source: lmdz_wrf/trunk/WRFV3/share/module_soil_pre.F @ 1531

Last change on this file since 1531 was 1, checked in by lfita, 10 years ago
  • -- --- Opening of the WRF+LMDZ coupling repository --- -- -

WRF: version v3.3
LMDZ: version v1818

More details in:

File size: 161.5 KB
Line 
1#if ( ! NMM_CORE == 1 )
2
3MODULE module_soil_pre
4
5   USE module_date_time
6   USE module_state_description
7
8   CHARACTER (LEN=3) :: num_cat_count
9   INTEGER , PARAMETER , DIMENSION(0:300) :: ints = &
10   (/    0,    1,    2,    3,    4,    5,    6,    7,    8,    9, &
11        10,   11,   12,   13,   14,   15,   16,   17,   18,   19, &
12        20,   21,   22,   23,   24,   25,   26,   27,   28,   29, &
13        30,   31,   32,   33,   34,   35,   36,   37,   38,   39, &
14        40,   41,   42,   43,   44,   45,   46,   47,   48,   49, &
15        50,   51,   52,   53,   54,   55,   56,   57,   58,   59, &
16        60,   61,   62,   63,   64,   65,   66,   67,   68,   69, &
17        70,   71,   72,   73,   74,   75,   76,   77,   78,   79, &
18        80,   81,   82,   83,   84,   85,   86,   87,   88,   89, &
19        90,   91,   92,   93,   94,   95,   96,   97,   98,   99, &
20       100,  101,  102,  103,  104,  105,  106,  107,  108,  109, &
21       110,  111,  112,  113,  114,  115,  116,  117,  118,  119, &
22       120,  121,  122,  123,  124,  125,  126,  127,  128,  129, &
23       130,  131,  132,  133,  134,  135,  136,  137,  138,  139, &
24       140,  141,  142,  143,  144,  145,  146,  147,  148,  149, &
25       150,  151,  152,  153,  154,  155,  156,  157,  158,  159, &
26       160,  161,  162,  163,  164,  165,  166,  167,  168,  169, &
27       170,  171,  172,  173,  174,  175,  176,  177,  178,  179, &
28       180,  181,  182,  183,  184,  185,  186,  187,  188,  189, &
29       190,  191,  192,  193,  194,  195,  196,  197,  198,  199, &
30       200,  201,  202,  203,  204,  205,  206,  207,  208,  209, &
31       210,  211,  212,  213,  214,  215,  216,  217,  218,  219, &
32       220,  221,  222,  223,  224,  225,  226,  227,  228,  229, &
33       230,  231,  232,  233,  234,  235,  236,  237,  238,  239, &
34       240,  241,  242,  243,  244,  245,  246,  247,  248,  249, &
35       250,  251,  252,  253,  254,  255,  256,  257,  258,  259, &
36       260,  261,  262,  263,  264,  265,  266,  267,  268,  269, &
37       270,  271,  272,  273,  274,  275,  276,  277,  278,  279, &
38       280,  281,  282,  283,  284,  285,  286,  287,  288,  289, &
39       290,  291,  292,  293,  294,  295,  296,  297,  298,  299, 300 /)
40
41   !  Excluded middle processing
42
43   LOGICAL , SAVE :: hold_ups
44   INTEGER , SAVE :: em_width
45
46   LOGICAL , EXTERNAL :: skip_middle_points_t
47
48CONTAINS
49
50   SUBROUTINE adjust_for_seaice_pre ( xice , landmask , tsk , ivgtyp , vegcat , lu_index , &
51                                      xland , landusef , isltyp , soilcat , soilctop , &
52                                      soilcbot , tmn , &
53                                      seaice_threshold , &
54                                      fractional_seaice, &
55                                      num_veg_cat , num_soil_top_cat , num_soil_bot_cat , &
56                                      iswater , isice , &
57                                      scheme , &
58                                      ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
59                                      ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
60                                      its , ite , jts , jte , kts , kte )
61
62      IMPLICIT NONE
63
64      INTEGER , INTENT(IN) :: ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
65                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
66                              its , ite , jts , jte , kts , kte , &
67                              iswater , isice
68      INTEGER , INTENT(IN) :: num_veg_cat , num_soil_top_cat , num_soil_bot_cat , scheme
69
70      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_veg_cat,jms:jme) , INTENT(INOUT):: landusef
71      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_soil_top_cat,jms:jme) , INTENT(INOUT):: soilctop
72      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_soil_bot_cat,jms:jme) , INTENT(INOUT):: soilcbot
73      INTEGER , DIMENSION(ims:ime,jms:jme), INTENT(OUT) :: isltyp , ivgtyp
74      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: landmask , xice , tsk , lu_index , &
75                                                           vegcat, xland , soilcat , tmn
76      REAL , INTENT(IN) :: seaice_threshold
77
78      INTEGER :: i , j , num_seaice_changes , loop
79      CHARACTER (LEN=132) :: message
80
81      INTEGER, INTENT(IN) :: fractional_seaice
82      REAL :: XICE_THRESHOLD
83
84      IF ( FRACTIONAL_SEAICE == 0 ) THEN
85         xice_threshold = 0.5
86      ELSEIF ( FRACTIONAL_SEAICE == 1 ) THEN
87         xice_threshold = 0.02
88      ENDIF
89
90      num_seaice_changes = 0
91      fix_seaice : SELECT CASE ( scheme )
92
93         CASE ( SLABSCHEME )
94            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
95               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
96                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
97                  IF ( xice(i,j) .GT. 200.0 ) THEN
98                     xice(i,j) = 0.
99                     num_seaice_changes = num_seaice_changes + 1
100                  END IF
101               END DO
102            END DO
103            IF ( num_seaice_changes .GT. 0 ) THEN
104               WRITE ( message , FMT='(A,I6)' ) &
105               'Total pre number of sea ice locations removed (due to FLAG values) = ', &
106               num_seaice_changes
107               CALL wrf_debug ( 0 , message )
108            END IF
109            num_seaice_changes = 0
110            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
111               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
112                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
113                  IF ( ( xice(i,j) .GE. xice_threshold ) .OR. &
114                       ( ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) .AND. ( tsk(i,j) .LT. seaice_threshold ) ) ) THEN
115                     IF ( FRACTIONAL_SEAICE == 0 ) THEN
116                        xice(i,j) = 1.0
117                     ENDIF
118                     num_seaice_changes = num_seaice_changes + 1
119                     if(landmask(i,j) .LT. 0.5 )tmn(i,j) = 271.4
120                     vegcat(i,j)=isice
121                     ivgtyp(i,j)=isice
122                     lu_index(i,j)=isice
123                     landmask(i,j)=1.
124                     xland(i,j)=1.
125                     DO loop=1,num_veg_cat
126                        landusef(i,loop,j)=0.
127                     END DO
128                     landusef(i,ivgtyp(i,j),j)=1.
129
130                     isltyp(i,j) = 16
131                     soilcat(i,j)=isltyp(i,j)
132                     DO loop=1,num_soil_top_cat
133                        soilctop(i,loop,j)=0
134                     END DO
135                     DO loop=1,num_soil_bot_cat
136                        soilcbot(i,loop,j)=0
137                     END DO
138                     soilctop(i,isltyp(i,j),j)=1.
139                     soilcbot(i,isltyp(i,j),j)=1.
140                  ELSE
141                     xice(i,j) = 0.0
142                  END IF
143               END DO
144            END DO
145            IF ( num_seaice_changes .GT. 0 ) THEN
146               WRITE ( message , FMT='(A,I6)' ) &
147               'Total pre number of sea ice location changes (water to land) = ', num_seaice_changes
148               CALL wrf_debug ( 0 , message )
149            END IF
150
151         CASE ( LSMSCHEME , RUCLSMSCHEME )
152            num_seaice_changes = 0
153            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
154               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
155                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
156                  IF ( landmask(i,j) .GT. 0.5 ) THEN
157                     if (xice(i,j).gt.0) num_seaice_changes = num_seaice_changes + 1
158                     xice(i,j) = 0.
159                  END IF
160               END DO
161            END DO
162            IF ( num_seaice_changes .GT. 0 ) THEN
163               WRITE ( message , FMT='(A,I6)' ) &
164               'Total pre number of land location changes (seaice set to zero) = ', num_seaice_changes
165               CALL wrf_debug ( 0 , message )
166            END IF
167
168      END SELECT fix_seaice
169
170   END SUBROUTINE adjust_for_seaice_pre
171
172   SUBROUTINE adjust_for_seaice_post ( xice , landmask , tsk_old , tsk , ivgtyp , vegcat , lu_index , &
173                                      xland , landusef , isltyp , soilcat , soilctop , &
174                                      soilcbot , tmn , vegfra , &
175                                      tslb , smois , sh2o , &
176                                      seaice_threshold , &
177                                      sst , flag_sst , &
178                                      fractional_seaice, &
179                                      num_veg_cat , num_soil_top_cat , num_soil_bot_cat , &
180                                      num_soil_layers , &
181                                      iswater , isice , &
182                                      scheme , &
183                                      ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
184                                      ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
185                                      its , ite , jts , jte , kts , kte )
186
187      IMPLICIT NONE
188
189      INTEGER , INTENT(IN) :: ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
190                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
191                              its , ite , jts , jte , kts , kte , &
192                              iswater , isice
193      INTEGER , INTENT(IN) :: num_veg_cat , num_soil_top_cat , num_soil_bot_cat , scheme
194      INTEGER , INTENT(IN) :: num_soil_layers
195
196      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_veg_cat,jms:jme) , INTENT(INOUT):: landusef
197      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_soil_top_cat,jms:jme) , INTENT(INOUT):: soilctop
198      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_soil_bot_cat,jms:jme) , INTENT(INOUT):: soilcbot
199      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_soil_layers,jms:jme) , INTENT(INOUT):: tslb , smois , sh2o
200      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme)                   , INTENT(IN):: sst
201      INTEGER , DIMENSION(ims:ime,jms:jme), INTENT(OUT) :: isltyp , ivgtyp
202      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: landmask , xice , tsk , lu_index , &
203                                                           vegcat, xland , soilcat , tmn , &
204                                                           tsk_old , vegfra
205      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_sst
206      REAL , INTENT(IN) :: seaice_threshold
207      REAL :: total_depth , mid_point_depth
208
209      INTEGER :: i , j , num_seaice_changes , loop
210      CHARACTER (LEN=132) :: message
211
212
213      INTEGER, INTENT(IN) :: fractional_seaice
214      real :: xice_threshold
215
216      IF ( FRACTIONAL_SEAICE == 0 ) THEN
217         xice_threshold = 0.5
218      ELSEIF ( FRACTIONAL_SEAICE == 1 ) THEN
219         xice_threshold = 0.02
220      ENDIF
221      num_seaice_changes = 0
222      fix_seaice : SELECT CASE ( scheme )
223
224         CASE ( SLABSCHEME )
225
226         CASE ( LSMSCHEME )
227            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
228               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
229                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
230                  IF ( xice(i,j) .GT. 200.0 ) THEN
231                     xice(i,j) = 0.
232                     num_seaice_changes = num_seaice_changes + 1
233                  END IF
234               END DO
235            END DO
236            IF ( num_seaice_changes .GT. 0 ) THEN
237               WRITE ( message , FMT='(A,I6)' ) &
238               'Total post number of sea ice locations removed (due to FLAG values) = ', &
239               num_seaice_changes
240               CALL wrf_debug ( 0 , message )
241            END IF
242            num_seaice_changes = 0
243            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
244               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
245                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
246                  IF ( ( ( tsk(i,j) .LT. 170 ) .OR. ( tsk(i,j) .GT. 400 ) ) .AND. &
247                       ( ( tsk_old(i,j) .GT. 170 ) .AND. ( tsk_old(i,j) .LT. 400 ) ) )THEN
248                     tsk(i,j) = tsk_old(i,j)
249                  END IF
250                  IF ( ( ( tsk(i,j) .LT. 170 ) .OR. ( tsk(i,j) .GT. 400 ) ) .AND. &
251                       ( ( tsk_old(i,j) .LT. 170 ) .OR. ( tsk_old(i,j) .GT. 400 ) ) )THEN
252                     print *,'TSK woes in seaice post, i,j=',i,j,'  tsk = ',tsk(i,j), tsk_old(i,j)
253                     CALL wrf_error_fatal ( 'TSK is unrealistic, problems for seaice post')
254                  ELSE IF ( ( xice(i,j) .GE. xice_threshold ) .OR. &
255                       ( ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) .AND. ( tsk(i,j) .LT. seaice_threshold ) ) ) THEN
256                     IF ( FRACTIONAL_SEAICE == 0 ) THEN
257                        xice(i,j) = 1.0
258                     ENDIF
259                     num_seaice_changes = num_seaice_changes + 1
260                     if(landmask(i,j) .LT. 0.5 )tmn(i,j) = 271.4
261                     vegcat(i,j)=isice
262                     ivgtyp(i,j)=isice
263                     lu_index(i,j)=isice
264                     landmask(i,j)=1.
265                     xland(i,j)=1.
266                     vegfra(i,j)=0.
267                     DO loop=1,num_veg_cat
268                        landusef(i,loop,j)=0.
269                     END DO
270                     landusef(i,ivgtyp(i,j),j)=1.
271
272                     tsk_old(i,j) = tsk(i,j)
273
274                     isltyp(i,j) = 16
275                     soilcat(i,j)=isltyp(i,j)
276                     DO loop=1,num_soil_top_cat
277                        soilctop(i,loop,j)=0
278                     END DO
279                     DO loop=1,num_soil_bot_cat
280                        soilcbot(i,loop,j)=0
281                     END DO
282                     soilctop(i,isltyp(i,j),j)=1.
283                     soilcbot(i,isltyp(i,j),j)=1.
284
285                     total_depth = 3. ! ice is 3 m deep, num_soil_layers equispaced layers
286                     DO loop = 1,num_soil_layers
287                        mid_point_depth=(total_depth/num_soil_layers)/2. + &
288                                        (loop-1)*(total_depth/num_soil_layers)
289                        tslb(i,loop,j) = ( (total_depth-mid_point_depth)*tsk(i,j) + &
290                                            mid_point_depth*tmn(i,j) ) / total_depth
291                     END DO
292
293                     DO loop=1,num_soil_layers
294                        smois(i,loop,j) = 1.0
295                        sh2o(i,loop,j)  = 0.0
296                     END DO
297                  ELSE IF ( xice(i,j) .LT. xice_threshold ) THEN
298                     xice(i,j) = 0.
299                  END IF
300               END DO
301            END DO
302            IF ( num_seaice_changes .GT. 0 ) THEN
303               WRITE ( message , FMT='(A,I6)' ) &
304               'Total post number of sea ice location changes (water to land) = ', num_seaice_changes
305               CALL wrf_debug ( 0 , message )
306            END IF
307
308        CASE ( RUCLSMSCHEME )
309            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
310               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
311                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
312                  IF ( xice(i,j) .GT. 200.0 ) THEN
313                     xice(i,j) = 0.
314                     num_seaice_changes = num_seaice_changes + 1
315                  END IF
316               END DO
317            END DO
318            IF ( num_seaice_changes .GT. 0 ) THEN
319               WRITE ( message , FMT='(A,I6)' ) &
320               'Total post number of sea ice locations removed (due to FLAG values) = ', &
321               num_seaice_changes
322               CALL wrf_debug ( 0 , message )
323            END IF
324            num_seaice_changes = 0
325            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
326               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
327                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
328                  IF ( ( ( tsk(i,j) .LT. 170 ) .OR. ( tsk(i,j) .GT. 400 ) ) .AND. &
329                       ( ( tsk_old(i,j) .GT. 170 ) .AND. ( tsk_old(i,j) .LT. 400 ) ) )THEN
330                     tsk(i,j) = tsk_old(i,j)
331                  END IF
332                  IF ( ( ( tsk(i,j) .LT. 170 ) .OR. ( tsk(i,j) .GT. 400 ) ) .AND. &
333                       ( ( tsk_old(i,j) .LT. 170 ) .OR. ( tsk_old(i,j) .GT. 400 ) ) )THEN
334                     print *,'TSK woes in seaice post, i,j=',i,j,'  tsk = ',tsk(i,j), tsk_old(i,j)
335                     CALL wrf_error_fatal ( 'TSK is unrealistic, problems for seaice post')
336                  ELSE IF ( ( xice(i,j) .GE. xice_threshold ) .OR. &
337                       ( ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) .AND. ( tsk(i,j) .LT. seaice_threshold ) ) ) THEN
338                       IF ( FRACTIONAL_SEAICE == 0 ) THEN
339                          xice(i,j) = 1.0
340                       ELSE
341                          xice(i,j)=max(0.25,xice(i,j))
342                       ENDIF
343                     num_seaice_changes = num_seaice_changes + 1
344                     if(landmask(i,j) .LT. 0.5 )tmn(i,j) = 271.4
345                     vegcat(i,j)=isice
346                     ivgtyp(i,j)=isice
347                     lu_index(i,j)=isice
348                     landmask(i,j)=1.
349                     xland(i,j)=1.
350                     vegfra(i,j)=0.
351                     DO loop=1,num_veg_cat
352                        landusef(i,loop,j)=0.
353                     END DO
354                     landusef(i,ivgtyp(i,j),j)=1.
355
356!tgs - compute blended sea ice/water skin temperature
357                   if(flag_sst.eq.1) then
358                     tsk(i,j) = xice(i,j)*(min(seaice_threshold,tsk(i,j)))  &
359                                +(1-xice(i,j))*sst(i,j)
360                   else
361                     tsk(i,j) = xice(i,j)*(min(seaice_threshold,tsk(i,j)))  &
362                                +(1-xice(i,j))*tsk(i,j)
363                   endif
364                     tsk_old(i,j) = tsk(i,j)
365
366                     isltyp(i,j) = 16
367                     soilcat(i,j)=isltyp(i,j)
368                     DO loop=1,num_soil_top_cat
369                        soilctop(i,loop,j)=0
370                     END DO
371                     DO loop=1,num_soil_bot_cat
372                        soilcbot(i,loop,j)=0
373                     END DO
374                     soilctop(i,isltyp(i,j),j)=1.
375                     soilcbot(i,isltyp(i,j),j)=1.
376
377                 total_depth = 3. ! ice is 3 m deep, num_soil_layers equispaced layers
378                       tslb(i,1,j) = tsk(i,j)
379                       tslb(i,num_soil_layers,j) = tmn(i,j)
380                     DO loop = 2,num_soil_layers-1
381                        mid_point_depth=(total_depth/num_soil_layers)/4. + &
382                                        (loop-2)*(total_depth/num_soil_layers)
383                        tslb(i,loop,j) = ( (total_depth-mid_point_depth)*tsk(i,j) + &
384                                            mid_point_depth*tmn(i,j) ) / total_depth
385                     END DO
386
387                     DO loop=1,num_soil_layers
388                        smois(i,loop,j) = 1.0
389                        sh2o(i,loop,j)  = 0.0
390                     END DO
391                  ELSE IF ( xice(i,j) .LT. xice_threshold ) THEN
392                     xice(i,j) = 0.
