source: lmdz_wrf/trunk/WRFV3/external/io_phdf5/wrf-phdf5.F90 @ 1567

Last change on this file since 1567 was 1, checked in by lfita, 10 years ago
  • -- --- Opening of the WRF+LMDZ coupling repository --- -- -

WRF: version v3.3
LMDZ: version v1818

More details in:

File size: 180.9 KB
Line 
1!/***************************************************************************
2!* The HDF5 WRF IO module was written by the the HDF Group at NCSA, the     *
3!* National Center for Supercomputing Applications.                         *
4!*     HDF Group                                                            *
5!*     National Center for Supercomputing Applications                      *
6!*     University of Illinois at Urbana-Champaign                           *
7!*     605 E. Springfield, Champaign IL 61820                               *
8!*     http://hdf.ncsa.uiuc.edu/                                            *
9!*                                                                          *
10!* Copyright 2004 by the Board of Trustees, University of Illinois,         *
11!*                                                                          *
12!* Redistribution or use of this IO module, with or without modification,   *
13!* is permitted for any purpose, including commercial  purposes.            *
14!*                                                                          *
15!* This software is an unsupported prototype.  Use at your own risk.        *
16!*     http://hdf.ncsa.uiuc.edu/apps/WRF-ROMS                               *
17!*                                                                          *
18!* This work was funded by the MEAD expedition at the National Center       *
19!* for Supercomputing Applications, NCSA.  For more information see:        *
20!*     http://www.ncsa.uiuc.edu/expeditions/MEAD                            *
21!*                                                                          *
22!*                                                                          *
23!****************************************************************************/
24
25
26subroutine HDF5IOWRITE(DataHandle,Comm,DateStr,Length,DomainStart,DomainEnd &
27     ,PatchStart,PatchEnd,MemoryOrder &
28     ,WrfDType,FieldType,groupID,TimeIndex &
29     ,DimRank ,DatasetName,XField,Status)
30
31  use wrf_phdf5_data
32  use ext_phdf5_support_routines
33  use HDF5
34  implicit none
35  include 'mpif.h'
36  include 'wrf_status_codes.h'
37
38  integer                     ,intent(in)     :: DataHandle
39  integer                     ,intent(inout)  :: Comm
40  character*(*)               ,intent(in)     :: DateStr
41  integer,dimension(NVarDims) ,intent(in)     :: Length
42
43  integer,dimension(NVarDims) ,intent(in)     :: DomainStart
44  integer,dimension(NVarDims) ,intent(in)     :: DomainEnd
45  integer,dimension(NVarDims) ,intent(in)     :: PatchStart
46  integer,dimension(NVarDims) ,intent(in)     :: PatchEnd
47
48  character*(*)               ,intent(in)     :: MemoryOrder
49
50  integer                     ,intent(in)     :: WrfDType
51  integer(hid_t)              ,intent(in)     :: FieldType
52  integer(hid_t)              ,intent(in)     :: groupID
53  integer                     ,intent(in)     :: TimeIndex
54
55  integer,dimension(*)        ,intent(in)     :: DimRank
56  character (*)               ,intent(in)     :: DatasetName
57  integer,dimension(*)        ,intent(inout)  :: XField
58  integer                     ,intent(out)    :: Status
59
60  integer(hid_t)                              :: dset_id
61  integer                                     :: NDim
62  integer,dimension(NVarDims)                 :: VStart
63  integer,dimension(NVarDims)                 :: VCount
64  character (3)                               :: Mem0
65  character (3)                               :: UCMem0
66  type(wrf_phdf5_data_handle) ,pointer         :: DH
67
68  ! attribute defination
69  integer(hid_t)                              :: dimaspace_id  ! DimRank dataspace id
70  integer(hid_t)                              :: dimattr_id    ! DimRank attribute id
71  integer(hsize_t) ,dimension(1)              :: dim_space
72  INTEGER(HID_T)                              :: dspace_id     ! Raw Data memory Dataspace id
73  INTEGER(HID_T)                              :: fspace_id     ! Raw Data file Dataspace id
74  INTEGER(HID_T)                              :: crp_list      ! chunk  identifier
75  integer(hid_t)                              :: h5_atypeid    ! for fieldtype,memorder attribute
76  integer(hid_t)                              :: h5_aspaceid   ! for fieldtype,memorder 
77  integer(hid_t)                              :: h5_attrid     ! for fieldtype,memorder
78  integer(hsize_t), dimension(7)              :: adata_dims
79  integer                                     :: routine_atype
80
81
82  integer,          dimension(:),allocatable  :: dimrank_data
83
84  INTEGER(HSIZE_T), dimension(:),allocatable  :: dims  ! Dataset dimensions
85  INTEGER(HSIZE_T), dimension(:),allocatable  :: sizes ! Dataset dimensions
86  INTEGER(HSIZE_T), dimension(:),allocatable  :: chunk_dims
87  INTEGER(HSIZE_T), dimension(:),allocatable  :: hdf5_maxdims
88  INTEGER(HSIZE_T), dimension(:),allocatable  :: offset
89  INTEGER(HSIZE_T), dimension(:),allocatable  :: count 
90  INTEGER(HSIZE_T), DIMENSION(7)              :: dimsfi
91  integer                                     :: hdf5err
92  integer                                     :: i,j
93  integer(size_t)                             :: dsetsize
94
95  ! FOR PARALLEL IO
96  integer(hid_t)                              :: xfer_list
97  logical                                     :: no_par
98
99
100  ! get the handle
101  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
102  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
103     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
104     call wrf_debug ( WARN , msg)
105     return
106  endif
107
108  ! get the rank of the dimension
109  call GetDim(MemoryOrder,NDim,Status)
110  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
111     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
112     call wrf_debug ( WARN , msg)
113     return
114  endif
115
116  ! If patch is equal to domain, the parallel is not necessary, sequential is used.
117  ! In this version, we haven't implemented this yet.
118  ! We use no_par to check whether we can use compact data storage.
119  no_par = .TRUE.
120  do i = 1,NDim
121     if((PatchStart(i)/=DomainStart(i)).or.(PatchEnd(i)/=DomainEnd(i))) then
122        no_par = .FALSE.
123        exit
124     endif
125  enddo
126
127  ! change the different Memory Order to XYZ for patch and domain
128  if(MemoryOrder.NE.'0') then
129     call ExtOrder(MemoryOrder,PatchStart,Status)
130     call ExtOrder(MemoryOrder,PatchEnd,Status)
131     call ExtOrder(MemoryOrder,DomainStart,Status)
132     call ExtOrder(MemoryOrder,DomainEnd,Status)
133  endif
134
135  ! allocating memory for dynamic arrays;
136  ! since the time step is always 1, we may ignore the fourth
137  ! dimension time; now keep it to make it consistent with sequential version
138  allocate(dims(NDim+1))
139  allocate(count(NDim+1))
140  allocate(offset(NDim+1))
141  allocate(sizes(NDim+1))
142
143
144  ! arrange offset, count for each hyperslab
145  dims(1:NDim)   = DomainEnd(1:NDim) - DomainStart(1:NDim) + 1
146  dims(NDim+1)   = 1
147
148  count(NDim+1)  = 1
149  count(1:NDim)  = Length(1:NDim)
150
151  offset(NDim+1) = 0
152  offset(1:NDim) = PatchStart(1:NDim) - 1
153
154
155  ! allocate the dataspace to write hyperslab data
156
157  dimsfi = 0
158  do i = 1, NDim + 1
159     dimsfi(i) = count(i)
160  enddo
161
162  ! create the memory space id
163  call h5screate_simple_f(NDim+1,count,dspace_id,hdf5err,count)
164  if(hdf5err.lt.0) then
165     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
166     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
167     call wrf_debug ( WARN , msg)
168     deallocate(dims)
169     deallocate(count)
170     deallocate(offset)
171     deallocate(sizes)
172     return
173  endif
174
175
176  ! create file space
177  call h5screate_simple_f(NDim+1,dims,fspace_id,hdf5err,dims)
178  if(hdf5err.lt.0) then       
179     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
180     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
181     call wrf_debug ( WARN , msg)
182     deallocate(dims)
183     deallocate(count)
184     deallocate(offset)
185     deallocate(sizes)
186     return
187  endif
188
189  ! compact storage when the patch is equal to the whole domain
190  ! calculate the non-decomposed dataset size
191
192  call h5tget_size_f(FieldType,dsetsize,hdf5err)
193  if(hdf5err.lt.0) then
194     Status = WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
195     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
196     call wrf_debug ( WARN , msg)
197     deallocate(dims)
198     deallocate(count)
199     deallocate(offset)
200     deallocate(sizes)
201     return
202  endif
203
204  do i =1,NDim
205     dsetsize = dsetsize*dims(i)
206  enddo
207  if(no_par.and.(dsetsize.le.CompDsetSize)) then
208     call h5pcreate_f(H5P_DATASET_CREATE_F,crp_list,hdf5err)
209     if(hdf5err.lt.0) then
210        Status =  WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
211        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
212        call wrf_debug ( WARN , msg)
213        deallocate(dims)
214        deallocate(count)
215        deallocate(offset)
216        deallocate(sizes)
217        return
218     endif
219     call h5pset_layout_f(crp_list,0,hdf5err)
220     if(hdf5err.lt.0) then
221        Status =  WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
222        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
223        call wrf_debug ( WARN , msg)
224        deallocate(dims)
225        deallocate(count)
226        deallocate(offset)
227        deallocate(sizes)
228        return
229     endif
230     call h5dcreate_f(DH%TgroupIDs(TimeIndex),DatasetName,FieldType,fspace_id,dset_id,&
231          hdf5err,crp_list)
232     call h5pclose_f(crp_list,hdf5err)
233  else
234     call h5dcreate_f(DH%TgroupIDs(TimeIndex),DatasetName,FieldType,fspace_id,dset_id,hdf5err)
235  endif
236
237  if(hdf5err.lt.0) then
238     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_CREATE
239     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
240     call wrf_debug ( WARN , msg)
241     deallocate(dims)
242     deallocate(count)
243     deallocate(offset)
244     deallocate(sizes)
245     return
246  endif
247
248  ! select the correct hyperslab for file space id
249  CALL h5sselect_hyperslab_f(fspace_id, H5S_SELECT_SET_F, offset, count &
250       ,hdf5err)
251  if(hdf5err.lt.0) then
252     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_GENERAL
253     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
254     call wrf_debug ( WARN , msg)
255     deallocate(dims)
256     deallocate(count)
257     deallocate(offset)
258     deallocate(sizes)
259     return
260  endif
261
262  ! Create property list for collective dataset write
263  CALL h5pcreate_f(H5P_DATASET_XFER_F, xfer_list, hdf5err)
264  if(hdf5err.lt.0) then
265     Status =  WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
266     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
267     call wrf_debug ( WARN , msg)
268     deallocate(dims)
269     deallocate(count)
270     deallocate(offset)
271     deallocate(sizes)
272     return
273  endif
274
275  CALL h5pset_dxpl_mpio_f(xfer_list, H5FD_MPIO_COLLECTIVE_F&
276       ,hdf5err)
277  if(hdf5err.lt.0) then
278     Status =  WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
279     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
280     call wrf_debug ( WARN , msg)
281     deallocate(dims)
282     deallocate(count)
283     deallocate(offset)
284     deallocate(sizes)
285     return
286  endif
287
288
289  ! write the data in memory space to file space
290  CALL h5dwrite_f(dset_id,FieldType,XField,dimsfi,hdf5err,&
291       mem_space_id =dspace_id,file_space_id =fspace_id, &
292       xfer_prp = xfer_list)
293  if(hdf5err.lt.0) then
294     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_WRITE
295     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
296     call wrf_debug ( WARN , msg)
297     deallocate(dims)
298     deallocate(count)
299     deallocate(offset)
300     deallocate(sizes)
301     return
302  endif
303
304  CALL h5pclose_f(xfer_list,hdf5err)
305  if(hdf5err.lt.0) then
306     Status =  WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
307     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
308     call wrf_debug ( WARN , msg)
309     deallocate(dims)
310     deallocate(count)
311     deallocate(offset)
312     deallocate(sizes)
313     return
314  endif
315
316  if(TimeIndex == 1) then
317     do i =1, MaxVars
318        if(DH%dsetids(i) == -1) then
319           DH%dsetids(i) = dset_id
320           DH%VarNames(i) = DataSetName
321           exit
322        endif
323     enddo
324     ! Only writing attributes when TimeIndex ==1
325     call write_hdf5_attributes(DataHandle,MemoryOrder,WrfDType,DimRank,&
326          NDim,dset_id,Status)
327  endif
328
329  call h5sclose_f(fspace_id,hdf5err)
330  call h5sclose_f(dspace_id,hdf5err)
331  if(TimeIndex /= 1) then
332     call h5dclose_f(dset_id,hdf5err) 
333  endif
334  if(hdf5err.lt.0) then
335     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASPACE 
336     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
337     call wrf_debug ( WARN , msg)
338     deallocate(dims)
339     deallocate(count)
340     deallocate(offset)
341     deallocate(sizes)
342     return
343  endif
344  Status = WRF_NO_ERR
345  return
346end subroutine  HDF5IOWRITE
347
348
349subroutine ext_phdf5_ioinit(SysDepInfo, Status)
350
351  use wrf_phdf5_data
352  use HDF5
353  implicit none
354
355  include 'wrf_status_codes.h'
356  include 'mpif.h'
