source: lmdz_wrf/trunk/tools/get_WRFsounding-surface_data.bash @ 2785

Last change on this file since 2785 was 2130, checked in by lfita, 7 years ago

Adding the use of $pyBIN
  • Property svn:executable set to *
File size: 33.5 KB
Line 
1#!/bin/bash
2#### Script to get data from a given specific sounding and surface stations from WRF
3##
4## e.g. # get_WRFsounding-surface_data.bash true ./ control 87576,-58.52,-34.81 87576,-58.52,-34.81 /home/lluis/PY/wrfout_d01_1995-01-01_00:00:00 WRFt:WRFtda:WRFp:WRFua:WRFva:ws:WRFwd,wds:wss:WRFtdas,T2,None,None ccc_mpirun!python
5if test $1 = '-h'; then
6  echo "************************************"
7  echo "*** Script to get snd & sfc data ***"
8  echo "***        from WRF output       ***"
9  echo "************************************"
10  echo "get_WRFsounding-surface_data.bash [scratch] [odir] [expl]                    \
11    [sndid],[sndlon],[sndlat] [sfcid],[sfclon],[sfclat] [infilen]                    \
12    [wrfsnddiags],[wrfsfcdiags],[wrfsfcnodiags],[wrfcdxdiags],[wrfcdxnodiags]        \
13    [pyBIN]('!' for spaces)"
14else
15errmsg='ERROR -- error -- ERROR -- error'
16
17if test $1 = 'true'; then fscratch=true
18else fscratch=false; fi
19
20odir=$2
21expl=$3
22if test ! $4 = 'None'; then
23  sndid=`echo $4 | tr ',' ' ' | awk '{print $1}'`
24  sndlon=`echo $4 | tr ',' ' ' | awk '{print $2}'`
25  sndlat=`echo $4 | tr ',' ' ' | awk '{print $3}'`
26else
27  sndid='None'
28fi
29
30if test ! $5 = 'None'; then
31  sfcid=`echo $5 | tr ',' ' ' | awk '{print $1}'`
32  sfclon=`echo $5 | tr ',' ' ' | awk '{print $2}'`
33  sfclat=`echo $5 | tr ',' ' ' | awk '{print $3}'`
34else
35  sfcid='None'
36fi
37
38infilen=$6
39
40if test ! $7 = 'None'; then
41  wrfsnddiags=`echo $7 | tr ',' ' ' | awk '{print $1}'`
42  wrfsfcdiags=`echo $7 | tr ',' ' ' | awk '{print $2}'`
43  wrfsfcnodiags=`echo $7 | tr ',' ' ' | awk '{print $3}'`
44  wrfcdxdiags=`echo $7 | tr ',' ' ' | awk '{print $4}'`
45  wrfcdxnodiags=`echo $7 | tr ',' ' ' | awk '{print $5}'`
46fi
47
48pyBIN=`echo $8 | tr '!' ' '`
49
50function isin_list() {
51# Function to check whether a value is in a list
52  list=$1
53  value=$2
54 
55  is=`echo ${list} | tr ':' '\n' | awk '{print "@"$1"@"}' | grep '@'${value}'@' | wc -w`
56  if test ${is} -eq 1
57  then
58    true
59  else
60    false
61  fi
62}
63
64function get_WRFsounding_data(){
65# Function to get the data to compute analysis in a sounding point
66#   stlon= longitude value of the station
67#   stlat= latitude value of the station
68#   filen= name of the file
69#   lonvarn= name of the longitude variable
70#   latvarn= name of the latitude variable
71#   snddiagnames= diagnostics to compute (as ':' separated list)
72
73  funcvals=$1
74
75  stlon=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $1}'`
76  stlat=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $2}'`
77  filen=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $3}'`
78  lonvarn=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $4}'`
79  latvarn=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $5}'`
80  snddiagnames=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $6}'`
81
82  vals=${lonvarn}':'${latvarn}':Time|0'
83  gridsndv=`${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o get_point -f ${filen} -S ${vals}         \
84    -v ${stlon},${stlat} | tr ' ' '!'`
85  echo "* get grid point: "${stlon}", "${stlat} >> ${ofileins}
86  echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o get_point -f ${filen} -S "'"${vals}"'"        \
87    -v ${stlon},${stlat} >> ${ofileins}
88  echo " " >> ${ofileins}
89
90  xsnd=`echo ${gridsndv} | tr '!' ' ' | awk '{print $1}' | tr ',' ' ' |              \
91   awk '{print $1}'`
92  ysnd=`echo ${gridsndv} | tr '!' ' ' | awk '{print $1}' | tr ',' ' ' |              \
93  awk '{print $2}'`
94  dsnd=`echo ${gridsndv} | tr '!' ' ' | awk '{print $2}'`
95
96  xsnd1=`expr ${xsnd} + 1`
97  ysnd1=`expr ${ysnd} + 1`
98
99  # Getting values
100  if ${fscratch}; then rm ${simsndptf} >& /dev/null; fi
101  if test ! -f ${simsndptf}; then
102    values='Time,0,-1,1@bottom_top,0,-1,1@south_north,'${ysnd}','${ysnd}',1@'
103    values=${values}'west_east,'${xsnd}','${xsnd}',1@south_north_stag,'${ysnd}','
104    values=${values}${ysnd1}',1@west_east_stag,'${xsnd}','${xsnd1}',1:False'
105    ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}             \
106      -S ${values} -v all
107    if test $? -ne 0; then
108      echo ${errmsg}
109      echo "  python failed!!"
