source: trunk/LMDZ.COMMON/makelmdz_fcm @ 985

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Common dynamics:
Updates in the dynamics (seq and ) to keep up with updates
in LMDZ5 (up to LMDZ5 trunk, rev 1760):

  • General stuff (essentially to keep up with Earth model):
  • Updated makelmdz_fcm and makelmdz (more control on dimension.h, added option -mem, although it is not usefull for now)
  • Updated build_gcm with more control over fcm
  • Updated create_make_gcm (enable looking for code in subdirectories)
  • bibio:
  • updates (just renaming the files actually...) new_unit.F90 => new_unit_m.F90, pchsp_95.F90 => pchsp_95_m.F90 and pchfe_95.F90 => pchfe_95_m.F90
  • filtrez:
  • mod_fft.F90: use more baseline CPP directives for preprocessor compatibility
  • mod_filtre_fft_loc.F90: added this new file
  • filtreg_mod.f90: added calls to init_..._loc
  • filtreg.F: fixed calls to DGEMM into SGEMM (preprocessing does the switch)
  • dyn3d:
  • removed obsolete files: etat0_netcdf.F90 limit_netcdf.F90

pres2lev.F90

  • added new file : pres2lev_mod.F90 (module containing "old" pres2lev)
  • gcm.F: changed args to call to inidissip (added arg "vert_prof_dissip")
  • inidissip.F90: added arg "vert_prof_dissip" and the "earth model" discterizations (flagged with "planet_type=="earth")
  • comdissnew.h: added 'vert_prof_dissip' to the common block
  • guide_mod.F90: added the "use pres2lev_mod"
  • conf_gcm.F: cosmetics, and evaluation of vert_prof_dissip, (and also of dissip_* factors, for Earth model)
  • comconst.h : added dissip_factz,dissip_zref variables (for Earth mode dissip)
  • dyn3dpar:
  • removed obsolete files: etat0_netcdf.F90 limit_netcdf.F90

pres2lev.F90 mod_const_para.F90

  • added new files: pres2lev_mod.F90 (module containing "old" pres2lev)

mod_const_mpi

  • abort_gcm : better control of abort in parallel mode
  • gcm.F: changed args to call to inidissip (added arg "vert_prof_dissip")
  • inidissip.F90: added arg "vert_prof_dissip" and the "earth model" discterizations (flagged with "planet_type=="earth")
  • comdissnew.h: added 'vert_prof_dissip' to the common block
  • filtreg_p.F : bug correction (array bounds)
  • guide_p_mod.F90 : added the "use pres2lev_mod"
  • conf_gcm.F : cosmetics (and evaluation of vert_prof_dissip , and

also of dissip_* factors, for Earth model)
plus check if "adjust" is indeed not used in OpenMP

  • comconst.h : add dissip_factz,dissip_zref variables (for Earth mode dissip)

