source: trunk/chantiers/commit_importants.log @ 52

**** commit_v5 ****

** ADAPTATION GCM POUR CP(T)
**--------------------------

* Ajout d'un fichier cpdet.F contenant toutes les routines nécessaires à 
  l'utilisation de Cp(T)
  -> routines ini_cpdet, t2tpot, tpot2t
  -> fonction cpdet(t)

* Du coup, suppression de tous les cpdet.* de phytitan et phyvenus

* Modif de gcm.F : initialisation ini_cpdet ajoutée

* Modif de comconst.h : ajout de nu_venus et t0_venus

* Modif de caldyn0.F : 
    - dimensions de pk (ip1jmp1 à la place de iip1,jjp1)
    - ajout de temp et tsurpk
    - calcul de temp (tpot2t) et tsurpk
    - passage de tsurpk à la place de teta dans sortvarc0
    
* Modif de caldyn.F :
    - passage de tsurpk en argument
    - dimensions de pk (ip1jmp1 à la place de iip1,jjp1)
    - ajout de temp
    - passage de tsurpk à la place de teta dans dudv2
    - passage de tsurpk à la place de teta dans sortvarc

* Modif de calfis.F :
    - ajout de zteta et zpk
    - calculs de zteta et zpk
    - calcul de ztfi via tpot2t
    - mise en commentaires de pcvgu/v/t/q car ne servent pas... 
    - (ajout commentaire sur traceurs intensifs)
    - modification du calcul de pdhfi

* Modif de diagedyn.F :
  (même si c'est une routine pure Terre, pour l'instant)
    - calcul de la temperature 
    - remplacement de RCPD par cpdet(T)

* Modif de leapfrog.F :
    - ajout de temp et tsurpk
    - calcul de temp (tpot2t) et tsurpk (3 endroits)
    - passage de tsurpk à la place de teta dans geopot (3 endroits)
    - passage de tsurpk en argument de caldyn
    - calcul de dtetaecdt

* Modif de vlspltqs.F
    - modif taille de tempe
    - calcul de tempe (via tpot2t)


** APPEL DE LA PHYSIQUE
**----------------------

* Modif de calfis.F :
    - on appelle physiq comme pour Venus et Titan quand on n'a pas la 
      clé CPP_EARTH
    - j'ai enlevé le mot clé planet_type, ça fait double emploi, non ?
    - j'ai laissé nqtot dans les arguments d'appel à physiq... A reverifier.

**** commit_v6 ****

* Modif de defrun.F : commentaire indiquant qu'il ne sert plus donc pas a jour !

* Modif de dynredem.F : correction faute orthographe dans commentaire

** IOIPSL, real8 vs real4
**-----------------------

J'élimine ce truc bancal. Il faudra compiler IOIPSL en double précision.
Du coup, pas de modifs spécifiques dans dyn3d. Par contre, il faudra éliminer
ça dans les physiques !


** Nombre de traceurs
**-------------------

* Modif de infotrac.F90 :
    - definition de type_trac
    - definition de nqtrue depend de planet_type
    - lecture de traceur.def depend de planet_type

* Modif de addfi.F :
    - separation des traceurs 1 et 2 pour qtestt/qtestw valable seulement 
      pour planet_type=earth

* Modif de caladvtrac.F :
    - deplacement du test sur planet_type pour virer tout ce qui concerne
      dq quand on n'est pas sur Terre

* Modif de calfis.F :
    - ajout d'une remarque concernant pdq...


** Avec ou sans advection de traceurs
**-----------------------------------

Reglé grace à iadv lu dans traceur.def: si 0, pas advecté.
Sans traceurs, on a donc un seul traceur dummy, non advecté, mais 
écrit dans start.nc et trimbalé partout...


** Homogeneisation des .def
**-------------------------

* Modif des deftanks/[titan/venus]/[gcm/physiq/run].def :
    - ajout planet_type
    - passage des cles physiques vers physiq.def
    - homogeneisation des parametres

* Modif de conf_gcm.F :
    - ok_strato mis à true par defaut

* Modif de clesph0.h :
    - ajout d'un commentaire: il faut virer ce fichier, ne sert plus a rien.


