source: trunk/LMDZ.COMMON/create_make_gcm @ 1228

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Common dynamics: Updates and modifications to enable running Mars physics with

LMDZ.COMMON dynamics:

  • For compilation: adapted makelmdz, create_make_gcm and makelmdz_fcm, bld.cfg to compile aeronomy routines in "aerono$physique" if it exists, and added "-P -traditional" preprocessing flags in "arch-linux-ifort*"
  • Added function "cbrt.F" (cubic root) in 'bibio'
  • Adapted the reading/writing of dynamics (re)start.nc files for Mars. The main issue is that different information (on time, reference and current) is stored and used differently, hence a few if (planet_type =="mars") here and there. Moreover in the martian case there is the possibility to store fields over multiple times. Some Mars-specific variables (ecritphy,ecritstart,timestart) added in control_mod.F and (hour_ini) in temps.h

EM

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Line 
1#!/bin/sh
2#
3# $Id: create_make_gcm 1461 2010-12-03 11:12:25Z emillour $
4#
5#set -xv
6
7rm -f create_make_gcm.log
8
9machine=`hostname`
10os=`uname`
11gcm=`pwd`
12libf=$gcm/libf
13libo=$gcm/libo
14CRAY=0
15if [ "$machine" = "atlas" -o "$machine" = "etoile" -o "$machine" = "axis" ] ; then
16  CRAY=1
17fi
18XNEC=0
19if [ "$machine" = "rhodes" ] ; then
20  XNEC=1
21fi
22X6NEC=0
23if [ "$machine" = "mercure" ] ; then
24  X6NEC=1
25fi
26X8BRODIE=0
27if [ "$machine" = "brodie" ] ; then
28  X8BRODIE=1
29fi
30VPP=0
31if [ "$machine" = "nymphea0" ] ; then
32  VPP=1
33fi
34#
35echo "#%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%"
36echo "# Definitions de Macros pour Make"
37echo "#%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%"
38echo
39echo "# Repertoires :"
40echo
41echo "GCM     = "$gcm
42echo 'LIBF    = $(GCM)/libf'
43if [ "$CRAY" = '0' ] ; then
44#   echo 'LIBO    = $(GCM)/libo/$(MACHINE)'
45   echo 'LIBO    = $(LIBOGCM)/$(MACHINE)'
46else
47   echo 'LIBO    = $(GCM)/libo'
48fi
49#echo 'LOCAL_DIR=$(GCM)'
50#echo $localdir
51echo "LOCAL_DIR=`echo $localdir`"
52echo 'BIBIO    = $(LIBF)/bibio'
53echo "FILTRE   = filtre"
54echo "PHYS  = "
55echo "DYN  = dyn "
56echo 'LIBPHY = $(LIBO)/libphy$(PHYS).a'
57echo 'DIRMAIN=dyn$(DIM)d$(FLAG_PARA)'
58echo 'RM=rm'
59echo
60echo "OPLINK = "
61echo
62echo '# Les differentes librairies pour l"edition des liens:'
63echo
64echo 'dyn3d            = $(LIBO)/libdyn3d.a $(LIBO)/lib$(FILTRE).a'
65echo 'dyn3dpar      = $(LIBO)/libdyn3dpar.a $(LIBO)/lib$(FILTRE).a'
66echo 'dyn2d            = $(LIBO)/libdyn2d.a'
67echo 'dyn1d            = $(LIBO)/libdyn1d.a'
68echo 'L_DYN      = -ldyn$(DIM)d$(FLAG_PARA)'
69echo 'L_FILTRE   = -l$(FILTRE)'
70echo 'L_PHY = -lphy$(PHYS) '
71echo 'L_BIBIO    = -lbibio'
72echo 'L_ADJNT    ='
73echo 'L_COSP     = -lcosp'
74echo 'L_AERONOMARS = -laeronomars'
75
76echo
77echo "#%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%"
78echo "# Option de compilation FORTRAN"
79echo "#%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%"
80echo
81   echo 'COMPILE = $(F77) $(OPTIM) $(INCLUDE) -c'
82   echo 'COMPILE90 = $(F90) $(OPTIM90) $(INCLUDE) -c'
83   echo 'COMPTRU90 = $(F90) $(OPTIMTRU90) $(INCLUDE) -c'
84   echo "LINK    = $LINK"
85   echo "AR      = $AR"
86echo
87echo
88echo '#%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%'
89echo '# Option de compilation C'
90echo '#%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%'
91echo
92echo 'COMPILEC = $(CCC) $(OPTIMC) $(INCLUDEC) -c'
93echo
94echo
95echo "#%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%"
96echo "# Creation des differents executables"
97echo "#%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%"
98echo
99echo "# Executables:"
100echo "# ------------"
101echo
102echo "PROG = code"
103echo
104#echo 'main : chimie $(DYN) bibio phys $(OPTION_DEP) '
105echo 'main : bibio $(DYN) phys $(OPTION_DEP) '
106echo '  cd $(LIBO) ; $(RANLIB) lib*.a ; cd $(GCM) ;\'
107echo '  cd $(LOCAL_DIR); \'
108echo '  $(COMPILE90) $(LIBF)/$(DIRMAIN)/$(SOURCE) -o $(PROG).o ; \'
109echo '  $(LINK) $(PROG).o -L$(LIBO) $(L_DYN) $(L_ADJNT) $(L_COSP) $(L_AERONOMARS) $(L_FILTRE) $(L_PHY) $(L_DYN) $(L_BIBIO) $(L_DYN) $(OPLINK) $(OPTION_LINK) -o $(LOCAL_DIR)/$(PROG).e ; $(RM) $(PROG).o '
110echo
111echo 'dyn : $(LIBO)/libdyn$(DIM)d$(FLAG_PARA).a $(FILTRE)$(DIM)d'