393                  END IF
394               END DO
395            END DO
396            IF ( num_seaice_changes .GT. 0 ) THEN
397               WRITE ( message , FMT='(A,I6)' ) &
398               'Total post number of sea ice location changes (water to land) = ', num_seaice_changes
399               CALL wrf_debug ( 0 , message )
400            END IF
401
402
403      END SELECT fix_seaice
404
405   END SUBROUTINE adjust_for_seaice_post
406
407   SUBROUTINE process_percent_cat_new ( landmask ,  &
408                                landuse_frac , soil_top_cat , soil_bot_cat , &
409                                isltyp , ivgtyp , &
410                                num_veg_cat , num_soil_top_cat , num_soil_bot_cat , &
411                                ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
412                                ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
413                                its , ite , jts , jte , kts , kte , &
414                                iswater )
415
416      IMPLICIT NONE
417
418      INTEGER , INTENT(IN) :: ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
419                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
420                              its , ite , jts , jte , kts , kte , &
421                              iswater
422      INTEGER , INTENT(IN) :: num_veg_cat , num_soil_top_cat , num_soil_bot_cat
423      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_veg_cat,jms:jme) , INTENT(INOUT):: landuse_frac
424      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_soil_top_cat,jms:jme) , INTENT(IN):: soil_top_cat
425      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_soil_bot_cat,jms:jme) , INTENT(IN):: soil_bot_cat
426      INTEGER , DIMENSION(ims:ime,jms:jme), INTENT(OUT) :: isltyp , ivgtyp
427      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: landmask
428
429      INTEGER :: i , j , l , ll, dominant_index
430      REAL :: dominant_value
431
432#ifdef WRF_CHEM
433!      REAL :: lwthresh = .99
434      REAL :: lwthresh = .50
435#else
436      REAL :: lwthresh = .50
437#endif
438
439      INTEGER , PARAMETER :: iswater_soil = 14
440      INTEGER :: iforce
441      CHARACTER (LEN=132) :: message
442      CHARACTER(LEN=256) :: mminlu
443      LOGICAL :: aggregate_lu
444integer :: change_water , change_land
445change_water = 0
446change_land = 0
447
448      !  Sanity check on the 50/50 points
449
450      DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
451         DO i = its , MIN(ide-1,ite)
452            IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
453            dominant_value = landuse_frac(i,iswater,j)
454            IF ( dominant_value .EQ. lwthresh ) THEN
455               DO l = 1 , num_veg_cat
456                  IF ( l .EQ. iswater ) CYCLE
457                  IF ( ( landuse_frac(i,l,j) .EQ. lwthresh ) .AND. ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) ) THEN
458                     PRINT *,i,j,' water and category ',l,' both at 50%, landmask is ',landmask(i,j)
459                     landuse_frac(i,l,j) = lwthresh - .01
460                     landuse_frac(i,iswater,j) = lwthresh + 0.01
461                  ELSE IF ( ( landuse_frac(i,l,j) .EQ. lwthresh ) .AND. ( landmask(i,j) .GT. 0.5 ) ) THEN
462                     PRINT *,i,j,' water and category ',l,' both at 50%, landmask is ',landmask(i,j)
463                     landuse_frac(i,l,j) = lwthresh + .01
464                     landuse_frac(i,iswater,j) = lwthresh - 0.01
465                  END IF
466               END DO
467            END IF
468         END DO
469      END DO
470
471      !  Compute the aggregate of the vegetation/land use categories.  Lump all of the grasses together,
472      !  all of the shrubs, all of the trees, etc.  Choose the correct set of available land use
473      !  categories.  Also, make sure that the user wants to actually avail themselves of aforementioned
474      !  opportunity, as mayhaps they don't.
475 
476      CALL nl_get_mminlu       ( 1 , mminlu       )
477      CALL nl_get_aggregate_lu ( 1 , aggregate_lu )
478      IF ( aggregate_lu ) THEN
479         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
480            DO i = its , MIN(ide-1,ite)
481               IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
482               CALL aggregate_categories_part1 ( landuse_frac , iswater , num_veg_cat , mminlu(1:4) )
483            END DO
484         END DO
485      END IF
486
487      !  Compute the dominant VEGETATION INDEX.
488
489      DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
490         DO i = its , MIN(ide-1,ite)
491            IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
492            dominant_value = landuse_frac(i,1,j)
493            dominant_index = 1
494            DO l = 2 , num_veg_cat
495               IF        ( l .EQ. iswater ) THEN
496                  ! wait a bit
497               ELSE IF ( ( l .NE. iswater ) .AND. ( landuse_frac(i,l,j) .GT. dominant_value ) ) THEN
498                  dominant_value = landuse_frac(i,l,j)
499                  dominant_index = l
500               END IF
501            END DO
502            IF ( landuse_frac(i,iswater,j) .GT. lwthresh ) THEN
503               dominant_value = landuse_frac(i,iswater,j)
504               dominant_index = iswater
505            ELSE IF ( ( landuse_frac(i,iswater,j) .EQ. lwthresh) .AND. &
506                      ( landmask(i,j) .LT. 0.5) .AND. &
507                      ( dominant_value .EQ. lwthresh) ) THEN
508               dominant_value = landuse_frac(i,iswater,j)
509               dominant_index = iswater
510            ELSE IF ( ( landuse_frac(i,iswater,j) .EQ. lwthresh) .AND. &
511                      ( landmask(i,j) .GT. 0.5) .AND. &
512                      ( dominant_value .EQ. lwthresh) ) THEN
513               !no op
514            ELSE IF ( ( landuse_frac(i,iswater,j) .EQ. lwthresh ) .AND. &
515                      ( dominant_value .LT. lwthresh ) ) THEN
516               dominant_value = landuse_frac(i,iswater,j)
517               dominant_index = iswater
518            END IF
519            IF      ( dominant_index .EQ. iswater ) THEN
520if(landmask(i,j).gt.lwthresh) then
521!print *,'changing to water at point ',i,j
522!WRITE ( num_cat_count , FMT = '(I3)' ) num_veg_cat
523!WRITE ( message , FMT = '('//num_cat_count//'(i3,1x))' ) ints(1:num_veg_cat)
524!CALL wrf_debug(1,message)
525!WRITE ( message , FMT = '('//num_cat_count//'(i3,1x))' ) nint(landuse_frac(i,:,j)*100)
526!CALL wrf_debug(1,message)
527change_water=change_water+1
528endif
529               landmask(i,j) = 0
530            ELSE IF ( dominant_index .NE. iswater ) THEN
531if(landmask(i,j).lt.lwthresh) then
532!print *,'changing to land at point ',i,j
533!WRITE ( num_cat_count , FMT = '(I3)' ) num_veg_cat
534!WRITE ( message , FMT = '('//num_cat_count//'(i3,1x))' ) ints(1:num_veg_cat)
535!CALL wrf_debug(1,message)
536!WRITE ( message , FMT = '('//num_cat_count//'(i3,1x))' ) nint(landuse_frac(i,:,j)*100)
537!CALL wrf_debug(1,message)
538change_land=change_land+1
539endif
540               landmask(i,j) = 1
541            END IF
542            ivgtyp(i,j) = dominant_index
543         END DO
544      END DO
545
546      !  Compute the dominant SOIL TEXTURE INDEX, TOP.
547
548      iforce = 0
549      DO i = its , MIN(ide-1,ite)
550         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
551            IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
552            dominant_value = soil_top_cat(i,1,j)
553            dominant_index = 1
554            IF ( landmask(i,j) .GT. lwthresh ) THEN
555               DO l = 2 , num_soil_top_cat
556                  IF ( ( l .NE. iswater_soil ) .AND. ( soil_top_cat(i,l,j) .GT. dominant_value ) ) THEN
557                     dominant_value = soil_top_cat(i,l,j)
558                     dominant_index = l
559                  END IF
560               END DO
561               IF ( dominant_value .LT. 0.01 ) THEN
562                  iforce = iforce + 1
563                  WRITE ( message , FMT = '(A,I4,I4)' ) &
564                  'based on landuse, changing soil to land at point ',i,j
565                  CALL wrf_debug(1,message)
566                  WRITE ( num_cat_count , FMT = '(I3)' ) num_soil_top_cat
567                  WRITE ( message , FMT = '('//num_cat_count//'(i3,1x))' ) (ints(l),l=1,num_soil_top_cat)
568                  CALL wrf_debug(1,message)
569                  WRITE ( message , FMT = '('//num_cat_count//'(i3,1x))' ) &
570                    ((nint(soil_top_cat(i,ints(l),j)*100)), l=1,num_soil_top_cat)
571                  CALL wrf_debug(1,message)
572                  dominant_index = 8
573               END IF
574            ELSE
575               dominant_index = iswater_soil
576            END IF
577            isltyp(i,j) = dominant_index
578         END DO
579      END DO
580
581if(iforce.ne.0)then
582WRITE(message,FMT='(A,I4,A,I6)' ) &
583'forcing artificial silty clay loam at ',iforce,' points, out of ',&
584(MIN(ide-1,ite)-its+1)*(MIN(jde-1,jte)-jts+1)
585CALL wrf_debug(0,message)
586endif
587print *,'LAND  CHANGE = ',change_land
588print *,'WATER CHANGE = ',change_water
589
590   END SUBROUTINE process_percent_cat_new
591
592   SUBROUTINE process_soil_real ( tsk , tmn , tavgsfc, &
593                                landmask , sst , ht, toposoil, &
594                                st_input , sm_input , sw_input , &
595                                st_levels_input , sm_levels_input , sw_levels_input , &
596                                zs , dzs , tslb , smois , sh2o , &
597                                flag_sst , flag_tavgsfc, flag_soilhgt, &
598                                flag_soil_layers, flag_soil_levels, &
599                                ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
600                                ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
601                                its , ite , jts , jte , kts , kte , &
602                                sf_surface_physics , num_soil_layers , real_data_init_type , &
603                                num_st_levels_input , num_sm_levels_input , num_sw_levels_input , &
604                                num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , num_sw_levels_alloc )
605
606      IMPLICIT NONE
607
608      INTEGER , INTENT(IN) :: ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
609                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
610                              its , ite , jts , jte , kts , kte , &
611                              sf_surface_physics , num_soil_layers , real_data_init_type , &
612                              num_st_levels_input , num_sm_levels_input , num_sw_levels_input , &
613                              num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , num_sw_levels_alloc
614
615      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_sst, flag_tavgsfc
616      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_soil_layers, flag_soil_levels, flag_soilhgt
617
618      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: landmask , sst
619
620      INTEGER , DIMENSION(1:num_st_levels_input) , INTENT(INOUT) :: st_levels_input
621      INTEGER , DIMENSION(1:num_sm_levels_input) , INTENT(INOUT) :: sm_levels_input
622      INTEGER , DIMENSION(1:num_sw_levels_input) , INTENT(INOUT) :: sw_levels_input
623      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_st_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: st_input
624      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_sm_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: sm_input
625      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_sw_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: sw_input
626
627      REAL, DIMENSION(1:num_soil_layers), INTENT(OUT)  ::  zs,dzs
628      REAL , DIMENSION(ims:ime,num_soil_layers,jms:jme) , INTENT(OUT) :: tslb , smois , sh2o
629      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: tavgsfc, ht, toposoil
630      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: tsk, tmn
631
632      INTEGER :: i , j , k, l , dominant_index , num_soil_cat , num_veg_cat, closest_layer
633      REAL :: dominant_value, closest_depth, diff_cm
634      REAL , ALLOCATABLE , DIMENSION(:) :: depth     ! Soil layer thicknesses (cm)
635      REAL, PARAMETER :: get_temp_closest_to = 30.   ! use soil temperature closest to this depth (cm)
636      REAL, PARAMETER :: something_big = 1.e6        ! Initialize closest depth as something big (cm)
637      INTEGER :: something_far = 1000                ! Soil array index far away
638      CHARACTER (LEN=132) :: message
639
640      !  Case statement for tmn initialization
641      !  Need to have a reasonable default value for annual mean deeeeep soil temperature
642      !  For sf_surface_physics = 1, we want to use close to a 30 cm value
643      !  for the bottom level of the soil temps.
644      ! NOTE:  We are assuming that soil_layers are the same for each grid point
645
646      fix_bottom_level_for_temp : SELECT CASE ( sf_surface_physics )
647         CASE (SLABSCHEME)
648            IF ( flag_tavgsfc  .EQ. 1 ) THEN
649               CALL wrf_debug ( 0 , 'Using average surface temperature for tmn')
650               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
651                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
652                     IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
653                     tmn(i,j) = tavgsfc(i,j)
654                  END DO
655               END DO
656            ELSE
657            ! Look for soil temp close to 30 cm
658               closest_layer = something_far
659               closest_depth = something_big
660               DO k = 1, num_st_levels_input
661                  diff_cm = abs( st_levels_input(k) - get_temp_closest_to )
662                  IF ( diff_cm < closest_depth ) THEN
663                     closest_depth = diff_cm
664                     closest_layer = k
665                  END IF
666               END DO
667               IF ( closest_layer == something_far ) THEN
668                  CALL wrf_debug ( 0 , 'No soil temperature data for grid%tmn near 30 cm')
669                  CALL wrf_debug ( 0 , 'Using 1 degree static annual mean temps' )
670               ELSE
671                  write(message, FMT='(A,F7.2,A,I3)')&
672                     'Soil temperature closest to ',get_temp_closest_to, &
673                     ' at level ',st_levels_input(closest_layer)
674                  CALL wrf_debug ( 0 , message )
675                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
676                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
677                        IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
678                        tmn(i,j) = st_input(i,closest_layer+1,j)
679                     END DO
680                  END DO
681               END IF
682            END IF
683
684         CASE (LSMSCHEME)
685
686         CASE (RUCLSMSCHEME)
687
688         CASE (PXLSMSCHEME)
689! When the input data from met_em is in layers, there is an additional level added to the beginning
690! of the array to define the surface, which is why we add the extra value (closest_layer+1)
691            IF ( flag_tavgsfc  .EQ. 1 ) THEN
692               CALL wrf_debug ( 0 , 'Using average surface temperature for tmn')
693               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
694                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
695                     IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
696                     tmn(i,j) = tavgsfc(i,j)
697                  END DO
698               END DO
699            ELSE
700            ! Look for soil temp close to 30 cm
701               closest_layer = num_st_levels_input+1
702               closest_depth = something_big
703               DO k = 1, num_st_levels_input
704                  diff_cm = abs( st_levels_input(k) - get_temp_closest_to )
705                  IF ( diff_cm < closest_depth ) THEN
706                     closest_depth = diff_cm
707                     closest_layer = k
708                  END IF
709               END DO
710               IF ( closest_layer == num_st_levels_input + 1 ) THEN
711                  CALL wrf_debug ( 0 , 'No soil temperature data for grid%tmn near 30 cm')
712                  CALL wrf_debug ( 0 , 'Using 1 degree static annual mean temps' )
713               ELSE
714                  write(message, FMT='(A,F7.2,A,I3)')&
715                     'Soil temperature closest to ',get_temp_closest_to, &
716                     ' at level ',st_levels_input(closest_layer)
717                  CALL wrf_debug ( 0 , message )
718                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
719                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
720                        IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
721                        tmn(i,j) = st_input(i,closest_layer+1,j)
722                     END DO
723                  END DO
724               END IF
725            END IF
726
727#if 0
728            ! Loop over layers and do a weighted mean
729            IF ( ALLOCATED ( depth ) ) DEALLOCATE ( depth )
730            ALLOCATE ( depth(num_st_levels_input) )
731            IF ( flag_soil_layers == 1 ) THEN
732               DO k = num_st_levels_input, 2, -1
733                  depth(k) = st_levels_input(k) - st_levels_input(k-1)
734               END DO
735               depth(1) = st_levels_input(1)
736            ELSE IF ( flag_soil_levels == 1 ) THEN
737               DO k = 2, num_st_levels_input
738                  depth(k) = st_levels_input(k) - st_levels_input(k-1)
739               END DO
740               depth(1) = 0.
741            END IF
742
743            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
744               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
745                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
746                  tmn(i,j) = 0.
747                  DO k = 1, num_st_levels_input
748                     tmn(i,j) = tmn(i,j) + depth(k) * st_input(i,k,j)
749                  END DO
750               END DO
751            END DO
752            DEALLOCATE ( depth )
753
754#endif
755
756      END SELECT fix_bottom_level_for_temp
757
758      !  Adjust the various soil temperature values depending on the difference in
759      !  elevation between the current model's elevation and the incoming data's
760      !  orography.
761
762      adjust_soil : SELECT CASE ( sf_surface_physics )
763
764         CASE ( SLABSCHEME , LSMSCHEME , RUCLSMSCHEME, PXLSMSCHEME )
765            CALL adjust_soil_temp_new ( tmn , sf_surface_physics , tsk , ht ,            &
766                                        toposoil , landmask , st_input, st_levels_input, &
767                                        flag_soilhgt , flag_tavgsfc ,                    &
768                                        flag_soil_layers , flag_soil_levels,             &
769                                        num_st_levels_input, num_st_levels_alloc,        &
770                                        ids , ide , jds , jde , kds , kde ,              &
771                                        ims , ime , jms , jme , kms , kme ,              &
772                                        its , ite , jts , jte , kts , kte )
773
774      END SELECT adjust_soil
775
776      !  Initialize the soil depth, and the soil temperature and moisture.
777   
778      IF      ( ( sf_surface_physics .EQ. SLABSCHEME ) .AND. ( num_soil_layers .GT. 1 ) ) THEN
779         CALL init_soil_depth_1 ( zs , dzs , num_soil_layers )
780         CALL init_soil_1_real ( tsk , tmn , tslb , zs , dzs , num_soil_layers , real_data_init_type , &
781                                 landmask , sst , flag_sst , &
782                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
783                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
784                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
785
786      ELSE IF ( ( sf_surface_physics .EQ. LSMSCHEME ) .AND. ( num_soil_layers .GT. 1 ) ) THEN
787         CALL init_soil_depth_2 ( zs , dzs , num_soil_layers )
788         CALL init_soil_2_real ( tsk , tmn , smois , sh2o , tslb , &
789                                 st_input , sm_input , sw_input , landmask , sst , &
790                                 zs , dzs , &
791                                 st_levels_input , sm_levels_input , sw_levels_input , &
792                                 num_soil_layers , num_st_levels_input , num_sm_levels_input , num_sw_levels_input , &
793                                 num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , num_sw_levels_alloc , &
794                                 flag_sst , flag_soil_layers , flag_soil_levels , &
795                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
796                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
797                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
798      ELSE IF ( ( sf_surface_physics .EQ. RUCLSMSCHEME ) .AND. ( num_soil_layers .GT. 1 ) ) THEN
799         CALL init_soil_depth_3 ( zs , dzs , num_soil_layers )
800         CALL init_soil_3_real ( tsk , tmn , smois , tslb , &
801                                 st_input , sm_input , landmask , sst , &
802                                 zs , dzs , &
803                                 st_levels_input , sm_levels_input , &
804                                 num_soil_layers , num_st_levels_input , num_sm_levels_input , &
805                                 num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , &
806                                 flag_sst , flag_soil_layers , flag_soil_levels , &
807                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
808                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
809                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
810      ELSE IF ( ( sf_surface_physics .EQ. PXLSMSCHEME ) .AND. ( num_soil_layers .GT. 1 ) ) THEN
811         CALL init_soil_depth_7 ( zs , dzs , num_soil_layers )
812         CALL init_soil_7_real ( tsk , tmn , smois , sh2o, tslb , &
813                                 st_input , sm_input , sw_input, landmask , sst , &
814                                 zs , dzs , &
815                                 st_levels_input , sm_levels_input , sw_levels_input, &
816                                 num_soil_layers , num_st_levels_input , num_sm_levels_input , num_sw_levels_input , &
817                                 num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , num_sw_levels_alloc , &
818                                 flag_sst , flag_soil_layers , flag_soil_levels , &
819                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
820                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
821                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
822      END IF
823
824   END SUBROUTINE process_soil_real
825
826   SUBROUTINE process_soil_ideal ( xland,xice,vegfra,snow,canwat,  &
827                                   ivgtyp,isltyp,tslb,smois, &
828                                   tsk,tmn,zs,dzs,           &
829                                   num_soil_layers,          &
830                                   sf_surface_physics ,      &
831                                   ids,ide, jds,jde, kds,kde,&
832                                   ims,ime, jms,jme, kms,kme,&
833                                   its,ite, jts,jte, kts,kte )
834
835      IMPLICIT NONE
836
837      INTEGER, INTENT(IN) ::ids,ide, jds,jde, kds,kde,  &
838                            ims,ime, jms,jme, kms,kme,  &
839                            its,ite, jts,jte, kts,kte
840
841      INTEGER, INTENT(IN) :: num_soil_layers , sf_surface_physics
842
843      REAL, DIMENSION( ims:ime, num_soil_layers, jms:jme ) , INTENT(INOUT) :: smois, tslb
844
845      REAL, DIMENSION(num_soil_layers), INTENT(OUT) :: dzs,zs
846
847      REAL, DIMENSION( ims:ime, jms:jme ) , INTENT(INOUT) :: tsk, tmn
848      REAL, DIMENSION( ims:ime, jms:jme ) , INTENT(OUT) :: xland, snow, canwat, xice, vegfra
849      INTEGER, DIMENSION( ims:ime, jms:jme ) , INTENT(OUT) :: ivgtyp, isltyp
850
851      !  Local variables.
