source: trunk/UTIL/PYTHON/meso.py @ 362

Last change on this file since 362 was 359, checked in by acolaitis, 14 years ago

PYTHON.
Added resolution and output filename choices.

--res X to choose X instead of 200 for png outputs
-O or --output to choose filename of the output

Added possibility to do operations between 2 files.
The plot consists of:

  • a main plot, given by the regular options corresponding to the choice of -var and -f.
  • a reference plot, given by the option --fref, in a similar way as the first plot (same var, same min/max, etc...)
  • a plot on which the operation between file 1 and ref file is done.

--operation to choose the operation. For now, there is + and -. It is really simple to add more.
--mope --Mope to choose min and maximum of the colorbar for the operation. Without specifying it, it is computed.
--titleref to change the title of the reference plot. To use in combination with --title for the title of the first plot.

Future work:

  • Add possibility to compare multiple files to the same reference file.
  • Add mesoscale support. (adding the options in meso.py is straightforward but some modif might have to be done in planetoplot.)


  • Property svn:executable set to *
File size: 10.5 KB
Line 
1#!/usr/bin/env python
2
3### A. Spiga
4
5###########################################################################################
6###########################################################################################
7### What is below relate to running the file as a command line executable (very convenient)
8if __name__ == "__main__":
9    import sys
10    from optparse import OptionParser    ### to be replaced by argparse
11    from api_wrapper import api_onelevel
12    from netCDF4 import Dataset
13    from myplot import getlschar, separatenames, readslices, adjust_length
14    from os import system
15    from planetoplot import planetoplot
16    import numpy as np
17
18    #############################
19    ### Get options and variables
20    parser = OptionParser()
21    parser.add_option('-f', '--file',   action='append',dest='namefile', type="string",  default=None,  help='[NEEDED] name of WRF file (append)')
22    parser.add_option('-l', '--level',  action='store',dest='nvert',     type="string",  default="0",   help='level or start,stop,step (def=0)(-i 2: p,mbar)(-i 3,4: z,km)')
23    parser.add_option('-p', '--proj',   action='store',dest='proj',      type="string",  default=None,  help='projection')
24    parser.add_option('-b', '--back',   action='store',dest='back',      type="string",  default=None,  help='background image (def: None)')
25    parser.add_option('-t', '--target', action='store',dest='target',    type="string",  default=None,  help='destination folder')
26    parser.add_option('-s', '--stride', action='store',dest='stride',    type="int",     default=3,     help='stride vectors (def=3)')
27    parser.add_option('-v', '--var',    action='append',dest='var',      type="string",  default=None,  help='variable color-shaded (append)')
28    parser.add_option('-n', '--num',    action='store',dest='numplot',   type="int",     default=None,  help='plot number (def=2)(<0: plot LT -*numplot*)')
29    parser.add_option('-i', '--interp', action='store',dest='interp',    type="int",     default=None,  help='interpolation (2: p, 3: z-amr, 4:z-als)')
30    parser.add_option('-c', '--color',  action='store',dest='colorb',    type="string",  default="def", help='change colormap (nobar: no colorbar)')
31    parser.add_option('-x', '--no-vect',action='store_false',dest='winds',               default=True,  help='no wind vectors')
32    parser.add_option('-m', '--min',    action='append',dest='vmin',     type="float",   default=None,  help='bounding minimum value (append)')   
33    parser.add_option('-M', '--max',    action='append',dest='vmax',     type="float",   default=None,  help='bounding maximum value (append)') 
34    parser.add_option('-T', '--tiled',  action='store_true',dest='tile',                 default=False, help='draw a tiled plot (no blank zone)')
35    parser.add_option('-z', '--zoom',   action='store',dest='zoom',      type="float",   default=None,  help='zoom factor in %')
36    parser.add_option('-N', '--no-api', action='store_true',dest='nocall',               default=False, help='do not recreate api file')
37    parser.add_option('-d', '--display',action='store_false',dest='display',             default=True,  help='do not pop up created images')
38    parser.add_option('-e', '--itstep', action='store',dest='itstep',    type="int",     default=None,  help='stride time (def=4)')
39    parser.add_option('-H', '--hole',   action='store_true',dest='hole',                 default=False, help='holes above max and below min')
40    parser.add_option('-S', '--save',   action='store',dest='save',      type="string",  default="gui", help='save mode (png,eps,svg,pdf or gui)(def=gui)')
41    parser.add_option('-a', '--anomaly',action='store_true',dest='anomaly',              default=False, help='compute and plot relative anomaly in %')
42    parser.add_option('-w', '--with',   action='store',dest='var2',      type="string",  default=None,  help='variable contoured')
43    parser.add_option('--div',          action='store',dest='ndiv',      type="int",     default=10,    help='number of divisions in colorbar (def: 10)')
44    parser.add_option('-F', '--first',  action='store',dest='first',     type="int",     default=1,     help='first subscript to plot (def: 1)')
45    parser.add_option('--mult',         action='store',dest='mult',      type="float",   default=1.,    help='a multiplicative factor to plotted field')
46    parser.add_option('--title',        action='store',dest='zetitle',   type="string",  default="fill",help='customize the whole title')
47    #parser.add_option('-V', action='store', dest='comb',        type="float",   default=None,  help='a defined combination of variables')
48
49    ############# T.N. changes
50    #parser.add_option('-o','--operation',action='store',dest='operation',type="string",   default=None ,help='matrix of operations between files (for now see code, sorry)')