110      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}      \
111        -S "'"${values}"'" -v all
112      exit
113    fi
114    echo "* get values at snd point: "${stlon}", "${stlat} >> ${ofileins}
115    echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}        \
116      -S "'"${values}"'" -v all >> ${ofileins}
117    echo " " >> ${ofileins}
118
119    ofilen='newfile_multidims.nc'
120    mv ${ofilen} ${simsndptf}
121  fi
122   
123  # Computing sounding diagnostics
124  snddiagd='Time@WRFtime,bottom_top@P'
125  diagns=`echo ${snddiagnames} | tr ':' ' '`
126
127  idiag=1
128  for diagn in ${diagns}; do
129    diagv=`cat $pyHOME/diagnostics.inf | grep ${diagn}',' | tr ',' ' ' |             \
130      awk '{print $2"|"$3}'`
131    if test ${idiag} -eq 1; then
132      snddiagvals=${diagv}
133    else
134      snddiagvals=${snddiagvals}','${diagv}
135    fi
136    idiag=`expr ${idiag} + 1`
137  done
138
139  if ${fscratch}; then rm ${simsnddiagsf}; fi
140  if test ! -f ${simsnddiagsf}; then
141    ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsndptf} -d ${snddiagd} -v ${snddiagvals}
142    if test $? -ne 0; then
143      echo ${errmsg}
144      echo "  python failed!!"
145      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsndptf} -d "'"${snddiagd}"'" -v \
146        "'"${snddiagvals}"'"
147      exit
148    fi
149    echo "* computing diagnostics at snd point: "${stlon}", "${stlat} >> ${ofileins}
150    echo ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f "'"${simsndptf}"'" -d "'"${snddiagd}"'" \
151      -v "'"${snddiagvals}"'" >> ${ofileins}
152    echo " " >> ${ofileins}
153
154    mv diagnostics.nc ${simsnddiagsf}
155    if $(isin_list ${snddiagnames} WRFt); then
156      #To deg
157      ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o valmod -S subc,273.15 -f ${simsnddiagsf} -v ta
158    fi
159    if $(isin_list ${snddiagnames} WRFp); then
160      #To Pa
161      ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o valmod -S divc,100. -f ${simsnddiagsf} -v pres
162    fi
163  fi
164}
165
166function get_WRFsurface_data(){
167# Function to get the data to compute analysis in a surface point
168#   stlon= longitude value of the station
169#   stlat= latitude value of the station
170#   filen= name of the file
171#   lonvarn= name of the longitude variable
172#   latvarn= name of the latitude variable
173#   sfcdiagnames= diagnostics to compute (as ':' separated list)
174#   nondiagvs= ':' list of variables which are not from a diagnostics ('None' for
175#     without)
176
177  funcvals=$1
178
179  stlon=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $1}'`
180  stlat=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $2}'`
181  filen=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $3}'`
182  lonvarn=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $4}'`
183  latvarn=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $5}'`
184  sfcdiagnames=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $6}'`
185  nondiagvs=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $7}'`
186
187  vals=${lonvarn}':'${latvarn}':Time|0'
188  gridsndv=`${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o get_point -f ${filen} -S ${vals}         \
189    -v ${stlon},${stlat} | tr ' ' '!'`
190  echo "* get grid point: "${stlon}", "${stlat} >> ${ofileins}
191  echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o get_point -f ${filen} -S "'"${vals}"'"        \
192    -v ${stlon},${stlat} >> ${ofileins}
193  echo " " >> ${ofileins}
194  xsnd=`echo ${gridsndv} | tr '!' ' ' | awk '{print $1}' | tr ',' ' ' |              \
195   awk '{print $1}'`
196  ysnd=`echo ${gridsndv} | tr '!' ' ' | awk '{print $1}' | tr ',' ' ' |              \
197  awk '{print $2}'`
198  dsnd=`echo ${gridsndv} | tr '!' ' ' | awk '{print $2}'`
199
200  xsnd1=`expr ${xsnd} + 1`
201  ysnd1=`expr ${ysnd} + 1`
202
203  # Getting values
204  if ${fscratch}; then rm ${simsfcptf} >& /dev/null; fi
205  if test ! -f ${simsfcptf}; then
206    values='Time,0,-1,1@south_north,'${ysnd}','${ysnd}',1@'
207    values=${values}'west_east,'${xsnd}','${xsnd}',1@south_north_stag,'${ysnd}','
208    values=${values}${ysnd1}',1@west_east_stag,'${xsnd}','${xsnd1}',1:false'
209    ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}             \
210      -S ${values} -v all
211    if test $? -ne 0; then
212      echo ${errmsg}
213      echo "  python failed!!"