357
358  CHARACTER*(*), INTENT(IN) :: SysDepInfo
359  integer, intent(out) :: status
360  integer              :: hdf5err
361
362  ! set up some variables inside the derived type
363  WrfDataHandles(1:WrfDataHandleMax)%Free = .true.
364  ! ?
365  WrfDataHandles(1:WrfDataHandleMax)%TimesName    = 'Times'
366  WrfDataHandles(1:WrfDataHandleMax)%DimUnlimName = 'Time' 
367
368  ! set up HDF5 global variables
369  call h5open_f(hdf5err)
370  if(hdf5err .lt.0) then
371     Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
372     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
373     call wrf_debug ( WARN , msg)
374     return
375  endif
376  return
377end subroutine ext_phdf5_ioinit
378
379
380subroutine ext_phdf5_ioclose( DataHandle, Status)
381
382  use wrf_phdf5_data
383  use ext_phdf5_support_routines
384  use hdf5
385  implicit none
386  include 'wrf_status_codes.h'   
387  include 'mpif.h'
388
389  integer              ,intent(in)       :: DataHandle
390  integer              ,intent(out)      :: Status
391  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer     :: DH
392  integer                                :: stat
393  integer                                :: NVar
394  integer                                :: hdferr
395  integer                                :: table_length
396  integer                                :: i
397  integer(hid_t)                         :: dtype_id
398  integer                                :: obj_count
399  integer(hid_t),allocatable,dimension(:) :: obj_ids
400  character(len=100)                       :: buf
401  integer(size_t)                        :: name_size
402
403  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
404  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
405     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', 906
406     call wrf_debug ( WARN , msg)
407     return
408  endif
409
410  ! THE FOLLOWING section writes dimscale information to the data set,may be put into a subroutine
411
412  ! check the file status, should be either open_for_read or opened_and_committed
413  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_NOT_OPENED) then
414     Status = WRF_HDF5_ERR_FILE_OPEN
415     write(msg,*) 'Warning FILE NOT OPENED in ',__FILE__,', line', __LINE__
416     call wrf_debug ( WARN , msg)
417  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_NOT_COMMITTED) then
418     Status = WRF_HDF5_ERR_DRYRUN_CLOSE
419     write(msg,*) 'Warning TRY TO CLOSE DRYRUN in ',__FILE__,', line', __LINE__
420     call wrf_debug ( WARN , msg)
421
422  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_AND_COMMITTED) then
423     ! Handle dim. scale
424     ! STORE "Times" as the first element of the dimensional table
425
426     DH%DIMTABLE(1)%dim_name  = 'Time'
427     DH%DIMTABLE(1)%Length    = DH%TimeIndex
428     DH%DIMTABLE(1)%unlimited = 1
429
430     do i =1,MaxTabDims
431        if(DH%DIMTABLE(i)%dim_name== NO_NAME) then
432           exit
433        endif
434     enddo
435
436     table_length = i-1
437     call store_table(DataHandle,table_length,Status)
438     if(Status.ne.WRF_NO_ERR) then
439        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
440        call wrf_debug ( WARN , msg)
441        return
442     endif
443     continue   
444  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_FOR_READ) then
445     !     call h5dclose_f(DH%TimesID,hdferr)
446     !     if(hdferr.lt.0) then
447     !       Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_CLOSE
448     !       write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
449     !       call wrf_debug ( WARN , msg)
450     !       return
451     !     endif
452     continue
453  else
454     Status = WRF_HDF5_ERR_BAD_FILE_STATUS
455     write(msg,*) 'Fatal hdf5err BAD FILE STATUS in ',__FILE__,', line', __LINE__
456     call wrf_debug ( FATAL , msg)
457     return
458  endif
459
460  ! close HDF5 APIs
461  do NVar = 1, MaxVars
462     if(DH%DsetIDs(NVar) /= -1) then
463        call h5dclose_f(DH%DsetIDs(NVar),hdferr)
464        if(hdferr .ne. 0) then
465           Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_CLOSE
466           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
467           call wrf_debug ( WARN , msg)
468           return
469        endif
470     endif
471  enddo
472
473  do i = 1, MaxTimes
474     if(DH%TgroupIDs(i) /= -1) then
475        call h5gclose_f(DH%TgroupIDs(i),hdferr)
476        if(hdferr .ne. 0) then
477           Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_CLOSE
478           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
479           call wrf_debug ( WARN , msg)
480           return
481        endif
482     endif
483  enddo
484
485  call h5gclose_f(DH%GroupID,hdferr)
486  if(hdferr .ne. 0) then
487     Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
488     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
489     call wrf_debug ( WARN , msg)
490     return
491  endif
492
493  call h5gclose_f(DH%DimGroupID,hdferr)
494  if(hdferr .ne. 0) then
495     Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
496     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
497     call wrf_debug ( WARN , msg)
498     return
499  endif
500
501  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
502     write(msg,*) 'HDF5 IO CLOSE error in ',__FILE__,', line', __LINE__
503     call wrf_debug ( WARN , msg)
504     return
505  endif
506
507  call h5fclose_f(DH%FileID,hdferr)
508  if(hdferr .ne. 0) then
509     Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
510     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
511     call wrf_debug ( WARN , msg)
512     return
513  endif
514
515  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
516     write(msg,*) 'HDF5 IO CLOSE error in ',__FILE__,', line', __LINE__
517     call wrf_debug ( WARN , msg)
518     return
519  endif
520
521  call free_memory(DataHandle,Status)
522  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
523     Status = WRF_HDF5_ERR_OTHERS
524     write(msg,*) 'Warning Status = ',__FILE__,', line', __LINE__
525     call wrf_debug ( WARN , msg)
526     return
527  endif
528
529  DH%Free=.true.
530  return
531end subroutine ext_phdf5_ioclose
532
533
534subroutine ext_phdf5_ioexit(Status)
535
536  use wrf_phdf5_data
537  use ext_phdf5_support_routines
538  use HDF5
539  implicit none
540  include 'wrf_status_codes.h'
541  include 'mpif.h'
542
543  integer              ,intent(out)      :: Status
544  integer                                :: hdf5err
545  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer     :: DH
546  integer                                :: i
547  integer                                :: stat
548
549
550  ! free memories
551  do i=1,WrfDataHandleMax
552     if(.not.WrfDataHandles(i)%Free) then
553        call free_memory(i,Status)
554        exit
555     endif
556  enddo
557
558  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
559     write(msg,*) 'free resources error in ',__FILE__,', line', __LINE__
560     call wrf_debug ( WARN , msg)
561     return
562  endif
563
564  CALL h5close_f(hdf5err)
565
566  if(hdf5err.lt.0) then
567     Status = WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
568     write(msg,*) 'Fatal DEALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
569     call wrf_debug ( FATAL , msg)
570     return
571  endif
572
573  return
574end subroutine ext_phdf5_ioexit
575
576
577
578!! This routine will set up everything to read HDF5 files
579subroutine ext_phdf5_open_for_read(FileName,Comm,iocomm,SysDepInfo,DataHandle,Status)
580
581  use wrf_phdf5_data
582  use ext_phdf5_support_routines
583  use HDF5
584  implicit none
585  include 'mpif.h'
586  include 'wrf_status_codes.h'
587
588  character*(*),intent(in)                     :: FileName
589  integer      ,intent(in)                     :: Comm
590  integer      ,intent(in)                     :: iocomm
591  character*(*),intent(in)                     :: SysDepInfo
592  integer      ,intent(out)                    :: DataHandle
593  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer          :: DH
594  integer      ,intent(out)                    :: Status
595
596  integer(hid_t)                               :: Fileid
597  integer(hid_t)                               :: tgroupid
598  integer(hid_t)                               :: dsetid
599  integer(hid_t)                               :: dspaceid
600  integer(hid_t)                               :: dtypeid
601  integer(hid_t)                               :: acc_plist
602  integer                                      :: nmembers
603  integer                                      :: submembers
604  integer                                      :: tmembers
605  integer                                      :: ObjType
606  character(len= 256)                           :: ObjName
607  character(len= 256)                           :: GroupName
608
609  integer                                      :: i,j
610  integer(hsize_t), dimension(7)               :: data_dims
611  integer(hsize_t), dimension(1)               :: h5dims
612  integer(hsize_t), dimension(1)               :: h5maxdims
613  integer                                      :: StoredDim
614  integer                                      :: NumVars
615
616  integer                                      :: hdf5err
617  integer                                      :: info,mpi_size,mpi_rank 
618  character(Len = MaxTimeSLen)                 :: tname
619  character(Len = 512)                         :: tgroupname
620
621
622  ! Allocating the data handle
623  call allocHandle(DataHandle,DH,Comm,Status)
624  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
625     return
626  endif
627
628  call h5pcreate_f(H5P_FILE_ACCESS_F,acc_plist,hdf5err)
629  if(hdf5err.lt.0) then
630     Status =  WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
631     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
632     call wrf_debug ( WARN , msg)
633     return
634  endif
635
636  info = MPI_INFO_NULL
637  CALL h5pset_fapl_mpio_f(acc_plist, comm, info, hdf5err)
638  !   call h5pset_fapl_mpiposix_f(acc_plist,comm,.false.,hdf5err)
639  if(hdf5err .lt. 0) then
640     Status = WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
641     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
642     call wrf_debug ( WARN , msg)
643     return
644  endif
645  !close every objects when closing HDF5 file.