852
853      INTEGER :: itf,jtf
854
855      itf=MIN(ite,ide-1)
856      jtf=MIN(jte,jde-1)
857
858      IF      ( ( sf_surface_physics .EQ. SLABSCHEME ) .AND. ( num_soil_layers .GT. 1 ) ) THEN
859         CALL init_soil_depth_1 ( zs , dzs , num_soil_layers )
860         CALL init_soil_1_ideal(tsk,tmn,tslb,xland,                      &
861                                ivgtyp,zs,dzs,num_soil_layers,           &
862                                ids,ide, jds,jde, kds,kde,               &
863                                ims,ime, jms,jme, kms,kme,               &
864                                its,ite, jts,jte, kts,kte                )
865      ELSE IF ( ( sf_surface_physics .EQ. LSMSCHEME ) .AND. ( num_soil_layers .GT. 1 ) ) THEN
866         CALL init_soil_depth_2 ( zs , dzs , num_soil_layers )
867         CALL init_soil_2_ideal ( xland,xice,vegfra,snow,canwat,         &
868                                  ivgtyp,isltyp,tslb,smois,tmn,          &
869                                  num_soil_layers,                       &
870                                  ids,ide, jds,jde, kds,kde,             &
871                                  ims,ime, jms,jme, kms,kme,             &
872                                  its,ite, jts,jte, kts,kte              )
873      ELSE IF ( ( sf_surface_physics .EQ. RUCLSMSCHEME ) .AND. ( num_soil_layers .GT. 1 ) ) THEN
874         CALL init_soil_depth_3 ( zs , dzs , num_soil_layers )
875
876      END IF
877
878   END SUBROUTINE process_soil_ideal
879
880   SUBROUTINE adjust_soil_temp_new ( tmn , sf_surface_physics , tsk , ter ,            &
881                                     toposoil , landmask , st_input , st_levels_input, &
882                                     flag_toposoil , flag_tavgsfc ,                    &
883                                     flag_soil_layers , flag_soil_levels,              &
884                                     num_st_levels_input, num_st_levels_alloc,         &
885                                     ids , ide , jds , jde , kds , kde ,               &
886                                     ims , ime , jms , jme , kms , kme ,               &
887                                     its , ite , jts , jte , kts , kte )
888
889      IMPLICIT NONE
890
891      INTEGER , INTENT(IN) :: ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
892                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
893                              its , ite , jts , jte , kts , kte
894      INTEGER , INTENT(IN) :: num_st_levels_input, num_st_levels_alloc
895
896      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN)    :: ter , toposoil , landmask
897      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: tmn , tsk
898      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_st_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: st_input
899      INTEGER , DIMENSION(1:num_st_levels_input) , INTENT(IN) :: st_levels_input
900
901      INTEGER , INTENT(IN) :: sf_surface_physics , flag_toposoil , flag_tavgsfc
902      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_soil_layers , flag_soil_levels
903 
904      INTEGER :: i , j, k , st_near_sfc
905
906      REAL :: soil_elev_min_val ,  soil_elev_max_val , soil_elev_min_dif , soil_elev_max_dif
907
908      !  Adjust the annual mean temperature as if it is based on from a sea-level elevation
909      !  if the value used is from the actual annula mean data set.  If the input field to
910      !  be used for tmn is one of the first-guess input temp fields, need to do an adjustment
911      !  only on the diff in topo from the model terrain and the first-guess terrain.
912
913       SELECT CASE ( sf_surface_physics )
914
915         CASE (LSMSCHEME)
916            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
917               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
918                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
919                  IF (landmask(i,j) .GT. 0.5 ) THEN
920                     tmn(i,j) = tmn(i,j) - 0.0065 * ter(i,j)
921                  END IF
922               END DO
923            END DO
924
925         CASE (RUCLSMSCHEME)
926            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
927               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
928                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
929                  IF (landmask(i,j) .GT. 0.5 ) THEN
930                     tmn(i,j) = tmn(i,j) - 0.0065 * ter(i,j)
931                  END IF
932               END DO
933            END DO
934
935      END SELECT
936
937
938      !  Do we have a soil field with which to modify soil temperatures?
939
940      IF ( flag_toposoil .EQ. 1 ) THEN
941
942         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
943            DO i = its , MIN(ide-1,ite)
944
945               IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
946               !  Is the toposoil field OK, or is it a subversive soil elevation field.  We can tell
947               !  usually by looking at values.  Anything less than -1000 m (lower than the Dead Sea) is
948               !  bad.  Anything larger than 10 km (taller than Everest) is toast.  Also, anything where
949               !  the difference between the soil elevation and the terrain is greater than 3 km means
950               !  that the soil data is either all zeros or that the data are inconsistent.  Any of these
951               !  three conditions is grievous enough to induce a WRF fatality.  However, if they are at
952               !  a water point, then we can safely ignore them.
953
954               soil_elev_min_val = toposoil(i,j)
955               soil_elev_max_val = toposoil(i,j)
956               soil_elev_min_dif = ter(i,j) - toposoil(i,j)
957               soil_elev_max_dif = ter(i,j) - toposoil(i,j)
958
959               IF      ( ( soil_elev_min_val .LT. -1000 ) .AND. ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) ) THEN
960                  CYCLE
961               ELSE IF ( ( soil_elev_min_val .LT. -1000 ) .AND. ( landmask(i,j) .GT. 0.5 ) ) THEN
962!print *,'no soil temperature elevation adjustment, soil height too small = ',toposoil(i,j)
963cycle
964!                 CALL wrf_error_fatal ( 'TOPOSOIL values have large negative values < -1000 m, unrealistic.' )
965               ENDIF
966
967               IF      ( ( soil_elev_max_val .GT. 10000 ) .AND. ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) ) THEN
968                  CYCLE
969               ELSE IF ( ( soil_elev_max_val .GT. 10000 ) .AND. ( landmask(i,j) .GT. 0.5 ) ) THEN
970print *,'no soil temperature elevation adjustment, soil height too high = ',toposoil(i,j)
971cycle
972                  CALL wrf_error_fatal ( 'TOPOSOIL values have large positive values > 10,000 m , unrealistic.' )
973               ENDIF
974
975               IF      ( ( ( soil_elev_min_dif .LT. -3000 ) .OR. ( soil_elev_max_dif .GT. 3000 ) ) .AND. &
976                           ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) ) THEN
977                  CYCLE
978               ELSE IF ( ( ( soil_elev_min_dif .LT. -3000 ) .OR. ( soil_elev_max_dif .GT. 3000 ) ) .AND. &
979                           ( landmask(i,j) .GT. 0.5 ) ) THEN
980print *,'no soil temperature elevation adjustment, diff of soil height and terrain = ',ter(i,j) - toposoil(i,j)
981cycle
982                  CALL wrf_error_fatal ( 'TOPOSOIL difference with terrain elevation differs by more than 3000 m, unrealistic' )
983               ENDIF
984
985               !  For each of the fields that we would like to modify, check to see if it came in from the SI.
986               !  If so, then use a -6.5 K/km lapse rate (based on the elevation diffs).  We only adjust when we
987               !  are not at a water point.
988
989               IF (landmask(i,j) .GT. 0.5 ) THEN
990                  IF ( sf_surface_physics .EQ. SLABSCHEME ) THEN
991                     st_near_sfc = 0                             ! Check if there is a soil layer above 40 cm
992                     DO k = 1, num_st_levels_input
993                        IF ( st_levels_input(k) .LE. 40 ) THEN
994                           st_near_sfc = 1
995                        END IF
996                     END DO
997                     IF ( ( flag_tavgsfc  == 1 ) .OR. ( st_near_sfc == 1 ) ) THEN
998                        tmn(i,j) = tmn(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
999                     ELSE
1000                        tmn(i,j) = tmn(i,j) - 0.0065 * ter(i,j)
1001                     END IF
1002                  END IF
1003
1004                  tsk(i,j) = tsk(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
1005     
1006                  IF ( flag_soil_layers == 1 ) THEN
1007                     DO k = 2, num_st_levels_input+1
1008                        st_input(i,k,j) = st_input(i,k,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
1009                     END DO
1010                  ELSE
1011                     DO k = 1, num_st_levels_input
1012                        st_input(i,k,j) = st_input(i,k,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
1013                     END DO
1014                  END IF
1015
1016               END IF
1017            END DO
1018         END DO
1019
1020      END IF
1021
1022   END SUBROUTINE adjust_soil_temp_new
1023
1024
1025   SUBROUTINE init_soil_depth_1 ( zs , dzs , num_soil_layers )
1026
1027      IMPLICIT NONE
1028
1029      INTEGER, INTENT(IN) :: num_soil_layers
1030
1031      REAL, DIMENSION(1:num_soil_layers), INTENT(OUT)  ::  zs,dzs
1032
1033      INTEGER                   ::      l
1034
1035      !  Define layers (top layer = 0.01 m).  Double the thicknesses at each step (dzs values).
1036      !  The distance from the ground level to the midpoint of the layer is given by zs.
1037
1038      !    -------   Ground Level   ----------      ||      ||   ||  ||
1039      !                                             ||      ||   ||  || zs(1) = 0.005 m
1040      !    --  --  --  --  --  --  --  --  --       ||      ||   ||  \/
1041      !                                             ||      ||   ||
1042      !    -----------------------------------      ||  ||  ||   \/   dzs(1) = 0.01 m
1043      !                                             ||  ||  ||
1044      !                                             ||  ||  || zs(2) = 0.02
1045      !    --  --  --  --  --  --  --  --  --       ||  ||  \/
1046      !                                             ||  ||
1047      !                                             ||  ||
1048      !    -----------------------------------  ||  ||  \/   dzs(2) = 0.02 m
1049      !                                         ||  ||
1050      !                                         ||  ||
1051      !                                         ||  ||
1052      !                                         ||  || zs(3) = 0.05
1053      !    --  --  --  --  --  --  --  --  --   ||  \/
1054      !                                         ||
1055      !                                         ||
1056      !                                         ||
1057      !                                         ||
1058      !    -----------------------------------  \/   dzs(3) = 0.04 m
1059
1060      IF ( num_soil_layers .NE. 5 ) THEN
1061         PRINT '(A)','Usually, the 5-layer diffusion uses 5 layers.  Change this in the namelist.'
1062         CALL wrf_error_fatal ( '5-layer_diffusion_uses_5_layers' )
1063      END IF
1064
1065      dzs(1)=.01
1066      zs(1)=.5*dzs(1)
1067
1068      DO l=2,num_soil_layers
1069         dzs(l)=2*dzs(l-1)
1070         zs(l)=zs(l-1)+.5*dzs(l-1)+.5*dzs(l)
1071      ENDDO
1072
1073   END SUBROUTINE init_soil_depth_1
1074
1075   SUBROUTINE init_soil_depth_2 ( zs , dzs , num_soil_layers )
1076
1077      IMPLICIT NONE
1078
1079      INTEGER, INTENT(IN) :: num_soil_layers
1080
1081      REAL, DIMENSION(1:num_soil_layers), INTENT(OUT)  ::  zs,dzs
1082
1083      INTEGER                   ::      l
1084
1085      dzs = (/ 0.1 , 0.3 , 0.6 , 1.0 /)
1086
1087      IF ( num_soil_layers .NE. 4 ) THEN
1088         PRINT '(A)','Usually, the LSM uses 4 layers.  Change this in the namelist.'
1089         CALL wrf_error_fatal ( 'LSM_uses_4_layers' )
1090      END IF
1091
1092      zs(1)=.5*dzs(1)
1093
1094      DO l=2,num_soil_layers
1095         zs(l)=zs(l-1)+.5*dzs(l-1)+.5*dzs(l)
1096      ENDDO
1097
1098   END SUBROUTINE init_soil_depth_2
1099
1100   SUBROUTINE init_soil_depth_3 ( zs , dzs , num_soil_layers )
1101
1102      IMPLICIT NONE
1103
1104      INTEGER, INTENT(IN) :: num_soil_layers
1105
1106      REAL, DIMENSION(1:num_soil_layers), INTENT(OUT)  ::  zs,dzs
1107
1108      INTEGER                   ::      l
1109
1110      CHARACTER (LEN=132) :: message
1111
1112! in RUC LSM ZS - soil levels, and DZS - soil layer thicknesses, not used
1113! ZS is specified in the namelist: num_soil_layers = 6 or 9.
1114! Other options with number of levels are possible, but
1115! WRF users should change consistently the namelist entry with the
1116!    ZS array in this subroutine.
1117
1118     IF ( num_soil_layers .EQ. 6) THEN
1119      zs  = (/ 0.00 , 0.05 , 0.20 , 0.40 , 1.60 , 3.00 /)
1120!      dzs = (/ 0.00 , 0.125, 0.175 , 0.70 , 1.30 , 1.40 /)
1121     ELSEIF ( num_soil_layers .EQ. 9) THEN
1122      zs  = (/ 0.00 , 0.05 , 0.20 , 0.40 , 0.60, 1.00, 1.60 , 2.20, 3.00 /)
1123!      dzs = (/ 0.00 , 0.125, 0.175 , 0.70 , 1.30 , 1.40 /)
1124     ENDIF
1125
1126      IF ( num_soil_layers .EQ. 4 .OR. num_soil_layers .EQ. 5 ) THEN
1127         write (message, FMT='(A)') 'The RUC LSM uses 6, 9 or more levels.  Change this in the namelist.'
1128         CALL wrf_error_fatal ( message )
1129      END IF
1130
1131   END SUBROUTINE init_soil_depth_3
1132
1133   SUBROUTINE init_soil_depth_7 ( zs , dzs , num_soil_layers )
1134
1135      IMPLICIT NONE
1136
1137      INTEGER, INTENT(IN) :: num_soil_layers
1138
1139      REAL, DIMENSION(1:num_soil_layers), INTENT(OUT)  ::  zs,dzs
1140
1141      INTEGER                   ::      l
1142
1143      dzs = (/ 0.01 , 0.99 /)
1144
1145      IF ( num_soil_layers .NE. 2 ) THEN
1146         PRINT '(A)','Usually, the PX LSM uses 2 layers.  Change this in the namelist.'
1147         CALL wrf_error_fatal ( 'PXLSM_uses_2_layers' )
1148      END IF
1149
1150      zs(1) = 0.5 * dzs(1)
1151      zs(2) = dzs(1) + 0.5 * dzs(2)
1152
1153   END SUBROUTINE init_soil_depth_7
1154
1155   SUBROUTINE init_soil_1_real ( tsk , tmn , tslb , zs , dzs , &
1156                                 num_soil_layers , real_data_init_type , &
1157                                 landmask , sst , flag_sst , &
1158                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
1159                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
1160                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
1161
1162      IMPLICIT NONE
1163
1164      INTEGER , INTENT(IN) :: num_soil_layers , real_data_init_type , &
1165                              ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
1166                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
1167                              its , ite , jts , jte , kts , kte
1168
1169      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_sst
1170
1171      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: landmask , sst
1172      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: tsk , tmn
1173
1174      REAL , DIMENSION(num_soil_layers) :: zs , dzs
1175
1176      REAL , DIMENSION(ims:ime,num_soil_layers,jms:jme) , INTENT(OUT) :: tslb
1177
1178      INTEGER :: i , j , l
1179
1180      !  Soil temperature is linearly interpolated between the skin temperature (taken to be at a
1181      !  depth of 0.5 cm) and the deep soil, annual temperature (taken to be at a depth of 23 cm).
1182      !  The tslb(i,1,j) is the skin temperature, and the tslb(i,num_soil_layers,j) level is the
1183      !  annual mean temperature.
1184
1185      DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1186         DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1187            IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1188            IF ( landmask(i,j) .GT. 0.5 ) THEN
1189               DO l = 1 , num_soil_layers
1190                  tslb(i,l,j)= ( tsk(i,j) * ( zs(num_soil_layers) - zs(l) )   + &
1191                                 tmn(i,j) * ( zs(              l) - zs(1) ) ) / &
1192                                            ( zs(num_soil_layers) - zs(1) )
1193               END DO
1194            ELSE
1195               IF ( ( real_data_init_type .EQ. 1 ) .AND. ( flag_sst .EQ. 1 ) ) THEN
1196                  DO l = 1 , num_soil_layers
1197                     tslb(i,l,j)= sst(i,j)
1198                  END DO
1199               ELSE
1200                  DO l = 1 , num_soil_layers
1201                     tslb(i,l,j)= tsk(i,j)
1202                  END DO
1203               END IF
1204            END IF
1205         END DO
1206      END DO
1207
1208   END SUBROUTINE init_soil_1_real
1209
1210   SUBROUTINE init_soil_1_ideal(tsk,tmn,tslb,xland,             &
1211                       ivgtyp,ZS,DZS,num_soil_layers,           &
1212                       ids,ide, jds,jde, kds,kde,               &
1213                       ims,ime, jms,jme, kms,kme,               &
1214                       its,ite, jts,jte, kts,kte                )
1215
1216      IMPLICIT NONE
1217
1218      INTEGER, INTENT(IN   )    ::      ids,ide, jds,jde, kds,kde, &
1219                                        ims,ime, jms,jme, kms,kme, &
1220                                        its,ite, jts,jte, kts,kte
1221
1222      INTEGER, INTENT(IN   )    ::      num_soil_layers
1223
1224      REAL, DIMENSION( ims:ime , num_soil_layers , jms:jme ), INTENT(OUT) :: tslb
1225      REAL, DIMENSION( ims:ime , jms:jme ), INTENT(OUT) :: xland
1226      INTEGER, DIMENSION( ims:ime , jms:jme ), INTENT(OUT) :: ivgtyp
1227
1228      REAL, DIMENSION(1:), INTENT(IN) :: dzs,zs
1229
1230      REAL, DIMENSION( ims:ime, jms:jme ) , INTENT(IN) :: tsk, tmn
1231
1232      !  Lcal variables.
1233
1234      INTEGER :: l,j,i,itf,jtf
1235
1236      itf=MIN(ite,ide-1)
1237      jtf=MIN(jte,jde-1)
1238
1239      IF (num_soil_layers.NE.1)THEN
1240         DO j=jts,jtf
1241            IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1242            DO l=1,num_soil_layers
1243               DO i=its,itf
1244                 tslb(i,l,j)=( tsk(i,j)*(zs(num_soil_layers)-zs(l)) + tmn(i,j)*(zs(l)-zs(1)) ) / &
1245                             ( zs(num_soil_layers)-zs(1) )
1246               ENDDO
1247            ENDDO
1248         ENDDO
1249      ENDIF
1250
1251!     DO j=jts,jtf
1252!        DO i=its,itf
1253!          xland(i,j)  = 2
1254!          ivgtyp(i,j) = 7
1255!        ENDDO
1256!     ENDDO
1257
1258   END SUBROUTINE init_soil_1_ideal
1259
1260   SUBROUTINE init_soil_2_real ( tsk , tmn , smois , sh2o , tslb , &
1261                                 st_input , sm_input , sw_input , landmask , sst , &
1262                                 zs , dzs , &
1263                                 st_levels_input , sm_levels_input , sw_levels_input , &
1264                                 num_soil_layers , num_st_levels_input , num_sm_levels_input ,  num_sw_levels_input , &
1265                                 num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc ,  num_sw_levels_alloc , &
1266                                 flag_sst , flag_soil_layers , flag_soil_levels , &
1267                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
1268                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
1269                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
1270
1271      IMPLICIT NONE
1272
1273      INTEGER , INTENT(IN) :: num_soil_layers , &
1274                              num_st_levels_input , num_sm_levels_input , num_sw_levels_input , &
1275                              num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , num_sw_levels_alloc , &
1276                              ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
1277                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
1278                              its , ite , jts , jte , kts , kte
1279
1280      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_sst, flag_soil_layers, flag_soil_levels
1281
1282      INTEGER , DIMENSION(1:num_st_levels_input) , INTENT(INOUT) :: st_levels_input
1283      INTEGER , DIMENSION(1:num_sm_levels_input) , INTENT(INOUT) :: sm_levels_input
1284      INTEGER , DIMENSION(1:num_sw_levels_input) , INTENT(INOUT) :: sw_levels_input
1285
1286      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_st_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: st_input
1287      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_sm_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: sm_input
1288      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_sw_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: sw_input
1289      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: landmask , sst
1290
1291      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: tmn
1292      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: tsk
1293      REAL , DIMENSION(num_soil_layers) :: zs , dzs
1294
1295      REAL , DIMENSION(ims:ime,num_soil_layers,jms:jme) , INTENT(OUT) :: tslb , smois , sh2o
1296
1297      REAL , ALLOCATABLE , DIMENSION(:) :: zhave
1298
1299      INTEGER :: i , j , l , lout , lin , lwant , lhave , num
1300      REAL :: temp
1301      LOGICAL :: found_levels
1302
1303      CHARACTER (LEN=132) :: message
1304
1305      !  Are there any soil temp and moisture levels - ya know, they are mandatory.