214      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}      \
215        -S "'"${values}"'" -v all
216      exit
217    fi
218  echo "* get values at sfc point: "${stlon}", "${stlat} >> ${ofileins}
219  echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}          \
220      -S "'"${values}"'" -v all >> ${ofileins}
221  echo " " >> ${ofileins}
222
223    ofilen='newfile_multidims.nc'
224    mv ${ofilen} ${simsfcptf}
225  fi
226   
227  # Computing sfc diagnostics
228  sfcdiagd='Time@WRFtime'
229  diagns=`echo ${sfcdiagnames} | tr ':' ' '`
230
231  idiag=1
232  for diagn in ${diagns}; do
233    diagv=`cat $pyHOME/diagnostics.inf | grep WRF | grep ${diagn}',' | tr ',' ' ' |  \
234      awk '{print $2"|"$3}'`
235    if test ${idiag} -eq 1; then
236      sfcdiagvals=${diagv}
237    else
238      sfcdiagvals=${sfcdiagvals}','${diagv}
239    fi
240    idiag=`expr ${idiag} + 1`
241  done
242
243  if ${fscratch}; then rm ${simsfcdiagsf}; fi
244  if test ! -f ${simsfcdiagsf}; then
245    ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsfcptf} -d ${sfcdiagd} -v ${sfcdiagvals}
246    if test $? -ne 0; then
247      echo ${errmsg}
248      echo "  python failed!!"
249      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsfcptf} -d "'"${sfcdiagd}"'"    \
250        -v "'"${sfcdiagvals}"'"
251      exit
252    fi
253    echo "* diagnostics at sfc point: "${stlon}", "${stlat} >> ${ofileins}
254    echo ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsfcptf} -d "'"${sfcdiagd}"'"      \
255      -v "'"${sfcdiagvals}"'" >> ${ofileins}
256    echo " " >> ${ofileins}
257    mv diagnostics.nc ${simsfcdiagsf}
258    if $(isin_list ${sfcdiagnames} wds); then
259      #To rad
260      ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o valmod -S mulc,0.0174532925199 -f              \
261        ${simsfcdiagsf} -v wds
262      ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o varaddattr -S 'units|rad' -f ${simsfcdiagsf}   \
263        -v wds
264    fi
265  fi
266
267  #Adding non-diagnostic variables
268  if test ! ${nondiagvs} = 'None'; then
269    varsadd=`echo ${nondiagvs} | tr ':' ' '`
270    for vadd in ${varsadd}; do
271      ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o fvaradd -S ${simsfcptf},${vadd} -f ${simsfcdiagsf}
272      if test $? -ne 0; then
273        echo ${errmsg}
274        echo "  python failed!!"
275        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o fvaradd -S "'"${simsfcptf},${vadd}"'"   \
276          -f ${simsfcdiagsf}
277        exit
278        rm ${simsfcdiagsf}
279      fi
280      echo "* adding variable '"${vadd}"' at sfc point: "${stlon}", "${stlat} >> ${ofileins}
281      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o fvaradd -S "'"${simsfcptf},${vadd}"'"     \
282        -f ${simsfcdiagsf} >> ${ofileins}
283      echo " " >> ${ofileins}
284      # CF varname
285      CFvarn=`${pyBIN} $pyHOME/generic.py -o variables_values -S ${vadd} |           \
286        grep -v variables_values | tr ':' ' ' | awk '{print $1}'`
287      if test $? -ne 0; then
288        echo ${errmsg}
289        echo "  python failed!!"
290        echo ${pyBIN} $pyHOME/generic.py -o variables_values -S ${vadd}
291        exit
292        rm ${simsfcdiagsf}
293      fi
294      ${pyBIN} $pyHOME/nc_var.py -o chvarname -S ${CFvarn} -f ${simsfcdiagsf} -v ${vadd}
295      if test $? -ne 0; then
296        echo ${errmsg}
297        echo "  python failed!!"
298        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o chvarname -S ${CFvarn}                  \
299          -f ${simsfcdiagsf} -v ${vadd}
300        exit
301        rm ${simsfcdiagsf}
302      fi
303    done
304  fi
305}
306
307function get_WRFsfc2D_data(){
308# Function to get the data to compute analysis in a surface map
309#   filen= name of the file
310#   sfcdiagnames= diagnostics to compute (as ':' separated list)
311#   nondiagvs= ':' list of variables which are not from a diagnostics ('None' for
312#     without)
313
314  funcvals=$1
315
316  filen=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $1}'`
317  sfcdiagnames=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $2}'`
318  nondiagvs=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $3}'`
319
320  # Computing sfc diagnostics
321  if test ! ${sfcdiagnames} = 'None'; then
322    sfcmapdiagd='Time@WRFtime:south_north@XLAT:west_east@XLONG'
323    diagns=`echo ${sfcdiagnames} | tr ':' ' '`
324
325    # getting that variables only required for the diagnostics
326    vardiags=''
327    idiag=1
328    for diagn in ${diagns}; do
329      diagv=`cat $pyHOME/diagnostics.inf | grep WRF | grep ${diagn}',' | tr ',' ' ' |\
330        awk '{print $2"|"$3}'`
331      if test ${idiag} -eq 1; then
332        sfcdiagvals=${diagv}
333        vardiags=`echo ${diagv} | tr '|' ' ' | awk '{print $2}' | tr '@' ':'`
334      else
335        sfcdiagvals=${sfcdiagvals}','${diagv}
336        vardiag=`echo ${diagv} | tr '|' ' ' | awk '{print $2}' | tr '@' ' '`
337        for vd in ${vardiag}; do
338          if ! $(isin_list ${vardiags} ${vd}); then vardiags=${vardiags}':'${vd}; fi
339        done
340      fi
341      idiag=`expr ${idiag} + 1`
342    done
343
344    # Inlcuding non-diagnostics
345    if test ! ${nondiagvs} = 'None'; then
346      nvns=`echo ${nondiagvs} | tr ':' ' '`
347      for vn in ${nvns}; do
348        if ! $(isin_list ${vardiags} ${vn}); then vardiags=${vardiags}':'${vn}; fi
349      done
350    fi
351  else
352    vardiags='Times:XLONG:XLAT:'${nondiagvs}
353  fi
354
355  vardiag=`echo ${vardiags} | tr ':' ','`
356 
357  # Getting values
358  if ${fscratch}; then rm ${simsfcmapf} >& /dev/null; fi
359  if test ! -f ${simsfcmapf}; then
360    values='Time,0,-1,1@south_north,0,-1,1@west_east,0,-1,1@south_north_stag,0,-1,1@'
361    values=${values}'west_east_stag,0,-1,1:False'
362    ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}             \
363      -S ${values} -v ${vardiag}
364    if test $? -ne 0; then
365      echo ${errmsg}
366      echo "  python failed!!"