646  call h5pset_fclose_degree_f(acc_plist,H5F_CLOSE_STRONG_F,hdf5err)
647  if(hdf5err .lt. 0) then
648     Status = WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
649     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
650     call wrf_debug ( WARN , msg)
651     return
652  endif
653
654
655  ! Open the file
656  call h5fopen_f(FileName,H5F_ACC_RDWR_F,Fileid,hdf5err &
657       ,acc_plist)
658  if(hdf5err.lt.0) then
659     Status =  WRF_HDF5_ERR_FILE_OPEN
660     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
661     call wrf_debug ( WARN , msg)
662     return
663  endif
664  call h5pclose_f(acc_plist,hdf5err)
665  if(hdf5err .lt. 0) then
666     Status = WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
667     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
668     call wrf_debug ( WARN , msg)
669     return
670  endif
671
672
673  ! Obtain the number of group
674  DH%FileID = Fileid
675  call h5gn_members_f(Fileid,"/",nmembers,hdf5err)
676  if(hdf5err.lt.0) then
677     Status = WRF_HDF5_ERR_GROUP
678     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
679     call wrf_debug ( WARN , msg)
680     return
681  endif
682
683  ! Retrieve group id and dimensional group id, the index must be from 0
684  do i = 0, nmembers - 1
685     call h5gget_obj_info_idx_f(Fileid,"/",i,ObjName,ObjType,&
686          hdf5err)
687     if(hdf5err.lt.0) then
688        Status = WRF_HDF5_ERR_GROUP
689        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
690        call wrf_debug ( WARN , msg)
691        return
692     endif
693
694     if(ObjName=='DIM_GROUP') then
695
696        call h5gopen_f(Fileid,"/DIM_GROUP",DH%DimGroupID,hdf5err)
697        if(hdf5err.lt.0) then
698           Status = WRF_HDF5_ERR_GROUP
699           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
700           call wrf_debug ( WARN , msg)
701           return
702        endif
703
704        ! For WRF model, the first seven character must be DATASET
705     else if(ObjName(1:7)=='DATASET')then
706
707        GroupName="/"//ObjName
708        call h5gopen_f(Fileid,GroupName,DH%GroupID,hdf5err)
709        if(hdf5err.lt.0) then
710           Status = WRF_HDF5_ERR_GROUP
711           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
712           call wrf_debug ( WARN , msg)
713           return
714        endif
715
716        call h5gn_members_f(FileID,GroupName,submembers,Status)
717        if(hdf5err.lt.0) then
718           Status = WRF_HDF5_ERR_GROUP
719           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
720           call wrf_debug ( WARN , msg)
721           return
722        endif
723
724        do j = 0, submembers -1
725           call h5gget_obj_info_idx_f(Fileid,GroupName,j,ObjName,ObjType,hdf5err)
726           if(hdf5err.lt.0) then
727              Status = WRF_HDF5_ERR_GROUP
728              write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
729              call wrf_debug ( WARN , msg)
730              return
731           endif
732           call numtochar(j+1,tname)
733           tgroupname = 'TIME_STAMP_'//tname
734
735           if(ObjName(1:17)==tgroupname) then
736              call h5gopen_f(DH%GroupID,tgroupname,tgroupid,hdf5err)
737              if(hdf5err.lt.0) then
738                 Status = WRF_HDF5_ERR_GROUP
739                 write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
740                 call wrf_debug ( WARN , msg)
741                 return
742              endif
743              call h5gn_members_f(DH%GroupID,tgroupname,tmembers,hdf5err)
744              if(hdf5err.lt.0) then
745                 Status = WRF_HDF5_ERR_GROUP
746                 write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
747                 call wrf_debug ( WARN , msg)
748                 return
749              endif
750              call h5dopen_f(tgroupid,"Times",dsetid,hdf5err)
751              if(hdf5err.lt.0) then
752                 Status = WRF_HDF5_ERR_DATASET_OPEN
753                 write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
754                 call wrf_debug ( WARN , msg)
755                 return
756              endif
757              call h5dget_space_f(dsetid,dspaceid,hdf5err)
758              if(hdf5err.lt.0) then
759                 Status = WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
760                 write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
761                 call wrf_debug ( WARN , msg)
762                 return
763              endif
764              call h5sget_simple_extent_ndims_f(dspaceid,StoredDim,hdf5err)
765              if(hdf5err.lt.0) then
766                 Status = WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
767                 write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
768                 call wrf_debug ( WARN , msg)
769                 return
770              endif
771              call h5sget_simple_extent_dims_f(dspaceid,h5dims,h5maxdims,hdf5err) 
772              if(hdf5err.lt.0) then
773                 Status = WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
774                 write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
775                 call wrf_debug ( WARN , msg)
776                 return
777              endif
778              data_dims(1) = h5dims(1)
779              call h5dget_type_f(dsetid,dtypeid,hdf5err)
780              if(hdf5err.lt.0) then
781                 Status = WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
782                 write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
783                 call wrf_debug ( WARN , msg)
784                 return
785              endif
786              call h5dread_f(dsetid,dtypeid,DH%Times(j+1),data_dims,hdf5err)
787              if(hdf5err.lt.0) then
788                 Status = WRF_HDF5_ERR_DATASET_READ
789                 write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
790                 call wrf_debug ( WARN , msg)
791                 return
792              endif
793              DH%CurrentVariable = 0
794              DH%CurrentTime     = 0
795              DH%TimeIndex       = 0
796              call h5tclose_f(dtypeid,hdf5err)
797              call h5sclose_f(dspaceid,hdf5err)
798           endif
799        enddo
800        DH%NumberTimes = submembers
801
802        !       the total member of HDF5 dataset.
803        DH%NumVars = tmembers*submembers
804     else
805        Status = WRF_HDF5_ERR_OTHERS
806     endif
807  enddo
808
809  DH%FileStatus      = WRF_FILE_OPENED_FOR_READ
810  DH%FileName        = FileName
811
812  ! obtain dimensional scale table
813  call retrieve_table(DataHandle,Status)
814  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
815     return
816  endif
817  return
818
819end subroutine ext_phdf5_open_for_read
820
821
822subroutine ext_phdf5_inquire_opened(DataHandle,FileName,FileStatus,Status)
823
824  use wrf_phdf5_data
825  use ext_phdf5_support_routines
826  use HDF5
827  implicit none
828  include 'wrf_status_codes.h'
829  integer                    ,intent(in)     :: DataHandle
830  character*(*)              ,intent(in)     :: FileName
831  integer                    ,intent(out)    :: FileStatus
832  integer                    ,intent(out)    :: Status
833  type(wrf_phdf5_data_handle) ,pointer       :: DH
834
835
836  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
837  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
838     FileStatus = WRF_FILE_NOT_OPENED
839     return
840  endif
841  if(FileName /= DH%FileName) then
842     FileStatus = WRF_FILE_NOT_OPENED
843  else
844     FileStatus = DH%FileStatus
845  endif
846  Status = WRF_NO_ERR
847  return
848end subroutine ext_phdf5_inquire_opened
849
850
851subroutine ext_phdf5_inquire_filename(DataHandle,FileName,FileStatus,Status)
852
853  use wrf_phdf5_data
854  use ext_phdf5_support_routines
855  use HDF5
856  implicit none
857  include 'wrf_status_codes.h'
858
859  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
860  character*(*)         ,intent(out)     :: FileName
861  integer               ,intent(out)    :: FileStatus
862  integer               ,intent(out)    :: Status
863  type(wrf_phdf5_data_handle) ,pointer        :: DH
864
865  ! This line is added to make sure the wrong file will not be opened
866  FileStatus = WRF_FILE_NOT_OPENED
867
868  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
869  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
870     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,',line',__LINE__
871     call wrf_debug (WARN, msg)
872     return
873  endif
874
875  FileName = DH%FileName
876  FileStatus = DH%FileStatus
877  Status = WRF_NO_ERR
878
879  return
880end subroutine ext_phdf5_inquire_filename
881
882
883! The real routine to read HDF5 files
884subroutine ext_phdf5_read_field(DataHandle,DateStr,Var,Field,FieldType,Comm,  &
885     IOComm, DomainDesc, MemoryOrder, Stagger, DimNames, &
886     DomainStart,DomainEnd,MemoryStart,MemoryEnd, &
887     PatchStart,PatchEnd,Status)
888
889  use wrf_phdf5_data
890  use ext_phdf5_support_routines
891  use HDF5
892
893  implicit none
894  include 'wrf_status_codes.h'
895  integer                       ,intent(in)    :: DataHandle
896  character*(*)                 ,intent(in)    :: DateStr
897  character*(*)                 ,intent(in)    :: Var
898  integer                       ,intent(out)   :: Field(*)
899  integer                       ,intent(in)    :: FieldType
900  integer                       ,intent(inout) :: Comm
901  integer                       ,intent(inout) :: IOComm
902  integer                       ,intent(in)    :: DomainDesc
903  character*(*)                 ,intent(in)    :: MemoryOrder
904  character*(*)                 ,intent(in)    :: Stagger ! Dummy for now
905  character*(*) , dimension (*) ,intent(in)    :: DimNames
906  integer ,dimension(*)         ,intent(in)    :: DomainStart, DomainEnd
907  integer ,dimension(*)         ,intent(in)    :: MemoryStart, MemoryEnd
908  integer ,dimension(*)         ,intent(in)    :: PatchStart,  PatchEnd
909  integer                       ,intent(out)   :: Status
910
911  type(wrf_phdf5_data_handle)    ,pointer       :: DH
912  integer                                      :: NDim
913  integer(hid_t)                               :: GroupID
914  character (VarNameLen)                       :: VarName
915  integer ,dimension(NVarDims)                 :: Length