1306
1307      num = num_st_levels_input * num_sm_levels_input
1308
1309      IF ( num .GE. 1 ) THEN
1310
1311         !  Ordered levels that we have data for.
1312
1313!tgs add option to initialize from RUCLSM
1314         IF ( flag_soil_levels == 1 ) THEN
1315           write(message, FMT='(A)') ' Assume RUC LSM 6-level input'
1316           CALL wrf_message ( message )
1317           ALLOCATE ( zhave( MAX(num_st_levels_input,num_sm_levels_input,num_sw_levels_input)  ) )
1318         ELSE
1319           write(message, FMT='(A)') ' Assume Noah LSM input'
1320           CALL wrf_message ( message )
1321         ALLOCATE ( zhave( MAX(num_st_levels_input,num_sm_levels_input,num_sw_levels_input) +2) )
1322         END IF
1323
1324
1325         !  Sort the levels for temperature.
1326
1327         outert : DO lout = 1 , num_st_levels_input-1
1328            innert : DO lin = lout+1 , num_st_levels_input
1329               IF ( st_levels_input(lout) .GT. st_levels_input(lin) ) THEN
1330                  temp = st_levels_input(lout)
1331                  st_levels_input(lout) = st_levels_input(lin)
1332                  st_levels_input(lin) = NINT(temp)
1333                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1334                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1335                        IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1336                        temp = st_input(i,lout+1,j)
1337                        st_input(i,lout+1,j) = st_input(i,lin+1,j)
1338                        st_input(i,lin+1,j) = temp
1339                     END DO
1340                  END DO
1341               END IF
1342            END DO innert
1343         END DO outert
1344!tgs add IF
1345      IF ( flag_soil_layers == 1 ) THEN
1346         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1347            DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1348               IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1349               st_input(i,1,j) = tsk(i,j)
1350               st_input(i,num_st_levels_input+2,j) = tmn(i,j)
1351            END DO
1352         END DO
1353      ENDIF
1354
1355         !  Sort the levels for moisture.
1356
1357         outerm: DO lout = 1 , num_sm_levels_input-1
1358            innerm : DO lin = lout+1 , num_sm_levels_input
1359               IF ( sm_levels_input(lout) .GT. sm_levels_input(lin) ) THEN
1360                  temp = sm_levels_input(lout)
1361                  sm_levels_input(lout) = sm_levels_input(lin)
1362                  sm_levels_input(lin) = NINT(temp)
1363                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1364                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1365                        IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1366                        temp = sm_input(i,lout+1,j)
1367                        sm_input(i,lout+1,j) = sm_input(i,lin+1,j)
1368                        sm_input(i,lin+1,j) = temp
1369                     END DO
1370                  END DO
1371               END IF
1372            END DO innerm
1373         END DO outerm
1374!tgs add IF
1375      IF ( flag_soil_layers == 1 ) THEN
1376         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1377            DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1378               IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1379               sm_input(i,1,j) = sm_input(i,2,j)
1380               sm_input(i,num_sm_levels_input+2,j) = sm_input(i,num_sm_levels_input+1,j)
1381            END DO
1382         END DO
1383      ENDIF
1384
1385         !  Sort the levels for liquid moisture.
1386
1387         outerw: DO lout = 1 , num_sw_levels_input-1
1388            innerw : DO lin = lout+1 , num_sw_levels_input
1389               IF ( sw_levels_input(lout) .GT. sw_levels_input(lin) ) THEN
1390                  temp = sw_levels_input(lout)
1391                  sw_levels_input(lout) = sw_levels_input(lin)
1392                  sw_levels_input(lin) = NINT(temp)
1393                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1394                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1395                        IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1396                        temp = sw_input(i,lout+1,j)
1397                        sw_input(i,lout+1,j) = sw_input(i,lin+1,j)
1398                        sw_input(i,lin+1,j) = temp
1399                     END DO
1400                  END DO
1401               END IF
1402            END DO innerw
1403         END DO outerw
1404         IF ( num_sw_levels_input .GT. 1 ) THEN
1405            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1406               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1407                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1408                  sw_input(i,1,j) = sw_input(i,2,j)
1409                  sw_input(i,num_sw_levels_input+2,j) = sw_input(i,num_sw_levels_input+1,j)
1410               END DO
1411            END DO
1412         END IF
1413
1414         found_levels = .TRUE.
1415
1416      ELSE IF ( ( num .LE. 0 ) .AND. (  start_date .NE. current_date ) ) THEN
1417
1418         found_levels = .FALSE.
1419
1420      ELSE
1421         CALL wrf_error_fatal ( &
1422         'No input soil level data (temperature, moisture or liquid, or all are missing). Required for LSM.' )
1423      END IF
1424
1425      !  Is it OK to continue?
1426
1427      IF ( found_levels ) THEN
1428
1429         !tgs:  Here are the levels that we have from the input for temperature.
1430
1431         IF ( flag_soil_levels == 1 ) THEN
1432            DO l = 1 , num_st_levels_input
1433               zhave(l) = st_levels_input(l) / 100.
1434            END DO
1435
1436         !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
1437
1438         z_wantt : DO lwant = 1 , num_soil_layers
1439            z_havet : DO lhave = 1 , num_st_levels_input -1
1440               IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
1441                    ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
1442                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1443                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1444                        IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1445                        tslb(i,lwant,j)= ( st_input(i,lhave,j ) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
1446                                           st_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
1447                                                                   ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
1448                     END DO
1449                  END DO
1450                  EXIT z_havet
1451               END IF
1452            END DO z_havet
1453         END DO z_wantt
1454
1455         ELSE
1456
1457         !  Here are the levels that we have from the input for temperature.  The input levels plus
1458         !  two more: the skin temperature at 0 cm, and the annual mean temperature at 300 cm.
1459
1460         zhave(1) = 0.
1461         DO l = 1 , num_st_levels_input
1462            zhave(l+1) = st_levels_input(l) / 100.
1463         END DO
1464         zhave(num_st_levels_input+2) = 300. / 100.
1465
1466         !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
1467
1468         z_wantt_2: DO lwant = 1 , num_soil_layers
1469            z_havet_2 : DO lhave = 1 , num_st_levels_input +2 -1
1470               IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
1471                    ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
1472                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1473                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1474                        IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1475                        tslb(i,lwant,j)= ( st_input(i,lhave  ,j) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
1476                                           st_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
1477                                                                   ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
1478                     END DO
1479                  END DO
1480                  EXIT z_havet_2
1481               END IF
1482            END DO z_havet_2
1483         END DO z_wantt_2
1484
1485      END IF
1486
1487!tgs:
1488      IF ( flag_soil_levels == 1 ) THEN
1489         DO l = 1 , num_sm_levels_input
1490            zhave(l) = sm_levels_input(l) / 100.
1491         END DO
1492
1493      !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
1494
1495      z_wantm : DO lwant = 1 , num_soil_layers
1496         z_havem : DO lhave = 1 , num_sm_levels_input -1
1497            IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
1498                 ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
1499               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1500                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1501                     IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1502                     smois(i,lwant,j)= ( sm_input(i,lhave,j ) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
1503                                         sm_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
1504                                                                 ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
1505                  END DO
1506               END DO
1507               EXIT z_havem
1508            END IF
1509         END DO z_havem
1510      END DO z_wantm
1511
1512      ELSE
1513         !  Here are the levels that we have from the input for moisture.  The input levels plus
1514         !  two more: a value at 0 cm and one at 300 cm.  The 0 cm value is taken to be identical
1515         !  to the most shallow layer's value.  Similarly, the 300 cm value is taken to be the same
1516         !  as the most deep layer's value.
1517
1518         zhave(1) = 0.
1519         DO l = 1 , num_sm_levels_input
1520            zhave(l+1) = sm_levels_input(l) / 100.
1521         END DO
1522         zhave(num_sm_levels_input+2) = 300. / 100.
1523
1524         !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
1525
1526         z_wantm_2 : DO lwant = 1 , num_soil_layers
1527            z_havem_2 : DO lhave = 1 , num_sm_levels_input +2 -1
1528               IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
1529                    ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
1530                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1531                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1532                        IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1533                        smois(i,lwant,j)= ( sm_input(i,lhave  ,j) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
1534                                            sm_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
1535                                                                    ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
1536                     END DO
1537                  END DO
1538                  EXIT z_havem_2
1539               END IF
1540            END DO z_havem_2
1541         END DO z_wantm_2
1542       ENDIF
1543
1544         !  Any liquid soil moisture to worry about?
1545
1546         IF ( num_sw_levels_input .GT. 1 ) THEN
1547
1548            zhave(1) = 0.
1549            DO l = 1 , num_sw_levels_input
1550               zhave(l+1) = sw_levels_input(l) / 100.
1551            END DO
1552            zhave(num_sw_levels_input+2) = 300. / 100.
1553
1554            !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
1555
1556            z_wantw : DO lwant = 1 , num_soil_layers
1557               z_havew : DO lhave = 1 , num_sw_levels_input +2 -1
1558                  IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
1559                       ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
1560                     DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1561                        DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1562                           IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1563                           sh2o(i,lwant,j)= ( sw_input(i,lhave  ,j) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
1564                                               sw_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
1565                                                                       ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
1566                        END DO
1567                     END DO
1568                     EXIT z_havew
1569                  END IF
1570               END DO z_havew
1571            END DO z_wantw
1572
1573         END IF
1574
1575
1576         !  Over water, put in reasonable values for soil temperature and moisture.  These won't be
1577         !  used, but they will make a more continuous plot.
1578
1579         IF ( flag_sst .EQ. 1 ) THEN
1580            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1581               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1582                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1583                  IF ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) THEN
1584                     DO l = 1 , num_soil_layers
1585                        tslb(i,l,j)= sst(i,j)
1586                        smois(i,l,j)= 1.0
1587                        sh2o (i,l,j)= 1.0
1588                     END DO
1589                  END IF
1590               END DO
1591            END DO
1592         ELSE
1593            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1594               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1595                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1596                  IF ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) THEN
1597                     DO l = 1 , num_soil_layers
1598                        tslb(i,l,j)= tsk(i,j)
1599                        smois(i,l,j)= 1.0
1600                        sh2o (i,l,j)= 1.0
1601                     END DO
1602                  END IF
1603               END DO
1604            END DO
1605         END IF
1606
1607         DEALLOCATE (zhave)
1608
1609      END IF
1610
1611   END SUBROUTINE init_soil_2_real
1612
1613   SUBROUTINE init_soil_2_ideal ( xland,xice,vegfra,snow,canwat,     &
1614                     ivgtyp,isltyp,tslb,smois,tmn,                  &
1615                     num_soil_layers,                               &
1616                     ids,ide, jds,jde, kds,kde,                     &
1617                     ims,ime, jms,jme, kms,kme,                     &
1618                     its,ite, jts,jte, kts,kte                      )
1619
1620      IMPLICIT NONE
1621
1622      INTEGER, INTENT(IN) ::ids,ide, jds,jde, kds,kde,  &
1623                            ims,ime, jms,jme, kms,kme,  &
1624                            its,ite, jts,jte, kts,kte
1625
1626      INTEGER, INTENT(IN) ::num_soil_layers
1627
1628      REAL, DIMENSION( ims:ime, num_soil_layers, jms:jme ) , INTENT(OUT) :: smois, tslb
1629
1630      REAL, DIMENSION( ims:ime, jms:jme ) , INTENT(IN)   :: xland
1631      REAL, DIMENSION( ims:ime, jms:jme ) , INTENT(OUT)  :: snow, canwat, xice, vegfra, tmn
1632
1633      INTEGER, DIMENSION( ims:ime, jms:jme ) , INTENT(OUT) :: ivgtyp, isltyp
1634
1635      INTEGER :: icm,jcm,itf,jtf
1636      INTEGER ::  i,j,l
1637
1638      itf=min0(ite,ide-1)
1639      jtf=min0(jte,jde-1)
1640
1641      icm = ide/2
1642      jcm = jde/2
1643
1644      DO j=jts,jtf
1645         DO l=1,num_soil_layers
1646            DO i=its,itf
1647               IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1648               if (xland(i,j) .lt. 1.5) then
1649               smois(i,1,j)=0.30
1650               smois(i,2,j)=0.30
1651               smois(i,3,j)=0.30
1652               smois(i,4,j)=0.30
1653
1654               tslb(i,1,j)=290.
1655               tslb(i,2,j)=290.
1656               tslb(i,3,j)=290.
1657               tslb(i,4,j)=290.
1658               endif
1659            ENDDO
1660         ENDDO
1661      ENDDO
1662
1663   END SUBROUTINE init_soil_2_ideal
1664
1665   SUBROUTINE init_soil_3_real ( tsk , tmn , smois , tslb , &
1666                                 st_input , sm_input , landmask, sst, &
1667                                 zs , dzs , &
1668                                 st_levels_input , sm_levels_input , &
1669                                 num_soil_layers , num_st_levels_input , num_sm_levels_input ,  &
1670                                 num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , &
1671                                 flag_sst , flag_soil_layers , flag_soil_levels , &
1672                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
1673                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
1674                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
1675
1676      IMPLICIT NONE
1677
1678      INTEGER , INTENT(IN) :: num_soil_layers , &
1679                              num_st_levels_input , num_sm_levels_input , &
1680                              num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , &
1681                              ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
1682                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
1683                              its , ite , jts , jte , kts , kte
1684
1685      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_sst, flag_soil_layers, flag_soil_levels
1686
1687      INTEGER , DIMENSION(1:num_st_levels_input) , INTENT(INOUT) :: st_levels_input
1688      INTEGER , DIMENSION(1:num_sm_levels_input) , INTENT(INOUT) :: sm_levels_input
1689
1690      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_st_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: st_input
1691      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_sm_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: sm_input
1692      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: landmask , sst
1693
1694      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: tmn
1695      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: tsk
1696      REAL , DIMENSION(num_soil_layers) :: zs , dzs
1697
1698      REAL , DIMENSION(ims:ime,num_soil_layers,jms:jme) , INTENT(OUT) :: tslb , smois
1699
1700      REAL , ALLOCATABLE , DIMENSION(:) :: zhave
1701
1702      INTEGER :: i , j , l , lout , lin , lwant , lhave, k
1703      REAL :: temp
1704
1705      CHARACTER (LEN=132) :: message
1706
1707      !  Allocate the soil layer array used for interpolating.
1708
1709      IF ( ( num_st_levels_input .LE. 0 ) .OR. &
1710           ( num_sm_levels_input .LE. 0 ) ) THEN
1711         write (message, FMT='(A)')&
1712'No input soil level data (either temperature or moisture, or both are missing).  Required for RUC LSM.'
1713         CALL wrf_error_fatal ( message )
1714      ELSE
1715         IF ( flag_soil_levels == 1 ) THEN
1716           write(message, FMT='(A)') ' Assume RUC LSM 6-level input'
1717           CALL wrf_message ( message )
1718           ALLOCATE ( zhave( MAX(num_st_levels_input,num_sm_levels_input)  ) )
1719         ELSE
1720           write(message, FMT='(A)') ' Assume non-RUC LSM input'
1721           CALL wrf_message ( message )
1722           ALLOCATE ( zhave( MAX(num_st_levels_input,num_soil_layers)  ) )
1723         END IF
1724      END IF
1725
1726      !  Sort the levels for temperature.
1727
1728      outert : DO lout = 1 , num_st_levels_input-1
1729         innert : DO lin = lout+1 , num_st_levels_input
1730            IF ( st_levels_input(lout) .GT. st_levels_input(lin) ) THEN
1731               temp = st_levels_input(lout)
1732               st_levels_input(lout) = st_levels_input(lin)
1733               st_levels_input(lin) = NINT(temp)
1734               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1735                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1736                     IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1737                     temp = st_input(i,lout,j)
1738                     st_input(i,lout,j) = st_input(i,lin,j)
1739                     st_input(i,lin,j) = temp
1740                  END DO
1741               END DO
1742            END IF
1743         END DO innert
1744      END DO outert
1745
1746      IF ( flag_soil_layers == 1 ) THEN
1747      DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1748         DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1749            IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1750            st_input(i,1,j) = tsk(i,j)
1751            st_input(i,num_st_levels_input+2,j) = tmn(i,j)
1752         END DO
1753      END DO
1754      END IF
1755
1756      !  Sort the levels for moisture.
1757
1758      outerm: DO lout = 1 , num_sm_levels_input-1
1759         innerm : DO lin = lout+1 , num_sm_levels_input
1760            IF ( sm_levels_input(lout) .GT. sm_levels_input(lin) ) THEN
1761               temp = sm_levels_input(lout)
1762               sm_levels_input(lout) = sm_levels_input(lin)
1763               sm_levels_input(lin) = NINT(temp)
1764               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1765                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1766                     IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1767                     temp = sm_input(i,lout,j)
1768                     sm_input(i,lout,j) = sm_input(i,lin,j)
1769                     sm_input(i,lin,j) = temp
1770                  END DO
1771               END DO
1772            END IF
1773         END DO innerm
1774      END DO outerm
1775
1776      IF ( flag_soil_layers == 1 ) THEN
1777      DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1778         DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1779            IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1780            sm_input(i,1,j) = (sm_input(i,2,j)-sm_input(i,3,j))/   &
1781                              (st_levels_input(2)-st_levels_input(1))*st_levels_input(1)+  &
1782                              sm_input(i,2,j)
1783!           sm_input(i,1,j) = sm_input(i,2,j)
1784            sm_input(i,num_sm_levels_input+2,j) = sm_input(i,num_sm_levels_input+1,j)
1785         END DO
1786      END DO
1787      END IF
1788
1789      !  Here are the levels that we have from the input for temperature.
1790
1791      IF ( flag_soil_levels == 1 ) THEN
1792         DO l = 1 , num_st_levels_input
1793            zhave(l) = st_levels_input(l) / 100.
1794         END DO
1795
1796      !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
1797
1798
1799      z_wantt : DO lwant = 1 , num_soil_layers
1800         z_havet : DO lhave = 1 , num_st_levels_input -1
1801            IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
1802                 ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
1803               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1804                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1805                     IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1806                     tslb(i,lwant,j)= ( st_input(i,lhave,j ) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
1807                                        st_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
1808                                                                ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
1809                  END DO
1810               END DO
1811               EXIT z_havet
1812            END IF
1813         END DO z_havet
1814      END DO z_wantt
1815
1816      ELSE
1817
1818         zhave(1) = 0.
1819         DO l = 1 , num_st_levels_input
1820            zhave(l+1) = st_levels_input(l) / 100.
1821         END DO
1822         zhave(num_st_levels_input+2) = 300. / 100.
1823
1824      !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
1825
1826      z_wantt_2 : DO lwant = 1 , num_soil_layers
1827         z_havet_2 : DO lhave = 1 , num_st_levels_input +2
1828            IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
1829                 ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
1830               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1831                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1832                     IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1833                     tslb(i,lwant,j)= ( st_input(i,lhave,j ) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
1834                                        st_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
1835                                                                ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
1836                  END DO
1837               END DO
1838               EXIT z_havet_2
1839            END IF
1840         END DO z_havet_2
1841      END DO z_wantt_2
1842
1843      END IF
1844
1845      !  Here are the levels that we have from the input for moisture.
1846
1847      IF ( flag_soil_levels .EQ. 1 ) THEN
1848         DO l = 1 , num_sm_levels_input
1849            zhave(l) = sm_levels_input(l) / 100.