EM

File size: 13.8 KB
Line 
1#!/bin/bash
2# $Id: makelmdz_fcm 1615 2012-02-10 15:42:26Z emillour $
3# This is a script in Bash.
4
5# FH : on ne crée plus le fichier arch.mk qui est supposé exister par
6# FH : ailleurs.
7# FH : ulterieurement, ce fichier sera pré-existant pour une série
8# FH : de configurations en versions optimisées et debug qui seront
9# FH : liés (ln -s) avec arch.mk en fonction de l'architecture.
10# FH : Pour le moment, cette version est en test et on peut créer les
11# FH : arch.mk en lançant une première fois makegcm.
12#
13##set -x
14########################################################################
15# options par defaut pour la commande make
16########################################################################
17
18dim="96x72x19"
19physique=lmd
20filtre=filtrez
21grille=reg
22couple=false
23veget=false
24chimie=false
25chemistry=false
26parallel=none
27paramem="par"
28compil_mod=prod
29io=ioipsl
30LIBPREFIX=""
31cosp=false
32bands=""
33scatterers=""
34
35LMDGCM=`/bin/pwd`
36LIBOGCM=$LMDGCM/libo
37LIBFGCM=$LMDGCM/libf
38# path for optional packages, but default set to ".void_dir"
39COSP_PATH=$LMDGCM/.void_dir
40CHEM_PATH=$LMDGCM/.void_dir
41# Path to fcm utility:
42fcm_path=$LMDGCM/tools/fcm/bin
43
44########################################################################
45#  Quelques initialisations de variables du shell.
46########################################################################
47
48CPP_KEY="" 
49INCLUDE=""
50LIB=""
51adjnt=""
52COMPIL_FFLAGS="%PROD_FFLAGS"
53PARA_FFLAGS=""
54PARA_LD=""
55EXT_SRC=""
56
57########################################################################
58# lecture des options de mymake
59########################################################################
60
61while (($# > 0))
62  do
63  case $1 in
64      "-h") cat <<fin
65Usage :
66makegcm [options] -arch arch exec
67[-h]                       : brief help
68[-d [[IMx]JMx]LM]          : IM, JM, LM are the dimensions in x, y, z (default: $dim)
69[-s nscat]                 : (Generic) Number of radiatively active scatterers
70[-b IRxVIS]                : (Generic) Number of infrared (IR) and visible (VIS) bands for radiative transfer
71[-p PHYS]                  : set of physical parametrizations (in libf/phyPHYS), (default: lmd)
72[-prod / -dev / -debug]    : compilation mode production (default) / developement / debug .
73[-c false/MPI1/MPI2]       : (Earth) coupling with ocean model : MPI1/MPI2/false (default: false)
74[-v false/true]            : (Earth) with or without vegetation (default: false)
75[-chimie INCA/false]       : (Earth) with INCA chemistry model or without (default: false)
76[-cosp cosp/false]         : (Earth) add the cosp model (default: false)
77[-parallel none/mpi/omp/mpi_omp] : parallelism (default: none) : mpi, openmp or mixted mpi_openmp
78[-g GRI]                   : grid configuration in dyn3d/GRI_xy.h  (default: reg, inclues a zoom)
79[-io IO]                   : Input/Output library (default: ioipsl)
80[-include INCLUDES]        : extra include path to add
81[-cpp CPP_KEY]             : additional preprocessing definitions
82[-adjnt]                   : adjoint model, not operational ...
83[-mem]                     : reduced memory dynamics (if in parallel mode)
84[-filtre NOMFILTRE]        : use filtre from libf/NOMFILTRE (default: filtrez)
85[-link LINKS]              : additional links with other libraries
86[-fcm_path path]           : path to the fcm tool (default: tools/fcm/bin)
87[-ext_src path]            : path to an additional set of routines to compile with the model
88 -arch arch                : target architecture
89 exec                      : executable to build
90fin
91          exit;;
92
93      "-d")
94          dim=$2 ; shift ; shift ;;
95     
96      "-p")
97          physique="$2" ;  shift ; shift ;;
98
99      "-s")
100          scatterers=$2 ; shift ; shift ;;
101
102      "-b")
103          bands=$2 ; shift ; shift ;;
104
105      "-g")
106          grille="$2" ; shift ; shift ;;
107
108      "-c")