** Homogeneisation de bilan_dyn
**-----------------------------

* Modif de leapfrog.def :
    - premier appel: il y a first, deplacement de first=.false., elimination prem
    - ajout d'initialisations
    - ajout des tendances de la couche superieure (d*top)
    - elimination itau_w (ne sert pas)
    - couche superieure: ajout addfi séparé
    - passage des d*dis en */s
    - appel bilan_dyn

* Modif de bilan_dyn.def :
    - modification appel (pour sortie des tendances en moment cinetique)
    - ajout tendances du* en m/s2
    - ajout variables pour transport vertical
    - ajout variables pour tendances en moment cinetique
    - Champs advectés: base=6 (ovap est un traceur...), 
      en commentaire pour l'instant, les traceurs.
    - introduction des calculs pour transport vertical
    - introduction des calculs pour tendances moment cinétique
    - présentation des déclarations
    - facteur fact_geovenus=-1 pour Vénus
    - petit ajustement possible pour ncum (problèmes de précision)
    - élminination des sorties grads
    - modif noms temp et ecin
    - modif sur incrementation itau et time
    - definitions et sorties: 
       limité pour l'instant à temp et ang, sans les psiQ
       sans la somme en lat du transport vertical, à revoir (1D seulement?).
    - modification calcul ang
    - modification tpot2t
    - correction sur fonction de courant psiQ


** Choix de spécificités Terre dans gcm.F
**---------------------------------------
( certains appels ont été mis sous flag CPP_EARTH ou planet_type=earth alors )
( qu'il sont aussi valables pour Venus et Titan...                           )
( ils etaient sous flag IOIPSL avant...                                      )

* Modif de gcm.F :
    - appel de dynetat0 modulé selon planet_type (mars est un cas à part)
    - appel de dynredem0 modulé selon planet_type (mars est un cas à part)
    - appel de iniphysiq: a mettre sous cle CPP_PHYS pour cas sans physique

* Modif de leapfrog.F :
    - appel de dynredem1 modulé selon planet_type (mars est un cas à part)

* Modif de calfis.F :
    - appel de physiq: a mettre sous cle CPP_PHYS pour cas sans physique
    - conservation de la possibilité de nsplit_phys
    - ajout commentaire sur unité des tendances

* Modif de conf_gcm.F :
    - commentaires pour nsplit_phys


**** commit_v7 ****

* Mise à niveau (de la dynamique) par rapport à la version 1447 de LMDZ5
* ----------------------------------------------------------------------

* Pour l'instant, on n'a pas touché à dyn3dpar, donc pour l'instant on ne
  fait que recopier les fichiers de la version 1447

* Mise à jour de routines (dans dyn3d) qui n'ont changé que côté LMDZ5:
- ener.h
- grid_noro.F
- iniacademic.F
- integrd.F
- limit_netcdf.F90

* Mise à jour des routines qui ont changé des deux côtés:
- addfi.F 
  * ajout d'un "USE control_mod, ONLY : planet_type"
  * mise en forme du if (planet_type=="earth") à l'identique de la revision 1447 (pour être peinard vis-à-vis de futures diff).
- caladvtrac.F 
  * ajout d'un "USE control_mod, ONLY : iapp_tracvl,planet_type"
  * mise en conformité de la taille du tableau dq(ip1jmp1,llm,nqtot) et non pas dq(ip1jmp1,llm,2) (qui oblige à avoir au moins 2 traceurs...)
  * mise entre if (planet_type=="earth") des calculs après advtrac (à nouveau, il faut avoir au moins 2 traceurs pour que ça ait un sens; et encore, ce morceau ne sert peut-être au final à rien).
  * A nouveau ces modifs étaient déjà en partie déjà faites; j'ai juste remis en forme comme dans la révision 1447 pour rester homogène avec le code terrestre.
- gcm.F
  * Mise d'un #ifdef CPP_PHYS autoure de Init_Phys_lmdz et InitComgeomphy , au lieu du (bancal) #ifdef CPP_EARTH
  * De même il faut bel et bien un #ifdef CPP_PHYS autour de iniphysiq & co.
- infotrac.F90
  * Ajout des modifs de forme et correction sur l'utilisation de trim() et taille des tableaux str1(23),str2(23)
  * On garde un type_trac='plnt' pour les planètes (Attention, il faudra vérifier que ça ne casse rien par ailleurs et surtout n'est-ce finalement pas redoundant avec le planet_type?).
- leapfrog.F
  * Ajout des modifs/améliorations pour le cas académique sans physique
   mais en utilisant dutop(),dvtop(), etc. pour le sponge layer
   
**** commit_v8 ****

** ADAPTATION DYNAMIQUE PARALLELE AU CP(T)
------------------------------------------

Remarques:
----------
- Modifs non testées par une compilation/exécution du code; finalement s'organiser un mode de fonctionnement ou on peut compiler le code (au moins sans physique) est assez impératif.
- On pourrait peut-être faire de cpdet.F90 un module...