1850         END DO
1851
1852      !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
1853
1854      z_wantm : DO lwant = 1 , num_soil_layers
1855         z_havem : DO lhave = 1 , num_sm_levels_input -1
1856            IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
1857                 ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
1858               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1859                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1860                     IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1861                     smois(i,lwant,j)= ( sm_input(i,lhave,j ) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
1862                                         sm_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
1863                                                                 ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
1864                  END DO
1865               END DO
1866               EXIT z_havem
1867            END IF
1868         END DO z_havem
1869      END DO z_wantm
1870
1871      ELSE
1872
1873         zhave(1) = 0.
1874         DO l = 1 , num_sm_levels_input
1875            zhave(l+1) = sm_levels_input(l) / 100.
1876         END DO
1877         zhave(num_sm_levels_input+2) = 300. / 100.
1878
1879      z_wantm_2 : DO lwant = 1 , num_soil_layers
1880         z_havem_2 : DO lhave = 1 , num_sm_levels_input +2
1881            IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
1882                 ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
1883               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1884                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1885                     IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1886                     smois(i,lwant,j)= ( sm_input(i,lhave,j ) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
1887                                         sm_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
1888                                                                 ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
1889                  END DO
1890               END DO
1891               EXIT z_havem_2
1892            END IF
1893         END DO z_havem_2
1894      END DO z_wantm_2
1895
1896      END IF
1897      !  Over water, put in reasonable values for soil temperature and moisture.  These won't be
1898      !  used, but they will make a more continuous plot.
1899
1900      IF ( flag_sst .EQ. 1 ) THEN
1901         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1902            DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1903               IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1904               IF ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) THEN
1905                  DO l = 1 , num_soil_layers
1906                     tslb(i,l,j) = sst(i,j)
1907                     tsk(i,j)    = sst(i,j)
1908                     smois(i,l,j)= 1.0
1909                  END DO
1910               END IF
1911            END DO
1912         END DO
1913      ELSE
1914         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1915            DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1916               IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1917               IF ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) THEN
1918                  DO l = 1 , num_soil_layers
1919                     tslb(i,l,j)= tsk(i,j)
1920                     smois(i,l,j)= 1.0
1921                  END DO
1922               END IF
1923            END DO
1924         END DO
1925      END IF
1926
1927      DEALLOCATE (zhave)
1928
1929   END SUBROUTINE init_soil_3_real
1930   SUBROUTINE init_soil_7_real ( tsk , tmn , smois , sh2o , tslb , &
1931                                 st_input , sm_input , sw_input , landmask , sst ,     &
1932                                 zs , dzs ,                                            &
1933                                 st_levels_input , sm_levels_input , sw_levels_input , &
1934                                 num_soil_layers , num_st_levels_input ,               &
1935                                 num_sm_levels_input ,  num_sw_levels_input ,          &
1936                                 num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc ,           &
1937                                 num_sw_levels_alloc ,                                 &
1938                                 flag_sst , flag_soil_layers , flag_soil_levels ,      &
1939                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde ,                   &
1940                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme ,                   &
1941                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
1942
1943      ! for soil temperature and moisture initialization for the PX LSM
1944
1945      IMPLICIT NONE
1946
1947      INTEGER , INTENT(IN) :: num_soil_layers , &
1948                              num_st_levels_input , num_sm_levels_input , num_sw_levels_input , &
1949                              num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , num_sw_levels_alloc , &
1950                              ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
1951                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
1952                              its , ite , jts , jte , kts , kte
1953
1954      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_sst, flag_soil_layers, flag_soil_levels
1955
1956      INTEGER , DIMENSION(1:num_st_levels_input) , INTENT(INOUT) :: st_levels_input
1957      INTEGER , DIMENSION(1:num_sm_levels_input) , INTENT(INOUT) :: sm_levels_input
1958      INTEGER , DIMENSION(1:num_sw_levels_input) , INTENT(INOUT) :: sw_levels_input
1959
1960      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_st_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: st_input
1961      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_sm_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: sm_input
1962      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_sw_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: sw_input
1963      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: landmask , sst
1964
1965      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: tmn
1966      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: tsk
1967      REAL , DIMENSION(num_soil_layers) :: zs , dzs
1968
1969      REAL , DIMENSION(ims:ime,num_soil_layers,jms:jme) , INTENT(OUT) :: tslb , smois , sh2o
1970
1971      REAL , ALLOCATABLE , DIMENSION(:) :: zhave
1972
1973      INTEGER :: i , j , l , lout , lin , lwant , lhave , num
1974      REAL    :: temp
1975      LOGICAL :: found_levels
1976
1977      !  Are there any soil temp and moisture levels - ya know, they are mandatory.
1978
1979      num = num_st_levels_input * num_sm_levels_input
1980
1981      IF ( num .GE. 1 ) THEN
1982
1983         !  Ordered levels that we have data for.
1984
1985         ALLOCATE ( zhave( MAX(num_st_levels_input,num_sm_levels_input,num_sw_levels_input) +2) )
1986
1987         !  Sort the levels for temperature.
1988         outert : DO lout = 1 , num_st_levels_input-1
1989            innert : DO lin = lout+1 , num_st_levels_input
1990               IF ( st_levels_input(lout) .GT. st_levels_input(lin) ) THEN
1991                  temp = st_levels_input(lout)
1992                  st_levels_input(lout) = st_levels_input(lin)
1993                  st_levels_input(lin) = NINT(temp)
1994                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
1995                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
1996                        IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
1997                        temp = st_input(i,lout+1,j)
1998                        st_input(i,lout+1,j) = st_input(i,lin+1,j)
1999                        st_input(i,lin+1,j) = temp
2000                     END DO
2001                  END DO
2002               END IF
2003            END DO innert
2004         END DO outert
2005         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2006            DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2007               IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
2008               st_input(i,1,j) = tsk(i,j)
2009               st_input(i,num_st_levels_input+2,j) = tmn(i,j)
2010            END DO
2011         END DO
2012
2013         !  Sort the levels for moisture.
2014
2015         outerm: DO lout = 1 , num_sm_levels_input-1
2016            innerm : DO lin = lout+1 , num_sm_levels_input
2017              IF ( sm_levels_input(lout) .GT. sm_levels_input(lin) ) THEN
2018                  temp = sm_levels_input(lout)
2019                  sm_levels_input(lout) = sm_levels_input(lin)
2020                  sm_levels_input(lin) = NINT(temp)
2021                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2022                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2023                        IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
2024                        temp = sm_input(i,lout+1,j)
2025                        sm_input(i,lout+1,j) = sm_input(i,lin+1,j)
2026                        sm_input(i,lin+1,j) = temp
2027                     END DO
2028                  END DO
2029               END IF
2030            END DO innerm
2031         END DO outerm
2032         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2033            DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2034               IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
2035               sm_input(i,1,j) = sm_input(i,2,j)
2036               sm_input(i,num_sm_levels_input+2,j) = sm_input(i,num_sm_levels_input+1,j)
2037            END DO
2038         END DO
2039
2040         !  Sort the levels for liquid moisture.
2041
2042         outerw: DO lout = 1 , num_sw_levels_input-1
2043            innerw : DO lin = lout+1 , num_sw_levels_input
2044               IF ( sw_levels_input(lout) .GT. sw_levels_input(lin) ) THEN
2045                  temp = sw_levels_input(lout)
2046                  sw_levels_input(lout) = sw_levels_input(lin)
2047                  sw_levels_input(lin) = NINT(temp)
2048                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2049                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2050                        IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
2051                        temp = sw_input(i,lout+1,j)
2052                        sw_input(i,lout+1,j) = sw_input(i,lin+1,j)
2053                        sw_input(i,lin+1,j) = temp
2054                     END DO
2055                  END DO
2056               END IF
2057            END DO innerw
2058         END DO outerw
2059        IF ( num_sw_levels_input .GT. 1 ) THEN
2060            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2061               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2062                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
2063                  sw_input(i,1,j) = sw_input(i,2,j)
2064                  sw_input(i,num_sw_levels_input+2,j) = sw_input(i,num_sw_levels_input+1,j)
2065               END DO
2066            END DO
2067         END IF
2068
2069         found_levels = .TRUE.
2070
2071      ELSE IF ( ( num .LE. 0 ) .AND. (  start_date .NE. current_date ) ) THEN
2072
2073         found_levels = .FALSE.
2074
2075      ELSE
2076         CALL wrf_error_fatal ( &
2077         'No input soil level data (temperature, moisture or liquid, or all are missing). Required for PX LSM.' )
2078      END IF
2079
2080      !  Is it OK to continue?
2081
2082      IF ( found_levels ) THEN
2083
2084         !  Here are the levels that we have from the input for temperature.  The input levels plus
2085         !  two more: the skin temperature at 0 cm, and the annual mean temperature at 300 cm.
2086
2087         zhave(1) = 0.
2088         DO l = 1 , num_st_levels_input
2089            zhave(l+1) = st_levels_input(l) / 100.
2090        END DO
2091         zhave(num_st_levels_input+2) = 300. / 100.
2092
2093         !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
2094
2095         z_wantt : DO lwant = 1 , num_soil_layers
2096            z_havet : DO lhave = 1 , num_st_levels_input +2 -1
2097               IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
2098                    ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
2099                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2100                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2101                        IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
2102                        tslb(i,lwant,j)= ( st_input(i,lhave  ,j) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
2103                                           st_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
2104                                                                   ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
2105                     END DO
2106                  END DO
2107                  EXIT z_havet
2108               END IF
2109            END DO z_havet
2110         END DO z_wantt
2111
2112         !  Here are the levels that we have from the input for moisture.  The input levels plus
2113         !  two more: a value at 0 cm and one at 300 cm.  The 0 cm value is taken to be identical
2114         !  to the most shallow layer's value.  Similarly, the 300 cm value is taken to be the same
2115         !  as the most deep layer's value.
2116
2117         zhave(1) = 0.
2118         DO l = 1 , num_sm_levels_input
2119            zhave(l+1) = sm_levels_input(l) / 100.
2120         END DO
2121        zhave(num_sm_levels_input+2) = 300. / 100.
2122
2123         !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
2124
2125         z_wantm : DO lwant = 1 , num_soil_layers
2126            z_havem : DO lhave = 1 , num_sm_levels_input +2 -1
2127               IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
2128                    ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
2129                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2130                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2131                        IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
2132                        smois(i,lwant,j)= ( sm_input(i,lhave  ,j) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
2133                                            sm_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
2134                                                                    ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
2135                     END DO
2136                  END DO
2137                  EXIT z_havem
2138               END IF
2139            END DO z_havem
2140         END DO z_wantm
2141
2142         !  Any liquid soil moisture to worry about?
2143
2144         IF ( num_sw_levels_input .GT. 1 ) THEN
2145
2146            zhave(1) = 0.
2147            DO l = 1 , num_sw_levels_input
2148               zhave(l+1) = sw_levels_input(l) / 100.
2149            END DO
2150            zhave(num_sw_levels_input+2) = 300. / 100.
2151
2152          !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
2153
2154            z_wantw : DO lwant = 1 , num_soil_layers
2155               z_havew : DO lhave = 1 , num_sw_levels_input +2 -1
2156                  IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
2157                       ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
2158                     DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2159                        DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2160                           IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
2161                           sh2o(i,lwant,j)= ( sw_input(i,lhave  ,j) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
2162                                               sw_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
2163                                                                       ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
2164                        END DO
2165                     END DO
2166                     EXIT z_havew
2167                  END IF
2168               END DO z_havew
2169            END DO z_wantw
2170
2171         END IF
2172
2173
2174        !  Over water, put in reasonable values for soil temperature and moisture.  These won't be
2175        !  used, but they will make a more continuous plot.
2176
2177     DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2178        DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2179             IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
2180             tslb(i,1,j)= tsk(i,j)
2181             tslb(i,2,j)= tmn(i,j)
2182        END DO
2183     END DO
2184
2185         IF ( flag_sst .EQ. 1 ) THEN
2186            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2187               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2188                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
2189                  IF ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) THEN
2190                     DO l = 1 , num_soil_layers
2191                        tslb(i,l,j)= sst(i,j)
2192                        smois(i,l,j)= 1.0
2193                        sh2o (i,l,j)= 1.0
2194                     END DO
2195                  END IF
2196               END DO
2197            END DO
2198         ELSE
2199            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2200               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2201                  IF ( skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , i , j , em_width , hold_ups ) ) CYCLE
2202                  IF ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) THEN
2203                     DO l = 1 , num_soil_layers
2204                        tslb(i,l,j)= tsk(i,j)
2205                        smois(i,l,j)= 1.0
2206                        sh2o (i,l,j)= 1.0
2207                     END DO
2208                  END IF
2209               END DO
2210            END DO
2211         END IF
2212
2213         DEALLOCATE (zhave)
2214
2215      END IF
2216
2217   END SUBROUTINE init_soil_7_real
2218
2219   SUBROUTINE aggregate_categories_part1  ( landuse_frac , iswater , num_veg_cat , mminlu )
2220      IMPLICIT NONE
2221
2222      INTEGER , INTENT(IN) :: iswater
2223      INTEGER , INTENT(IN) :: num_veg_cat
2224      CHARACTER (LEN=4) , INTENT(IN) :: mminlu
2225      REAL , DIMENSION(1:num_veg_cat) , INTENT(INOUT):: landuse_frac
2226
2227      !  Local variables
2228
2229      INTEGER , PARAMETER :: num_special_bins =  3 ! grass, shrubs, trees; add a new line in the "cib" array if updating this
2230      INTEGER , PARAMETER :: max_cats_per_bin =  8 ! larger than max num of cats inside each of the special bins
2231                                                   ! So, no more than 8 total tree categories that we need to consider.
2232      INTEGER , PARAMETER :: fl               = -1 ! Flag value so that we know this is not a valid category to consider.
2233      INTEGER , DIMENSION ( max_cats_per_bin * num_special_bins ) :: cib_usgs = &
2234      (/  2 ,  3 ,  4 ,  5 ,  6 ,  7 , 10 , fl , & ! grass
2235          8 ,  9 , fl , fl , fl , fl , fl , fl , & ! shrubs
2236         11 , 12 , 13 , 14 , 15 , fl , fl , fl /)  ! trees
2237      INTEGER , DIMENSION ( max_cats_per_bin * num_special_bins ) :: cib_modis = &
2238      (/  9 , 10 , 12 , 14 , fl , fl , fl , fl , & ! grass
2239          6 ,  7 ,  8 , fl , fl , fl , fl , fl , & ! shrubs
2240          1 ,  2 ,  3 ,  4 ,  5 , fl , fl , fl /)  ! trees
2241 
2242      IF      ( mminlu(1:4) .EQ. 'USGS' ) THEN
2243         CALL aggregate_categories_part2  ( landuse_frac , iswater , num_veg_cat , &
2244                                            num_special_bins , max_cats_per_bin , fl , cib_usgs  )
2245      ELSE IF ( mminlu(1:4) .EQ. 'MODI' ) THEN
2246         CALL aggregate_categories_part2  ( landuse_frac , iswater , num_veg_cat , &
2247                                            num_special_bins , max_cats_per_bin , fl , cib_modis )
2248      END IF
2249
2250   END SUBROUTINE aggregate_categories_part1
2251
2252   SUBROUTINE aggregate_categories_part2  ( landuse_frac , iswater , num_veg_cat , &
2253                                            num_special_bins , max_cats_per_bin , fl , cib )
2254      IMPLICIT NONE
2255
2256      INTEGER , INTENT(IN) :: iswater
2257      INTEGER , INTENT(IN) :: num_veg_cat
2258      REAL , DIMENSION(1:num_veg_cat) , INTENT(INOUT):: landuse_frac
2259      INTEGER , INTENT(IN) :: num_special_bins , max_cats_per_bin , fl
2260      INTEGER , DIMENSION ( max_cats_per_bin * num_special_bins ) , INTENT(IN) :: cib
2261
2262      !  Local variables
2263
2264      REAL , DIMENSION(1:num_veg_cat) :: landuse_frac_work ! copy of the input array, allows us to be wreckless
2265      INTEGER , DIMENSION ( max_cats_per_bin , num_special_bins ) :: cats_in_bin
2266      INTEGER :: ib , ic ! indexes for the bin and the category loops
2267      REAL    , DIMENSION ( num_special_bins ) :: bin_max_val , bin_sum ! max category value in this bin, sum of all cats in this bin
2268      INTEGER , DIMENSION ( num_special_bins ) :: bin_max_idx ! index of this maximum category in this bin
2269      INTEGER :: bin_work , bin_orig ! the bin from whence the maximum hails, respectively for the aggregated and the original data
2270      INTEGER :: max_cat_orig , max_cat_work
2271      REAL    :: max_val_orig , max_val_work
2272
2273      !  Find the max in the original.  If it is >= 50%, no need to even be in here.
2274
2275      DO ic = 1 , num_veg_cat
2276         IF ( landuse_frac(ic) .GE. 0.5 ) THEN
2277            RETURN
2278         END IF
2279      END DO
2280
2281      !  Put the categories in the bin into a 2d array.
2282
2283      cats_in_bin = RESHAPE ( cib , (/  max_cats_per_bin , num_special_bins /) )
2284
2285      !  Make a copy of the incoming array so that we can eventually diff our working copy with
2286      !  the original.
2287
2288      landuse_frac_work = landuse_frac
2289
2290      !  Loop over each of the special bins that we know about.  Find the max values and the locations of such.
2291
2292      DO ib = 1 , num_special_bins
2293
2294         !  For this bin, we know about specific categories.  We get the sum of all of those
2295         !  categories that we know about for this bin, and we keep track of which category
2296         !  is dominant.
2297
2298         bin_sum    (ib) =  0
2299         bin_max_val(ib) = fl
2300
2301         cat_loop_accumulate : DO ic = 1 , max_cats_per_bin
2302           
2303            !  Have we run out of valid categories in this bin?  For example, we would not necessarily have
2304            !  the same number of tree categories as there are grass categories.
2305     
2306            IF      ( cats_in_bin(ic,ib) .EQ. fl ) THEN
2307               EXIT cat_loop_accumulate
2308            END IF
2309
2310            bin_sum(ib) = bin_sum(ib) + landuse_frac(cats_in_bin(ic,ib))
2311
2312            IF ( landuse_frac(cats_in_bin(ic,ib)) .GT. bin_max_val(ib) ) THEN
2313               bin_max_val(ib) = landuse_frac(cats_in_bin(ic,ib))
2314               bin_max_idx(ib) = cats_in_bin(ic,ib)
2315            END IF
2316
2317         END DO cat_loop_accumulate
2318
2319         cat_loop_assign : DO ic = 1 , max_cats_per_bin
2320           
2321            !  Plow through each cat in the bin.  If we find the dominant one, he gets the total sum.  If we land on
2322            !  the other guys in the bin, they get set back to zero to maintain the original aggregate influence.
2323     
2324            IF      ( cats_in_bin(ic,ib) .EQ. fl ) THEN
2325               EXIT cat_loop_assign
2326            ELSE IF ( cats_in_bin(ic,ib) .EQ. bin_max_idx(ib) ) THEN
2327               landuse_frac_work(cats_in_bin(ic,ib)) = bin_sum(ib)
2328            ELSE
2329               landuse_frac_work(cats_in_bin(ic,ib)) = 0
2330            END IF
2331
2332         END DO cat_loop_assign
2333
2334      END DO
2335
2336      !  Now we loop through the categorical data, and get the max+location for the original input data and the
2337      !  modified work data.  Water is not allowed to be a "max" category unless it is greater than 50%.  We hit
2338      !  that test up at the top already, so we can toss out water willy nilly here.
2339
2340      max_cat_orig = fl
2341      max_val_orig =  0
2342      max_cat_work = fl
2343      max_val_work =  0
2344
2345      DO ic = 1 , num_veg_cat
2346         IF ( ic .EQ. iswater ) THEN
2347            CYCLE
2348         END IF
2349         IF ( landuse_frac(ic) .GT. max_val_orig ) THEN
2350            max_val_orig = landuse_frac(ic)
2351            max_cat_orig = ic
2352         END IF
2353         IF ( landuse_frac_work(ic) .GT. max_val_work ) THEN
2354            max_val_work = landuse_frac_work(ic)
2355            max_cat_work = ic
2356         END IF
2357      END DO
2358
2359      !  Find the bin for the maximimum value of the original data.