916  integer ,dimension(NVarDims)                 :: StoredStart
917  integer ,dimension(NVarDims)                 :: StoredLen
918  integer, dimension(NVarDims)                 :: TemDataStart
919  integer ,dimension(:,:,:,:)  ,allocatable    :: XField
920  integer                                      :: NVar
921  integer                                      :: j
922  integer                                      :: i1,i2,j1,j2,k1,k2
923  integer                                      :: x1,x2,y1,y2,z1,z2
924  integer                                      :: l1,l2,m1,m2,n1,n2
925  character (VarNameLen)                       :: Name
926  integer                                      :: XType
927  integer                                      :: StoredDim
928  integer                                      :: NAtts
929  integer                                      :: Len
930  integer                                      :: stat
931  integer                                      :: di
932  integer                                      :: FType
933  integer(hsize_t),dimension(7)                :: data_dims
934  integer(hsize_t),dimension(:) ,allocatable   :: h5_dims
935  integer(hsize_t),dimension(:) ,allocatable   :: h5_maxdims
936  integer(hsize_t),dimension(:) ,allocatable   :: DataStart
937  integer(hsize_t),dimension(:) ,allocatable   :: Datacount
938  integer(hid_t)                               :: tgroupid
939  integer(hid_t)                               :: dsetid
940  integer(hid_t)                               :: dtype_id
941  integer(hid_t)                               :: dmemtype_id
942  integer(hid_t)                               :: dspace_id
943  integer(hid_t)                               :: memspace_id
944  integer                                      :: class_type
945  integer                                      :: TimeIndex
946  logical                                      :: flag
947  integer                                      :: hdf5err
948
949  character(Len = MaxTimeSLen)                 :: tname
950  character(Len = 512)                         :: tgroupname
951
952
953  ! FOR PARALLEL IO
954  integer                                      :: mpi_rank
955  integer(hid_t)                               :: xfer_list
956
957
958  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
959  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
960     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
961     call wrf_debug ( WARN , msg)
962     return
963  endif
964
965  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_NOT_OPENED) then
966     Status = WRF_HDF5_ERR_FILE_NOT_OPENED
967     write(msg,*) 'Warning FILE NOT OPENED in ',__FILE__,', line', __LINE__
968     call wrf_debug ( WARN , msg)
969  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_NOT_COMMITTED) then
970     Status = WRF_HDF5_ERR_DRYRUN_READ
971     write(msg,*) 'Warning DRYRUN READ in ',__FILE__,', line', __LINE__
972     call wrf_debug ( WARN , msg)
973  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_AND_COMMITTED) then
974     Status = WRF_HDF5_ERR_READ_WONLY_FILE
975     write(msg,*) 'Warning READ WRITE ONLY FILE in ',__FILE__,', line', __LINE__
976     call wrf_debug ( WARN , msg)
977  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_FOR_READ) then
978
979     ! obtain TimeIndex
980     call GetDataTimeIndex('read',DataHandle,DateStr,TimeIndex,Status)
981
982     ! obtain the absolute name of the group where the dataset is located
983     call numtochar(TimeIndex,tname)
984     tgroupname = 'TIME_STAMP_'//tname
985
986     call h5gopen_f(DH%GroupID,tgroupname,tgroupid,hdf5err)
987     if(hdf5err.lt.0) then
988        Status = WRF_HDF5_ERR_GROUP
989        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
990        call wrf_debug ( WARN , msg)
991        return
992     endif
993
994     call h5dopen_f(tgroupid,Var,dsetid,hdf5err)
995     if(hdf5err.lt.0) then
996        Status = WRF_HDF5_ERR_DATASET_OPEN
997        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
998        call wrf_debug ( WARN , msg)
999        return
1000     endif
1001
1002     ! Obtain the memory datatype
1003     select case(FieldType)
1004     case (WRF_REAL)
1005        dmemtype_id = H5T_NATIVE_REAL
1006     case (WRF_DOUBLE)
1007        dmemtype_id = H5T_NATIVE_DOUBLE
1008     case (WRF_INTEGER)
1009        dmemtype_id = H5T_NATIVE_INTEGER
1010     case (WRF_LOGICAL)
1011        dmemtype_id = DH%EnumID
1012     case default
1013        Status = WRF_HDF5_ERR_DATA_TYPE_NOTFOUND
1014        write(msg,*) 'Warning BAD Memory Data type in ',__FILE__,',line',__LINE__
1015        call wrf_debug(WARN,msg)
1016        return
1017     end select
1018
1019     ! Obtain the datatype
1020     call h5dget_type_f(dsetid,dtype_id,hdf5err)
1021     if(hdf5err.lt.0) then
1022        Status = WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
1023        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1024        call wrf_debug ( WARN , msg)
1025        return
1026     endif
1027
1028     ! double check whether the Fieldtype is the type of the dataset
1029     ! we may do the force coercion between real and double
1030     call h5tget_class_f(dtype_id,class_type,hdf5err)
1031     if(hdf5err.lt.0) then
1032        Status = WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
1033        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1034        call wrf_debug ( WARN , msg)
1035        return
1036     endif
1037
1038     if( (FieldType == WRF_REAL .OR. FieldType == WRF_DOUBLE) ) then
1039        if ( class_type /= H5T_FLOAT_F)  then
1040           Status = WRF_HDF5_ERR_TYPE_MISMATCH
1041           write(msg,*) 'Warning TYPE MISMATCH in ',__FILE__,', line', __LINE__
1042           call wrf_debug ( WARN , msg)
1043           return
1044        endif
1045     else if(FieldType == WRF_CHARACTER) then
1046        if(class_type /= H5T_STRING_F) then
1047           Status = WRF_HDF5_ERR_TYPE_MISMATCH
1048           write(msg,*) 'Warning TYPE MISMATCH in ',__FILE__,', line', __LINE__
1049           call wrf_debug ( WARN , msg)
1050           return
1051        endif
1052     else if(FieldType == WRF_INTEGER) then
1053        if(class_type /= H5T_INTEGER_F) then
1054           Status = WRF_HDF5_ERR_TYPE_MISMATCH
1055           write(msg,*) 'Warning TYPE MISMATCH in ',__FILE__,', line', __LINE__
1056           call wrf_debug ( WARN , msg)
1057           return
1058        endif
1059     else if(FieldType == WRF_LOGICAL) then
1060        if(class_type /= H5T_ENUM_F) then
1061           Status = WRF_HDF5_ERR_TYPE_MISMATCH
1062           write(msg,*) 'Warning TYPE MISMATCH in ',__FILE__,', line', __LINE__
1063           call wrf_debug ( WARN , msg)
1064           return
1065        endif
1066        call h5tequal_f(dtype_id,DH%EnumID,flag,hdf5err)
1067        if(hdf5err.lt.0) then
1068           Status = WRF_HDF5_ERR_DATASET_OPEN
1069           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1070           call wrf_debug ( WARN , msg)
1071           return
1072        endif
1073        if(flag .EQV. .FALSE.) then
1074           Status = WRF_HDF5_ERR_TYPE_MISMATCH
1075           write(msg,*) 'Warning TYPE MISMATCH in ',__FILE__,', line', __LINE__
1076           call wrf_debug ( WARN , msg)
1077           return
1078        endif
1079     else
1080        Status = WRF_HDF5_ERR_BAD_DATA_TYPE
1081        write(msg,*)'Fatal Non-WRF supported TYPE in ',__FILE__,', line',__LINE__
1082        call wrf_debug(FATAL, msg)
1083        return
1084     endif
1085
1086     ! Obtain the dataspace, check whether the dataspace is within the range
1087     ! transpose the memory order to the disk order
1088     call h5dget_space_f(dsetid,dspace_id,hdf5err)
1089     if(hdf5err.lt.0) then
1090        Status = WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
1091        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1092        call wrf_debug ( WARN , msg)
1093        return
1094     endif
1095
1096     call GetDim(MemoryOrder,NDim,Status)
1097
1098     Length(1:NDim) = PatchEnd(1:NDim)-PatchStart(1:NDim)+1
1099     call ExtOrder(MemoryOrder,Length,Status)
1100
1101     ! Obtain the rank of the dimension
1102     call h5sget_simple_extent_ndims_f(dspace_id,StoredDim,hdf5err)
1103     if(hdf5err.lt.0) then
1104        Status = WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
1105        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1106        call wrf_debug ( WARN , msg)
1107        return
1108     endif
1109
1110     ! From NetCDF implementation, only do error handling
1111     if((NDim+1) /= StoredDim) then
1112        Status = WRF_HDF5_ERR_BAD_VARIABLE_DIM
1113        write(msg,*) 'Fatal error BAD VARIABLE DIMENSION in ',__FILE__,', line', __LINE__
1114        call wrf_debug ( FATAL , msg)
1115        return
1116     endif
1117     allocate(h5_dims(StoredDim))
1118     allocate(h5_maxdims(StoredDim))
1119     allocate(DataStart(StoredDim))
1120     allocate(DataCount(StoredDim))
1121
1122     call h5sget_simple_extent_dims_f(dspace_id,h5_dims,h5_maxdims,hdf5err)
1123     if(hdf5err.lt.0) then
1124        Status = WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
1125        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1126        call wrf_debug ( WARN , msg)
1127        return
1128     endif
1129
1130     ! This part of code needs to be adjusted, currently use NetCDF convention 
1131     do j = 1, NDim
1132        if(Length(j) > h5_dims(j)) then
1133           Status = WRF_HDF5_ERR_READ_PAST_EOF
1134           write(msg,*) 'Warning READ PAST EOF in ',__FILE__,', line', __LINE__
1135           call wrf_debug ( WARN , msg)
1136           return
1137        elseif(Length(j) <= 0) then
1138           Status = WRF_HDF5_ERR_ZERO_LENGTH_READ
1139           write(msg,*) 'Warning ZERO LENGTH READ in ',__FILE__,', line', __LINE__
1140           call wrf_debug ( WARN , msg)
1141           return
1142        endif
1143     enddo
1144
1145     ! create memspace_id
1146     data_dims(1:NDim) = Length(1:NDim)
1147     data_dims(NDim+1) = 1
1148
1149     call h5screate_simple_f(NDim+1,data_dims,memspace_id,hdf5err)
1150     if(hdf5err.lt.0) then
1151        Status = WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
1152        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1153        call wrf_debug ( WARN , msg)
1154        return
1155     endif
1156
1157     ! DataStart can start from PatchStart.