51    parser.add_option('--lat',          action='append',dest='slat',type="string",   default=None, help='slices along latitude. One value, or two values separated by comas for averaging')
52    parser.add_option('--lon',          action='append',dest='slon', type="string",   default=None, help='slices along longitude. One value, or two values separated by comas for averaging')
53    parser.add_option('--vert',         action='append',dest='svert',type="string",   default=None, help='slices along vertical axis. One value, or two values separated by comas for averaging') # quelles coordonnees ?
54    parser.add_option('--time',         action='append',dest='stime',type="string",   default=None, help='slices along time. One value, or two values separated by comas for averaging') # quelles coordonnees ?
55
56    ############# A.C. changes
57    parser.add_option('-O','--output',  action='store' ,dest='output',type="string",   default=None, help='Output file name')
58    parser.add_option('--res',  action='store' ,dest='res',type="float",   default=200., help='Resolution for png outputs. --save png must be specified. (def=200.)')
59
60    (opt,args) = parser.parse_args()
61    if opt.namefile is None: 
62        print "I want to eat one file at least ! Use winds.py -f name_of_my_file. Or type winds.py -h"
63        exit()
64    if opt.var is None and opt.anomaly is True:
65        print "Cannot ask to compute anomaly if no variable is set"
66        exit()
67    print "Options:", opt
68
69    listvar = '' 
70    if opt.var is None:
71        zerange = [-999999]
72    else:
73        zelen = len(opt.var)
74        zerange = range(zelen)
75        #if zelen == 1: listvar = opt.var[0] + ','
76        #else         :
77        for jjj in zerange: listvar += opt.var[jjj] + ','
78        listvar = listvar[0:len(listvar)-1]
79        vmintab = adjust_length (opt.vmin, zelen) 
80        vmaxtab = adjust_length (opt.vmax, zelen)
81
82    print "namefile, length", opt.namefile, len(opt.namefile)
83
84    zeslat  = readslices(opt.slat)
85    zeslon  = readslices(opt.slon)
86    zesvert = readslices(opt.svert)
87    zestime = readslices(opt.stime)
88    print "slat,zeslat", opt.slat, zeslat
89    print "slon,zeslon", opt.slon, zeslon
90    print "svert,zesvert", opt.svert, zesvert
91    print "stime,zestime", opt.stime, zestime
92
93    for i in range(len(opt.namefile)):
94
95        zefile = opt.namefile[i]
96        print zefile   
97        #zelevel = opt.nvert   
98        stralt = None
99        [lschar,zehour,zehourin] = getlschar ( zefile )  ## getlschar from wrfout (or simply return "" if another file)
100   
101        inputnvert = separatenames(opt.nvert)
102        if np.array(inputnvert).size == 1:
103            zelevel = float(inputnvert[0])
104            ze_interp_levels = [-9999.]
105        else:
106            zelevel = -99.
107            ze_interp_levels = np.linspace(float(inputnvert[0]),float(inputnvert[1]),float(inputnvert[2]))
108        print 'level: ', zelevel
109        print 'interp_levels: ',ze_interp_levels
110
111        #####################################################
112        ### Call Fortran routines for vertical interpolations       
113        if opt.interp is not None:
114            if zelevel == 0. and opt.interp == 4:  zelevel = 0.010
115            ### winds or no winds
116            if opt.winds            :  zefields = 'uvmet'
117            else                    :  zefields = ''
118            ### var or no var
119            #if opt.var is None      :  pass
120            if zefields == ''       :  zefields = listvar
121            else                    :  zefields = zefields + "," + listvar
122            if opt.var2 is not None : zefields = zefields + "," + opt.var2 
123            print zefields
124            zefile = api_onelevel (  path_to_input   = '', \
125                                     input_name      = zefile, \
126                                     fields          = zefields, \
127                                     interp_method   = opt.interp, \
128                                     interp_level    = ze_interp_levels, \
129                                     onelevel        = zelevel, \
130                                     nocall          = opt.nocall )
131            print zefile
132            zelevel = 0 ## so that zelevel could play again the role of nvert
133
134        if opt.var is None: zerange = [-999999]
135        else:               zerange = range(zelen) 
136        for jjj in zerange:
137            if jjj == -999999: 
138                argvar  = None
139                zevmin = None
140                zevmax = None
141            else:
142                argvar = opt.var[jjj]
143                if vmintab[jjj] != -999999:  zevmin = vmintab[jjj]
144                else:                        zevmin = None
145                if vmaxtab[jjj] != -999999:  zevmax = vmaxtab[jjj] 
146                else:                        zevmax = None
147            #############
148            ### Main call
149            name = planetoplot (zefile,level=int(zelevel),vertmode=opt.interp,\
150                proj=opt.proj,back=opt.back,target=opt.target,stride=opt.stride,var=argvar,\
151                numplot=opt.numplot,colorb=opt.colorb,winds=opt.winds,\
152                addchar=lschar,interv=[zehour,zehourin],vmin=zevmin,vmax=zevmax,\
153                tile=opt.tile,zoom=opt.zoom,display=opt.display,\
154                itstep=opt.itstep,hole=opt.hole,save=opt.save,\
155                anomaly=opt.anomaly,var2=opt.var2,ndiv=opt.ndiv,first=opt.first,\
156                mult=opt.mult,zetitle=opt.zetitle,\
157                slon=zeslon,slat=zeslat,svert=zesvert,stime=zestime,\
158                outputname=opt.output,resolution=opt.res)
159        print 'Done: '+name
160        system("rm -f to_be_erased")
161 
162    #########################################################
163    ### Generate a .sh file with the used command saved in it
164    command = ""
165    for arg in sys.argv: command = command + arg + ' '
166    f = open(name+'.sh', 'w')
167    f.write(command)
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.