109          couple="$2" ; shift ; shift ;;
110
111      "-prod")
112          compil_mod="prod" ; shift ;;
113
114      "-dev")
115          compil_mod="dev" ; shift ;;
116
117      "-debug")
118          compil_mod="debug" ; shift ;;
119
120      "-io")
121          io="$2" ; shift ; shift ;;
122
123      "-v")
124          veget="$2" ; shift ; shift ;;
125
126      "-chimie")
127          chimie="$2" ; shift ; shift ;;
128
129      "-parallel")
130          parallel="$2" ; shift ; shift ;;
131     
132      "-include")
133          INCLUDE="$INCLUDE -I$2" ; shift ; shift ;;
134
135      "-cpp")
136          CPP_KEY="$CPP_KEY $2" ; shift ; shift ;;
137
138      "-adjnt")
139          echo "not operational ... work to be done here ";exit
140          opt_dep="$opt_dep adjnt" ; adjnt="-ladjnt -ldyn3d "
141          optim="$optim -Dadj" ; shift ;;
142
143      "-cosp")
144          cosp="$2" ; shift ; shift ;;
145
146      "-mem")
147          paramem="mem" ; shift ;;
148
149      "-filtre")
150          filtre=$2 ; shift ; shift ;;
151
152      "-link")
153          LIB="$LIB $2" ; shift ; shift ;;
154
155      "-fcm_path")
156          fcm_path=$2 ; shift ; shift ;;
157
158      "-ext_src")
159          EXT_SRC=$2 ; shift ; shift ;;
160
161      "-arch")
162          arch=$2 ; shift ; shift ;;
163
164      *)
165          code="$1" ; shift ;;
166  esac
167done
168
169###############################################################
170# path to fcm
171###############################################################
172# handle case when provided path to fcm was given as a relative
173# path (from makelmdz_fcm script directory) and not an absolute path
174if [[ ${fcm_path:0:1} != "/" ]] ; then
175  # prepend with makelmdz_fcm location
176  fcm_path=$(cd $(dirname $0) ; pwd)"/"${fcm_path}
177fi
178
179# add fcm_path to PATH
180export PATH=${fcm_path}:${PATH}
181
182echo "Path to fcm:"
183echo ${fcm_path}
184
185###############################################################
186# lecture des chemins propres à l'architecture de la machine #
187###############################################################
188rm -f .void_file
189echo > .void_file
190rm -rf .void_dir
191mkdir .void_dir
192rm -f arch.path
193ln -s arch/arch-${arch}.path ./arch.path
194source arch.path
195
196########################################################################
197# Definition des clefs CPP, des chemins des includes et modules
198#  et des libraries
199########################################################################
200
201if [[ "$compil_mod" == "prod" ]]
202then
203  COMPIL_FFLAGS="%PROD_FFLAGS"
204elif [[ "$compil_mod" == "dev" ]]
205then
206  COMPIL_FFLAGS="%DEV_FFLAGS"
207elif [[ "$compil_mod" == "debug" ]]
208then
209  COMPIL_FFLAGS="%DEBUG_FFLAGS"
210fi
211
212if [[ "$physique" != "nophys" ]]
213then
214   #We'll use some physics
215   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_PHYS"
216   if [[ "${physique:0:3}" == "lmd" ]]
217   then
218   #For lmd physics, default planet type is Earth
219   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_EARTH"
220   fi
221fi
222
223if [[ "$chimie" == "INCA" ]]
224then
225   CPP_KEY="$CPP_KEY INCA"
226   INCLUDE="$INCLUDE -I${INCA_INCDIR}"
227   LIB="$LIB -L${INCA_LIBDIR} -lchimie"
228fi
229
230if [[ "$couple" != "false" ]]
231then
232   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_COUPLE"
233   INCLUDE="$INCLUDE -I${OASIS_INCDIR}"
234   LIB="$LIB -L${OASIS_LIBDIR} -lpsmile.${couple} -lmpp_io"
235fi
236
237if [[ "$parallel" == "mpi" ]]
238then
239   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_PARA CPP_MPI"
240   PARA_FFLAGS="%MPI_FFLAGS"
241   PARA_LD="%MPI_LD"
242elif [[ "$parallel" == "omp" ]]
243then
244   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_PARA CPP_OMP"
245   PARA_FFLAGS="%OMP_FFLAGS"
246   PARA_LD="%OMP_LD"
247elif [[ "$parallel" == "mpi_omp" ]]
248then
249   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_PARA CPP_MPI CPP_OMP"
250   PARA_FFLAGS="%MPI_FFLAGS %OMP_FFLAGS"
251   PARA_LD="%MPI_LD %OMP_LD"
252fi
253