1158     TEMDataStart(1:NDim) = PatchStart(1:NDim)-1
1159
1160     if(MemoryOrder.NE.'0') then
1161        call ExtOrder(MemoryOrder,TEMDataStart,Status)
1162     endif
1163
1164     DataStart(1:NDim) = TEMDataStart(1:NDim)
1165     DataStart(NDim+1) = 0
1166     DataCount(1:NDim) = Length(1:NDim)
1167     DataCount(NDim+1) = 1
1168
1169     ! transpose the data XField to Field
1170     call GetIndices(NDim,MemoryStart,MemoryEnd,l1,l2,m1,m2,n1,n2)
1171     StoredStart = 1
1172     StoredLen(1:NDim) = Length(1:NDim)
1173
1174     ! the dimensional information inside the disk may be greater than
1175     ! the dimension(PatchEnd-PatchStart); here we can speed up
1176     ! the performance by using hyperslab selection
1177     call GetIndices(NDim,StoredStart,StoredLen,x1,x2,y1,y2,z1,z2)
1178     call GetIndices(NDim,PatchStart,PatchEnd,i1,i2,j1,j2,k1,k2)
1179
1180     ! di is for double type data
1181     di = 1
1182     if(FieldType == WRF_DOUBLE) di = 2
1183     allocate(XField(di,x1:x2,y1:y2,z1:z2), STAT=stat)
1184
1185     ! use hyperslab to only read this current timestamp
1186     call h5sselect_hyperslab_f(dspace_id,H5S_SELECT_SET_F, &
1187          DataStart,DataCount,hdf5err)
1188     if(hdf5err.lt.0) then
1189        Status = WRF_HDF5_ERR_DATASET_GENERAL
1190        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1191        call wrf_debug ( WARN , msg)
1192        return
1193     endif
1194
1195     ! read the data in this time stamp
1196     call h5dread_f(dsetid,dmemtype_id,XField,data_dims,hdf5err, &
1197          memspace_id,dspace_id,H5P_DEFAULT_F)
1198     if(hdf5err.lt.0) then
1199        Status = WRF_HDF5_ERR_DATASET_READ
1200        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1201        call wrf_debug ( WARN , msg)
1202        return
1203     endif
1204
1205     call transpose_hdf5('read',MemoryOrder,di, Field,l1,l2,m1,m2,n1,n2 &
1206          ,XField,x1,x2,y1,y2,z1,z2 &
1207          ,i1,i2,j1,j2,k1,k2 )
1208
1209     deallocate(XField, STAT=stat)
1210     if(stat/= 0) then
1211        Status = WRF_HDF5_ERR_DEALLOCATION
1212        write(msg,*) 'Fatal DEALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
1213        call wrf_debug ( FATAL , msg)
1214        return
1215     endif
1216
1217     call h5dclose_f(dsetid,hdf5err)
1218     if(hdf5err.lt.0) then
1219        Status = WRF_HDF5_ERR_DATASET_CLOSE
1220        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1221        call wrf_debug ( WARN , msg)
1222        return
1223     endif
1224     deallocate(h5_dims)
1225     deallocate(h5_maxdims)
1226     deallocate(DataStart)
1227     deallocate(DataCount)
1228  else
1229     Status = WRF_HDF5_ERR_BAD_FILE_STATUS
1230     write(msg,*) 'Fatal error BAD FILE STATUS in ',__FILE__,', line', __LINE__
1231     call wrf_debug ( FATAL , msg)
1232  endif
1233
1234  DH%first_operation  = .FALSE.
1235
1236  return
1237end subroutine ext_phdf5_read_field
1238
1239!! This routine essentially sets up everything to write HDF5 files
1240SUBROUTINE ext_phdf5_open_for_write_begin(FileName,Comm,IOComm,SysDepInfo,DataHandle,Status)
1241
1242  use wrf_phdf5_data
1243  use HDF5
1244  use ext_phdf5_support_routines
1245  implicit none
1246  include 'mpif.h'
1247  include 'wrf_status_codes.h'
1248
1249  character*(*)        ,intent(in)            :: FileName
1250  integer              ,intent(in)            :: Comm
1251  integer              ,intent(in)            :: IOComm
1252  character*(*)        ,intent(in)            :: SysDepInfo
1253  integer              ,intent(out)           :: DataHandle
1254  integer              ,intent(out)           :: Status
1255  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer          :: DH
1256  integer(hid_t)                              :: file5_id
1257  integer(hid_t)                              :: g_id
1258  integer(hid_t)                              :: gdim_id
1259  integer                                     :: hdferr
1260  integer                                     :: i
1261  integer                                     :: stat
1262  character (7)                               :: Buffer
1263  integer                                     :: VDimIDs(2)
1264  character(Len = 512)                        :: groupname
1265
1266  ! For parallel IO
1267  integer(hid_t)                              :: plist_id
1268  integer                                     :: hdf5_comm,info,mpi_size,mpi_rank 
1269
1270
1271  call allocHandle(DataHandle,DH,Comm,Status)
1272  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1273     write(msg,*) 'Fatal ALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
1274     call wrf_debug ( FATAL , msg)
1275     return
1276  endif
1277  DH%TimeIndex = 0
1278  DH%Times     = ZeroDate
1279
1280  CALL h5pcreate_f(H5P_FILE_ACCESS_F, plist_id, hdferr)
1281  if(hdferr .lt. 0) then
1282     Status = WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
1283     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1284     call wrf_debug ( WARN , msg)
1285     return
1286  endif
1287
1288  info      = MPI_INFO_NULL
1289
1290  CALL h5pset_fapl_mpio_f(plist_id, comm, info, hdferr)
1291
1292  if(hdferr .lt. 0) then
1293     Status = WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
1294     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1295     call wrf_debug ( WARN , msg)
1296     return
1297  endif
1298
1299  call h5fcreate_f(FileName,H5F_ACC_TRUNC_F,file5_id,hdferr &
1300       ,access_prp = plist_id)
1301  if(hdferr .lt. 0) then
1302     Status = WRF_HDF5_ERR_FILE_CREATE
1303     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1304     call wrf_debug ( WARN , msg)
1305     return
1306  endif
1307
1308  call h5pclose_f(plist_id,hdferr)
1309  if(hdferr .lt. 0) then
1310     Status = WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
1311     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1312     call wrf_debug ( WARN , msg)
1313     return
1314  endif
1315
1316  DH%FileStatus            = WRF_FILE_OPENED_NOT_COMMITTED
1317  DH%FileName              = FileName
1318  ! should add a check to see whether the file opened has been used by previous handles
1319  DH%VarNames  (1:MaxVars) = NO_NAME
1320  DH%MDVarNames(1:MaxVars) = NO_NAME
1321
1322  ! group name information is stored at SysDepInfo
1323  groupname = "/"//SysDepInfo
1324!  write(*,*) "groupname ",groupname
1325  call h5gcreate_f(file5_id,groupname,g_id,hdferr)
1326  if(hdferr .lt. 0) then
1327     Status = WRF_HDF5_ERR_GROUP
1328     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1329     call wrf_debug ( WARN , msg)
1330     return
1331  endif
1332
1333  ! create dimensional group id
1334  call h5gcreate_f(file5_id,"/DIM_GROUP",gdim_id,hdferr)
1335  if(hdferr .lt. 0) then
1336     Status = WRF_HDF5_ERR_GROUP
1337     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1338     call wrf_debug ( WARN , msg)
1339     return
1340  endif
1341
1342  DH%FileID     = file5_id
1343  DH%GroupID    = g_id
1344  DH%DIMGroupID = gdim_id
1345
1346  return
1347
1348end subroutine ext_phdf5_open_for_write_begin
1349
1350! HDF5 doesnot need this stage, basically this routine
1351! just updates the File status.
1352SUBROUTINE ext_phdf5_open_for_write_commit(DataHandle, Status)
1353
1354  use wrf_phdf5_data
1355  use ext_phdf5_support_routines
1356  use HDF5
1357  implicit none
1358  include 'wrf_status_codes.h'
1359
1360  integer              ,intent(in)       :: DataHandle
1361  integer              ,intent(out)      :: Status
1362  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer     :: DH
1363  integer(hid_t)                         :: enum_type
1364  integer                                :: i
1365  integer                                :: stat
1366
1367
1368  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
1369  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1370     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1371     call wrf_debug ( WARN , msg)
1372     return
1373  endif
1374
1375  DH%FileStatus  = WRF_FILE_OPENED_AND_COMMITTED
1376  DH%first_operation  = .TRUE.
1377  return
1378end subroutine ext_phdf5_open_for_write_commit
1379
1380! The real routine to write HDF5 file
1381subroutine ext_phdf5_write_field(DataHandle,DateStr,Var,Field,FieldType,&
1382     Comm,IOComm,DomainDesc,MemoryOrder,  &
1383     Stagger,DimNames,DomainStart,DomainEnd,&
1384     MemoryStart,MemoryEnd,PatchStart,PatchEnd,&
1385     Status)
1386
1387  use wrf_phdf5_data
1388  use ext_phdf5_support_routines
1389  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
1390  implicit none
1391  include 'wrf_status_codes.h'
1392
1393  integer                       ,intent(in)      :: DataHandle
1394  character*(*)                 ,intent(in)      :: DateStr
1395  character*(*)                 ,intent(in)      :: Var
1396  integer                       ,intent(inout)   :: Field(*)
1397  integer                       ,intent(in)      :: FieldType
1398  integer                       ,intent(inout)   :: Comm
1399  integer                       ,intent(inout)   :: IOComm
1400  integer                       ,intent(in)      :: DomainDesc
1401  character*(*)                 ,intent(in)      :: MemoryOrder
1402  character*(*)                 ,intent(in)      :: Stagger ! Dummy for now
1403  character*(*) , dimension (*) ,intent(in)      :: DimNames
1404  integer ,dimension(*)         ,intent(in)      :: DomainStart, DomainEnd
1405  integer ,dimension(*)         ,intent(in)      :: MemoryStart, MemoryEnd
1406  integer ,dimension(*)         ,intent(in)      :: PatchStart,  PatchEnd
1407  integer                       ,intent(out)     :: Status
1408
1409  type(wrf_phdf5_data_handle)    ,pointer        :: DH
1410  integer(hid_t)                                 :: GroupID
1411  integer                                        :: NDim
1412  character (VarNameLen)                         :: VarName
1413  character (3)                                  :: MemO
1414  character (3)                                  :: UCMemO
1415  integer(hid_t)                                 :: DsetID
1416  integer      ,dimension(NVarDims)              :: Length
1417  integer      ,dimension(NVarDims)              :: DomLength
1418  integer      ,dimension(NVarDims+1)            :: DimRank
1419  character(256),dimension(NVarDims)              :: RODimNames
1420  integer      ,dimension(NVarDims)              :: StoredStart
1421  integer      ,dimension(:,:,:,:),allocatable   :: XField
1422  integer      ,dimension(:,:,:,:),allocatable   :: BUFFER! for logical field
1423  integer                                        :: stat
1424  integer                                        :: NVar
1425  integer                                        :: i,j,k,m,dim_flag
1426  integer                                        :: i1,i2,j1,j2,k1,k2
1427  integer                                        :: x1,x2,y1,y2,z1,z2
1428  integer                                        :: l1,l2,m1,m2,n1,n2
1429  integer(hid_t)                                 :: XType
1430  integer                                        :: di
1431  character (256)                                 :: NullName
1432  integer                                        :: TimeIndex
1433  integer ,dimension(NVarDims+1)                 :: temprank
1434  logical                                        :: NotFound
1435
1436
1437  NullName = char(0)
1438  dim_flag = 0
1439
1440  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
1441  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1442     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1443     call wrf_debug ( WARN , msg)
1444     return
1445  endif
1446
1447  ! Examine here, Nov. 7th, 2003
1448  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_AND_COMMITTED) then
1449
1450     ! obtain group id and initialize the rank of dimensional attributes
1451     GroupID = DH%GroupID
1452     DimRank = -1
1453
1454     ! get the rank of the dimension based on MemoryOrder string(cleaver from NetCDF)
1455     call GetDim(MemoryOrder,NDim,Status)
1456     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1457        write(msg,*) 'Warning BAD MEMORY ORDER in ',__FILE__,', line', __LINE__
1458        call wrf_debug ( WARN , msg)
1459        return
1460     endif
1461
1462     ! check whether the DateStr is the correct length
1463     call DateCheck(DateStr,Status)
1464     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1465        write(msg,*) 'Warning DATE STRING ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
1466        call wrf_debug ( WARN , msg)
1467        return
1468     endif
1469
1470     ! get the dataset name and dimensional information of the data
1471     VarName           = Var
1472     Length(1:NDim)    = PatchEnd(1:NDim) - PatchStart(1:NDim) + 1
1473     DomLength(1:NDim) = DomainEnd(1:NDim) - DomainStart(1:NDim) + 1
1474
1475     ! Transposing the data order and dim. string order, store to RODimNames
1476     call ExtOrder(MemoryOrder,Length,Status)
1477     call ExtOrder(MemoryOrder,DomLength,Status)
1478     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1479        write(msg,*) 'Warning BAD MEMORY ORDER in ',__FILE__,', line', __LINE__
1480        call wrf_debug ( WARN , msg)
1481        return
1482     endif
1483
1484     ! Map datatype from WRF to HDF5
1485     select case (FieldType)
1486     case (WRF_REAL)
1487        XType = H5T_NATIVE_REAL
1488     case (WRF_DOUBLE)
1489        Xtype = H5T_NATIVE_DOUBLE
1490     case (WRF_INTEGER)
1491        XType = H5T_NATIVE_INTEGER
1492     case (WRF_LOGICAL)
1493        XType = DH%EnumID
1494     case default
1495        Status = WRF_HDF5_ERR_DATA_TYPE_NOTFOUND
1496        return
1497     end select
1498
1499     ! HANDLE  with dim. scale
1500     ! handle dimensional scale data; search and store them in a table.