367      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}      \
368        -S "'"${values}"'"  -v ${vardiag}
369      exit
370    fi
371    echo "* get values for 2D map diagnostics: " >> ${ofileins}
372    echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}        \
373      -S "'"${values}"'" -v ${vardiag} >> ${ofileins}
374    echo " " >> ${ofileins}
375
376    ofilen='newfile_multidims.nc'
377    mv ${ofilen} ${simsfcmapf}
378  fi
379
380  if ${fscratch}; then rm ${simsfcmapdiagsf}; fi
381  if test ! -f ${simsfcmapdiagsf}; then
382    if test ! ${sfcdiagnames} = 'None'; then
383      ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsfcmapf} -d ${sfcmapdiagd}           \
384        -v ${sfcdiagvals}
385      if test $? -ne 0; then
386        echo ${errmsg}
387        echo "  python failed!!"
388        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsfcmapf} -d "'"${sfcmapdiagd}"'" \
389          -v "'"${sfcdiagvals}"'"
390        exit
391      fi
392      echo "* diagnostics for sfc 2D map: " >> ${ofileins}
393      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsfcmapf} -d "'"${sfcmapdiagd}"'" \
394        -v "'"${sfcdiagvals}"'" >> ${ofileins}
395      echo " " >> ${ofileins}
396      mv diagnostics.nc ${simsfcmapdiagsf}
397      if $(isin_list ${sfcdiagnames} wds); then
398        #To rad
399        ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o valmod -S mulc,0.0174532925199               \
400          -f ${simsfcmapdiagsf} -v wds
401        ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o varaddattr -S 'units|rad'                    \
402          -f ${simsfcmapdiagsf} -v wds
403      fi
404    fi
405    # If there was not diagnostics
406    if test ! -f ${simsfcmapdiagsf}; then
407      dddv='Time@Times'
408      selvars='XLONG,XLAT,Times'
409      ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o selvar -S ${dddv} -f ${simsfcmapf} -v ${selvars}
410      if test $? -ne 0; then
411        echo ${errmsg}
412        echo "  python failed!!"
413        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o selvar -S "'"${ddv}"'" -f ${simsfmapf}  \
414          -v ${vars}
415        exit
416        rm ${simsfcmapf}
417      fi
418      echo "* creation of diagnostics file for 2D map:" >>  ${ofileins}
419      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o selvar -S "'"${dddv}"'" -f ${simsfcmapf}  \
420          -v ${selvars} >> ${ofileins}
421      echo " " >> ${ofileins}
422      mv selvar_new.nc ${simsfcmapdiagsf}
423      ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o WRF_CFtime_creation -S 19491201000000,minutes  \
424        -f ${simsfcmapdiagsf} -v time
425      if test $? -ne 0; then
426        echo ${errmsg}
427        echo "  python failed!!"
428        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o WRF_CFtime_creation                     \
429         -S 19491201000000,minutes -f ${simsfcmapdiagsf} -v time
430        exit
431        rm ${simsfcmapdiagsf}
432      fi
433      echo "* creation of CF-time variable for file at sfc point: "${stlon}", "      \
434        ${stlat} >> ${ofileins}
435      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o WRF_CFtime_creation                       \
436        -S 19491201000000,minutes -f ${simsfcmapdiagsf} -v time >> ${ofileins}
437      echo " " >> ${ofileins}
438    fi 
439    #Adding non-diagnostic variables
440    if test ! ${nondiagvs} = 'None'; then
441      varsadd=`echo ${nondiagvs} | tr ':' ' '`
442      for vadd in ${varsadd}; do
443        ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o fvaradd -S ${simsfcmapf},${vadd}             \
444          -f ${simsfcmapdiagsf}
445        if test $? -ne 0; then
446          echo ${errmsg}
447          echo "  python failed!!"
448          echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o fvaradd -S "'"${simsfcmapf},${vadd}"'" \
449            -f ${simsfcmapdiagsf}
450          exit
451          rm ${simsfcmapdiagsf}
452        fi
453        echo "* adding variable '"${vadd}"' at sfc map: " >> ${ofileins}
454        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o fvaradd -S "'"${simsfcmapf},${vadd}"'"  \
455          -f ${simsfcmapdiagsf} >> ${ofileins}
456        echo " " >> ${ofileins}
457        # CF varname
458        CFvarn=`${pyBIN} $pyHOME/generic.py -o variables_values -S ${vadd} |         \
459          grep -v variables_values | tr ':' ' ' | awk '{print $1}'`
460        if test $? -ne 0; then
461          echo ${errmsg}
462          echo "  python failed!!"
