source: trunk/UTIL/PYTHON/pp.py @ 874

Last change on this file since 874 was 865, checked in by aslmd, 12 years ago

UTIL PYTHON. Improved redope (also available now with contours). Added --add (same as --mult for an addition). Added colormaps. Tried a different way to put wind vector reference (above colorbar).

  • Property svn:executable set to *
File size: 9.8 KB
RevLine 
[349]1#!/usr/bin/env python
2
[392]3### A. Spiga + T. Navarro + A. Colaitis
[349]4
5###########################################################################################
6###########################################################################################
7### What is below relate to running the file as a command line executable (very convenient)
8if __name__ == "__main__":
9    import sys
10    from optparse import OptionParser    ### to be replaced by argparse
11    from api_wrapper import api_onelevel
[464]12    from gcm_transformations import call_zrecast
[349]13    from netCDF4 import Dataset
[392]14    from myplot import getlschar, separatenames, readslices, adjust_length, whatkindfile, errormess
[349]15    from os import system
16    from planetoplot import planetoplot
[377]17    from myscript import getparseroptions
[478]18    import glob
[349]19    import numpy as np
20
[478]21
[349]22    #############################
23    ### Get options and variables
[392]24    parser = OptionParser() ; getparseroptions(parser) ; (opt,args) = parser.parse_args()
[721]25    if opt.file is None:                                errormess("I want to eat one file at least ! Use pp.py -f name_of_my_file. Or type pp.py -h")
[392]26    if opt.var is None and opt.anomaly is True:         errormess("Cannot ask to compute anomaly if no variable is set")
27    if opt.fref is not None and opt.operat is None:     errormess("you must specify an operation when using a reference file")
28    if opt.operat in ["+","-"] and opt.fref is None:    errormess("you must specifiy a reference file when using inter-file operations")
29    if opt.fref is not None and opt.operat is not None and opt.itp is not None: interpref=True
30    else:   interpref=False
[451]31    if opt.rate is not None:      opt.save = "avi"
32    elif opt.save == "avi":       opt.rate = 8   ## this is a default value for -S avi
33    if opt.save == "html":        opt.rate = -1  ## this is convenient because everything is done in planetoplot with mrate
[349]34
[392]35    #############################
36    ### Get infos about slices
37    zeslat  = readslices(opt.slat) ; zeslon  = readslices(opt.slon) ; zesvert = readslices(opt.svert) ; zestime = readslices(opt.stime)
[818]38
[392]39    reffile = opt.fref
40    zexaxis = [opt.xmin,opt.xmax] ; zeyaxis=[opt.ymin,opt.ymax]
[349]41
[392]42    #############################
[478]43    ### Catch multiple files
[479]44    if "*" in opt.file[0] or "?" in opt.file[0]: 
45        yeah = glob.glob(opt.file[0]) ; yeah.sort()
46        opt.file[0] = yeah[0] 
[489]47        for file in yeah[1:]: opt.file[0] = opt.file[0] + "," + file
[478]48
49    #############################
[392]50    ### 1. LOOP ON FILE LISTS TO BE PUT IN DIFFERENT FIGURES
51    for i in range(len(opt.file)):
[349]52
[392]53      zefiles = separatenames(opt.file[i])
[380]54
[426]55      typefile = whatkindfile(Dataset(zefiles[0])) ; stralt = None
[562]56      if typefile in ["meso"]:         
[392]57          [lschar,zehour,zehourin] = getlschar ( zefiles[0] )
[818]58          if opt.var is None:  opt.var = ["HGT"] ; opt.nocolorb = True
[429]59      elif typefile in ["geo"]:
[763]60          lschar=""
[818]61          if opt.var is None:  opt.var = ["HGT_M"] ; opt.nocolorb = True
[763]62      else:                                     
63          lschar="" 
[721]64          if opt.var is None: 
65             opt.var = ["phisinit"] ; opt.clb = "nobar"
66             ### temporaire... en attendant mieux.
[818]67             if opt.back == "titan": opt.var = ["phis"] ; opt.nocolorb = True
[380]68
[392]69      if opt.vmin is not None : zevmin  = opt.vmin[min(i,len(opt.vmin)-1)]
70      else:                     zevmin = None
71      if opt.vmax is not None : zevmax  = opt.vmax[min(i,len(opt.vmax)-1)]
72      else:                     zevmax = None
73      #print "vmin, zevmin", opt.vmin, zevmin ; print "vmax, zevmax", opt.vmax, zevmax
[380]74
[392]75      #############################
76      ### 2. LOOP ON VAR LISTS TO BE PUT IN DIFFERENT FIGURES
77      for j in range(len(opt.var)):
[380]78
[392]79        zevars = separatenames(opt.var[j])
[380]80
[377]81        inputnvert = separatenames(opt.lvl)
[351]82        if np.array(inputnvert).size == 1:
83            zelevel = float(inputnvert[0])
84            ze_interp_levels = [-9999.]
[610]85        elif np.array(inputnvert).size > 2:
[489]86            zelevel = -99.
[610]87            start = float(inputnvert[0])
88            stop = float(inputnvert[1])
89            if np.array(inputnvert).size == 2:  numsample = 20
90            else:                               numsample = float(inputnvert[2])
91            if stop > start:   
92               ## altitude coordinates
93               ze_interp_levels = np.linspace(start,stop,numsample)
94            else:
95               ## pressure coordinates
96               ze_interp_levels = np.logspace(np.log10(start),np.log10(stop),numsample)
[351]97
[392]98        #########################################################
[377]99        if opt.itp is not None:
[562]100         if opt.itp > 0:
[392]101          #####
102          ##### MESOSCALE : written by AS
103          #####
[562]104          if typefile in ["meso"]:
[377]105            if zelevel == 0. and opt.itp == 4:  zelevel = 0.010