1501     ! The table is one dimensional array of compound data type. One member of
1502     ! the type is HDF5 string, representing the name of the dim(west_east_stag eg.)
1503     ! Another number is the length of the dimension(west_east_stag = 31)
1504     ! In this part, we will not store TIME but leave it at the end since the time
1505     ! index won't be known until the end of the run; since all fields(HDF5 datasets)
1506     ! have the same timestamp, writing it once should be fine.
1507
1508     ! 1) create a loop for dimensions
1509     call GetDataTimeIndex('write',DataHandle,DateStr,TimeIndex,Status)
1510     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1511        return
1512     endif
1513
1514     if(TimeIndex == 1) then
1515
1516        ! 2) get the dim. name, the first dim. is reserved for time,
1517        call ExtOrderStr(MemoryOrder,DimNames,RODimNames,Status)
1518        if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1519           write(msg,*) 'Warning BAD MEMORY ORDER in ',__FILE__,', line', __LINE__
1520           call wrf_debug ( WARN , msg)
1521           return
1522        endif
1523        ! 3) get the dim. length
1524        ! 4) inside the loop, search the table for dimensional name( table module)
1525        !    IF FOUND, go to the next dimension, return the table dimensional rank
1526        !    (For example, find west_east_stag in the table, the rank of "west_east_stag"
1527        !     is 3; so return 3 for the array dimrank.)
1528        !    in the table; so through the table, we can find the information
1529        !    such as names, length of this dimension
1530        ! 4.1) save the rank into an array for attribute
1531        !      if not found,  go to 5)
1532        ! 4)' the first dimension is reserved for time, so table starts from j = 2
1533        !
1534        ! 5) NOT FOUND, inside the loop add the new dimensional information to the
1535        ! table(table module)
1536
1537        ! The first dimension of the field is always "time" and "time"
1538        ! is also the first dimension of the "table".
1539        k = 2
1540        DimRank(1) = 1
1541
1542        do i = 1,NDim
1543           do j = 2,MaxTabDims
1544
1545              ! Search for the table and see if we are at the end of the table
1546              if (DH%DIMTABLE(j)%dim_name == NO_NAME) then
1547
1548                 ! Sometimes the RODimNames is NULLName or ''. If that happens,
1549                 ! we will search the table from the beginning and see
1550                 ! whether the name is FAKEDIM(the default name) and  the
1551                 ! current length of the dim. is the same as that of FAKEDIM;
1552                 ! if yes, use this FAKEDIM for the current field dim.
1553
1554                 if(RODimNames(i) ==''.or. RODimNames(i)==NullName) then
1555                    do m = 2,j
1556                       if(DomLength(i)==DH%DIMTABLE(m)%Length.and. &
1557                            DH%DIMTABLE(m)%dim_name(1:7)=='FAKEDIM')then
1558                          DimRank(k) = m
1559                          k = k + 1
1560                          dim_flag = 1
1561                          exit
1562                       endif
1563                    enddo
1564                    ! No FAKEDIM and the same length dim. is found,
1565                    ! Add another dimension "FAKEDIM + j", with the length
1566                    ! as DomLength(i)
1567                    if (dim_flag == 1) then
1568                       dim_flag = 0
1569                    else   
1570                       RODimNames(i) = 'FAKEDIM'//achar(j+iachar('0'))
1571                       DH%DIMTABLE(j)%dim_name  = RODimNames(i)
1572                       DH%DIMTABLE(j)%length    = DomLength(i)
1573                       DimRank(k) = j
1574                       k          = k + 1
1575                    endif
1576                    ! no '' or NULLName is found, then assign this RODimNames
1577                    ! to the dim. table.
1578                 else
1579                    DH%DIMTABLE(j)%dim_name  = RODimNames(i)
1580                    DH%DIMTABLE(j)%length    = DomLength(i)
1581                    DimRank(k)               = j
1582                    k = k + 1
1583                 endif
1584                 exit
1585                 ! If we found the current dim. in the table already,save the rank
1586              else if(DH%DIMTABLE(j)%dim_name == RODimNames(i)) then
1587                 ! remember the rank of dimensional scale
1588                 DimRank(k) = j
1589                 k = k + 1
1590                 exit
1591              else
1592                 continue
1593              endif
1594           enddo
1595        enddo
1596     endif ! end of timeindex of 1
1597
1598     ! 6) create an attribute array called DimRank to store the rank of the attribute.
1599     !    This will be done in the HDF5IOWRITE routine       
1600
1601     ! 7) before the end of the run, 1) update time, 2) write the table to HDF5.
1602
1603     ! get the index of l1,.......for writing HDF5 file.
1604     StoredStart = 1
1605     call GetIndices(NDim,MemoryStart,MemoryEnd,l1,l2,m1,m2,n1,n2)
1606     call GetIndices(NDim,StoredStart,Length   ,x1,x2,y1,y2,z1,z2)
1607     call GetIndices(NDim,PatchStart, PatchEnd ,i1,i2,j1,j2,k1,k2)
1608     di=1
1609     if(FieldType == WRF_DOUBLE) di = 2
1610     allocate(XField(di,x1:x2,y1:y2,z1:z2), STAT=stat)
1611     if(stat/= 0) then
1612        Status = WRF_ERR_FATAL_ALLOCATION_ERROR
1613        write(msg,*) 'Fatal ALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line',__LINE__
1614        call wrf_debug ( FATAL , msg)
1615        return
1616     endif
1617
1618     ! Transpose the real data for tools people
1619     call Transpose_hdf5('write',MemoryOrder,di, Field,l1,l2,m1,m2,n1,n2 &
1620          ,XField,x1,x2,y1,y2,z1,z2 &
1621          ,i1,i2,j1,j2,k1,k2 )
1622
1623     ! handle with logical data separately,because of not able to
1624     ! map Fortran Logical type to C type
1625     if(FieldType .eq. WRF_LOGICAL) then
1626        allocate(BUFFER(di,x1:x2,y1:y2,z1:z2), STAT=stat)
1627        do k =z1,z2
1628           do j = y1,y2
1629              do i = x1,x2
1630                 do m = 1,di
1631                    if(XField(m,i,j,k)/= 0) then
1632                       BUFFER(m,i,j,k) = 1
1633                    else
1634                       BUFFER(m,i,j,k) = 0
1635                    endif
1636                 enddo
1637              enddo
1638           enddo
1639        enddo
1640        call HDF5IOWRITE(DataHandle,Comm,DateStr,Length,DomainStart, DomainEnd &
1641             ,PatchStart,PatchEnd, MemoryOrder &
1642             ,FieldType,XType,groupID,TimeIndex,DimRank &
1643             ,Var,BUFFER,Status)
1644        deallocate(BUFFER,STAT=stat)
1645        if(stat/=0) then
1646           Status = WRF_ERR_FATAL_ALLOCATION_ERROR
1647           write(msg,*) 'Fatal ALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line',__LINE__
1648           call wrf_debug ( FATAL , msg)
1649           return
1650        endif
1651     else
1652        call HDF5IOWRITE(DataHandle,Comm,DateStr,Length, DomainStart, DomainEnd &
1653             ,PatchStart, PatchEnd, MemoryOrder &
1654             ,FieldType,XType,groupID,TimeIndex,DimRank &
1655             ,Var,XField,Status)
1656     endif
1657
1658     if (Status /= WRF_NO_ERR) then
1659        return
1660     endif
1661
1662     deallocate(XField,STAT=stat)
1663     if(stat/=0) then
1664        Status = WRF_ERR_FATAL_ALLOCATION_ERROR
1665        write(msg,*) 'Fatal ALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line',__LINE__
1666        call wrf_debug ( FATAL , msg)