2360
2361      bin_orig = -1
2362      bin_loop_orig : DO ib = 1 , num_special_bins
2363         cat_loop_orig : DO ic = 1 , max_cats_per_bin
2364            IF      ( cats_in_bin(ic,ib) .EQ. fl           ) THEN
2365               EXIT cat_loop_orig
2366            ELSE IF ( cats_in_bin(ic,ib) .EQ. max_cat_orig ) THEN
2367               bin_orig = ib
2368               EXIT bin_loop_orig
2369            END IF
2370         END DO cat_loop_orig
2371      END DO bin_loop_orig
2372
2373      !  Find the bin for the maximimum value of the aggregated data.
2374
2375      bin_work = -1
2376      bin_loop_work : DO ib = 1 , num_special_bins
2377         cat_loop_work : DO ic = 1 , max_cats_per_bin
2378            IF      ( cats_in_bin(ic,ib) .EQ. fl           ) THEN
2379               EXIT cat_loop_work
2380            ELSE IF ( cats_in_bin(ic,ib) .EQ. max_cat_work ) THEN
2381               bin_work = ib
2382               EXIT bin_loop_work
2383            END IF
2384         END DO cat_loop_work
2385      END DO bin_loop_work
2386
2387      !  So the big question is, did the aggregation change the bin?  If the aggregation does not change the resulting
2388      !  bin, then we leave everything alone.  However, if there would be a change in the eventual bin chosen by
2389      !  the simple dominant-category method, then we become pro-active interventionists and rectify this heinous
2390      !  injustice foisted upon the lowly flora.
2391
2392      IF ( bin_work .EQ. bin_orig ) THEN
2393         !  No op, we do nothing.
2394      ELSE
2395         DO ic = 1 , max_cats_per_bin
2396            landuse_frac(cats_in_bin(ic,bin_work)) = landuse_frac_work(cats_in_bin(ic,bin_work))
2397         END DO
2398      END IF
2399           
2400   END SUBROUTINE aggregate_categories_part2
2401
2402END MODULE module_soil_pre
2403
2404FUNCTION skip_middle_points_t ( ids , ide , jds , jde , &
2405                                i_in , j_in , width ,   &
2406                                subtleties_exist )      &
2407                       RESULT ( skip_it )
2408 
2409   IMPLICIT NONE
2410
2411   INTEGER , INTENT(IN) :: ids , ide , jds , jde
2412   INTEGER , INTENT(IN) :: i_in , j_in , width
2413   LOGICAL , INTENT(IN) :: subtleties_exist
2414   
2415   LOGICAL              :: skip_it
2416
2417   INTEGER , PARAMETER :: slop = 0
2418
2419   IF ( subtleties_exist ) THEN
2420      skip_it = .FALSE.
2421   ELSE
2422      IF ( ( i_in .GE. ids+width+slop ) .AND. ( i_in .LE. ide-1-width-slop )   .AND. &
2423           ( j_in .GE. jds+width+slop ) .AND. ( j_in .LE. jde-1-width-slop ) ) THEN
2424         skip_it = .TRUE.
2425      ELSE
2426         skip_it = .FALSE.
2427      END IF
2428   END IF
2429
2430END FUNCTION skip_middle_points_t
2431
2432#else
2433
2434MODULE module_soil_pre
2435
2436   USE module_date_time
2437   USE module_state_description
2438
2439CONTAINS
2440
2441   SUBROUTINE process_percent_cat_new ( landmask ,  &
2442                                landuse_frac , soil_top_cat , soil_bot_cat , &
2443                                isltyp , ivgtyp , &
2444                                num_veg_cat , num_soil_top_cat , num_soil_bot_cat , &
2445                                ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
2446                                ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
2447                                its , ite , jts , jte , kts , kte , &
2448                                iswater )
2449
2450      IMPLICIT NONE
2451
2452      INTEGER , INTENT(IN) :: ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
2453                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
2454                              its , ite , jts , jte , kts , kte , &
2455                              iswater
2456      INTEGER , INTENT(IN) :: num_veg_cat , num_soil_top_cat , num_soil_bot_cat
2457      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_veg_cat,jms:jme) , INTENT(INOUT):: landuse_frac
2458      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_soil_top_cat,jms:jme) , INTENT(IN):: soil_top_cat
2459      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_soil_bot_cat,jms:jme) , INTENT(IN):: soil_bot_cat
2460      INTEGER , DIMENSION(ims:ime,jms:jme), INTENT(OUT) :: isltyp , ivgtyp
2461      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: landmask
2462
2463      INTEGER :: i , j , l , ll, dominant_index
2464      REAL :: dominant_value
2465
2466#ifdef WRF_CHEM
2467!      REAL :: lwthresh = .99
2468      REAL :: lwthresh = .50
2469#else
2470      REAL :: lwthresh = .50
2471#endif
2472
2473      INTEGER , PARAMETER :: iswater_soil = 14
2474      INTEGER :: iforce
2475      CHARACTER (LEN=1024) :: message
2476
2477      !  Sanity check on the 50/50 points
2478
2479      DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2480         DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2481            dominant_value = landuse_frac(i,iswater,j)
2482            IF ( dominant_value .EQ. lwthresh ) THEN
2483               DO l = 1 , num_veg_cat
2484                  IF ( l .EQ. iswater ) CYCLE
2485                  IF ( landuse_frac(i,l,j) .EQ. lwthresh ) THEN
2486                write(message, FMT='(I4,I4,A,I4,A,F12.4)') i,j,' water and category ',l,' both at 50%, landmask is ',landmask(i,j)
2487                call wrf_message ( message )
2488                     landuse_frac(i,l,j) = lwthresh - .01
2489                     landuse_frac(i,iswater,j) = 1. - (lwthresh + 0.01)
2490                  END IF
2491               END DO
2492            END IF
2493         END DO
2494      END DO
2495
2496      !  Compute the dominant VEGETATION INDEX.
2497
2498      DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2499         DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2500            dominant_value = landuse_frac(i,1,j)
2501            dominant_index = 1
2502            DO l = 2 , num_veg_cat
2503               IF        ( l .EQ. iswater ) THEN
2504                  ! wait a bit
2505               ELSE IF ( ( l .NE. iswater ) .AND. ( landuse_frac(i,l,j) .GT. dominant_value ) ) THEN
2506                  dominant_value = landuse_frac(i,l,j)
2507                  dominant_index = l
2508               END IF
2509            END DO
2510            IF ( landuse_frac(i,iswater,j) .GT. lwthresh ) THEN
2511               dominant_value = landuse_frac(i,iswater,j)
2512               dominant_index = iswater
2513#if 0
2514si needs to beef up consistency checks before we can use this part
2515            ELSE IF ( ( landuse_frac(i,iswater,j) .EQ. lwthresh) .AND. &
2516                      ( dominant_value .EQ. lwthresh) ) THEN
2517               ! no op
2518#else
2519ELSEIF((landuse_frac(i,iswater,j).EQ.lwthresh).AND.(dominant_value.EQ.lwthresh).and.(dominant_index.LT.iswater))THEN
2520write(message,*)'temporary SI landmask fix'
2521call wrf_message(trim(message))
2522! no op
2523ELSEIF((landuse_frac(i,iswater,j).EQ.lwthresh).AND.(dominant_value.EQ.lwthresh).and.(dominant_index.GT.iswater))THEN
2524write(message,*)'temporary SI landmask fix'
2525call wrf_message(trim(message))
2526dominant_value = landuse_frac(i,iswater,j)
2527dominant_index = iswater
2528#endif
2529            ELSE IF ( ( landuse_frac(i,iswater,j) .EQ. lwthresh ) .AND. &
2530                      ( dominant_value .LT. lwthresh ) ) THEN
2531               dominant_value = landuse_frac(i,iswater,j)
2532               dominant_index = iswater
2533            END IF
2534            IF      ( dominant_index .EQ. iswater ) THEN
2535if(landmask(i,j).gt.lwthresh) then
2536write(message,*) 'changing to water at point ',i,j
2537call wrf_message(trim(message))
2538write(message,*)  nint(landuse_frac(i,:,j)*100)
2539call wrf_message(trim(message))
2540endif
2541               landmask(i,j) = 0
2542            ELSE IF ( dominant_index .NE. iswater ) THEN
2543if(landmask(i,j).lt.lwthresh) then
2544write(message,*) 'changing to land at point ',i,j
2545call wrf_message(trim(message))
2546write(message,*) nint(landuse_frac(i,:,j)*100)
2547call wrf_message(trim(message))
2548endif
2549               landmask(i,j) = 1
2550            END IF
2551            ivgtyp(i,j) = dominant_index
2552         END DO
2553      END DO
2554
2555      !  Compute the dominant SOIL TEXTURE INDEX, TOP.
2556
2557      iforce = 0
2558      DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2559         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2560            dominant_value = soil_top_cat(i,1,j)
2561            dominant_index = 1
2562            IF ( landmask(i,j) .GT. lwthresh ) THEN
2563               DO l = 2 , num_soil_top_cat
2564                  IF ( ( l .NE. iswater_soil ) .AND. ( soil_top_cat(i,l,j) .GT. dominant_value ) ) THEN
2565                     dominant_value = soil_top_cat(i,l,j)
2566                     dominant_index = l
2567                  END IF
2568               END DO
2569               IF ( dominant_value .LT. 0.01 ) THEN
2570                  iforce = iforce + 1
2571                  WRITE ( message , FMT = '(A,I4,I4)' ) &
2572                  'based on landuse, changing soil to land at point ',i,j
2573                  CALL wrf_debug(1,message)
2574!atec             WRITE ( message , FMT = '(16(i3,1x))' ) &
2575!atec             1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10,11,12, 13, 14, 15, 16
2576!atec             CALL wrf_debug(1,message)
2577!atec             WRITE ( message , FMT = '(16(i3,1x))' ) &
2578!atec             nint(soil_top_cat(i,:,j)*100)
2579!atec             CALL wrf_debug(1,message)
2580                  dominant_index = 8
2581               END IF
2582            ELSE
2583               dominant_index = iswater_soil
2584            END IF
2585            isltyp(i,j) = dominant_index
2586         END DO
2587      END DO
2588
2589if(iforce.ne.0)then
2590WRITE(message,FMT='(A,I4,A,I6)' ) &
2591'forcing artificial silty clay loam at ',iforce,' points, out of ',&
2592(MIN(ide-1,ite)-its+1)*(MIN(jde-1,jte)-jts+1)
2593CALL wrf_debug(0,message)
2594endif
2595
2596   END SUBROUTINE process_percent_cat_new
2597
2598   SUBROUTINE process_soil_real ( tsk , tmn , &
2599                                landmask , sst , &
2600                                st_input , sm_input , sw_input , st_levels_input , sm_levels_input , sw_levels_input , &
2601                                zs , dzs , tslb , smois , sh2o , &
2602                                flag_sst , flag_soilt000, flag_soilm000, &
2603                                ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
2604                                ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
2605                                its , ite , jts , jte , kts , kte , &
2606                                sf_surface_physics , num_soil_layers , real_data_init_type , &
2607                                num_st_levels_input , num_sm_levels_input , num_sw_levels_input , &
2608                                num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , num_sw_levels_alloc )
2609
2610      IMPLICIT NONE
2611
2612      INTEGER , INTENT(IN) :: ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
2613                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
2614                              its , ite , jts , jte , kts , kte , &
2615                              sf_surface_physics , num_soil_layers , real_data_init_type , &
2616                              num_st_levels_input , num_sm_levels_input , num_sw_levels_input , &
2617                              num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , num_sw_levels_alloc
2618
2619      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_sst, flag_soilt000, flag_soilm000
2620
2621      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: landmask , sst
2622
2623      INTEGER , DIMENSION(1:num_st_levels_input) , INTENT(INOUT) :: st_levels_input
2624      INTEGER , DIMENSION(1:num_sm_levels_input) , INTENT(INOUT) :: sm_levels_input
2625      INTEGER , DIMENSION(1:num_sw_levels_input) , INTENT(INOUT) :: sw_levels_input
2626      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_st_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: st_input
2627      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_sm_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: sm_input
2628      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_sw_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: sw_input
2629
2630      REAL, DIMENSION(1:num_soil_layers), INTENT(OUT)  ::  zs,dzs
2631      REAL , DIMENSION(ims:ime,num_soil_layers,jms:jme) , INTENT(OUT) :: tslb , smois , sh2o
2632      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: tmn
2633      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: tsk
2634
2635      INTEGER :: i , j , l , dominant_index , num_soil_cat , num_veg_cat
2636      REAL :: dominant_value
2637
2638      !  Initialize the soil depth, and the soil temperature and moisture.
2639
2640      IF      ( ( sf_surface_physics .EQ. SLABSCHEME ) .AND. ( num_soil_layers .GT. 1 ) ) THEN
2641         CALL init_soil_depth_1 ( zs , dzs , num_soil_layers )
2642         CALL init_soil_1_real ( tsk , tmn , tslb , zs , dzs , num_soil_layers , real_data_init_type , &
2643                                 landmask , sst , flag_sst , &
2644                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
2645                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
2646                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
2647
2648      ELSE IF ( ( sf_surface_physics .EQ. LSMSCHEME .or. sf_surface_physics .eq. 88 ) .AND. &
2649                ( num_soil_layers .GT. 1 ) ) THEN
2650         CALL init_soil_depth_2 ( zs , dzs , num_soil_layers )
2651         CALL init_soil_2_real ( tsk , tmn , smois , sh2o , tslb , &
2652                                 st_input , sm_input , sw_input , landmask , sst , &
2653                                 zs , dzs , &
2654                                 st_levels_input , sm_levels_input , sw_levels_input , &
2655                                 num_soil_layers , num_st_levels_input , num_sm_levels_input , num_sw_levels_input , &
2656                                 num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , num_sw_levels_alloc , &
2657                                 flag_sst , flag_soilt000 , flag_soilm000 , &
2658                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
2659                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
2660                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
2661!        CALL init_soil_old ( tsk , tmn , &
2662!                             smois , tslb , zs , dzs , num_soil_layers , &
2663!                             st000010_input , st010040_input , st040100_input , st100200_input , &
2664!                             st010200_input , &
2665!                             sm000010_input , sm010040_input , sm040100_input , sm100200_input , &
2666!                             sm010200_input , &
2667!                             landmask_input , sst_input , &
2668!                             ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
2669!                             ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
2670!                             its , ite , jts , jte , kts , kte )
2671      ELSE IF ( ( sf_surface_physics .EQ. RUCLSMSCHEME ) .AND. ( num_soil_layers .GT. 1 ) ) THEN
2672         CALL init_soil_depth_3 ( zs , dzs , num_soil_layers )
2673         CALL init_soil_3_real ( tsk , tmn , smois , tslb , &
2674                                 st_input , sm_input , landmask , sst , &
2675                                 zs , dzs , &
2676                                 st_levels_input , sm_levels_input , &
2677                                 num_soil_layers , num_st_levels_input , num_sm_levels_input , &
2678                                 num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , &
2679                                 flag_sst , flag_soilt000 , flag_soilm000 , &
2680                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
2681                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
2682                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
2683      END IF
2684
2685   END SUBROUTINE process_soil_real
2686
2687   SUBROUTINE process_soil_ideal ( xland,xice,vegfra,snow,canwat,  &
2688                                   ivgtyp,isltyp,tslb,smois, &
2689                                   tsk,tmn,zs,dzs,           &
2690                                   num_soil_layers,          &
2691                                   sf_surface_physics ,      &
2692                                   ids,ide, jds,jde, kds,kde,&
2693                                   ims,ime, jms,jme, kms,kme,&
2694                                   its,ite, jts,jte, kts,kte )
2695
2696      IMPLICIT NONE
2697
2698      INTEGER, INTENT(IN) ::ids,ide, jds,jde, kds,kde,  &
2699                            ims,ime, jms,jme, kms,kme,  &
2700                            its,ite, jts,jte, kts,kte
2701
2702      INTEGER, INTENT(IN) :: num_soil_layers , sf_surface_physics
2703
2704      REAL, DIMENSION( ims:ime, num_soil_layers, jms:jme ) , INTENT(INOUT) :: smois, tslb
2705
2706      REAL, DIMENSION(num_soil_layers), INTENT(OUT) :: dzs,zs
2707
2708      REAL, DIMENSION( ims:ime, jms:jme ) , INTENT(INOUT) :: tsk, tmn
2709      REAL, DIMENSION( ims:ime, jms:jme ) , INTENT(OUT) :: xland, snow, canwat, xice, vegfra
2710      INTEGER, DIMENSION( ims:ime, jms:jme ) , INTENT(OUT) :: ivgtyp, isltyp
2711
2712      !  Local variables.
2713
2714      INTEGER :: itf,jtf
2715
2716      itf=MIN(ite,ide-1)
2717      jtf=MIN(jte,jde-1)
2718
2719      IF      ( ( sf_surface_physics .EQ. SLABSCHEME ) .AND. ( num_soil_layers .GT. 1 ) ) THEN
2720         CALL init_soil_depth_1 ( zs , dzs , num_soil_layers )
2721         CALL init_soil_1_ideal(tsk,tmn,tslb,xland,                      &
2722                                ivgtyp,zs,dzs,num_soil_layers,           &
2723                                ids,ide, jds,jde, kds,kde,               &
2724                                ims,ime, jms,jme, kms,kme,               &
2725                                its,ite, jts,jte, kts,kte                )
2726      ELSE IF ( ( sf_surface_physics .EQ. LSMSCHEME ) .AND. ( num_soil_layers .GT. 1 ) ) THEN
2727         CALL init_soil_depth_2 ( zs , dzs , num_soil_layers )
2728         CALL init_soil_2_ideal ( xland,xice,vegfra,snow,canwat,         &
2729                                  ivgtyp,isltyp,tslb,smois,tmn,          &
2730                                  num_soil_layers,                       &
2731                                  ids,ide, jds,jde, kds,kde,             &
2732                                  ims,ime, jms,jme, kms,kme,             &
2733                                  its,ite, jts,jte, kts,kte              )
2734      ELSE IF ( ( sf_surface_physics .EQ. RUCLSMSCHEME ) .AND. ( num_soil_layers .GT. 1 ) ) THEN
2735         CALL init_soil_depth_3 ( zs , dzs , num_soil_layers )
2736
2737      END IF
2738
2739   END SUBROUTINE process_soil_ideal
2740
2741   SUBROUTINE adjust_soil_temp_new ( tmn , sf_surface_physics , &
2742                                 tsk , ter , toposoil , landmask , flag_toposoil , &
2743                                      st000010 ,      st010040 ,      st040100 ,      st100200 ,      st010200 , &
2744                                 flag_st000010 , flag_st010040 , flag_st040100 , flag_st100200 , flag_st010200 , &
2745                                      soilt000 ,      soilt005 ,      soilt020 ,      soilt040 ,      soilt160 ,      soilt300 , &
2746                                 flag_soilt000 , flag_soilt005 , flag_soilt020 , flag_soilt040 , flag_soilt160 , flag_soilt300 , &
2747                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
2748                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
2749                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
2750
2751      IMPLICIT NONE
2752
2753      INTEGER , INTENT(IN) :: ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
2754                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
2755                              its , ite , jts , jte , kts , kte
2756
2757      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN)    :: ter , toposoil , landmask
2758      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: tmn , tsk
2759      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: st000010 , st010040 , st040100 , st100200 , st010200
2760      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: soilt000 , soilt005 , soilt020 , soilt040 , soilt160 , soilt300
2761
2762      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_st000010 , flag_st010040 , flag_st040100 , flag_st100200 , flag_st010200
2763      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_soilt000 , flag_soilt005 , flag_soilt020 , flag_soilt040 , flag_soilt160 , flag_soilt300
2764      INTEGER , INTENT(IN) :: sf_surface_physics , flag_toposoil
2765
2766      INTEGER :: i , j
2767
2768      REAL :: soil_elev_min_val ,  soil_elev_max_val , soil_elev_min_dif , soil_elev_max_dif
2769
2770      !  Do we have a soil field with which to modify soil temperatures?