112echo
113echo 'phys : $(LIBPHY)'
114echo
115#echo 'chimie : $(LIBO)/libchimie.a'
116echo
117echo 'bibio : $(LIBO)/libbibio.a'
118echo
119echo 'adjnt : $(LIBO)/libadjnt.a'
120echo
121echo 'cosp : $(LIBO)/libcosp.a'
122echo
123echo 'chimtitan : $(LIBO)/libchimtitan.a'
124echo 
125echo 'aeronomars : $(LIBO)/libaeronomars.a'
126echo
127echo '$(FILTRE)3d : $(LIBO)/lib$(FILTRE).a'
128echo
129echo '$(FILTRE)2d :'
130echo
131echo '$(FILTRE)1d :'
132echo
133echo "#%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%"
134echo "# Contenu des differentes bibliotheques"
135echo "#%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%"
136echo
137echo
138cd $libf >/dev/null 2>&1
139for diri in ` ls `
140do
141   if [ -d $diri ] ; then
142   if [ "`ls $diri/*.F $diri/*/*.F`" != "" ] || [ "`ls $diri/*.F90 $diri/*/*.F90`" != "" ]  ; then 
143#      cd $diri >/dev/null 2>&1
144      echo
145      listlib=""
146# Liste des fichiers .F et .F90 n'etant pas des programmes principaux
147      for fili in `ls $diri/*.F $diri/*/*.F`
148      do
149         # Check if file is a routine or main program
150         # i.e: look for the "program" keword preceeded by leading spaces
151         test=` (  head $fili | grep -i '^ *program' ) `
152         if [ "$test" = "" ] ; then 
153            # if it is not a main program, add it to the list
154            listlib=$listlib" "$fili
155         fi
156      done
157      for fili in `ls $diri/*.F90 $diri/*/*.F90`
158      do
159         # Check if file is a routine or main program
160         # i.e. look for "program" keyword (with possibly some leading spaces)
161         test=` (  head $fili | grep -i '^ \{0,\}program' ) `
162         if [ "$test" = "" ] ; then
163            # if it is not a main program, add it to the list
164            listlib=$listlib" "$fili
165         fi 
166      done
167#
168      echo
169      echo $listlib >> create_make_gcm.log
170      echo
171      echo "#======================================================================="
172      echo "# Contenu de la bibliotheque correspondant au Directory "$diri
173      echo "#======================================================================="
174      echo
175      for trufile in $listlib
176      do
177         fili=`echo $trufile | awk -F/ ' { print $NF } ' | cut -d. -f1`
178         echo '$(LIBO)/lib'$diri".a : " '$(LIBO)/lib'$diri".a("$fili".o)"
179         echo
180      done
181      echo '.PRECIOUS   : $(LIBO)/lib'$diri'.a'
182      echo
183      echo
184      echo "# Compilation des membres de la bibliotheque lib"$diri".a"
185      echo
186      for trufile in $listlib
187      do
188#         if [ -f $fili.F90 ] ; then
189#           trufile=$fili.F90
190#         else
191#           trufile=$fili.F
192#         fi
193         fili=`echo $trufile | awk -F/ ' { print $NF } ' | cut -d. -f1`
194         F90=0 ; egrep -i '^ *use ' $trufile > /dev/null 2>&1 && F90=1
195                 egrep -i '^ *module ' $trufile > /dev/null 2>&1 && F90=1
196                 egrep -i '#include*.inc ' $trufile > /dev/null 2>&1 && F90=1
197         str1='$(LIBO)/lib'$diri'.a('$fili'.o) : $(LIBF)/'$trufile
198         [ "$fili" = "chem.subs" ] && str1=$str1' $(LIBF)/'$diri/chem.mods.F
199
200##########################################################################
201# TRAITEMENT DES DEPENDANCES
202# Differents cas de dependance correspondant a des include ou des
203# use module.
204# soit dans le repertoire local soit dans un autre.
205# Pour dyn3d, il faudrait remplacer la chaine de caractere par $DYN
206# ou quelque chose du genre.
207##########################################################################
208
209         for stri in ` ( sed -e '/^[cC\!]/d' $trufile | sed -n "/\#include/s/\#include//p" | sed 's/\"//g' ; sed -e '/^[cC\!]/d' $trufile | egrep -i '^ *use ' | sed -e 's/,/ /' | awk ' { print $2 } ' ) `
210         do
211            echo $trufile $fili $stri >> create_make_gcm.log
212            strj=`echo $stri | tr [A-Z] [a-z]`
213            str2=""
214            for dirinc in filtrez bibio grid dyn3d $diri $diri/*/ ; do
215# Recherche dans l'ordre hierarchique inverse car seule la derniere
216# ligne est conservee
217               if [ -f $dirinc/$stri ] ; then
218                  str2='$(LIBF)/'$dirinc/$stri