1667        return
1668     endif
1669  endif
1670
1671  DH%first_operation  = .FALSE.
1672
1673  return
1674
1675end subroutine ext_phdf5_write_field
1676
1677! set_time routine is only used for open_for_read
1678subroutine ext_phdf5_set_time(DataHandle, DateStr, Status)
1679
1680  use wrf_phdf5_data
1681  use ext_phdf5_support_routines
1682  use HDF5
1683  implicit none
1684  include 'wrf_status_codes.h'
1685
1686  integer               ,intent(in)          :: DataHandle
1687  character*(*)         ,intent(in)          :: DateStr
1688  integer               ,intent(out)         :: Status
1689  type(wrf_phdf5_data_handle) ,pointer        :: DH
1690  integer                                    :: i
1691
1692  ! check whether the Date length is equal to DateStrLen defined at wrf_phdf5_data
1693  ! sees not enough, leave it for the time being 3/12/2003
1694  call DateCheck(DateStr,Status)
1695  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1696     write(msg,*) 'Warning DATE STRING ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
1697     call wrf_debug ( WARN , msg)
1698     return
1699  endif
1700
1701  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
1702  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1703     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1704     call wrf_debug ( WARN , msg)
1705     return
1706  endif
1707  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_NOT_OPENED) then
1708     Status = WRF_HDF5_ERR_FILE_NOT_OPENED
1709     write(msg,*) 'Warning FILE NOT OPENED in ',__FILE__,', line', __LINE__
1710     call wrf_debug ( WARN , msg)
1711  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_NOT_COMMITTED) then
1712     Status = WRF_HDF5_ERR_FILE_NOT_COMMITTED
1713     write(msg,*) 'Warning FILE NOT COMMITTED in ',__FILE__,', line', __LINE__
1714     call wrf_debug ( WARN , msg)
1715  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_AND_COMMITTED) then
1716     Status = WRF_HDF5_ERR_READ_WONLY_FILE
1717     write(msg,*) 'Warning READ WRITE ONLY FILE in ',__FILE__,', line', __LINE__
1718     call wrf_debug ( WARN , msg)
1719  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_FOR_READ) then
1720     do i=1,MaxTimes
1721        if(DH%Times(i)==DateStr) then
1722           DH%CurrentTime = i
1723           exit
1724        endif
1725        if(i==MaxTimes) then
1726           Status = WRF_HDF5_ERR_TIME
1727           return
1728        endif
1729     enddo
1730     DH%CurrentVariable = 0
1731     Status = WRF_NO_ERR
1732  else
1733     Status = WRF_HDF5_ERR_BAD_FILE_STATUS
1734     write(msg,*) 'FATAL BAD FILE STATUS in ',__FILE__,', line', __LINE__
1735     call wrf_debug ( FATAL , msg)
1736  endif
1737  return
1738end subroutine ext_phdf5_set_time
1739
1740! get_next_time routine is only used for open_for_read
1741subroutine ext_phdf5_get_next_time(DataHandle, DateStr, Status)
1742  use wrf_phdf5_data
1743  use ext_phdf5_support_routines
1744  use HDF5
1745  implicit none
1746  include 'wrf_status_codes.h'
1747
1748  integer               ,intent(in)          :: DataHandle
1749  character*(*)         ,intent(out)         :: DateStr
1750  integer               ,intent(out)         :: Status
1751  type(wrf_phdf5_data_handle) ,pointer        :: DH
1752
1753  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
1754  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1755     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1756     call wrf_debug ( WARN , msg)
1757     return
1758  endif
1759
1760  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_NOT_OPENED) then
1761     Status = WRF_HDF5_ERR_FILE_NOT_OPENED
1762     write(msg,*) 'Warning FILE NOT OPENED in ',__FILE__,', line', __LINE__
1763     call wrf_debug ( WARN , msg)
1764  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_NOT_COMMITTED) then
1765     Status = WRF_HDF5_ERR_DRYRUN_READ
1766     write(msg,*) 'Warning DRYRUN READ in ',__FILE__,', line', __LINE__
1767     call wrf_debug ( WARN , msg)
1768  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_AND_COMMITTED) then
1769     Status = WRF_HDF5_ERR_READ_WONLY_FILE
1770     write(msg,*) 'Warning READ WRITE ONLY FILE in ',__FILE__,', line', __LINE__
1771     call wrf_debug ( WARN , msg)
1772  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_FOR_READ) then
1773     if(DH%CurrentTime >= DH%NumberTimes) then
1774        Status = WRF_HDF5_ERR_TIME
1775        write(msg,*) 'Warning READ WRITE ONLY FILE in ',__FILE__,', line', __LINE__
1776        call wrf_debug ( WARN , msg)
1777        return
1778     endif
1779     DH%CurrentTime     = DH%CurrentTime +1
1780     DateStr            = DH%Times(DH%CurrentTime)
1781     DH%CurrentVariable = 0
1782     Status = WRF_NO_ERR
1783  else
1784     Status = WRF_HDF5_ERR_BAD_FILE_STATUS
1785     write(msg,*) 'Fatal error BAD FILE STATUS in ',__FILE__,', line', __LINE__
1786     call wrf_debug ( FATAL , msg)
1787  endif
1788  return
1789end subroutine ext_phdf5_get_next_time
1790
1791! get_previous_time routine
1792subroutine ext_phdf5_get_previous_time(DataHandle, DateStr, Status)
1793  use wrf_phdf5_data
1794  use ext_phdf5_support_routines
1795  use HDF5
1796  implicit none
1797  include 'wrf_status_codes.h'
1798
1799  integer               ,intent(in)          :: DataHandle
1800  character*(*)         ,intent(out)         :: DateStr
1801  integer               ,intent(out)         :: Status
1802  type(wrf_phdf5_data_handle) ,pointer        :: DH
1803
1804  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
1805  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1806     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1807     call wrf_debug ( WARN , msg)
1808     return
1809  endif
1810
1811  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_NOT_OPENED) then
1812     Status = WRF_HDF5_ERR_FILE_NOT_OPENED
1813     write(msg,*) 'Warning FILE NOT OPENED in ',__FILE__,', line', __LINE__
1814     call wrf_debug ( WARN , msg)
1815  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_NOT_COMMITTED) then
1816     Status = WRF_HDF5_ERR_DRYRUN_READ
1817     write(msg,*) 'Warning DRYRUN READ in ',__FILE__,', line', __LINE__
1818     call wrf_debug ( WARN , msg)
1819  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_AND_COMMITTED) then
1820     Status = WRF_HDF5_ERR_READ_WONLY_FILE
1821     write(msg,*) 'Warning READ WRITE ONLY FILE in ',__FILE__,', line', __LINE__
1822     call wrf_debug ( WARN , msg)
1823  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_FOR_READ) then
1824     if(DH%CurrentTime.GT.0) then
1825       DH%CurrentTime = DH%CurrentTime - 1
1826     endif
1827     DateStr            = DH%Times(DH%CurrentTime)
1828     DH%CurrentVariable = 0
1829     Status = WRF_NO_ERR
1830  else
1831     Status = WRF_HDF5_ERR_BAD_FILE_STATUS
1832     write(msg,*) 'Fatal error BAD FILE STATUS in ',__FILE__,', line', __LINE__
1833     call wrf_debug ( FATAL , msg)
1834  endif
1835  return
1836end subroutine ext_phdf5_get_previous_time
1837
1838subroutine ext_phdf5_get_var_info(DataHandle,Name,NDim,MemoryOrder,Stagger,DomainStart,DomainEnd,WrfType,Status)
1839
1840  use wrf_phdf5_data
1841  use ext_phdf5_support_routines
1842  use HDF5
1843  implicit none
1844  include 'wrf_status_codes.h'
1845  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
1846  character*(*)         ,intent(in)     :: Name
1847  integer               ,intent(out)    :: NDim
1848  character*(*)         ,intent(out)    :: MemoryOrder
1849  character*(*)         ,intent(out)    :: Stagger ! Dummy for now
1850  integer ,dimension(*) ,intent(out)    :: DomainStart, DomainEnd
1851  integer               ,intent(out)    :: WrfType
1852  integer               ,intent(out)    :: Status
1853  type(wrf_phdf5_data_handle) ,pointer   :: DH
1854  integer                               :: VarID
1855  integer ,dimension(NVarDims)          :: VDimIDs
1856  integer                               :: j
1857  integer                               :: hdf5err
1858  integer                               :: XType
1859
1860  character(Len =MaxTimeSLen)           :: tname
1861  character(Len = 512)                  :: tgroupname
1862  integer(hid_t)                        :: tgroupid
1863  integer(hid_t)                        :: dsetid
1864  integer(hid_t)                        :: dspaceid
1865  integer                               :: HDF5_NDim
1866  integer(hsize_t),dimension(:),allocatable         :: h5dims
1867  integer(hsize_t),dimension(:),allocatable         :: h5maxdims
1868
1869  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
1870  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1871     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1872     call wrf_debug ( WARN , TRIM(msg))
1873     return
1874  endif
1875  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_NOT_OPENED) then
1876     Status = WRF_HDF5_ERR_FILE_NOT_OPENED
1877     write(msg,*) 'Warning FILE NOT OPENED in ',__FILE__,', line', __LINE__
1878     call wrf_debug ( WARN , TRIM(msg))
1879     return
1880  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_NOT_COMMITTED) then
1881     Status = WRF_HDF5_ERR_DRYRUN_READ
1882     write(msg,*) 'Warning DRYRUN READ in ',__FILE__,', line', __LINE__
1883     call wrf_debug ( WARN , TRIM(msg))
1884     return
1885  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_AND_COMMITTED) then
1886     Status = WRF_HDF5_ERR_READ_WONLY_FILE
1887     write(msg,*) 'Warning READ WRITE ONLY FILE in ',__FILE__,', line', __LINE__   
1888     call wrf_debug ( WARN , TRIM(msg))
1889     return
1890  elseif(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_FOR_READ) then
1891     if(Name /= "Times") then
1892        call numtochar(1,tname)
1893        tgroupname = 'TIME_STAMP_'//tname
1894        call h5gopen_f(DH%GroupID,tgroupname,tgroupid,hdf5err)
1895        if(hdf5err.lt.0) then
1896           Status = WRF_HDF5_ERR_GROUP
1897           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1898           call wrf_debug ( WARN , msg)
1899           return
1900        endif
1901        call h5dopen_f(tgroupid,Name,dsetid,hdf5err)
1902        if(hdf5err /= 0) then
1903           STATUS = WRF_HDF5_ERR_DATASET_OPEN
1904           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1905           call wrf_debug ( WARN , msg)
1906           return
1907        endif
1908        call h5dget_space_f(dsetid,dspaceid,hdf5err)
1909        if(hdf5err.lt.0) then
1910           Status = WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
1911           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1912           call wrf_debug ( WARN , msg)
1913           return
1914        endif
1915
1916        call h5sget_simple_extent_ndims_f(dspaceid,HDF5_NDim,hdf5err)
1917        if(hdf5err.lt.0) then
1918           Status = WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
1919           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1920           call wrf_debug ( WARN , msg)
1921           return
1922        endif
1923
1924        call ext_phdf5_get_var_ti_char(DataHandle,"MemoryOrder",Name,MemoryOrder,Status)
1925        if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1926           Status = WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_GENERAL
1927           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1928           call wrf_debug ( WARN , msg)
1929           return
1930        endif
1931
1932        ! get the rank of the dimension
1933        call GetDim(MemoryOrder,NDim,Status)
1934        if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1935           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1936           call wrf_debug ( WARN , msg)
1937           return
1938        endif
1939        if((NDim+1)/= HDF5_NDim)then
1940           Status = WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
1941           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1942           call wrf_debug ( WARN , msg)
1943           return
1944        endif
1945        call ext_phdf5_get_var_ti_char(DataHandle,"Stagger",Name,Stagger,Status)
1946        if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1947           Status = WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_GENERAL
1948           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1949           call wrf_debug ( WARN , msg)
1950           return
1951        endif
1952        call ext_phdf5_get_var_ti_integer(DataHandle,"FieldType",Name,WrfType,Status)
1953        if(Status /= WRF_NO_ERR) then
1954           Status = WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_GENERAL
1955           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1956           call wrf_debug ( WARN , msg)
1957           return
1958        endif
1959
1960        ! obtain Domain Start and Domain End.