Retour sur leapfrog.F: (version séquentielle, dans dyn3d):
----------------------
- On revient en arrière sur l'utilisation de dutop(),dvtop(),dtetatop() au lieu des dufi(),dvfi() et dtetafi() pour les appels à top_bound. Dans la version terrestre, différente du sponge Martien (et Vénusien), ces tendances sont liées.
=> A 'hamoniser' plus tard.

Modifications (dans dyn3dpar):
------------------------------

* infotrac.F90 : recopié à l'identique depuis dyn3d

* comconst.h : recopié à l'identique depuis dyn3d

* caldyn0.F : recopié à l'identique depuis dyn3d

* cpdet.F :
  - création des routines t2tpot_p et tpot2t_p , versions // de t2tpot et tpot2t

* gcm.F :
  - on encadre les appels à Init_Phys_lmdz et Init_interface_dyn_phys par des #ifdef CPP_PHYS (et non plus ifdef CPP_EARTH).
  - ajout de l'appel à ini_cpdet pour Cp(T)
  - appel de dynetat0 modulé selon planet_type (Mars est le cas pathologique)
  - appel à iniphysiq encadré par un #ifdef CPP_PHYS
  - appel de dynredem0_p modulé selon planet_type (Mars est le cas pathologique)
  
* leapfrog_p.F :
  - ajout variables temp et tsurpk
  - ajout des calculs des hallos pour temp() et tsurkp() (NOTE POUR PLUS TARD: vérifier que c'est bien nécessaire...)
  - utilisation tpot2t_p et calcul de tsurkp() avant appel à geopot_p (sans oublier de modifier argument de geopot_p, teta => tsurpk). (3 fois)
  - ajout argument tsurpk dans l'appel à caldyn_p.
  - ajout des passages en (m/s)/s des dudis , dvdis et dtetadis.
  - calcul de dtetaecdt en passant par la température.
  - changement des arguments de l'appel à bilan_dyn_p.
  - appel de dynredem1_p modulé selon planet_type (Mars est le cas pathologique).

* calfis_p.F :
  - utilisation de la clef CPP_PHYS (et non plus CPP_EARTH).
  - ajout des variables locales zteta et zpk.
  - ajout calcul de zteta et zpk.
  - calcul de ztfi via tpot2t_p (NOTE POUR PLUS TARD: vérifier que la taille "physique" du champ ne pose pas pb par rapport au découpage //).
  - appel de la routine physiq selon planet_type.
  - modification calcul de pdhfi.
  
* caldyn_p.F :
  - ajout de tsurpk dans les arguments.
  - passage de tsurkp à la place de teta dans dudv2_p.
  - passage de tsurkp à la place de teta dans sortvarc.
  
* vlspltqs_p.F :
  - modification de la taille de tempe (tempe(ip1jmp1,llm) au lieu de tempe(ip1jmp1).
  - calcul de tempe via tpot2t_p (NOTE POUR PLUS TARD: probablement à revoir! Etrangement vlspltqs_p ne contient aucune instruction OpenMP !?! Il y a là un truc qui m'échappe...)

* bilan_dyn_p.F : A FAIRE... (mis de côté pour l'instant car pas sûr que l'ancien bilan_dyn_p fonctionne en mode mixte mpi/omp, à vérifier d'abord, avant de tenter des modifs...) 

**** commit_v11 ****

24/01/2011 ajout du modele meso-echelle martien, ancienne physique -- A. Spiga

**** commit_v17 ****

24/01/2011 ajout du module LES, ancienne physique -- A. Spiga

**** commit_v37 ****
27/01/2011 Remise en route chantier compilation -- Ehouarn
- Modifs et corrections pour pouvoir compiler le gcm (en séquentiel, avec
   makelmdz_fcm pour l'instant):
 * ajout de fichiers 'arch' pour linux-64 (pour Bellonzi, avec ioipsl et en r8)
 * modification de makelmdz_fcm, ajout de la clé CPP_PHYS si on compile avec
   une physique
 * correction de quelques typos/bugs révélés à la compilation:
 - infotrac.F90 : supression des appels à 'lnblnk' (remplacés par len_trim)
 - bilan_dyn.F : déclaration des variables znom3,znom3l,zunites3, planet_type
 - cpdet.F : "use control_mod, ONLY: planet_type" mis aux bons endroits
             (idem sur cpdet.F dans dyn3dpar)
 - leapfrog.F : declaration de  ztetaec(), dtec, cpdet , itau_w, duspg()
 - diagedyn.F : correction typo; attention dans diagedyn.F il y a du
                include "../phylmd/YOMCST.h"
                Ca va poser problème qd on change de physique....

