| [836] | 1 | |
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| [870] | 2 | ***** en parallele dans LMDZ.UNIVERSAL |
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| 3 | --> ciclad |
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| 4 | makelmdz_fcm -d 64x48x20 -arch CICLADifort -parallel mpi -p generic gcm |
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| 5 | makelmdz_fcm -d 64x48x20 -arch CICLADifort -parallel mpi -p generic -debug gcm |
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| 6 | --> gnome |
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| 7 | makelmdz_fcm -d 128x96x20 -arch GNOMEp -parallel mpi -p generic gcm |
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| 8 | |
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| 9 | **** sequentiel dans LMDZ.UNIVERSAL |
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| 10 | makelmdz_fcm -d 64x48x20 -arch CICLADifort-seq -p generic -debug gcm |
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| 11 | |
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| 12 | **** pour comparer avec LMDZ.GENERIC (compiler dans le dossier de simu avec le lien absolu) |
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| 13 | **** (attention il faut utiliser un traceur.def legerement different) |
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| 14 | /home/spiga/MODELES/LMDZ.GENERIC/makegcm -d 64x48x20 -t 2 gcm |
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| 15 | **** ou plutot pour ne pas s'embeter avec les traceurs et regler peu de bandes |
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| 16 | /home/spiga/MODELES/LMDZ.GENERIC/makegcm -d 64x48x20 -t 0 -s 1 -b 3x2 gcm |
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| 17 | **** (attention il faut utiliser un traceur.def legerement different) |
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| 18 | |
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| 19 | **** ETAT INITIAUX |
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| 20 | **** POUR LE MOMENT DANS LMDZ.GENERIC |
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| 21 | --> pour start2archive (pas sur qu'il faille encore NOTRAC) |
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| 22 | /home/spiga/MODELES/LMDZ.GENERIC/makegcm -d 64x48x20 -t 0 -debug -cpp NOTRAC start2archive > logcomp |
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| 23 | --> pour newstart |
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| 24 | /home/spiga/MODELES/LMDZ.GENERIC/makegcm -d 64x48x20 -t 0 newstart |
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| 25 | /home/spiga/MODELES/LMDZ.GENERIC/makegcm -d 128x96x20 -t 0 -debug -cpp NOTRAC newstart |
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| 26 | |
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| 27 | -------------------------------------------------- |
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| 28 | FOR LARGE DOMAINS (sur gnome au dela de 256x192) |
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| 29 | 1. recompile netcdf (see below) |
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| 30 | 2. apply patches for large domains in LMDZ.GENERIC (this is for newstart) |
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| 31 | 3. compile with -arch GNOMEp_large |
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| 32 | makelmdz_fcm -d 256x256x20 -arch GNOMEp_large -parallel mpi -p generic gcm |
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| 33 | -------------------------------------------------- |
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| 34 | |
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| 35 | -------------------------------------------------- |
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| 36 | NETCDF RECOMPILE FOR LARGE DOMAINS |
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| 37 | -------------------------------------------------- |
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| 38 | |
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| 39 | |
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| 40 | >>> Prepare things for install: |
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| 41 | gunzip netcdf.tar.gz |
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| 42 | tar xf netcdf.tar |
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| 43 | cd netcdf-4.0.1 |
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| 44 | |
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| 45 | export CPP="icc -E" |
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| 46 | export F77=ifort |
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| 47 | export FFLAGS="-O2 -ip -no-prec-div -mcmodel=large -shared-intel -fPIC" |
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| 48 | export F90=ifort |
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| 49 | export FCFLAGS="-O2 -ip -no-prec-div -mcmodel=large -shared-intel -fPIC" |
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| 50 | export CC=icc |
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| 51 | export CFLAGS="-O2 -ip -no-prec-div -mcmodel=large -shared-intel -fPIC" |
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| 52 | export CXX=icpc |
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| 53 | export CXXFLAGS="-O2 -ip -no-prec-div -mcmodel=large -shared-intel -fPIC" |
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| 54 | #export LDFLAGS="-mcmodel=large -shared-intel -fPIC" |
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| 55 | |
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| 56 | |
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| 57 | make clean |
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| 58 | |
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| 59 | ./configure --prefix=/san/home/spiga/netcdf.4.0.1 --enable-shared > configure.log 2>&1 |
