source: trunk/UTIL/PYTHON/pp.py @ 796

Last change on this file since 796 was 792, checked in by acolaitis, 12 years ago

PYTHON GRAPHICS

  • Added option --finddevil which finds the steepest pressure drop in the PSFC field of the file, and add a cross in it's position.

This new function is intended to provide lon and lat of a dust devil to planetoplot. This could be used to drive a slice plot at the corresponding location.

  • Removed dumpbdy for LES files (no relaxation zone)
  • Added --mark mode to tiled plot
  • Added routines in mymath to convert back and forth between greyscale Image objects and 2D arrays
  • Property svn:executable set to *
File size: 9.8 KB
Line 
1#!/usr/bin/env python
2
3### A. Spiga + T. Navarro + A. Colaitis
4
5###########################################################################################
6###########################################################################################
7### What is below relate to running the file as a command line executable (very convenient)
8if __name__ == "__main__":
9    import sys
10    from optparse import OptionParser    ### to be replaced by argparse
11    from api_wrapper import api_onelevel
12    from gcm_transformations import call_zrecast
13    from netCDF4 import Dataset
14    from myplot import getlschar, separatenames, readslices, adjust_length, whatkindfile, errormess
15    from os import system
16    from planetoplot import planetoplot
17    from myscript import getparseroptions
18    import glob
19    import numpy as np
20
21
22    #############################
23    ### Get options and variables
24    parser = OptionParser() ; getparseroptions(parser) ; (opt,args) = parser.parse_args()
25    if opt.file is None:                                errormess("I want to eat one file at least ! Use pp.py -f name_of_my_file. Or type pp.py -h")
26    if opt.var is None and opt.anomaly is True:         errormess("Cannot ask to compute anomaly if no variable is set")
27    if opt.fref is not None and opt.operat is None:     errormess("you must specify an operation when using a reference file")
28    if opt.operat in ["+","-"] and opt.fref is None:    errormess("you must specifiy a reference file when using inter-file operations")
29    if opt.fref is not None and opt.operat is not None and opt.itp is not None: interpref=True
30    else:   interpref=False
31    if opt.rate is not None:      opt.save = "avi"
32    elif opt.save == "avi":       opt.rate = 8   ## this is a default value for -S avi
33    if opt.save == "html":        opt.rate = -1  ## this is convenient because everything is done in planetoplot with mrate
34
35    #############################
36    ### Get infos about slices
37    zeslat  = readslices(opt.slat) ; zeslon  = readslices(opt.slon) ; zesvert = readslices(opt.svert) ; zestime = readslices(opt.stime)
38    reffile = opt.fref
39    zexaxis = [opt.xmin,opt.xmax] ; zeyaxis=[opt.ymin,opt.ymax]
40
41    #############################
42    ### Catch multiple files
43    if "*" in opt.file[0] or "?" in opt.file[0]: 
44        yeah = glob.glob(opt.file[0]) ; yeah.sort()
45        opt.file[0] = yeah[0] 
46        for file in yeah[1:]: opt.file[0] = opt.file[0] + "," + file
47
48    #############################
49    ### 1. LOOP ON FILE LISTS TO BE PUT IN DIFFERENT FIGURES
50    for i in range(len(opt.file)):
51
52      zefiles = separatenames(opt.file[i])
53
54      typefile = whatkindfile(Dataset(zefiles[0])) ; stralt = None
55      if typefile in ["meso"]:         
56          [lschar,zehour,zehourin] = getlschar ( zefiles[0] )
57          if opt.var is None:  opt.var = ["HGT"] #; opt.clb = "nobar" # otherwise breaks the automatic one-var file capability
58      elif typefile in ["geo"]:
59          lschar=""
60          if opt.var is None:  opt.var = ["HGT_M"] ; opt.clb = "nobar"
61      else:                                     
62          lschar="" 
63          if opt.var is None: 
64             opt.var = ["phisinit"] ; opt.clb = "nobar"
65             ### temporaire... en attendant mieux.
66             if opt.back == "titan": opt.var = ["phis"] ; opt.clb = "nobar"
67
68      if opt.vmin is not None : zevmin  = opt.vmin[min(i,len(opt.vmin)-1)]
69      else:                     zevmin = None
70      if opt.vmax is not None : zevmax  = opt.vmax[min(i,len(opt.vmax)-1)]
71      else:                     zevmax = None
72      #print "vmin, zevmin", opt.vmin, zevmin ; print "vmax, zevmax", opt.vmax, zevmax
73
74      #############################
75      ### 2. LOOP ON VAR LISTS TO BE PUT IN DIFFERENT FIGURES
76      for j in range(len(opt.var)):
77
78        zevars = separatenames(opt.var[j])
79
80        inputnvert = separatenames(opt.lvl)
81        if np.array(inputnvert).size == 1:
82            zelevel = float(inputnvert[0])
83            ze_interp_levels = [-9999.]
84        elif np.array(inputnvert).size > 2:
85            zelevel = -99.
86            start = float(inputnvert[0])
87            stop = float(inputnvert[1])
88            if np.array(inputnvert).size == 2:  numsample = 20
89            else:                               numsample = float(inputnvert[2])
90            if stop > start:   
91               ## altitude coordinates
92               ze_interp_levels = np.linspace(start,stop,numsample)
93            else:
94               ## pressure coordinates
95               ze_interp_levels = np.logspace(np.log10(start),np.log10(stop),numsample)
96
97        #########################################################
98        if opt.itp is not None:
99         if opt.itp > 0:
100          #####
101          ##### MESOSCALE : written by AS
102          #####
103          if typefile in ["meso"]:
104            if zelevel == 0. and opt.itp == 4:  zelevel = 0.010
105            ### winds or no winds
106            if opt.winds            :  zefields = 'uvmet'
107            elif opt.var[j] in ['deltat','DELTAT'] : zefields = 'tk,TSURF'
108            elif opt.var[j] in ['uv','UV','hodograph','hodograph_2'] : zefields = 'U,V'
109            else                    :  zefields = ''
110            ### var or no var
111            if zefields == ''       :  zefields = opt.var[j] 
112            else                    :  zefields = zefields + "," + opt.var[j]
113            if opt.var2 is not None :  zefields = zefields + "," + opt.var2 
114            ### call fortran routines
115            for fff in range(len(zefiles)):
116                newname = api_onelevel (  path_to_input   = '', \
117                                               input_name      = zefiles[fff], \
118                                               fields          = zefields, \
119                                               interp_method   = opt.itp, \
120                                               interp_level    = ze_interp_levels, \
121                                               onelevel        = zelevel, \
122                                               nocall          = opt.nocall )
123                if fff == 0: zetab = newname
124                else:        zetab = np.append(zetab,newname)
125            if interpref:
126                reffile = api_onelevel (  path_to_input   = '', \
127                                               input_name      = opt.fref, \
128                                               fields          = zefields, \
129                                               interp_method   = opt.itp, \
130                                               interp_level    = ze_interp_levels, \
131                                               onelevel        = zelevel, \
132                                               nocall          = opt.nocall )
133            zefiles = zetab #; print zefiles
134            zelevel = 0 ## so that zelevel could play again the role of nvert
135          #####
136          ##### GCM : written by AC
137          #####
138          elif typefile == "gcm":
139            inputvar = zevars
140            if opt.var2 is not None : inputvar = np.append(inputvar,opt.var2)
141            interpolated_files=""
142            interpolated_files=call_zrecast(interp_mode=opt.itp,\
143                    input_name=zefiles,\
144                    fields=inputvar,\
145                    limites = ze_interp_levels,\
146                    predefined=opt.intas)
147
148            zefiles=interpolated_files
149            if interpref:
150               interpolated_ref=""
151               interpolated_ref=call_zrecast(interp_mode=opt.itp,\
152                    input_name=[opt.fref],\
153                    fields=zevars,\
154                    predefined=opt.intas)
155
156               reffile=interpolated_ref[0]
157          else:
158            print "type not supported"
159            exit()
160
161        #############
162        ### Main call
163        name = planetoplot (zefiles,level=int(zelevel),vertmode=opt.itp,\
164                proj=opt.proj,back=opt.back,target=opt.tgt,stride=opt.ste,var=zevars,\
165                clb=separatenames(opt.clb),winds=opt.winds,\
166                addchar=lschar,vmin=zevmin,vmax=zevmax,\
167                tile=opt.tile,zoom=opt.zoom,display=opt.display,\
168                hole=opt.hole,save=opt.save,\
169                anomaly=opt.anomaly,var2=opt.var2,ndiv=opt.ndiv,\
170                mult=opt.mult,zetitle=separatenames(opt.zetitle),\
171                slon=zeslon,slat=zeslat,svert=zesvert,stime=zestime,\
172                outputname=opt.out,resolution=opt.res,\
173                ope=opt.operat,fileref=reffile,minop=opt.vminope,maxop=opt.vmaxope,titleref=opt.titref,\
174                invert_y=opt.inverty,xaxis=zexaxis,yaxis=zeyaxis,ylog=opt.logy,xlog=opt.logx,yintegral=opt.column,\
175                blat=opt.blat,blon=opt.blon,tsat=opt.tsat,flagnolow=opt.nolow,\
176                mrate=opt.rate,mquality=opt.quality,trans=opt.trans,zarea=opt.area,axtime=opt.axtime,\
177                redope=opt.redope,seevar=opt.seevar,xlab=opt.xlab,ylab=opt.ylab,lbls=separatenames(opt.labels),\
178                lstyle=separatenames(opt.linestyle),cross=readslices(opt.mark),markdevil=opt.mdevil,facwind=opt.facwind,\
179                trycol=opt.trycol,streamflag=opt.stream,analysis=opt.analysis)
180        print 'DONE: '+name
181        system("rm -f to_be_erased")
182 
183    #########################################################
184    ### Generate a .sh file with the used command saved in it
185    command = "" 
186    for arg in sys.argv: command = command + arg + ' '
187    #if typefile not in ["meso","mesoapi"]: name = 'pycommand'
188    if opt.save == "gui":    name = 'pycommand'
189    elif opt.save == "avi":  system("mv -f movie*.avi "+name+".avi")
190    elif opt.save == "html": system("cat $PYTHONPATH/header.html > anim.html ; cat zepics >> anim.html ; cat $PYTHONPATH/body.html >> anim.html ; rm -rf zepics "+name+" ; mkdir "+name+" ; mv anim.html image*png "+name) 
191    f = open(name+'.sh', 'w')
192    f.write(command)
193
194    #print "********** OPTIONS: ", opt
195    print "********************************************************** END"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.