source: trunk/UTIL/PYTHON/pp.py @ 507

Last change on this file since 507 was 507, checked in by aslmd, 13 years ago

UTIL PYTHON: added an option --seevar to see the list of variables in file. also if there is only one variable and the name is not right the script figure it out.

  • Property svn:executable set to *
File size: 8.5 KB
Line 
1#!/usr/bin/env python
2
3### A. Spiga + T. Navarro + A. Colaitis
4
5###########################################################################################
6###########################################################################################
7### What is below relate to running the file as a command line executable (very convenient)
8if __name__ == "__main__":
9    import sys
10    from optparse import OptionParser    ### to be replaced by argparse
11    from api_wrapper import api_onelevel
12    from gcm_transformations import call_zrecast
13    from netCDF4 import Dataset
14    from myplot import getlschar, separatenames, readslices, adjust_length, whatkindfile, errormess
15    from os import system
16    from planetoplot import planetoplot
17    from myscript import getparseroptions
18    import glob
19    import numpy as np
20
21
22    #############################
23    ### Get options and variables
24    parser = OptionParser() ; getparseroptions(parser) ; (opt,args) = parser.parse_args()
25    if opt.file is None:                                errormess("I want to eat one file at least ! Use winds.py -f name_of_my_file. Or type winds.py -h")
26    if opt.var is None and opt.anomaly is True:         errormess("Cannot ask to compute anomaly if no variable is set")
27    if opt.fref is not None and opt.operat is None:     errormess("you must specify an operation when using a reference file")
28    if opt.operat in ["+","-"] and opt.fref is None:    errormess("you must specifiy a reference file when using inter-file operations")
29    if opt.fref is not None and opt.operat is not None and opt.itp is not None: interpref=True
30    else:   interpref=False
31    if opt.rate is not None:      opt.save = "avi"
32    elif opt.save == "avi":       opt.rate = 8   ## this is a default value for -S avi
33    if opt.save == "html":        opt.rate = -1  ## this is convenient because everything is done in planetoplot with mrate
34
35    #############################
36    ### Get infos about slices
37    zeslat  = readslices(opt.slat) ; zeslon  = readslices(opt.slon) ; zesvert = readslices(opt.svert) ; zestime = readslices(opt.stime)
38    reffile = opt.fref
39    zexaxis = [opt.xmin,opt.xmax] ; zeyaxis=[opt.ymin,opt.ymax]
40
41    #############################
42    ### Catch multiple files
43    if "*" in opt.file[0] or "?" in opt.file[0]: 
44        yeah = glob.glob(opt.file[0]) ; yeah.sort()
45        opt.file[0] = yeah[0] 
46        for file in yeah[1:]: opt.file[0] = opt.file[0] + "," + file
47
48    #############################
49    ### 1. LOOP ON FILE LISTS TO BE PUT IN DIFFERENT FIGURES
50    for i in range(len(opt.file)):
51
52      zefiles = separatenames(opt.file[i])
53
54      typefile = whatkindfile(Dataset(zefiles[0])) ; stralt = None
55      if typefile in ["meso","mesoapi","mesoideal"]:         
56          [lschar,zehour,zehourin] = getlschar ( zefiles[0] )
57          if opt.var is None:  opt.var = ["HGT"] ; opt.clb = "nobar"
58      elif typefile in ["geo"]:
59          [lschar,zehour,zehourin] = ["",0,0]
60          if opt.var is None:  opt.var = ["HGT_M"] ; opt.clb = "nobar"
61      else:                                       
62          [lschar,zehour,zehourin] = ["",0,0]
63          if opt.var is None:  opt.var = ["phisinit"] ; opt.clb = "nobar"
64
65      if opt.vmin is not None : zevmin  = opt.vmin[min(i,len(opt.vmin)-1)]
66      else:                     zevmin = None
67      if opt.vmax is not None : zevmax  = opt.vmax[min(i,len(opt.vmax)-1)]
68      else:                     zevmax = None
69      #print "vmin, zevmin", opt.vmin, zevmin ; print "vmax, zevmax", opt.vmax, zevmax
70
71      #############################
72      ### 2. LOOP ON VAR LISTS TO BE PUT IN DIFFERENT FIGURES
73      for j in range(len(opt.var)):
74
75        zevars = separatenames(opt.var[j])
76
77        inputnvert = separatenames(opt.lvl)
78        if np.array(inputnvert).size == 1:
79            zelevel = float(inputnvert[0])
80            ze_interp_levels = [-9999.]
81        elif np.array(inputnvert).size == 2:
82            zelevel = -99.
83            ze_interp_levels = np.linspace(float(inputnvert[0]),float(inputnvert[1]),20)
84        else:
85            zelevel = -99.
86            ze_interp_levels = np.linspace(float(inputnvert[0]),float(inputnvert[1]),float(inputnvert[2]))
87
88        #########################################################