2771
2772      IF ( flag_toposoil .EQ. 1 ) THEN
2773
2774         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
2775            DO i = its , MIN(ide-1,ite)
2776
2777               !  Is the toposoil field OK, or is it a subversive soil elevation field.  We can tell
2778               !  usually by looking at values.  Anything less than -1000 m (lower than the Dead Sea) is
2779               !  bad.  Anything larger than 10 km (taller than Everest) is toast.  Also, anything where
2780               !  the difference between the soil elevation and the terrain is greater than 3 km means
2781               !  that the soil data is either all zeros or that the data are inconsistent.  Any of these
2782               !  three conditions is grievous enough to induce a WRF fatality.  However, if they are at
2783               !  a water point, then we can safely ignore them.
2784
2785               soil_elev_min_val = toposoil(i,j)
2786               soil_elev_max_val = toposoil(i,j)
2787               soil_elev_min_dif = ter(i,j) - toposoil(i,j)
2788               soil_elev_max_dif = ter(i,j) - toposoil(i,j)
2789
2790               IF      ( ( soil_elev_min_val .LT. -1000 ) .AND. ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) ) THEN
2791                  CYCLE
2792               ELSE IF ( ( soil_elev_min_val .LT. -1000 ) .AND. ( landmask(i,j) .GT. 0.5 ) ) THEN
2793!print *,'no soil temperature elevation adjustment, soil height too small = ',toposoil(i,j)
2794cycle
2795!                 CALL wrf_error_fatal ( 'TOPOSOIL values have large negative values < -1000 m, unrealistic.' )
2796               ENDIF
2797
2798               IF      ( ( soil_elev_max_val .GT. 10000 ) .AND. ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) ) THEN
2799                  CYCLE
2800               ELSE IF ( ( soil_elev_max_val .GT. 10000 ) .AND. ( landmask(i,j) .GT. 0.5 ) ) THEN
2801print *,'no soil temperature elevation adjustment, soil height too high = ',toposoil(i,j)
2802cycle
2803                  CALL wrf_error_fatal ( 'TOPOSOIL values have large positive values > 10,000 m , unrealistic.' )
2804               ENDIF
2805
2806               IF      ( ( ( soil_elev_min_dif .LT. -3000 ) .OR. ( soil_elev_max_dif .GT. 3000 ) ) .AND. &
2807                           ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) ) THEN
2808                  CYCLE
2809               ELSE IF ( ( ( soil_elev_min_dif .LT. -3000 ) .OR. ( soil_elev_max_dif .GT. 3000 ) ) .AND. &
2810                           ( landmask(i,j) .GT. 0.5 ) ) THEN
2811print *,'no soil temperature elevation adjustment, diff of soil height and terrain = ',ter(i,j) - toposoil(i,j)
2812cycle
2813                  CALL wrf_error_fatal ( 'TOPOSOIL difference with terrain elevation differs by more than 3000 m, unrealistic' )
2814               ENDIF
2815
2816               !  For each of the fields that we would like to modify, check to see if it came in from the SI.
2817               !  If so, then use a -6.5 K/km lapse rate (based on the elevation diffs).  We only adjust when we
2818               !  are not at a water point.
2819
2820               IF (landmask(i,j) .GT. 0.5 ) THEN
2821
2822                  IF ( sf_surface_physics .EQ. SLABSCHEME .OR. sf_surface_physics .EQ. PXLSMSCHEME ) THEN
2823                     tmn(i,j) = tmn(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
2824                  END IF
2825
2826                  tsk(i,j) = tsk(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
2827
2828                  IF ( flag_st000010 .EQ. 1 ) THEN
2829                     st000010(i,j) = st000010(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
2830                  END IF
2831                  IF ( flag_st010040 .EQ. 1 ) THEN
2832                     st010040(i,j) = st010040(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
2833                  END IF
2834                  IF ( flag_st040100 .EQ. 1 ) THEN
2835                     st040100(i,j) = st040100(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
2836                  END IF
2837                  IF ( flag_st100200 .EQ. 1 ) THEN
2838                     st100200(i,j) = st100200(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
2839                  END IF
2840                  IF ( flag_st010200 .EQ. 1 ) THEN
2841                     st010200(i,j) = st010200(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
2842                  END IF
2843
2844                  IF ( flag_soilt000 .EQ. 1 ) THEN
2845                     soilt000(i,j) = soilt000(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
2846                  END IF
2847                  IF ( flag_soilt005 .EQ. 1 ) THEN
2848                     soilt005(i,j) = soilt005(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
2849                  END IF
2850                  IF ( flag_soilt020 .EQ. 1 ) THEN
2851                     soilt020(i,j) = soilt020(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
2852                  END IF
2853                  IF ( flag_soilt040 .EQ. 1 ) THEN
2854                     soilt040(i,j) = soilt040(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
2855                  END IF
2856                  IF ( flag_soilt160 .EQ. 1 ) THEN
2857                     soilt160(i,j) = soilt160(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
2858                  END IF
2859                  IF ( flag_soilt300 .EQ. 1 ) THEN
2860                     soilt300(i,j) = soilt300(i,j) - 0.0065 * ( ter(i,j) - toposoil(i,j) )
2861                  END IF
2862
2863               END IF
2864            END DO
2865         END DO
2866
2867      END IF
2868
2869   END SUBROUTINE adjust_soil_temp_new
2870
2871
2872   SUBROUTINE init_soil_depth_1 ( zs , dzs , num_soil_layers )
2873
2874      IMPLICIT NONE
2875
2876      INTEGER, INTENT(IN) :: num_soil_layers
2877
2878      REAL, DIMENSION(1:num_soil_layers), INTENT(OUT)  ::  zs,dzs
2879
2880      INTEGER                   ::      l
2881
2882      CHARACTER (LEN=132) :: message
2883
2884      !  Define layers (top layer = 0.01 m).  Double the thicknesses at each step (dzs values).
2885      !  The distance from the ground level to the midpoint of the layer is given by zs.
2886
2887      !    -------   Ground Level   ----------      ||      ||   ||  ||
2888      !                                             ||      ||   ||  || zs(1) = 0.005 m
2889      !    --  --  --  --  --  --  --  --  --       ||      ||   ||  \/
2890      !                                             ||      ||   ||
2891      !    -----------------------------------      ||  ||  ||   \/   dzs(1) = 0.01 m
2892      !                                             ||  ||  ||
2893      !                                             ||  ||  || zs(2) = 0.02
2894      !    --  --  --  --  --  --  --  --  --       ||  ||  \/
2895      !                                             ||  ||
2896      !                                             ||  ||
2897      !    -----------------------------------  ||  ||  \/   dzs(2) = 0.02 m
2898      !                                         ||  ||
2899      !                                         ||  ||
2900      !                                         ||  ||
2901      !                                         ||  || zs(3) = 0.05
2902      !    --  --  --  --  --  --  --  --  --   ||  \/
2903      !                                         ||
2904      !                                         ||
2905      !                                         ||
2906      !                                         ||
2907      !    -----------------------------------  \/   dzs(3) = 0.04 m
2908
2909      IF ( num_soil_layers .NE. 5 ) THEN
2910         write(message,FMT= '(A)') 'Usually, the 5-layer diffusion uses 5 layers.  Change this in the namelist.'
2911         CALL wrf_error_fatal ( message )
2912      END IF
2913
2914      dzs(1)=.01
2915      zs(1)=.5*dzs(1)
2916
2917      DO l=2,num_soil_layers
2918         dzs(l)=2*dzs(l-1)
2919         zs(l)=zs(l-1)+.5*dzs(l-1)+.5*dzs(l)
2920      ENDDO
2921
2922   END SUBROUTINE init_soil_depth_1
2923
2924   SUBROUTINE init_soil_depth_2 ( zs , dzs , num_soil_layers )
2925
2926      IMPLICIT NONE
2927
2928      INTEGER, INTENT(IN) :: num_soil_layers
2929
2930      REAL, DIMENSION(1:num_soil_layers), INTENT(OUT)  ::  zs,dzs
2931
2932      INTEGER                   ::      l
2933
2934      CHARACTER (LEN=132) :: message
2935
2936      dzs = (/ 0.1 , 0.3 , 0.6 , 1.0 /)
2937
2938      IF ( num_soil_layers .NE. 4 ) THEN
2939         write(message,FMT='(A)') 'Usually, the LSM uses 4 layers.  Change this in the namelist.'
2940         CALL wrf_error_fatal ( message )
2941      END IF
2942
2943      zs(1)=.5*dzs(1)
2944
2945      DO l=2,num_soil_layers
2946         zs(l)=zs(l-1)+.5*dzs(l-1)+.5*dzs(l)
2947      ENDDO
2948
2949   END SUBROUTINE init_soil_depth_2
2950
2951   SUBROUTINE init_soil_depth_3 ( zs , dzs , num_soil_layers )
2952
2953      IMPLICIT NONE
2954
2955      INTEGER, INTENT(IN) :: num_soil_layers
2956
2957      REAL, DIMENSION(1:num_soil_layers), INTENT(OUT)  ::  zs,dzs
2958
2959      INTEGER                   ::      l
2960
2961      CHARACTER (LEN=132) :: message
2962
2963! in RUC LSM ZS - soil levels, and DZS - soil layer thicknesses, not used
2964! ZS is specified in the namelist: num_soil_layers = 6 or 9.
2965! Other options with number of levels are possible, but
2966! WRF users should change consistently the namelist entry with the
2967!    ZS array in this subroutine.
2968
2969     IF ( num_soil_layers .EQ. 6) THEN
2970      zs  = (/ 0.00 , 0.05 , 0.20 , 0.40 , 1.60 , 3.00 /)
2971!      dzs = (/ 0.00 , 0.125, 0.175 , 0.70 , 1.30 , 1.40 /)
2972     ELSEIF ( num_soil_layers .EQ. 9) THEN
2973      zs  = (/ 0.00 , 0.05 , 0.20 , 0.40 , 0.60, 1.00, 1.60 , 2.20, 3.00 /)
2974!      dzs = (/ 0.00 , 0.125, 0.175 , 0.70 , 1.30 , 1.40 /)
2975     ENDIF
2976
2977      IF ( num_soil_layers .EQ. 4 .OR. num_soil_layers .EQ. 5 ) THEN
2978         WRITE(message,FMT= '(A)')'Usually, the RUC LSM uses 6, 9 or more levels.  Change this in the namelist.'
2979         CALL wrf_error_fatal ( message )
2980      END IF
2981
2982   END SUBROUTINE init_soil_depth_3
2983
2984   SUBROUTINE init_soil_1_real ( tsk , tmn , tslb , zs , dzs , &
2985                                 num_soil_layers , real_data_init_type , &
2986                                 landmask , sst , flag_sst , &
2987                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
2988                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
2989                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
2990
2991      IMPLICIT NONE
2992
2993      INTEGER , INTENT(IN) :: num_soil_layers , real_data_init_type , &
2994                              ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
2995                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
2996                              its , ite , jts , jte , kts , kte
2997
2998      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_sst
2999
3000      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: landmask , sst
3001      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: tsk , tmn
3002
3003      REAL , DIMENSION(num_soil_layers) :: zs , dzs
3004
3005      REAL , DIMENSION(ims:ime,num_soil_layers,jms:jme) , INTENT(OUT) :: tslb
3006
3007      INTEGER :: i , j , l
3008
3009      !  Soil temperature is linearly interpolated between the skin temperature (taken to be at a
3010      !  depth of 0.5 cm) and the deep soil, annual temperature (taken to be at a depth of 23 cm).
3011      !  The tslb(i,1,j) is the skin temperature, and the tslb(i,num_soil_layers,j) level is the
3012      !  annual mean temperature.
3013
3014      DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3015         DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3016            IF ( landmask(i,j) .GT. 0.5 ) THEN
3017               DO l = 1 , num_soil_layers
3018                  tslb(i,l,j)= ( tsk(i,j) * ( zs(num_soil_layers) - zs(l) )   + &
3019                                 tmn(i,j) * ( zs(              l) - zs(1) ) ) / &
3020                                            ( zs(num_soil_layers) - zs(1) )
3021               END DO
3022            ELSE
3023               IF ( ( real_data_init_type .EQ. 1 ) .AND. ( flag_sst .EQ. 1 ) ) THEN
3024                  DO l = 1 , num_soil_layers
3025                     tslb(i,l,j)= sst(i,j)
3026                  END DO
3027               ELSE
3028                  DO l = 1 , num_soil_layers
3029                     tslb(i,l,j)= tsk(i,j)
3030                  END DO
3031               END IF
3032            END IF
3033         END DO
3034      END DO
3035
3036   END SUBROUTINE init_soil_1_real
3037
3038   SUBROUTINE init_soil_1_ideal(tsk,tmn,tslb,xland,             &
3039                       ivgtyp,ZS,DZS,num_soil_layers,           &
3040                       ids,ide, jds,jde, kds,kde,               &
3041                       ims,ime, jms,jme, kms,kme,               &
3042                       its,ite, jts,jte, kts,kte                )
3043
3044      IMPLICIT NONE
3045
3046      INTEGER, INTENT(IN   )    ::      ids,ide, jds,jde, kds,kde, &
3047                                        ims,ime, jms,jme, kms,kme, &
3048                                        its,ite, jts,jte, kts,kte
3049
3050      INTEGER, INTENT(IN   )    ::      num_soil_layers
3051
3052      REAL, DIMENSION( ims:ime , 1 , jms:jme ), INTENT(OUT) :: tslb
3053      REAL, DIMENSION( ims:ime , jms:jme ), INTENT(OUT) :: xland
3054      INTEGER, DIMENSION( ims:ime , jms:jme ), INTENT(OUT) :: ivgtyp
3055
3056      REAL, DIMENSION(1:), INTENT(IN) :: dzs,zs
3057
3058      REAL, DIMENSION( ims:ime, jms:jme ) , INTENT(IN) :: tsk, tmn
3059
3060      !  Lcal variables.
3061
3062      INTEGER :: l,j,i,itf,jtf
3063
3064      itf=MIN(ite,ide-1)
3065      jtf=MIN(jte,jde-1)
3066
3067      IF (num_soil_layers.NE.1)THEN
3068         DO j=jts,jtf
3069            DO l=1,num_soil_layers
3070               DO i=its,itf
3071                 tslb(i,l,j)=( tsk(i,j)*(zs(num_soil_layers)-zs(l)) + tmn(i,j)*(zs(l)-zs(1)) ) / &
3072                             ( zs(num_soil_layers)-zs(1) )
3073               ENDDO
3074            ENDDO
3075         ENDDO
3076      ENDIF
3077      DO j=jts,jtf
3078         DO i=its,itf
3079           xland(i,j)  = 2
3080           ivgtyp(i,j) = 7
3081         ENDDO
3082      ENDDO
3083
3084   END SUBROUTINE init_soil_1_ideal
3085
3086   SUBROUTINE init_soil_2_real ( tsk , tmn , smois , sh2o , tslb , &
3087                                 st_input , sm_input , sw_input , landmask , sst , &
3088                                 zs , dzs , &
3089                                 st_levels_input , sm_levels_input , sw_levels_input , &
3090                                 num_soil_layers , num_st_levels_input , num_sm_levels_input ,  num_sw_levels_input , &
3091                                 num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc ,  num_sw_levels_alloc , &
3092                                 flag_sst , flag_soilt000 , flag_soilm000 , &
3093                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
3094                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
3095                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
3096
3097      IMPLICIT NONE
3098
3099      INTEGER , INTENT(IN) :: num_soil_layers , &
3100                              num_st_levels_input , num_sm_levels_input , num_sw_levels_input , &
3101                              num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , num_sw_levels_alloc , &
3102                              ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
3103                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
3104                              its , ite , jts , jte , kts , kte
3105
3106      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_sst, flag_soilt000, flag_soilm000
3107
3108      INTEGER , DIMENSION(1:num_st_levels_input) , INTENT(INOUT) :: st_levels_input
3109      INTEGER , DIMENSION(1:num_sm_levels_input) , INTENT(INOUT) :: sm_levels_input
3110      INTEGER , DIMENSION(1:num_sw_levels_input) , INTENT(INOUT) :: sw_levels_input
3111
3112      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_st_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: st_input
3113      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_sm_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: sm_input
3114      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_sw_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: sw_input
3115      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: landmask , sst
3116
3117      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: tmn
3118      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: tsk
3119      REAL , DIMENSION(num_soil_layers) :: zs , dzs
3120
3121      REAL , DIMENSION(ims:ime,num_soil_layers,jms:jme) , INTENT(OUT) :: tslb , smois , sh2o
3122
3123      REAL , ALLOCATABLE , DIMENSION(:) :: zhave
3124
3125      INTEGER :: i , j , l , lout , lin , lwant , lhave , num
3126      REAL :: temp
3127      LOGICAL :: found_levels
3128
3129      CHARACTER (LEN=132) :: message
3130
3131      !  Are there any soil temp and moisture levels - ya know, they are mandatory.
3132
3133      num = num_st_levels_input * num_sm_levels_input
3134
3135      IF ( num .GE. 1 ) THEN
3136
3137         !  Ordered levels that we have data for.
3138         IF ( flag_soilt000 .eq. 1 ) THEN
3139           write(message, FMT='(A)') ' Assume RUC LSM 6-level input'
3140           CALL wrf_message ( message )
3141           ALLOCATE ( zhave( MAX(num_st_levels_input,num_sm_levels_input,num_sw_levels_input)  ) )
3142         ELSE
3143           write(message, FMT='(A)') ' Assume Noah LSM input'
3144           CALL wrf_message ( message )
3145         ALLOCATE ( zhave( MAX(num_st_levels_input,num_sm_levels_input,num_sw_levels_input) +2) )
3146         END IF
3147
3148
3149         !  Sort the levels for temperature.
3150!print*,'num_st_levels_input, st_levels_input', num_st_levels_input, st_levels_input
3151!print*,'num_sm_levels_input,num_sw_levels_input',num_sm_levels_input,num_sw_levels_input
3152
3153         outert : DO lout = 1 , num_st_levels_input-1
3154            innert : DO lin = lout+1 , num_st_levels_input
3155               IF ( st_levels_input(lout) .GT. st_levels_input(lin) ) THEN
3156                  temp = st_levels_input(lout)
3157                  st_levels_input(lout) = st_levels_input(lin)
3158                  st_levels_input(lin) = NINT(temp)
3159                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3160                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3161                        temp = st_input(i,lout+1,j)
3162                        st_input(i,lout+1,j) = st_input(i,lin+1,j)
3163                        st_input(i,lin+1,j) = temp
3164                     END DO
3165                  END DO
3166               END IF
3167            END DO innert
3168         END DO outert
3169!tgs add IF
3170      IF ( flag_soilt000 .NE. 1 ) THEN
3171         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3172            DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3173               st_input(i,1,j) = tsk(i,j)
3174               st_input(i,num_st_levels_input+2,j) = tmn(i,j)
3175            END DO
3176         END DO
3177      ENDIF
3178
3179
3180#if ( NMM_CORE == 1 )
3181!new
3182!       write(0,*) 'st_input(1) in init_soil_2_real'
3183!       DO J=MIN(jde-1,jte),JTS, -MIN(jde-1,jte)/15
3184!       write(0,616) (st_input(I,1,J),I=its , MIN(ide-1,ite),MIN(ide-1,ite)/10)
3185!       ENDDO
3186
3187!       write(0,*) 'st_input(2) in init_soil_2_real'
3188!       DO J=MIN(jde-1,jte),JTS, -MIN(jde-1,jte)/15
3189!       write(0,616) (st_input(I,2,J),I=its , MIN(ide-1,ite),MIN(ide-1,ite)/10)
3190!       ENDDO
3191
3192  616   format(20(f4.0,1x))
3193#endif
3194
3195         !  Sort the levels for moisture.