219               elif [ -f $dirinc/$strj ] ; then
220                  str2='$(LIBF)/'$dirinc/$stri
221               elif [ -f $dirinc/$strj.F90 ]  || [ -f $dirinc/$strj.F ]  ; then 
222                  strlib=`echo $dirinc | awk -F/ ' { print $1 } '`
223                  str2='$(LIBO)/lib'$strlib'.a('$strj'.o)'
224               fi
225            done
226            if [ "$str2" = "" ] ; then
227               echo Warn: Include $diri $trufile $fili $stri pas trouve >> $gcm/create_make_gcm.log
228            elif [ "$str2" = "$str1" ] ; then
229               echo Warn: Include $diri $trufile $fili $stri $str1 trouve 2x >> $gcm/create_make_gcm.log
230            else
231               echo $str1 \\
232               str1=$str2
233            fi
234         done # Fin de la boucle sur les dependances et ecriture de la derniere
235         echo $str1
236         # Compile in LIBO directory; and before compiling, remove
237         # object from library
238         echo ' cd $(LIBO); \'
239         echo ' $(AR) d $(LIBO)/lib'$diri'.a '$fili'.o ; \'
240         if [ "$F90" -eq '0' ] ; then
241         ## Fixed Form Fortran 77
242           echo '       $(COMPILE) $(LIBF)/'$trufile' ; \'
243         else
244         ## Fortran 90
245           if [ -f $fili.F90 ] ; then
246              ## Free Form
247              echo '    $(COMPTRU90) $(LIBF)/'$trufile' ; \'
248           else
249              echo '    $(COMPILE90) $(LIBF)/'$trufile' ; \'
250           fi
251         fi
252         # Put generated object in library
253         echo ' $(AR) r $(LIBO)/lib'$diri'.a '$fili'.o ; $(RM) '$fili'.o ; \'
254         echo ' cd $(GCM)'
255         echo
256      done
257#       
258      echo
259      cd $libf
260##############################
261## CAS DES FICHIERS EN C
262######
263   elif [ "`ls $diri/*.c`" != "" ] ; then 
264      cd $diri >/dev/null 2>&1
265      echo
266      listlib=""
267      for i in `ls *.c`
268      do
269         fili=`basename $i .c`
270         # Check if file is a function or main program
271         # i.e. look for "int main" keywords (with possibly some leading spaces)
272         test=` (  head $i | grep '^ \{0,\}int main' ) `
273         if [ "$test" = "" ] ; then 
274            # if it is not a main program, add it to the list
275            listlib=$listlib" "$fili
276         fi
277      done
278#
279      echo
280      echo
281      echo '#======================================================================='
282      echo '# Contenu de la bibliotheque correspondant au Directory '$diri
283      echo '#======================================================================='
284      echo
285      for fili in $listlib
286      do
287         echo '$(LIBO)/lib'$diri".a : " '$(LIBO)/lib'$diri".a("$fili".o)"
288         echo
289      done
290      echo '.PRECIOUS   : $(LIBO)/lib'$diri'.a'
291      echo
292      echo
293      echo '# Compilation des membres de la bibliotheque lib'$diri'.a'
294      echo
295      for fili in $listlib
296      do
297         str1='$(LIBO)/lib'$diri'.a('$fili'.o) : $(LIBF)/'$diri/$fili.c
298         for stri in ` ( sed -n "/\#include/s/\#include//p" $fili.c  | sed 's/\"//g' ) `
299         do
300            if [ -f $stri ] ; then
301               echo $str1 \\
302               str1='$(LIBF)/'$diri'/'$stri
303            else
304               for dirinc in dyn3d grid bibio
305               do
306                  if [ -f ../$dirinc/$stri ] ; then
307                     echo $str1 \\
308                     str1='$(LIBF)/'`cd .. ; ls */$stri | head -1`
309                  fi
310               done
311            fi
312         done
313         echo $str1
314         # Compile in LIBO directory; and before compiling, remove
315         # object from library
316         echo ' cd $(LIBO); \'
317         echo ' $(AR) d $(LIBO)/lib'$diri'.a '$fili'.o ; \'
318         ## C
319         echo ' $(COMPILEC) $(LIBF)/'$diri'/'$fili'.c; \'
320         # Put generated object in library
321         echo ' $(AR) r $(LIBO)/lib'$diri'.a '$fili'.o ; $(RM) '$fili'.o ; \'
322         echo ' cd $(GCM)'
323         echo
324      done
325#       
326      echo
327      cd $libf
328##############################
329   fi
330   fi
331done
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.