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| 60 | |
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| 61 | >>> go for it ! |
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| 62 | make > make.log 2>&1 |
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| 63 | >>>> some warnings, but no errors |
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| 64 | >> Tests: |
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| 65 | make test > make_test.log 2>&1 |
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| 66 | >>>> Everything seems OK |
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| 67 | |
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| 68 | make install > make_install.log 2>&1 |
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| 69 | |
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| 70 | |
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| 71 | -Wl,-rpath -Wl, |
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| 72 | |
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| 73 | ---------------------------------------------------------------------- |
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| 74 | Libraries have been installed in: |
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| 75 | /san/home/spiga/netcdf.4.0.1/lib |
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| 76 | |
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| 77 | If you ever happen to want to link against installed libraries |
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| 78 | in a given directory, LIBDIR, you must either use libtool, and |
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| 79 | specify the full pathname of the library, or use the `-LLIBDIR' |
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| 80 | flag during linking and do at least one of the following: |
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| 81 | - add LIBDIR to the `LD_LIBRARY_PATH' environment variable |
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| 82 | during execution |
|---|
| 83 | - add LIBDIR to the `LD_RUN_PATH' environment variable |
|---|
| 84 | during linking |
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| 85 | - use the `-Wl,-rpath -Wl,LIBDIR' linker flag |
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| 86 | - have your system administrator add LIBDIR to `/etc/ld.so.conf' |
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| 87 | |
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| 88 | See any operating system documentation about shared libraries for |
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| 89 | more information, such as the ld(1) and ld.so(8) manual pages. |
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| 90 | ---------------------------------------------------------------------- |
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| 91 | |
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| 92 | |
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| 93 | |
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| 94 | vieilles notes lorsqu'on etait avec LMDZ5 et pas LMDZ.COMMON |
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| 95 | |
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| [836] | 96 | faire descendre |
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| 97 | http://svn.lmd.jussieu.fr/LMDZ/LMDZ5/trunk |
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| 98 | |
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| 99 | svn co http://svn.lmd.jussieu.fr/LMDZ/LMDZ5/trunk LMDZ5 |
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| 100 | |
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| 101 | cd LMDZ5/libf |
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| 102 | executer |
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| 103 | $MOD/LMDZ.GENERIC/libf/phystd/for_lmdz5/linkgen.sh |
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| 104 | |
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| 105 | |
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| 106 | faire generatedoth.sh dans phygeneric |
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| 107 | (ou alors modifier makelmdz_fcm) |
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| 108 | |
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| 109 | |
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| [870] | 110 | penser | compiler IOIPSL voir dans LMDZ.COMMON |
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| [836] | 111 | puis modifier arch.path |
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| 112 | et compiler et c'est bon |
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| 113 | |
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| 114 | EN FAIT LE CICLAD IFORT EST AUSSI VALABLE SUR LES MACHINES DU LMD |
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| 115 | mais IL FAUT ENLEVER LES OPTIONS APRES NC_DOUBLE |
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| 116 | |
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| [832] | 117 | makelmdz_fcm -d 48x36x19 -arch CICLADifort -parallel mpi -p dev gcm > log_makelmdz_fcm & |
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| 118 | ou pas dev |
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| 119 | makelmdz_fcm -d 48x36x19 -arch CICLADifort -parallel mpi -p dev gcm |
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| [862] | 120 | makelmdz_fcm -d 128x96x20 -arch GNOMEp -parallel mpi -p generic gcm |
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| [832] | 121 | |
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| [870] | 122 | pour initialisation idealisee, qqch comme iniaqua dans phyaqua ??? |
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| [852] | 123 | |
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