[822]106            if np.array(inputnvert).size == 1:  zesvert = readslices([str(zelevel)])
[349]107            ### winds or no winds
108            if opt.winds            :  zefields = 'uvmet'
[612]109            elif opt.var[j] in ['deltat','DELTAT'] : zefields = 'tk,TSURF'
[763]110            elif opt.var[j] in ['uv','UV','hodograph','hodograph_2'] : zefields = 'U,V'
[349]111            else                    :  zefields = ''
112            ### var or no var
[392]113            if zefields == ''       :  zefields = opt.var[j] 
114            else                    :  zefields = zefields + "," + opt.var[j]
115            if opt.var2 is not None :  zefields = zefields + "," + opt.var2 
116            ### call fortran routines
117            for fff in range(len(zefiles)):
118                newname = api_onelevel (  path_to_input   = '', \
119                                               input_name      = zefiles[fff], \
120                                               fields          = zefields, \
121                                               interp_method   = opt.itp, \
122                                               interp_level    = ze_interp_levels, \
123                                               onelevel        = zelevel, \
124                                               nocall          = opt.nocall )
125                if fff == 0: zetab = newname
126                else:        zetab = np.append(zetab,newname)
[569]127            if interpref:
128                reffile = api_onelevel (  path_to_input   = '', \
129                                               input_name      = opt.fref, \
130                                               fields          = zefields, \
131                                               interp_method   = opt.itp, \
132                                               interp_level    = ze_interp_levels, \
133                                               onelevel        = zelevel, \
134                                               nocall          = opt.nocall )
[392]135            zefiles = zetab #; print zefiles
[349]136            zelevel = 0 ## so that zelevel could play again the role of nvert
[392]137          #####
138          ##### GCM : written by AC
139          #####
140          elif typefile == "gcm":
[475]141            inputvar = zevars
142            if opt.var2 is not None : inputvar = np.append(inputvar,opt.var2)
[392]143            interpolated_files=""
144            interpolated_files=call_zrecast(interp_mode=opt.itp,\
145                    input_name=zefiles,\
[475]146                    fields=inputvar,\
[489]147                    limites = ze_interp_levels,\
[464]148                    predefined=opt.intas)
[349]149
[392]150            zefiles=interpolated_files
151            if interpref:
152               interpolated_ref=""
153               interpolated_ref=call_zrecast(interp_mode=opt.itp,\
[380]154                    input_name=[opt.fref],\
[409]155                    fields=zevars,\
[464]156                    predefined=opt.intas)
[380]157
[392]158               reffile=interpolated_ref[0]
159          else:
[429]160            print "type not supported"
[392]161            exit()
[377]162
[392]163        #############
164        ### Main call
165        name = planetoplot (zefiles,level=int(zelevel),vertmode=opt.itp,\
166                proj=opt.proj,back=opt.back,target=opt.tgt,stride=opt.ste,var=zevars,\
[760]167                clb=separatenames(opt.clb),winds=opt.winds,\
[763]168                addchar=lschar,vmin=zevmin,vmax=zevmax,\
[349]169                tile=opt.tile,zoom=opt.zoom,display=opt.display,\
[424]170                hole=opt.hole,save=opt.save,\
171                anomaly=opt.anomaly,var2=opt.var2,ndiv=opt.ndiv,\
[865]172                mult=opt.mult,add=opt.add,zetitle=separatenames(opt.zetitle),\
[359]173                slon=zeslon,slat=zeslat,svert=zesvert,stime=zestime,\
[377]174                outputname=opt.out,resolution=opt.res,\
[380]175                ope=opt.operat,fileref=reffile,minop=opt.vminope,maxop=opt.vmaxope,titleref=opt.titref,\
[763]176                invert_y=opt.inverty,xaxis=zexaxis,yaxis=zeyaxis,ylog=opt.logy,xlog=opt.logx,yintegral=opt.column,\
[453]177                blat=opt.blat,blon=opt.blon,tsat=opt.tsat,flagnolow=opt.nolow,\
[483]178                mrate=opt.rate,mquality=opt.quality,trans=opt.trans,zarea=opt.area,axtime=opt.axtime,\
[612]179                redope=opt.redope,seevar=opt.seevar,xlab=opt.xlab,ylab=opt.ylab,lbls=separatenames(opt.labels),\
[792]180                lstyle=separatenames(opt.linestyle),cross=readslices(opt.mark),markdevil=opt.mdevil,facwind=opt.facwind,\
[817]181                trycol=opt.trycol,streamflag=opt.stream,nocolorb=opt.nocolorb,analysis=opt.analysis)
[392]182        print 'DONE: '+name
[349]183        system("rm -f to_be_erased")
184 
185    #########################################################
186    ### Generate a .sh file with the used command saved in it
[392]187    command = "" 
[349]188    for arg in sys.argv: command = command + arg + ' '
[424]189    #if typefile not in ["meso","mesoapi"]: name = 'pycommand'
[451]190    if opt.save == "gui":    name = 'pycommand'
191    elif opt.save == "html": system("cat $PYTHONPATH/header.html > anim.html ; cat zepics >> anim.html ; cat $PYTHONPATH/body.html >> anim.html ; rm -rf zepics "+name+" ; mkdir "+name+" ; mv anim.html image*png "+name) 
[349]192    f = open(name+'.sh', 'w')
193    f.write(command)
[392]194
[468]195    #print "********** OPTIONS: ", opt
[392]196    print "********************************************************** END"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.