| 1 | #!/bin/bash  | 
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| 2 | ######################################################################### | 
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| 3 | # Script to automatically install the NetCDF 4.0.1 Library | 
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| 4 | ######################################################################### | 
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| 5 | # Defaults | 
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| 6 | ######################################################################### | 
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| 7 | install_dir=$(pwd)/netcdf-4.0.1 | 
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| 8 | compiler_suite=gnu | 
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| 9 | configure_options="" | 
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| 10 | ######################################################################### | 
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| 11 | #  Options  | 
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| 12 | ######################################################################### | 
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| 13 | while (($# > 0)) | 
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| 14 |    do | 
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| 15 |    case $1 in | 
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| 16 |      "-h") cat <<........fin | 
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| 17 |     $0 [ -prefix path ]       where (path) to install | 
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| 18 |                               (default: $install_dir) | 
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| 19 |        [ -compiler gnu | intel ] compiler suite (Fortran, C, C++) to use | 
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| 20 |                               (default: $compiler_suite) | 
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| 21 |        [ -options opt ]       additional options string | 
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| 22 |                               for the NetCDF configure script | 
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| 23 |                               (default: $configure_options) | 
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| 24 | ........fin | 
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| 25 |      exit ;; | 
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| 26 |      "-prefix") install_dir=$2 ; shift ; shift ;; | 
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| 27 |      "-compiler") compiler_suite=$2 ; shift ; shift ;; | 
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| 28 |      "-options") configure_options=$2 ; shift ; shift ;; | 
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| 29 |      *) echo "Error, bad argument $1" ; $0 -h ; exit | 
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| 30 |    esac | 
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| 31 | done | 
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| 32 |  | 
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| 33 | # Install directory (get full path) | 
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| 34 | mkdir -p $install_dir | 
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| 35 | install_dir=$(cd $install_dir ; pwd -P ) | 
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| 36 | cd $install_dir | 
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| 37 |  | 
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| 38 | rm -rf netcdf-4.0.1* | 
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| 39 | wget http://www.lmd.jussieu.fr/~lmdz/Distrib/netcdf-4.0.1.tar.gz | 
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| 40 | tar xzf netcdf-4.0.1.tar.gz ; cd netcdf-4.0.1  | 
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| 41 |  | 
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| 42 | if [[ ${compiler_suite} == "gnu" ]] ; then | 
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| 43 |   f_compiler="gfortran" | 
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| 44 |   c_compiler="gcc" | 
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| 45 |   cxx_compiler="g++" | 
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| 46 | elif [[ ${compiler_suite} == "intel" ]] ; then | 
|---|
| 47 |   f_compiler="ifort" | 
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| 48 |   c_compiler="icc" | 
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| 49 |   cxx_compiler="icpc" | 
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| 50 | else | 
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| 51 |   echo "unknown compiler family $compiler_suite" | 
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| 52 |   echo "might as well stop here" | 
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| 53 |   exit | 
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| 54 | fi | 
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| 55 |  | 
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| 56 | export FC=$f_compiler | 
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| 57 | export F90=$f_compiler | 
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| 58 | export CC=$c_compiler | 
|---|
| 59 | export CXX=$cxx_compiler | 
|---|
| 60 | if [[ ${f_compiler} == "gfortran" ]] ; then | 
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| 61 |   export FFLAGS=" -O2 -fPIC" | 
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| 62 |   export FCFLAGS="-O2 -ffree-form -fPIC" | 
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| 63 |   export CPPFLAGS="" | 
|---|
| 64 |   export CFLAGS="-O2 -fPIC" | 
|---|
| 65 |   export CXXFLAGS="-O2 -fPIC" | 
|---|
| 66 | elif [[ ${f_compiler} == "ifort" ]] ; then | 
|---|
| 67 |   export CPP="icc -E" | 
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| 68 |   export FFLAGS="-O2 -ip -fpic" | 
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| 69 |   export FCFLAGS="-O2 -ip -fpic" | 
|---|
| 70 |   export CPPFLAGS="" | 
|---|
| 71 |   export CFLAGS="-O2 -ip -fpic" | 
|---|
| 72 |   export CXXFLAGS="-O2 -ip -fpic" | 
|---|
| 73 | else | 
|---|
| 74 |   echo "unknown compiler $f_compiler" | 
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| 75 |   echo "might as well stop here" | 
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| 76 |   exit | 
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| 77 | fi | 
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| 78 |  | 
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| 79 | ./configure $configure_options --prefix=$install_dir > configure.log 2>&1  | 
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| 80 |  | 
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| 81 | make > make.log 2>&1 | 
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| 82 |  | 
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| 83 | make test > make_test.log 2>&1 | 
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| 84 |  | 
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| 85 | make install > make_install.log 2>&1 | 
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| 86 |  | 
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| 87 | if [[ -f $install_dir/bin/nc-config ]] ; then | 
|---|
| 88 |   echo "successfully installed the netcdf library in $install_dir" | 
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| 89 | fi | 
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