254if [[ ( "$parallel" == "omp" || "$parallel" == "mpi_omp" ) \
255   && "$compil_mod" == "debug" ]]
256then
257    echo "Usually, parallelization with OpenMP requires some optimization."
258    echo "We suggest switching to \"-dev\"."
259fi
260
261if [[ "$veget" == "true" ]]
262then
263   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_VEGET"
264   INCLUDE="${INCLUDE} -I${ORCH_INCDIR}"
265   LIB="${LIB} -L${ORCH_LIBDIR} -l${LIBPREFIX}sechiba -l${LIBPREFIX}parameters -l${LIBPREFIX}stomate -l${LIBPREFIX}parallel -l${LIBPREFIX}orglob"
266fi
267
268if [[ $io == ioipsl ]]
269then
270   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_IOIPSL"
271   INCLUDE="$INCLUDE -I${IOIPSL_INCDIR}"
272   LIB="$LIB -L${IOIPSL_LIBDIR} -l${LIBPREFIX}ioipsl"
273fi
274
275if [[ "$cosp" == "true" ]]
276then
277   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_COSP"
278   COSP_PATH="$LIBFGCM/cosp"
279#   LIB="${LIB} -l${LIBPREFIX}cosp"
280fi
281
282if [[ "$physique" == "titan" ]]
283then
284   CHEM_PATH="${LIBFGCM}/chim${physique}"
285   INCLUDE="$INCLUDE -I${LIBFGCM}/chim${physique}"
286fi
287
288INCLUDE="$INCLUDE ${NETCDF_INCDIR}"
289LIB="$LIB ${NETCDF_LIBDIR}"
290
291########################################################################
292# calcul du nombre de dimensions
293########################################################################
294
295
296dim_full=$dim
297dim=`echo $dim | sed -e 's/[^0-9]/ /g'` 
298set $dim
299dimc=$#
300echo calcul de la dimension
301echo dim $dim
302echo dimc $dimc
303
304
305########################################################################
306# Gestion des dimensions du modele.
307# on cree ou remplace le fichier des dimensions
308########################################################################
309
310cd $LIBFGCM/grid
311if [[ -f dimensions.h ]]
312then
313  echo 'ATTENTION: vous etes sans doute en train de compiler le modele par ailleurs'
314  echo "Attendez que la premiere compilation soit terminee pour relancer la suivante."
315  echo "Si vous etes sur que vous ne compilez pas le modele par ailleurs,"
316  echo  vous pouvez continuer en repondant oui.
317  echo "Voulez-vous vraiment continuer?"
318  echo ""
319  echo "WARNING: you are probably already compiling the model somewhere else."
320  echo "Wait until the first compilation is finished before launching this one."
321  echo "If you are sure that you are not compiling elsewhere, just answer "
322  echo "yes (or 'oui') to the question below to proceed."
323  echo "Do you wish to continue?"
324  read reponse
325  if [[ $reponse == "oui" || $reponse == "yes" ]]
326  then
327    \rm -f $LIBFGCM/grid/dimensions.h
328  else
329    exit
330  fi
331fi
332
333
334cd $LIBFGCM/grid/dimension
335./makdim $dim
336cat $LIBFGCM/grid/dimensions.h
337cd $LMDGCM
338
339if [[ "$bands" != "" ]]
340then
341  # Generic model, recreate bands.h (IR & VIS bands for radiative transfer)
342  bands=$(echo $bands | sed -e 's/[^0-9]/ /g')
343  cd $LIBFGCM/phy$physique/bands
344  ./makbands $bands
345  cat $LIBFGCM/phy$physique/bands.h
346  cd $LMDGCM
347fi
348
349if [[ "$scatterers" != "" ]]
350then
351  # Generic model, recreate scatterers.h
352  cd $LIBFGCM/phy$physique/scatterers
353  ./make_scatterers $scatterers
354  cat $LIBFGCM/phy$physique/scatterers.h
355  cd $LMDGCM
356fi
357
358
359########################################################################
360# Differentes dynamiques (3d, 2d, 1d)
361########################################################################
362
363dimension=`echo $dim | wc -w`
364echo dimension $dimension
365
366if (( $dimension == 3 ))
367then
368  cd $LIBFGCM/grid
369  \rm fxyprim.h
370  cp -p fxy_${grille}.h fxyprim.h
371#else
372#  echo "Probleme dans les dimensions de la dynamique !!"
373#  echo "Non reactive pour l'instant !!!"
374fi
375
376if (( $dimension == 1 ))
377then
378##in 1D, add dyn3d to include path (because main prog is in physics)
379  INCLUDE="$INCLUDE -Ilibf/dyn3d"
380#  echo pas de dynamique
381#  dyn="DYN= L_DYN=-ldyn3d "
382fi
383