- Avec ces modifs, la compilation marche sans physque, avec ou sans ioipsl
  et avec la physique terrestre phylmd.

********************************************
**** commit_v51 (et quelques autres...) ****
********************************************

29/01/2011 --- A. SPIGA

Nouveautes LMD_MM_MARS - LMD_LES_MARS - LMDZ.MARS [dossier mars]

Ce commit fait le bilan des chantiers d'uniformisation des diverses sources du mesochelle
[tous les commits par "spiga" depuis le debut sont relatifs a ces chantiers]

Chantiers acheves avec compilation et execution testees:

1. le meme coeur dynamique peut maintenant etre compile avec ancienne ou nouvelle physique; option -p sur makemeso.

2. la meme interface module_lmd_driver est partagee par LMD_MM_MARS et LMD_LES_MARS

3. le meme libf est partage entre modele mesoechelle et gcm
   les quelques routines qui different sont notees meso_ et integrees aux sources du gcm

=====> De 4 version du modele + 1 version de la nouvelle physique, on passe a une seule version du modele
meso-echelle dont la physique est automatiquement indexee sur les modifications effectuees dans le GCM 
[quelques routines mesoechelle mises a part]

* Reste a tester LMD_LES_MARS avec la nouvelle physique. Modifications mineures attendues suite au point 2. 
* Reste a tester le nesting qui devrait induire des modifications dues a des lignes trop longues... ce sera transparent du point de vue GCM.

********************
**** commit_v52 ****
********************

********** chantier principal du commit
********** --- version LMDZ5 qui fonctionne pour tests geantes
********** --- prochaine etape, tests sur GNOME

M      libf/dyn3dpar/comconst.h
M      libf/dyn3dpar/conf_planete.F90
ajout du flux de chaleur intrinseque: ihf
[par defaut il est nul] 

M      libf/dyn3dpar/gcm.F
changements cosmetiques 
[pour diff plus efficace avec version non par]

M      libf/dyn3dpar/iniacademic.F
possibilites de variations latitudinales
de temperature plus originales 
[seulement pour planet_type.eq."giant"]

M      libf/dyn3dpar/leapfrog_p.F
1. ajout d'une tendance causee par le flux de chaleur intrinseque
      (seulement prise en compte si planet_type.eq."giant")
2. correction bugs problematiques a la compilation et au run
--> probleme dans les boucles (l'indice etait llm et non l)
--> ajout de SAVE pour les variables paralleles
--> correction des declarations de variables manquantes

M      libf/dyn3dpar/calfis_p.F
correction d'une deuxieme parenthese manquante sur ALLOCATE(zteta(klon,llm))

M      libf/phylmd/regr_lat_time_climoz_m.F90
erreur a la compilation avec FCM... il s'agit d'une routine terrestre
il y a visiblement un probleme avec o3_in
en attendant, les lignes sont commentees avec !AS

A      deftanks/giant  8 fichiers
ajout de fichiers de configuration typiques pour les geantes gazeuses
[experimental pour le moment... on est loin de jupiter]
       --> comparaisons entre un run ancien [avec LMDZ5-dev sur SVN ipsl sans cp var] 
       et run avec version sur ce SVN planeto donne des resultats similaires

********** pratique

A      ioipsl
A      ioipsl/compile_ioipsl.bash
A      ioipsl/util 16 fichiers
script et utilitaire pour compiler IOIPSL de facon independante
il suffit d'executer ./compile_ioipsl.bash

M      arch/arch-AMD64_CICLAD.path
si IOIPSL a ete compile avec la methode precedente, les bons
PATH sont definis dans ce fichier [le NETCDF est aussi OK]

M      000-README-svn
mise a jour options "svn status"

M      mars/libf/phymars/meso_callkeys.h
mise a jour mineure du fichier 
[ecri_phys etait defini mais pas dans la liste]