    … …  
    17471747   
    17481748   
    1749     IF (is_north_pole) THEN
     1749    IF (is_north_pole_dyn) THEN
    17501750      DO i=1,dimsize
    17511751        DO ij=1,nbp_lon
    … …  
    17551755    ENDIF
    17561756   
    1757     IF (is_south_pole) THEN
     1757    IF (is_south_pole_dyn) THEN
    17581758      DO i=1,dimsize
    17591759        DO ij=nbp_lon*(jj_nb-1)+1,nbp_lon*jj_nb
    … …  
    17821782   
    17831783    offset=ii_begin
    1784     IF (is_north_pole) Offset=nbp_lon
     1784    IF (is_north_pole_dyn) Offset=nbp_lon
    17851785   
    17861786   
    … …  
    17921792   
    17931793   
    1794     IF (is_north_pole) THEN
     1794    IF (is_north_pole_dyn) THEN
    17951795      DO i=1,dimsize
    17961796        DO ij=1,nbp_lon
    … …  
    18001800    ENDIF
    18011801   
    1802     IF (is_south_pole) THEN
     1802    IF (is_south_pole_dyn) THEN
    18031803      DO i=1,dimsize
    18041804        DO ij=nbp_lon*(jj_nb-1)+1,nbp_lon*jj_nb
    … …  
    18241824
    18251825    offset=ii_begin
    1826     IF (is_north_pole) offset=nbp_lon
     1826    IF (is_north_pole_dyn) offset=nbp_lon
    18271827
    18281828    DO i=1,dimsize
    … …  
    18321832    ENDDO
    18331833
    1834     IF (is_north_pole) THEN
     1834    IF (is_north_pole_dyn) THEN
    18351835      DO i=1,dimsize
    18361836        VarOut(1,i)=VarIn(1,i)
    … …  
    18541854
    18551855    offset=ii_begin
    1856     IF (is_north_pole) offset=nbp_lon
     1856    IF (is_north_pole_dyn) offset=nbp_lon
    18571857
    18581858    DO i=1,dimsize
    … …  
    18621862    ENDDO
    18631863
    1864     IF (is_north_pole) THEN
     1864    IF (is_north_pole_dyn) THEN
    18651865      DO i=1,dimsize
    18661866         VarOut(1,i)=VarIn(1,i)
    … …  
    18831883
    18841884    offset=ii_begin
    1885     IF (is_north_pole) offset=nbp_lon
     1885    IF (is_north_pole_dyn) offset=nbp_lon
    18861886
    18871887    DO i=1,dimsize
    … …  
    18911891    ENDDO
    18921892
    1893     IF (is_north_pole) THEN
     1893    IF (is_north_pole_dyn) THEN
    18941894      DO i=1,dimsize
    18951895        VarOut(1,i)=VarIn(1,i)

  • trunk/LMDZ.MARS/libf/phy_common/mod_phys_lmdz_omp_data.F90

    r1657 r1682  
    11!
    2 !$Id: mod_phys_lmdz_omp_data.F90 2326 2015-07-10 12:24:29Z emillour $
     2!$Id: mod_phys_lmdz_omp_data.F90 2429 2016-01-27 12:43:09Z fairhead $
    33!
    44MODULE mod_phys_lmdz_omp_data
    … …  
    77  INTEGER,SAVE :: omp_rank
    88  LOGICAL,SAVE :: is_omp_root
     9  LOGICAL,SAVE :: is_omp_master  ! alias of is_omp_root
    910  LOGICAL,SAVE :: is_using_omp
     11  LOGICAL,SAVE :: is_north_pole_phy, is_south_pole_phy
    1012 
    1113  INTEGER,SAVE,DIMENSION(:),ALLOCATABLE :: klon_omp_para_nb
    … …  
    1618  INTEGER,SAVE :: klon_omp_begin
    1719  INTEGER,SAVE :: klon_omp_end
    18 !$OMP  THREADPRIVATE(omp_rank,klon_omp,is_omp_root,klon_omp_begin,klon_omp_end)
     20!$OMP  THREADPRIVATE(omp_rank,klon_omp,is_omp_root,is_omp_master,klon_omp_begin,klon_omp_end)
     21!$OMP  THREADPRIVATE(is_north_pole_phy, is_south_pole_phy)
    1922
    2023CONTAINS
    2124 
    2225  SUBROUTINE Init_phys_lmdz_omp_data(klon_mpi)
    23     USE dimphy
     26    USE dimphy
     27    USE mod_phys_lmdz_mpi_data, ONLY : is_north_pole_dyn, is_south_pole_dyn
    2428    IMPLICIT NONE
    2529    INTEGER, INTENT(in) :: klon_mpi
    … …  
    4347        omp_size=OMP_GET_NUM_THREADS()
    4448!$OMP END MASTER
     49!$OMP BARRIER
    4550        omp_rank=OMP_GET_THREAD_NUM()   
    4651#else   
    … …  
    5661   ELSE
    5762     abort_message = 'ANORMAL : OMP_MASTER /= 0'
    58      !-- abort_gcm only in the dynamics
    59      !CALL abort_gcm (modname,abort_message,1)
    60      print *,modname,abort_message
    61      STOP
     63     CALL abort_physic (modname,abort_message,1)
    6264   ENDIF
    6365!$OMP END MASTER
    64 
     66   is_omp_master=is_omp_root
    6567
    6668!$OMP MASTER
     69
    6770    ALLOCATE(klon_omp_para_nb(0:omp_size-1))
    6871    ALLOCATE(klon_omp_para_begin(0:omp_size-1))
    … …  
    8386!$OMP END MASTER
    8487!$OMP BARRIER
     88
     89   if ((is_north_pole_dyn) .AND. (omp_rank == 0 )) then
     90      is_north_pole_phy = .TRUE.
     91    else
     92      is_north_pole_phy = .FALSE.
     93    endif
     94    if ((is_south_pole_dyn) .AND. (omp_rank == omp_size-1)) then
     95      is_south_pole_phy = .TRUE.
     96    else
     97      is_south_pole_phy = .FALSE.
     98    endif
    8599   
    86100    klon_omp=klon_omp_para_nb(omp_rank)
    … …  
    93107
    94108  SUBROUTINE Print_module_data
     109  USE print_control_mod, ONLY: lunout
    95110  IMPLICIT NONE
    96   INCLUDE "iniprint.h"
    97111
    98112!$OMP CRITICAL 