384######################################################################
385#   Traitement special pour le nouveau rayonnement de Laurent Li.
386#   ---> YM desactive pour le traitemement en parallele
387######################################################################
388
389#if [[ -f $libf/phy$physique/raddim.h ]]
390#then
391# if [[ -f $libf/phy$physique/raddim.$dimh.h ]]
392#then
393#  \rm -f $libf/phy$physique/raddim.h
394#  cp -p $libf/phy$physique/raddim.$dimh.h $libf/phy$physique/raddim.h
395#  echo $libf/phy$physique/raddim.$dimh.h
396#  cat $libf/phy$physique/raddim.h
397# else
398#  echo On peut diminuer la taille de l executable en creant
399#  echo le fichier $libf/phy$physique/raddim.$dimh.h
400#  \cp -p $libf/phy$physique/raddim.defaut.h $libf/phy$physique/raddim.h
401# fi
402#fi
403
404######################################################################
405# Gestion du filtre qui n'existe qu'en 3d.
406######################################################################
407
408if (( `expr $dimc \> 2` == 1 ))
409then
410   filtre="FILTRE=$filtre"
411else
412   filtre="FILTRE= L_FILTRE= "
413fi
414echo MACRO FILTRE $filtre
415
416echo $dimc
417
418
419
420######################################################################
421# Creation du suffixe de la configuration
422######################################################################
423
424
425SUFF_NAME=_${dim_full}
426SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_phy${physique}
427
428if [[ "$parallel" != "none" ]]
429then
430  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_para
431  DYN=dyn${dimc}d${paramem}
432  if [[ "$paramem" == "mem" ]]
433  then
434   SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_${paramem}
435  fi
436else
437  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_seq
438  DYN=dyn${dimc}d
439  ## specific stuff for 1D model (needs includes which are in dyn3d)
440  if (( $dimension == 1 )) ; then
441    SUFF_NAME=${SUFF_NAME}
442    DYN=dyn3d
443  fi
444fi
445
446if [[ $veget == "true" ]]
447then
448  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_orch
449fi
450
451if [[ $couple != "false" ]]
452then
453  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_couple
454fi
455
456if [[ $chimie == "INCA" ]]
457then
458  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_inca
459fi
460
461cd $LMDGCM
462config_fcm="config.fcm"
463rm -f $config_fcm
464touch $config_fcm
465rm -f bin/${code}${SUFF_NAME}.e
466rm -f arch.fcm
467rm -f arch.opt
468
469echo "%ARCH          $arch"          >> $config_fcm
470echo "%INCDIR        $INCLUDE"       >> $config_fcm 
471echo "%LIB           $LIB"           >> $config_fcm
472echo "%ROOT_PATH     $PWD"           >> $config_fcm
473echo "%LIBF          $LIBFGCM"       >> $config_fcm
474echo "%LIBO          $LIBOGCM"       >> $config_fcm
475echo "%DYN           $DYN"           >> $config_fcm
476echo "%PHYS          phy${physique}" >> $config_fcm
477echo "%COSP          $COSP_PATH"     >> $config_fcm
478echo "%CHEM          $CHEM_PATH"     >> $config_fcm
479echo "%CPP_KEY       $CPP_KEY"       >> $config_fcm
480echo "%EXEC          $code"          >> $config_fcm
481echo "%SUFF_NAME     $SUFF_NAME"     >> $config_fcm
482echo "%COMPIL_FFLAGS $COMPIL_FFLAGS" >> $config_fcm
483echo "%PARA_FFLAGS   $PARA_FFLAGS"   >> $config_fcm
484echo "%PARA_LD       $PARA_LD"       >> $config_fcm
485echo "%EXT_SRC       $EXT_SRC"       >> $config_fcm
486
487
488
489ln -s arch/arch-${arch}.fcm arch.fcm
490if test -f arch/arch-${arch}.opt &&  [ $compil_mod = "prod" ]
491  then
492  ln -s arch/arch-${arch}.opt arch.opt
493else
494  ln -s .void_file arch.opt
495fi
496
497
498rm -f $LIBOGCM/${arch}${SUFF_NAME}/.config/fcm.bld.lock
499./build_gcm
500
501rm -rf tmp_src
502rm -rf config
503ln -s $LIBOGCM/${arch}${SUFF_NAME}/.config config
504ln -s $LIBOGCM/${arch}${SUFF_NAME}/.config/tmp tmp_src
505
506if [[ -r $LIBFGCM/grid/dimensions.h ]]
507then
508  # Cleanup: remove dimension.h file
509  \rm -f $LIBFGCM/grid/dimensions.h
510fi
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.