463          echo ${pyBIN} $pyHOME/generic.py -o variables_values -S ${vadd}
464          exit
465          rm ${simsfcmapdiagsf}
466        fi
467        ${pyBIN} $pyHOME/nc_var.py -o chvarname -S ${CFvarn} -f ${simsfcmapdiagsf}   \
468          -v ${vadd}
469        if test $? -ne 0; then
470          echo ${errmsg}
471          echo "  python failed!!"
472          echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o chvarname -S ${CFvarn}                \
473            -f ${simsfcmapdiagsf} -v ${vadd}
474          exit
475          rm ${simsfcmapdiagsf}
476        fi
477      done
478    fi
479  fi
480}
481
482function get_WRFCDXsurface_data(){
483# Function to get the WRFCDX data to compute analysis in a surface point
484#   stlon= longitude value of the station
485#   stlat= latitude value of the station
486#   filen= name of the file
487#   lonvarn= name of the longitude variable
488#   latvarn= name of the latitude variable
489#   sfcdiagnames= diagnostics to compute (as ':' separated list)
490#   nondiagvs= ':' list of variables which are not from a diagnostics ('None' for
491#     without)
492
493  funcvals=$1
494
495  stlon=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $1}'`
496  stlat=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $2}'`
497  filen=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $3}'`
498  lonvarn=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $4}'`
499  latvarn=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $5}'`
500  sfcdiagnames=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $6}'`
501  nondiagvs=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $7}'`
502
503  vals=${lonvarn}':'${latvarn}':Time|0'
504  gridsndv=`${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o get_point -f ${filen} -S ${vals}         \
505    -v ${stlon},${stlat} | tr ' ' '!'`
506  echo "* get grid point: "${stlon}", "${stlat} >> ${ofileins}
507  echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o get_point -f ${filen} -S "'"${vals}"'"        \
508    -v ${stlon},${stlat} >> ${ofileins}
509  echo " " >> ${ofileins}
510  xsnd=`echo ${gridsndv} | tr '!' ' ' | awk '{print $1}' | tr ',' ' ' |              \
511   awk '{print $1}'`
512  ysnd=`echo ${gridsndv} | tr '!' ' ' | awk '{print $1}' | tr ',' ' ' |              \
513  awk '{print $2}'`
514  dsnd=`echo ${gridsndv} | tr '!' ' ' | awk '{print $2}'`
515
516  xsnd1=`expr ${xsnd} + 1`
517  ysnd1=`expr ${ysnd} + 1`
518
519  # Getting values
520  if ${fscratch}; then rm ${simsfcptf} >& /dev/null; fi
521  if test ! -f ${simsfcptf}; then
522    values='Time,0,-1,1@south_north,'${ysnd}','${ysnd}',1@'
523    values=${values}'west_east,'${xsnd}','${xsnd}',1:False'
524    ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}             \
525      -S ${values} -v all
526    if test $? -ne 0; then
527      echo ${errmsg}
528      echo "  python failed!!"
529      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}      \
530        -S "'"${values}"'" -v all
531      exit
532    fi
533    echo "* get values at sfc point: "${stlon}", "${stlat} >> ${ofileins}
534    echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}        \
535      -S "'"${values}"'" -v all >> ${ofileins}
536    echo " " >> ${ofileins}
537
538    ofilen='newfile_multidims.nc'
539    mv ${ofilen} ${simsfcptf}
540  fi
541   
542  # Computing sfc diagnostics
543  if ${fscratch}; then rm ${simsfcdiagsf}; fi
544  if test ! -f ${simsfcdiagsf}; then
545    if test ! ${sfcdiagnames} = 'None'; then
546      sfcdiagd='Time@WRFtime'
547      diagns=`echo ${sfcdiagnames} | tr ':' ' '`
548
549      idiag=1
550      for diagn in ${diagns}; do
551        diagv=`cat $pyHOME/diagnostics.inf | grep WRF | grep ${diagn}',' | tr ',' ' ' |\
552          awk '{print $2"|"$3}'`
553        if test ${idiag} -eq 1; then
554          sfcdiagvals=${diagv}
555        else
556          sfcdiagvals=${sfcdiagvals}','${diagv}
557        fi
558        idiag=`expr ${idiag} + 1`
559      done
560
561      ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsfcptf} -d ${sfcdiagd} -v ${sfcdiagvals}
562      if test $? -ne 0; then
563        echo ${errmsg}
564        echo "  python failed!!"
565        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsfcptf} -d "'"${sfcdiagd}"'"  \
566          -v "'"${sfcdiagvals}"'"
567        exit
568      fi
569      echo "* diagnostics at sfc point: "${stlon}", "${stlat} >> ${ofileins}
570      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsfcptf} -d "'"${sfcdiagd}"'"    \
571        -v "'"${sfcdiagvals}"'" >> ${ofileins}
572      echo " " >> ${ofileins}
573      mv diagnostics.nc ${simsfcdiagsf}
574    fi
575
576    #Adding non-diagnostic variables
577    if test ! ${nondiagvs} = 'None'; then
578      # If there was not diagnostics
579      if test ! -f ${simsfcdiagsf}; then
580        dddv='Time@Times'
581        selvars='Times'
582        ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o selvar -S ${dddv} -f ${simsfcptf} -v ${selvars}
583        if test $? -ne 0; then
584          echo ${errmsg}
585          echo "  python failed!!"