89        ### Call Fortran routines for vertical interpolations ###     
90        #########################################################
91        if opt.itp is not None:
92          #####
93          ##### MESOSCALE : written by AS
94          #####
95          if typefile in ["meso","mesoideal"]:
96            if zelevel == 0. and opt.itp == 4:  zelevel = 0.010
97            ### winds or no winds
98            if opt.winds            :  zefields = 'uvmet'
99            else                    :  zefields = ''
100            ### var or no var
101            if zefields == ''       :  zefields = opt.var[j] 
102            else                    :  zefields = zefields + "," + opt.var[j]
103            if opt.var2 is not None :  zefields = zefields + "," + opt.var2 
104            ### call fortran routines
105            for fff in range(len(zefiles)):
106                newname = api_onelevel (  path_to_input   = '', \
107                                               input_name      = zefiles[fff], \
108                                               fields          = zefields, \
109                                               interp_method   = opt.itp, \
110                                               interp_level    = ze_interp_levels, \
111                                               onelevel        = zelevel, \
112                                               nocall          = opt.nocall )
113                if fff == 0: zetab = newname
114                else:        zetab = np.append(zetab,newname)
115            zefiles = zetab #; print zefiles
116            zelevel = 0 ## so that zelevel could play again the role of nvert
117          #####
118          ##### GCM : written by AC
119          #####
120          elif typefile == "gcm":
121            inputvar = zevars
122            if opt.var2 is not None : inputvar = np.append(inputvar,opt.var2)
123            interpolated_files=""
124            interpolated_files=call_zrecast(interp_mode=opt.itp,\
125                    input_name=zefiles,\
126                    fields=inputvar,\
127                    limites = ze_interp_levels,\
128                    predefined=opt.intas)
129
130            zefiles=interpolated_files
131            if interpref:
132               interpolated_ref=""
133               interpolated_ref=call_zrecast(interp_mode=opt.itp,\
134                    input_name=[opt.fref],\
135                    fields=zevars,\
136                    predefined=opt.intas)
137
138               reffile=interpolated_ref[0]
139          else:
140            print "type not supported"
141            exit()
142
143        #############
144        ### Main call
145        name = planetoplot (zefiles,level=int(zelevel),vertmode=opt.itp,\
146                proj=opt.proj,back=opt.back,target=opt.tgt,stride=opt.ste,var=zevars,\
147                colorb=opt.clb,winds=opt.winds,\
148                addchar=lschar,interv=[zehour,zehourin],vmin=zevmin,vmax=zevmax,\
149                tile=opt.tile,zoom=opt.zoom,display=opt.display,\
150                hole=opt.hole,save=opt.save,\
151                anomaly=opt.anomaly,var2=opt.var2,ndiv=opt.ndiv,\
152                mult=opt.mult,zetitle=opt.zetitle,\
153                slon=zeslon,slat=zeslat,svert=zesvert,stime=zestime,\
154                outputname=opt.out,resolution=opt.res,\
155                ope=opt.operat,fileref=reffile,minop=opt.vminope,maxop=opt.vmaxope,titleref=opt.titref,\
156                invert_y=opt.inverty,xaxis=zexaxis,yaxis=zeyaxis,ylog=opt.logy,yintegral=opt.column,\
157                blat=opt.blat,blon=opt.blon,tsat=opt.tsat,flagnolow=opt.nolow,\
158                mrate=opt.rate,mquality=opt.quality,trans=opt.trans,zarea=opt.area,axtime=opt.axtime,\
159                redope=opt.redope,seevar=opt.seevar,xlab=opt.xlab,ylab=opt.ylab)
160        print 'DONE: '+name
161        system("rm -f to_be_erased")
162 
163    #########################################################
164    ### Generate a .sh file with the used command saved in it
165    command = "" 
166    for arg in sys.argv: command = command + arg + ' '
167    #if typefile not in ["meso","mesoapi"]: name = 'pycommand'
168    if opt.save == "gui":    name = 'pycommand'
169    elif opt.save == "avi":  system("mv -f movie*.avi "+name+".avi")
170    elif opt.save == "html": system("cat $PYTHONPATH/header.html > anim.html ; cat zepics >> anim.html ; cat $PYTHONPATH/body.html >> anim.html ; rm -rf zepics "+name+" ; mkdir "+name+" ; mv anim.html image*png "+name) 
171    f = open(name+'.sh', 'w')
172    f.write(command)
173
174    #print "********** OPTIONS: ", opt
175    print "********************************************************** END"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.