  • trunk/LMDZ.MARS/libf/phy_common/mod_phys_lmdz_para.F90

    r1543 r1682  
    11!
    2 !$Header$
     2! $Id: mod_phys_lmdz_para.F90 2429 2016-01-27 12:43:09Z fairhead $
    33!
    44MODULE mod_phys_lmdz_para
    … …  
    1111  LOGICAL,SAVE :: is_parallel
    1212  LOGICAL,SAVE :: is_master
     13
    1314 
    1415!$OMP THREADPRIVATE(klon_loc,is_master)
    … …  
    1819  SUBROUTINE Init_phys_lmdz_para(nbp,nbp_lon,nbp_lat,communicator)
    1920  IMPLICIT NONE
    20     INTEGER,INTENT(in) :: nbp
    21     INTEGER,INTENT(in) :: nbp_lon
    22     INTEGER,INTENT(in) :: nbp_lat
    23     INTEGER,INTENT(in) :: communicator
     21    INTEGER,INTENT(IN) :: nbp
     22    INTEGER,INTENT(IN) :: nbp_lon
     23    INTEGER,INTENT(IN) :: nbp_lat
     24    INTEGER,INTENT(IN) :: communicator
    2425
    2526    CALL Init_phys_lmdz_mpi_data(nbp,nbp_lon,nbp_lat,communicator)
    … …  
    4142       is_parallel=.FALSE.
    4243     ENDIF
     44
     45
    4346     
    4447  END SUBROUTINE Init_phys_lmdz_para
    … …  
    4649  SUBROUTINE Test_transfert
    4750  USE mod_grid_phy_lmdz
     51  USE print_control_mod, ONLY: lunout
    4852  IMPLICIT NONE
    49     INCLUDE "iniprint.h"
    5053 
    5154    REAL :: Test_Field1d_glo(klon_glo,nbp_lev)

  • trunk/LMDZ.MARS/libf/phy_common/physics_distribution_mod.F90

    r1543 r1682  
    1010                                       nbp, nbp_lon, nbp_lat, nbp_lev, &
    1111                                       communicator)
    12   USE mod_phys_lmdz_para, ONLY: init_phys_lmdz_para
     12  USE mod_phys_lmdz_para, ONLY: init_phys_lmdz_para, klon_omp
    1313  USE mod_grid_phy_lmdz, ONLY: init_grid_phy_lmdz
     14  USE dimphy, ONLY : Init_dimphy
     15
    1416  IMPLICIT NONE
    1517    INTEGER,INTENT(IN) :: grid_type
    … …  
    2426    CALL init_grid_phy_lmdz(grid_type,nvertex, nbp_lon,nbp_lat,nbp_lev)
    2527    CALL init_phys_lmdz_para(nbp,nbp_lon, nbp_lat, communicator)
     28!$OMP PARALLEL
     29    CALL init_dimphy(klon_omp,nbp_lev)
     30!$OMP END PARALLEL
    2631
    2732  END SUBROUTINE init_physics_distribution 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.