586          echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o selvar -S "'"${dddv}"'" -f ${simsfcptf}\
587            -v ${vars}
588          exit
589          rm ${simsfcptf}
590        fi
591        echo "* creation of diagnostics file at sfc point: "${stlon}", "${stlat} >>  \
592          ${ofileins}
593        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o selvar -S "'"${dddv}"'" -f ${simsfcptf} \
594            -v ${selvars} >> ${ofileins}
595        echo " " >> ${ofileins}
596        mv selvar_new.nc ${simsfcdiagsf}
597        ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o WRF_CFtime_creation                          \
598          -S 19491201000000,minutes -f ${simsfcdiagsf} -v time
599        if test $? -ne 0; then
600          echo ${errmsg}
601          echo "  python failed!!"
602          echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o WRF_CFtime_creation                   \
603           -S 19491201000000,minutes -f ${simsfcdiagsf} -v time
604          exit
605          rm ${simsfcdiagsf}
606        fi
607        echo "* creation of CF-time variable for file at sfc point: "${stlon}", "    \
608          ${stlat} >> ${ofileins}
609        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o WRF_CFtime_creation                     \
610          -S 19491201000000,minutes -f ${simsfcdiagsf} -v time >> ${ofileins}
611        echo " " >> ${ofileins}
612      fi 
613      varsadd=`echo ${nondiagvs} | tr ':' ' '`
614      for vadd in ${varsadd}; do
615        ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o fvaradd -S ${simsfcptf},${vadd}              \
616          -f ${simsfcdiagsf}
617        if test $? -ne 0; then
618          echo ${errmsg}
619          echo "  python failed!!"
620          echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o fvaradd -S "'"${simsfcptf},${vadd}"'" \
621            -f ${simsfcdiagsf}
622          exit
623          rm ${simsfcdiagsf}
624        fi
625        echo "* adding variable '"${vadd}"' at sfc point: "${stlon}", "${stlat} >>   \
626          ${ofileins}
627        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o fvaradd -S "'"${simsfcptf},${vadd}"'"   \
628          -f ${simsfcdiagsf} >> ${ofileins}
629        echo " " >> ${ofileins}
630        # CF varname
631        CFvarn=`${pyBIN} $pyHOME/generic.py -o variables_values -S ${vadd} |         \
632          grep -v variables_values | tr ':' ' ' | awk '{print $1}'`
633        if test $? -ne 0; then
634          echo ${errmsg}
635          echo "  python failed!!"
636          echo ${pyBIN} $pyHOME/generic.py -o variables_values -S ${vadd}
637          exit
638          rm ${simsfcdiagsf}
639        fi
640        ${pyBIN} $pyHOME/nc_var.py -o chvarname -S ${CFvarn} -f ${simsfcdiagsf}      \
641          -v ${vadd}
642        if test $? -ne 0; then
643          echo ${errmsg}
644          echo "  python failed!!"
645          echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o chvarname -S ${CFvarn}                \
646            -f ${simsfcdiagsf} -v ${vadd}
647          exit
648          rm ${simsfcdiagsf}
649        fi
650      done
651    fi
652  fi
653}
654
655function get_WRFCDXsfc2D_data(){
656# Function to get the data from WRFCDX to compute analysis in a surface map
657#   filen= name of the file
658#   sfcdiagnames= diagnostics to compute (as ':' separated list)
659#   nondiagvs= ':' list of variables which are not from a diagnostics ('None' for
660#     without)
661#   sfcmapdiagd= name of the dimensions and dimension variables to use for diagnostics
662
663  funcvals=$1
664
665  filen=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $1}'`
666  sfcdiagnames=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $2}'`
667  nondiagvs=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $3}'`
668  sfcmapdiagd=`echo ${funcvals} | tr '#' ' ' | awk '{print $4}'`
669
670  # Computing sfc diagnostics
671  if test ! ${sfcdiagnames} = 'None'; then
672    diagns=`echo ${sfcdiagnames} | tr ':' ' '`
673
674    # getting that variables only required for the diagnostics
675    vardiags=''
676    idiag=1
677    for diagn in ${diagns}; do
678      diagv=`cat $pyHOME/diagnostics.inf | grep WRF | grep ${diagn}',' | tr ',' ' ' |\
679        awk '{print $2"|"$3}'`
680      if test ${idiag} -eq 1; then
681        sfcdiagvals=${diagv}
682        vardiags=`echo ${diagv} | tr '|' ' ' | awk '{print $2}' | tr '@' ':'`
683      else
684        sfcdiagvals=${sfcdiagvals}','${diagv}
685        vardiag=`echo ${diagv} | tr '|' ' ' | awk '{print $2}' | tr '@' ' '`
686        for vd in ${vardiag}; do
687          if ! $(isin_list ${vardiags} ${vd}); then vardiags=${vardiags}':'${vd}; fi
688        done
689      fi
690      idiag=`expr ${idiag} + 1`
691    done
692
693      # Inlcuding non-diagnostics
694      if test ! ${nondiagvs} = 'None'; then
695        nvns=`echo ${nondiagvs} | tr ':' ' '`
696        for vn in ${nvns}; do
697          if ! $(isin_list ${vardiags} ${vn}); then vardiags=${vardiags}':'${vn}; fi
698      done
699      if ! $(isin_list ${vardiags} 'time'); then vardiags=${vardiags}':time'; fi
700    fi
701  else
702    vardiags='LON:LAT:Times:'${nondiagvs}
703  fi
704  vardiag=`echo ${vardiags} | tr ':' ','`
705 
706  # Getting values
707  if ${fscratch}; then rm ${simsfcmapf} >& /dev/null; fi
708  if test ! -f ${simsfcmapf}; then
709    values='Time,0,-1,1@south_north,0,-1,1@west_east,0,-1,1:False'
710    ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}             \
711      -S ${values} -v ${vardiag}
712    if test $? -ne 0; then
713      echo ${errmsg}
714      echo "  python failed!!"