3196
3197         outerm: DO lout = 1 , num_sm_levels_input-1
3198            innerm : DO lin = lout+1 , num_sm_levels_input
3199               IF ( sm_levels_input(lout) .GT. sm_levels_input(lin) ) THEN
3200                  temp = sm_levels_input(lout)
3201                  sm_levels_input(lout) = sm_levels_input(lin)
3202                  sm_levels_input(lin) = NINT(temp)
3203                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3204                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3205                        temp = sm_input(i,lout+1,j)
3206                        sm_input(i,lout+1,j) = sm_input(i,lin+1,j)
3207                        sm_input(i,lin+1,j) = temp
3208                     END DO
3209                  END DO
3210               END IF
3211            END DO innerm
3212         END DO outerm
3213!tgs add IF
3214      IF ( flag_soilm000 .NE. 1 ) THEN
3215         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3216            DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3217               sm_input(i,1,j) = sm_input(i,2,j)
3218               sm_input(i,num_sm_levels_input+2,j) = sm_input(i,num_sm_levels_input+1,j)
3219            END DO
3220         END DO
3221      ENDIF
3222
3223         !  Sort the levels for liquid moisture.
3224
3225         outerw: DO lout = 1 , num_sw_levels_input-1
3226            innerw : DO lin = lout+1 , num_sw_levels_input
3227               IF ( sw_levels_input(lout) .GT. sw_levels_input(lin) ) THEN
3228                  temp = sw_levels_input(lout)
3229                  sw_levels_input(lout) = sw_levels_input(lin)
3230                  sw_levels_input(lin) = NINT(temp)
3231                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3232                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3233                        temp = sw_input(i,lout+1,j)
3234                        sw_input(i,lout+1,j) = sw_input(i,lin+1,j)
3235                        sw_input(i,lin+1,j) = temp
3236                     END DO
3237                  END DO
3238               END IF
3239            END DO innerw
3240         END DO outerw
3241         IF ( num_sw_levels_input .GT. 1 ) THEN
3242            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3243               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3244                  sw_input(i,1,j) = sw_input(i,2,j)
3245                  sw_input(i,num_sw_levels_input+2,j) = sw_input(i,num_sw_levels_input+1,j)
3246               END DO
3247            END DO
3248         END IF
3249
3250         found_levels = .TRUE.
3251
3252      ELSE IF ( ( num .LE. 0 ) .AND. (  start_date .NE. current_date ) ) THEN
3253
3254         found_levels = .FALSE.
3255
3256      ELSE
3257         CALL wrf_error_fatal ( &
3258         'No input soil level data (temperature, moisture or liquid, or all are missing). Required for LSM.' )
3259      END IF
3260
3261      !  Is it OK to continue?
3262
3263      IF ( found_levels ) THEN
3264
3265!tgs add IF
3266      IF ( flag_soilt000 .NE.1) THEN
3267!tgs initialize from Noah data
3268         !  Here are the levels that we have from the input for temperature.  The input levels plus
3269         !  two more: the skin temperature at 0 cm, and the annual mean temperature at 300 cm.
3270
3271         zhave(1) = 0.
3272         DO l = 1 , num_st_levels_input
3273            zhave(l+1) = st_levels_input(l) / 100.
3274         END DO
3275         zhave(num_st_levels_input+2) = 300. / 100.
3276
3277         !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
3278
3279         z_wantt : DO lwant = 1 , num_soil_layers
3280            z_havet : DO lhave = 1 , num_st_levels_input +2 -1
3281               IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
3282                    ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
3283                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3284                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3285                        tslb(i,lwant,j)= ( st_input(i,lhave  ,j) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
3286                                           st_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
3287                                                                   ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
3288                     END DO
3289                  END DO
3290                  EXIT z_havet
3291               END IF
3292            END DO z_havet
3293         END DO z_wantt
3294
3295     ELSE
3296
3297!tgs initialize from RUCLSM data
3298         DO l = 1 , num_st_levels_input
3299            zhave(l) = st_levels_input(l) / 100.
3300         END DO
3301
3302      !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
3303
3304
3305      z_wantt_2 : DO lwant = 1 , num_soil_layers
3306         z_havet_2 : DO lhave = 1 , num_st_levels_input -1
3307            IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
3308                 ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
3309               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3310                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3311                     tslb(i,lwant,j)= ( st_input(i,lhave,j ) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
3312                                        st_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
3313                                                                ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
3314                  END DO
3315               END DO
3316               EXIT z_havet_2
3317            END IF
3318         END DO z_havet_2
3319      END DO z_wantt_2
3320
3321      ENDIF
3322
3323
3324      IF ( flag_soilm000 .NE. 1 ) THEN
3325!tgs initialize from Noah
3326         !  Here are the levels that we have from the input for moisture.  The input levels plus
3327         !  two more: a value at 0 cm and one at 300 cm.  The 0 cm value is taken to be identical
3328         !  to the most shallow layer's value.  Similarly, the 300 cm value is taken to be the same
3329         !  as the most deep layer's value.
3330
3331         zhave(1) = 0.
3332         DO l = 1 , num_sm_levels_input
3333            zhave(l+1) = sm_levels_input(l) / 100.
3334         END DO
3335         zhave(num_sm_levels_input+2) = 300. / 100.
3336
3337         !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
3338
3339         z_wantm : DO lwant = 1 , num_soil_layers
3340            z_havem : DO lhave = 1 , num_sm_levels_input +2 -1
3341               IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
3342                    ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
3343                  DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3344                     DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3345                        smois(i,lwant,j)= ( sm_input(i,lhave  ,j) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
3346                                            sm_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
3347                                                                    ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
3348                     END DO
3349                  END DO
3350                  EXIT z_havem
3351               END IF
3352            END DO z_havem
3353         END DO z_wantm
3354
3355     ELSE
3356
3357!tgs  initialize from RUCLSM data
3358         DO l = 1 , num_sm_levels_input
3359            zhave(l) = sm_levels_input(l) / 100.
3360         END DO
3361
3362      !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
3363
3364      z_wantm_2 : DO lwant = 1 , num_soil_layers
3365         z_havem_2 : DO lhave = 1 , num_sm_levels_input -1
3366            IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
3367                 ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
3368               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3369                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3370                     smois(i,lwant,j)= ( sm_input(i,lhave,j ) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
3371                                         sm_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
3372                                                                 ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
3373                  END DO
3374               END DO
3375               EXIT z_havem_2
3376             END IF
3377         END DO z_havem_2
3378      END DO z_wantm_2
3379
3380     ENDIF
3381         !  Any liquid soil moisture to worry about?
3382
3383         IF ( num_sw_levels_input .GT. 1 ) THEN
3384
3385            zhave(1) = 0.
3386            DO l = 1 , num_sw_levels_input
3387               zhave(l+1) = sw_levels_input(l) / 100.
3388            END DO
3389            zhave(num_sw_levels_input+2) = 300. / 100.
3390
3391            !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
3392
3393            z_wantw : DO lwant = 1 , num_soil_layers
3394               z_havew : DO lhave = 1 , num_sw_levels_input +2 -1
3395                  IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
3396                       ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
3397                     DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3398                        DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3399                           sh2o(i,lwant,j)= ( sw_input(i,lhave  ,j) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
3400                                               sw_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
3401                                                                       ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
3402                        END DO
3403                     END DO
3404                     EXIT z_havew
3405                  END IF
3406               END DO z_havew
3407            END DO z_wantw
3408
3409         END IF
3410
3411
3412         !  Over water, put in reasonable values for soil temperature and moisture.  These won't be
3413         !  used, but they will make a more continuous plot.
3414
3415         IF ( flag_sst .EQ. 1 ) THEN
3416            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3417               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3418                  IF ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) THEN
3419                     DO l = 1 , num_soil_layers
3420                        tslb(i,l,j)= sst(i,j)
3421!tgs add line for tsk
3422                        tsk(i,j)    = sst(i,j)
3423                        smois(i,l,j)= 1.0
3424                        sh2o (i,l,j)= 1.0
3425                     END DO
3426                  END IF
3427               END DO
3428            END DO
3429         ELSE
3430            DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3431               DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3432                  IF ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) THEN
3433                     DO l = 1 , num_soil_layers
3434                        tslb(i,l,j)= tsk(i,j)
3435                        smois(i,l,j)= 1.0
3436                        sh2o (i,l,j)= 1.0
3437                     END DO
3438                  END IF
3439               END DO
3440            END DO
3441         END IF
3442
3443         DEALLOCATE (zhave)
3444
3445      END IF
3446
3447   END SUBROUTINE init_soil_2_real
3448
3449   SUBROUTINE init_soil_2_ideal ( xland,xice,vegfra,snow,canwat,     &
3450                     ivgtyp,isltyp,tslb,smois,tmn,                  &
3451                     num_soil_layers,                               &
3452                     ids,ide, jds,jde, kds,kde,                     &
3453                     ims,ime, jms,jme, kms,kme,                     &
3454                     its,ite, jts,jte, kts,kte                      )
3455
3456      IMPLICIT NONE
3457
3458      INTEGER, INTENT(IN) ::ids,ide, jds,jde, kds,kde,  &
3459                            ims,ime, jms,jme, kms,kme,  &
3460                            its,ite, jts,jte, kts,kte
3461
3462      INTEGER, INTENT(IN) ::num_soil_layers
3463
3464      REAL, DIMENSION( ims:ime, num_soil_layers, jms:jme ) , INTENT(OUT) :: smois, tslb
3465
3466      REAL, DIMENSION( ims:ime, jms:jme ) , INTENT(OUT)  :: xland, snow, canwat, xice, vegfra, tmn
3467
3468      INTEGER, DIMENSION( ims:ime, jms:jme ) , INTENT(OUT) :: ivgtyp, isltyp
3469
3470      INTEGER :: icm,jcm,itf,jtf
3471      INTEGER ::  i,j,l
3472
3473      itf=min0(ite,ide-1)
3474      jtf=min0(jte,jde-1)
3475
3476      icm = ide/2
3477      jcm = jde/2
3478
3479      DO j=jts,jtf
3480         DO l=1,num_soil_layers
3481            DO i=its,itf
3482
3483               smois(i,1,j)=0.10
3484               smois(i,2,j)=0.10
3485               smois(i,3,j)=0.10
3486               smois(i,4,j)=0.10
3487
3488               tslb(i,1,j)=295.
3489               tslb(i,2,j)=297.
3490               tslb(i,3,j)=293.
3491               tslb(i,4,j)=293.
3492
3493            ENDDO
3494         ENDDO
3495      ENDDO
3496
3497      DO j=jts,jtf
3498         DO i=its,itf
3499            xland(i,j)  =   2
3500            tmn(i,j)    = 294.
3501            xice(i,j)   =   0.
3502            vegfra(i,j) =   0.
3503            snow(i,j)   =   0.
3504            canwat(i,j) =   0.
3505            ivgtyp(i,j) =   7
3506            isltyp(i,j) =   8
3507         ENDDO
3508      ENDDO
3509
3510   END SUBROUTINE init_soil_2_ideal
3511
3512   SUBROUTINE init_soil_3_real ( tsk , tmn , smois , tslb , &
3513                                 st_input , sm_input , landmask, sst, &
3514                                 zs , dzs , &
3515                                 st_levels_input , sm_levels_input , &
3516                                 num_soil_layers , num_st_levels_input , num_sm_levels_input ,  &
3517                                 num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , &
3518                                 flag_sst , flag_soilt000 , flag_soilm000 , &
3519                                 ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
3520                                 ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
3521                                 its , ite , jts , jte , kts , kte )
3522
3523      IMPLICIT NONE
3524
3525      INTEGER , INTENT(IN) :: num_soil_layers , &
3526                              num_st_levels_input , num_sm_levels_input , &
3527                              num_st_levels_alloc , num_sm_levels_alloc , &
3528                              ids , ide , jds , jde , kds , kde , &
3529                              ims , ime , jms , jme , kms , kme , &
3530                              its , ite , jts , jte , kts , kte
3531
3532      INTEGER , INTENT(IN) :: flag_sst, flag_soilt000, flag_soilm000
3533
3534      INTEGER , DIMENSION(1:num_st_levels_input) , INTENT(INOUT) :: st_levels_input
3535      INTEGER , DIMENSION(1:num_sm_levels_input) , INTENT(INOUT) :: sm_levels_input
3536
3537      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_st_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: st_input
3538      REAL , DIMENSION(ims:ime,1:num_sm_levels_alloc,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: sm_input
3539      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: landmask , sst
3540
3541      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(IN) :: tmn
3542      REAL , DIMENSION(ims:ime,jms:jme) , INTENT(INOUT) :: tsk
3543      REAL , DIMENSION(num_soil_layers) :: zs , dzs
3544
3545      REAL , DIMENSION(ims:ime,num_soil_layers,jms:jme) , INTENT(OUT) :: tslb , smois
3546
3547      REAL , ALLOCATABLE , DIMENSION(:) :: zhave
3548
3549      INTEGER :: i , j , l , lout , lin , lwant , lhave
3550      REAL :: temp
3551
3552      !  Allocate the soil layer array used for interpolating.
3553
3554      IF ( ( num_st_levels_input .LE. 0 ) .OR. &
3555           ( num_sm_levels_input .LE. 0 ) ) THEN
3556         PRINT '(A)','No input soil level data (either temperature or moisture, or both are missing).  Required for RUC LSM.'
3557         CALL wrf_error_fatal ( 'no soil data' )
3558      ELSE
3559         IF ( flag_soilt000 .eq. 1 ) THEN
3560           PRINT '(A)',' Assume RUC LSM 6-level input'
3561           ALLOCATE ( zhave( MAX(num_st_levels_input,num_sm_levels_input)  ) )
3562         ELSE
3563           PRINT '(A)',' Assume non-RUC LSM input'
3564           ALLOCATE ( zhave( MAX(num_st_levels_input,num_soil_layers)  ) )
3565         END IF
3566      END IF
3567
3568      !  Sort the levels for temperature.
3569
3570      outert : DO lout = 1 , num_st_levels_input-1
3571         innert : DO lin = lout+1 , num_st_levels_input
3572            IF ( st_levels_input(lout) .GT. st_levels_input(lin) ) THEN
3573               temp = st_levels_input(lout)
3574               st_levels_input(lout) = st_levels_input(lin)
3575               st_levels_input(lin) = NINT(temp)
3576               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3577                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3578                     temp = st_input(i,lout,j)
3579                     st_input(i,lout,j) = st_input(i,lin,j)
3580                     st_input(i,lin,j) = temp
3581                  END DO
3582               END DO
3583            END IF
3584         END DO innert
3585      END DO outert
3586
3587      IF ( flag_soilt000 .NE. 1 ) THEN
3588      DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3589         DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3590            st_input(i,1,j) = tsk(i,j)
3591            st_input(i,num_st_levels_input+2,j) = tmn(i,j)
3592         END DO
3593      END DO
3594      END IF
3595
3596      !  Sort the levels for moisture.
3597
3598      outerm: DO lout = 1 , num_sm_levels_input-1
3599         innerm : DO lin = lout+1 , num_sm_levels_input
3600            IF ( sm_levels_input(lout) .GT. sm_levels_input(lin) ) THEN
3601               temp = sm_levels_input(lout)
3602               sm_levels_input(lout) = sm_levels_input(lin)
3603               sm_levels_input(lin) = NINT(temp)
3604               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3605                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3606                     temp = sm_input(i,lout,j)
3607                     sm_input(i,lout,j) = sm_input(i,lin,j)
3608                     sm_input(i,lin,j) = temp
3609                  END DO
3610               END DO
3611            END IF
3612         END DO innerm
3613      END DO outerm
3614
3615      IF ( flag_soilm000 .NE. 1 ) THEN
3616      DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3617         DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3618            sm_input(i,1,j) = sm_input(i,2,j)
3619            sm_input(i,num_sm_levels_input+2,j) = sm_input(i,num_sm_levels_input+1,j)
3620         END DO
3621      END DO
3622      END IF
3623
3624      !  Here are the levels that we have from the input for temperature.
3625
3626      IF ( flag_soilt000 .EQ. 1 ) THEN
3627         DO l = 1 , num_st_levels_input
3628            zhave(l) = st_levels_input(l) / 100.
3629         END DO
3630
3631      !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
3632
3633      z_wantt : DO lwant = 1 , num_soil_layers
3634         z_havet : DO lhave = 1 , num_st_levels_input -1
3635            IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
3636                 ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
3637               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3638                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3639                     tslb(i,lwant,j)= ( st_input(i,lhave,j ) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
3640                                        st_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
3641                                                                ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
3642                  END DO
3643               END DO
3644               EXIT z_havet
3645            END IF
3646         END DO z_havet
3647      END DO z_wantt
3648
3649      ELSE
3650
3651         zhave(1) = 0.
3652         DO l = 1 , num_st_levels_input
3653            zhave(l+1) = st_levels_input(l) / 100.
3654         END DO
3655         zhave(num_st_levels_input+2) = 300. / 100.
3656
3657      !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
3658
3659      z_wantt_2 : DO lwant = 1 , num_soil_layers
3660         z_havet_2 : DO lhave = 1 , num_st_levels_input +2
3661            IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
3662                 ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
3663               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3664                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3665                     tslb(i,lwant,j)= ( st_input(i,lhave,j ) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
3666                                        st_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
3667                                                                ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
3668                  END DO
3669               END DO
3670               EXIT z_havet_2
3671            END IF
3672         END DO z_havet_2
3673      END DO z_wantt_2
3674
3675      END IF
3676
3677      !  Here are the levels that we have from the input for moisture.
3678
3679      IF ( flag_soilm000 .EQ. 1 ) THEN
3680         DO l = 1 , num_sm_levels_input
3681            zhave(l) = sm_levels_input(l) / 100.
3682         END DO
3683
3684      !  Interpolate between the layers we have (zhave) and those that we want (zs).
3685
3686      z_wantm : DO lwant = 1 , num_soil_layers
3687         z_havem : DO lhave = 1 , num_sm_levels_input -1
3688            IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
3689                 ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
3690               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3691                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3692                     smois(i,lwant,j)= ( sm_input(i,lhave,j ) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
3693                                         sm_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
3694                                                                 ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
3695                  END DO
3696               END DO
3697               EXIT z_havem
3698            END IF
3699         END DO z_havem
3700      END DO z_wantm
3701
3702      ELSE
3703
3704         zhave(1) = 0.
3705         DO l = 1 , num_sm_levels_input
3706            zhave(l+1) = sm_levels_input(l) / 100.
3707         END DO
3708         zhave(num_sm_levels_input+2) = 300. / 100.
3709
3710      z_wantm_2 : DO lwant = 1 , num_soil_layers
3711         z_havem_2 : DO lhave = 1 , num_sm_levels_input +2
3712            IF ( ( zs(lwant) .GE. zhave(lhave  ) ) .AND. &
3713                 ( zs(lwant) .LE. zhave(lhave+1) ) ) THEN
3714               DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3715                  DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3716                     smois(i,lwant,j)= ( sm_input(i,lhave,j ) * ( zhave(lhave+1) - zs   (lwant) ) + &
3717                                         sm_input(i,lhave+1,j) * ( zs   (lwant  ) - zhave(lhave) ) ) / &
3718                                                                 ( zhave(lhave+1) - zhave(lhave) )
3719                  END DO
3720               END DO
3721               EXIT z_havem_2
3722            END IF
3723         END DO z_havem_2
3724      END DO z_wantm_2
3725
3726      END IF
3727      !  Over water, put in reasonable values for soil temperature and moisture.  These won't be
3728      !  used, but they will make a more continuous plot.
3729
3730      IF ( flag_sst .EQ. 1 ) THEN
3731         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3732            DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3733               IF ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) THEN
3734                  DO l = 1 , num_soil_layers
3735                     tslb(i,l,j) = sst(i,j)
3736                     tsk(i,j)    = sst(i,j)
3737                     smois(i,l,j)= 1.0
3738                  END DO
3739               END IF
3740            END DO
3741         END DO
3742      ELSE
3743         DO j = jts , MIN(jde-1,jte)
3744            DO i = its , MIN(ide-1,ite)
3745               IF ( landmask(i,j) .LT. 0.5 ) THEN
3746                  DO l = 1 , num_soil_layers
3747                     tslb(i,l,j)= tsk(i,j)
3748                     smois(i,l,j)= 1.0
3749                  END DO
3750               END IF
3751            END DO
3752         END DO
3753      END IF
3754
3755      DEALLOCATE (zhave)
3756
3757   END SUBROUTINE init_soil_3_real
3758
3759END MODULE module_soil_pre
3760
3761#endif
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.