715      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}      \
716        -S "'"${values}"'"  -v ${vardiag}
717      exit
718    fi
719    echo "* get values for 2D map diagnostics: " >> ${ofileins}
720    echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o DataSetSection_multidims -f ${filen}        \
721      -S "'"${values}"'" -v ${vardiag} >> ${ofileins}
722    echo " " >> ${ofileins}
723
724    ofilen='newfile_multidims.nc'
725    mv ${ofilen} ${simsfcmapf}
726  fi
727
728  if ${fscratch}; then rm ${simsfcmapdiagsf}; fi
729  if test ! -f ${simsfcmapdiagsf}; then
730    if test ! ${sfcdiagnames} = 'None'; then 
731      ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsfcmapf} -d ${sfcmapdiagd}           \
732        -v ${sfcdiagvals}
733      if test $? -ne 0; then
734        echo ${errmsg}
735        echo "  python failed!!"
736        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsfcmapf}                      \
737          -d "'"${sfcmapdiagd}"'" -v "'"${sfcdiagvals}"'"
738        exit
739      fi
740      echo "* diagnostics for sfc 2D map: " >> ${ofileins}
741      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/diagnostics.py -f ${simsfcmapf} -d "'"${sfcmapdiagd}"'" \
742        -v "'"${sfcdiagvals}"'" >> ${ofileins}
743      echo " " >> ${ofileins}
744      mv diagnostics.nc ${simsfcmapdiagsf}
745    fi
746    # If there was not diagnostics
747    if test ! -f ${simsfcmapdiagsf}; then
748      dddv='Time@Times'
749      selvars='LON,LAT,Times'
750      ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o selvar -S ${dddv} -f ${simsfcmapf} -v ${selvars}
751      if test $? -ne 0; then
752        echo ${errmsg}
753        echo "  python failed!!"
754        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o selvar -S "'"${ddv}"'" -f ${simsfmapf}  \
755          -v ${vars}
756        exit
757        rm ${simsfcmapf}
758      fi
759      echo "* creation of diagnostics file for 2D map:" >>  ${ofileins}
760      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o selvar -S "'"${dddv}"'" -f ${simsfcmapf}  \
761          -v ${selvars} >> ${ofileins}
762      echo " " >> ${ofileins}
763      mv selvar_new.nc ${simsfcmapdiagsf}
764      ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o WRF_CFtime_creation -S 19491201000000,minutes  \
765        -f ${simsfcmapdiagsf} -v time
766      if test $? -ne 0; then
767        echo ${errmsg}
768        echo "  python failed!!"
769        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o WRF_CFtime_creation                     \
770         -S 19491201000000,minutes -f ${simsfcmapdiagsf} -v time
771        exit
772        rm ${simsfcmapdiagsf}
773      fi
774      echo "* creation of CF-time variable for file at sfc point: "${stlon}", "      \
775        ${stlat} >> ${ofileins}
776      echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o WRF_CFtime_creation                       \
777        -S 19491201000000,minutes -f ${simsfcmapdiagsf} -v time >> ${ofileins}
778      echo " " >> ${ofileins}
779    fi 
780
781    #Adding non-diagnostic variables
782    if test ! ${nondiagvs} = 'None'; then
783      varsadd=`echo ${nondiagvs} | tr ':' ' '`
784      for vadd in ${varsadd}; do
785        ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o fvaradd -S ${simsfcmapf},${vadd}             \
786          -f ${simsfcmapdiagsf}
787        if test $? -ne 0; then
788          echo ${errmsg}
789          echo "  python failed!!"
790          echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o fvaradd -S "'"${simsfcmapf},${vadd}"'" \
791            -f ${simsfcmapdiagsf}
792          exit
793          rm ${simsfcmapdiagsf}
794        fi
795        echo "* adding variable '"${vadd}"' at sfc map: " >> ${ofileins}
796        echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o fvaradd -S "'"${simsfcmapf},${vadd}"'"  \
797          -f ${simsfcmapdiagsf} >> ${ofileins}
798        echo " " >> ${ofileins}
799        # CF varname
800        CFvarn=`${pyBIN} $pyHOME/generic.py -o variables_values -S ${vadd} |         \
801          grep -v variables_values | tr ':' ' ' | awk '{print $1}'`
802        if test $? -ne 0; then
803          echo ${errmsg}
804          echo "  python failed!!"
805          echo ${pyBIN} $pyHOME/generic.py -o variables_values -S ${vadd}
806          exit
807          rm ${simsfcmapdiagsf}
808        fi
809        ${pyBIN} $pyHOME/nc_var.py -o chvarname -S ${CFvarn} -f ${simsfcmapdiagsf}   \
810          -v ${vadd}
811        if test $? -ne 0; then
812          echo ${errmsg}
813          echo "  python failed!!"
814          echo ${pyBIN} ${pyHOME}/nc_var.py -o chvarname -S ${CFvarn}                \
815            -f ${simsfcmapdiagsf} -v ${vadd}
816          exit
817          rm ${simsfcmapdiagsf}
818        fi
819      done
820    fi
821  fi
822}
823
824
825#######    #######
826## MAIN
827    #######
828
829  rootsh=`pwd`
830
831  ofileins=${rootsh}'/allins_functions.inf'
832
833  if ${fscratch}; then
834    echo "All instructions _______ " > ${ofileins}
835    echo "******* ****** ***** **** *** ** *" >> ${ofileins}
836    echo " " >> ${ofileins}
837  fi
838
839  fileN=`basename ${infilen}`
840  fdate=`echo ${fileN} | tr '_' ' ' | awk '{print $3"_"$4}'`
841
842  # Sounding
843  if test ! ${sndid} = 'None' && test ! ${wrfsnddiags} = 'None'; then
844    stid=${sndid}
845    simsndptf=${odir}'/simout_vars_sndpt_'${stid}'_'${expl}'_'${fdate}'.nc'
846    simsnddiagsf=${odir}'/simout_snddiags_'${stid}'_'${expl}'_'${fdate}'.nc'
847
848    fvals=${sndlon}'#'${sndlat}'#'${infilen}'#XLONG#XLAT#'${wrfsnddiags}
849    get_WRFsounding_data ${fvals}
850  fi
851
852  # Surface
853  if test ! ${sfcid} = 'None'  && test ! ${wrfsfcdiags} = 'None' ||                  \
854    test ! ${wrfsfcnodiags} = 'None'; then
855    stid=${sfcid}
856    simsfcptf=${odir}'/simout_vars_sfcpt_'${stid}'_'${expl}'_'${fdate}'.nc'
857    simsfcdiagsf=${odir}'/simout_sfcdiags_'${stid}'_'${expl}'_'${fdate}'.nc'
858 
859    fvals=${sfclon}'#'${sfclat}'#'${infilen}'#XLONG#XLAT#'${wrfsfcdiags}'#'${wrfsfcnodiags}
860    get_WRFsurface_data ${fvals}
861  fi
862
863  # Surface maps
864  if test ! ${wrfsfcdiags} = 'None' || test ! ${wrfsfcnodiags} = 'None'; then
865    simsfcmapf=${odir}'/simout_vars_sfcmap_'${expl}'_'${fdate}'.nc'
866    simsfcmapdiagsf=${odir}'/simout_sfcmapdiags_'${expl}'_'${fdate}'.nc'
867
868    fvals=${infilen}'#'${wrfsfcdiags}'#'${wrfsfcnodiags}
869    get_WRFsfc2D_data ${fvals}
870  fi
871
872  # cdx snd
873  if test ! ${sndid} = 'None'; then
874    if test ! ${wrfcdxdiags} = 'None' || test ! ${wrfcdxnodiags} = 'None'; then
875      stid=${sndid}
876      simsfcptf=${odir}'/simcdx_vars_sndpt_'${stid}'_'${expl}'_'${fdate}'.nc'
877      simsfcdiagsf=${odir}'/simcdx_snddiags_'${stid}'_'${expl}'_'${fdate}'.nc'
878 
879      fvals=${sndlon}'#'${sndlat}'#'${infilen}'#LON#LAT#'${wrfcdxdiags}'#'
880      fvals=${fvals}${wrfcdxnodiags}
881      get_WRFCDXsurface_data ${fvals}
882    fi
883  fi
884
885  # cdx Surface
886  if test ! ${sfcid} = 'None'; then
887   if test ! ${wrfcdxdiags} = 'None' || test ! ${wrfcdxnodiags} = 'None'; then
888      stid=${sfcid}
889      simsfcptf=${odir}'/simcdx_vars_sfcpt_'${stid}'_'${expl}'_'${fdate}'.nc'
890      simsfcdiagsf=${odir}'/simcdx_sfcdiags_'${stid}'_'${expl}'_'${fdate}'.nc'
891 
892      fvals=${sfclon}'#'${sfclat}'#'${infilen}'#LON#LAT#'${wrfcdxdiags}'#'
893      fvals=${fvals}${wrfcdxnodiags}
894      get_WRFCDXsurface_data ${fvals}
895    fi
896  fi
897
898  # cdx Surface maps
899  if test ! ${wrfcdxdiags} = 'None' || test ! ${wrfcdxnodiags} = 'None'; then
900    simsfcmapf=${odir}'/simcdx_vars_sfcmap_'${expl}'_'${fdate}'.nc'
901    simsfcmapdiagsf=${odir}'/simcdx_sfcmapdiags_'${expl}'_'${fdate}'.nc'
902
903    fvals=${infilen}'#'${wrfcdxdiags}'#'${wrfcdxnodiags}
904    get_WRFCDXsfc2D_data ${fvals}
905  fi
906
907fi
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.