1961        allocate(h5dims(NDim+1))
1962        allocate(h5maxdims(NDim+1))
1963        call h5sget_simple_extent_dims_f(dspaceid,h5dims,h5maxdims,hdf5err)
1964        if(hdf5err .lt. 0) then
1965           Status = WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
1966           write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
1967           call wrf_debug ( WARN , msg)
1968           return
1969        endif
1970
1971        do j =1, NDim
1972           DomainStart(j) = 1
1973           DomainEnd(j) = h5dims(j)
1974        enddo
1975        deallocate(h5dims)
1976        deallocate(h5maxdims)
1977     endif
1978     return
1979  endif
1980  return
1981end subroutine ext_phdf5_get_var_info
1982
1983! obtain the domain time independent attribute with REAL type
1984subroutine ext_phdf5_get_dom_ti_real(DataHandle,Element,Data,Count,OutCount,Status)
1985
1986  use wrf_phdf5_data
1987  use ext_phdf5_support_routines
1988  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
1989  use get_attrid_routine
1990  implicit none
1991  include 'wrf_status_codes.h'
1992
1993  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
1994  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
1995  real                  ,intent(out)    :: Data(*)
1996  real    ,dimension(:),allocatable     :: buffer
1997  integer               ,intent(in)     :: Count
1998  integer               ,intent(out)    :: OutCount
1999  integer               ,intent(out)    :: Status
2000  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
2001  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
2002  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
2003  integer                               :: rank
2004  integer(hid_t)                        :: attr_type
2005  integer(hsize_t), dimension(7)        :: h5_dims
2006  integer                               :: hdf5err
2007
2008  ! Do nothing unless it is time to read time-independent domain metadata.
2009  IF ( .NOT. phdf5_ok_to_get_dom_ti( DataHandle ) ) THEN
2010    Status = WRF_NO_ERR
2011    return
2012  ENDIF
2013
2014  attr_type = H5T_NATIVE_REAL
2015
2016  call get_attrid(DataHandle,Element,h5_attrid,Status)
2017  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2018     return
2019  endif
2020
2021  call check_type(DataHandle,attr_type,h5_attrid,Status)
2022  if (Status /= WRF_NO_ERR) then
2023     return
2024  endif
2025
2026  call retrieve_ti_info(DataHandle,h5_attrid,h5_atypeid,&
2027       Count,OutCount,Status)
2028  if (Status /= WRF_NO_ERR) then
2029     return
2030  endif
2031
2032  allocate(buffer(OutCount))
2033
2034  h5_dims(1) = OutCount
2035  call h5aread_f(h5_attrid,attr_type,buffer,h5_dims,hdf5err)
2036  if(hdf5err.lt.0) then
2037     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_READ
2038     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2039     call wrf_debug ( WARN , msg)
2040     deallocate(buffer)
2041     return
2042  endif
2043
2044  data(1:OutCount) = buffer(1:OutCount)
2045
2046  deallocate(buffer)
2047
2048  return
2049
2050end subroutine ext_phdf5_get_dom_ti_real
2051
2052! obtain the domain time independent attribute with REAL8 type
2053subroutine ext_phdf5_get_dom_ti_double(DataHandle,Element,Data,Count,OutCount,Status)
2054
2055  use wrf_phdf5_data
2056  use ext_phdf5_support_routines
2057  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
2058  use get_attrid_routine
2059  implicit none
2060  include 'wrf_status_codes.h'
2061
2062  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
2063  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
2064  real*8                ,intent(out)    :: Data(*)
2065  integer               ,intent(in)     :: Count
2066  integer               ,intent(out)    :: OutCount
2067  integer               ,intent(out)    :: Status
2068  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
2069  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
2070  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
2071  integer                               :: rank
2072  integer                               :: hdf5err
2073  integer(hid_t)                        :: attr_type
2074  integer(hsize_t), dimension(7)        :: h5_dims
2075
2076  ! Do nothing unless it is time to read time-independent domain metadata.
2077  IF ( .NOT. phdf5_ok_to_get_dom_ti( DataHandle ) ) THEN
2078    Status = WRF_NO_ERR
2079    return
2080  ENDIF
2081
2082  attr_type = H5T_NATIVE_DOUBLE
2083  call get_attrid(DataHandle,Element,h5_attrid,Status)
2084  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2085     return
2086  endif
2087
2088  call check_type(DataHandle,attr_type,h5_attrid,Status)
2089  if (Status /= WRF_NO_ERR) then
2090     return
2091  endif
2092
2093  call  retrieve_ti_info(DataHandle,h5_attrid,h5_atypeid,&
2094       Count,OutCount,Status)
2095  if (Status /= WRF_NO_ERR) then
2096     return
2097  endif
2098
2099  h5_dims(1) = OutCount
2100  call h5aread_f(h5_attrid,attr_type,data,h5_dims,hdf5err)
2101  if(hdf5err.lt.0) then
2102     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_READ
2103     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2104     call wrf_debug ( WARN , msg)
2105     return
2106  endif
2107
2108  return
2109end subroutine ext_phdf5_get_dom_ti_double
2110
2111
2112! obtain the domain time independent attribute with integer type
2113subroutine ext_phdf5_get_dom_ti_integer(DataHandle,Element,Data,Count,OutCount,Status)
2114
2115  use wrf_phdf5_data
2116  use ext_phdf5_support_routines
2117  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
2118  use get_attrid_routine
2119  implicit none
2120  include 'wrf_status_codes.h'
2121
2122  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
2123  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
2124  integer               ,intent(out)    :: Data(*)
2125  integer               ,intent(in)     :: Count
2126  integer               ,intent(out)    :: OutCount
2127  integer               ,intent(out)    :: Status
2128  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
2129  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
2130  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
2131  integer                               :: rank
2132  integer(hid_t)                        :: attr_type
2133  integer(hsize_t), dimension(7)        :: h5_dims
2134  integer                               :: hdf5err
2135
2136  ! Do nothing unless it is time to read time-independent domain metadata.
2137  IF ( .NOT. phdf5_ok_to_get_dom_ti( DataHandle ) ) THEN
2138    Status = WRF_NO_ERR
2139    return
2140  ENDIF
2141
2142  attr_type = H5T_NATIVE_INTEGER
2143
2144  call get_attrid(DataHandle,Element,h5_attrid,Status)
2145  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2146     return
2147  endif
2148
2149  call check_type(DataHandle,attr_type,h5_attrid,Status)
2150  if (Status /= WRF_NO_ERR) then
2151     return
2152  endif
2153
2154  call  retrieve_ti_info(DataHandle,h5_attrid,h5_atypeid,&
2155       Count,OutCount,Status)
2156  if (Status /= WRF_NO_ERR) then
2157     return
2158  endif
2159
2160  h5_dims(1) = OutCount
2161  call h5aread_f(h5_attrid,attr_type,Data,h5_dims,Status)
2162  if(hdf5err.lt.0) then
2163     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_READ
2164     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2165     call wrf_debug ( WARN , msg)
2166     return
2167  endif
2168
2169  return
2170end subroutine ext_phdf5_get_dom_ti_integer
2171
2172
2173subroutine ext_phdf5_get_dom_ti_logical(DataHandle,Element,Data,Count,OutCount,Status)
2174
2175  use wrf_phdf5_data
2176  use ext_phdf5_support_routines
2177  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
2178  use get_attrid_routine
2179  implicit none
2180  include 'wrf_status_codes.h'
2181
2182  integer               ,intent(in)           :: DataHandle
2183  character*(*)         ,intent(in)           :: Element
2184  logical               ,intent(out)          :: Data(*)
2185  integer,       dimension(:),allocatable     :: buffer
2186  integer               ,intent(in)           :: Count
2187  integer               ,intent(out)          :: OutCount
2188  integer               ,intent(out)          :: Status
2189  integer(hid_t)                              :: h5_atypeid
2190  integer(hid_t)                              :: h5_aspaceid
2191  integer(hid_t)                              :: h5_attrid
2192  integer                                     :: rank
2193  integer(hid_t)                              :: attr_type
2194  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer          :: DH
2195  integer(hsize_t), dimension(7)              :: h5_dims
2196  integer                                     :: hdf5err
2197
2198
2199  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
2200  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2201     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2202     call wrf_debug ( WARN , msg)
2203     return
2204  endif
2205
2206  ! Do nothing unless it is time to read time-independent domain metadata.
2207  IF ( .NOT. phdf5_ok_to_get_dom_ti( DataHandle ) ) THEN
2208    Status = WRF_NO_ERR
2209    return
2210  ENDIF
2211
2212  attr_type = DH%EnumID
2213  call get_attrid(DataHandle,Element,h5_attrid,Status)
2214  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2215     return
2216  endif
2217
2218  call check_type(DataHandle,attr_type,h5_attrid,Status)
2219  if (status /= WRF_NO_ERR) then
2220     return
2221  endif
2222
2223  call  retrieve_ti_info(DataHandle,h5_attrid,h5_atypeid,&
2224       Count,OutCount,Status)
2225  if (Status /= WRF_NO_ERR) then
2226     return
2227  endif
2228
2229  h5_dims(1) = OutCount
2230
2231  allocate(buffer(OutCount))
2232
2233  call h5aread_f(h5_attrid,attr_type,buffer,h5_dims,hdf5err)
2234  if(hdf5err.lt.0) then
2235     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_READ
2236     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2237     call wrf_debug ( WARN , msg)
2238     deallocate(buffer)
2239     return
2240  endif
2241
2242  Data(1:OutCount) = buffer(1:OutCount)==1
2243  deallocate(buffer)
2244  return
2245end subroutine ext_phdf5_get_dom_ti_logical
2246
2247! obtain the domain time independent attribute with char type
2248subroutine ext_phdf5_get_dom_ti_char(DataHandle,Element,Data,Status)
2249
2250  use wrf_phdf5_data
2251  use ext_phdf5_support_routines
2252  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
2253  use get_attrid_routine
2254  implicit none
2255  include 'wrf_status_codes.h'
2256
2257  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
2258  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
2259  character*(*)         ,intent(out)    :: Data
2260  integer                               :: Count
2261  integer                               :: OutCount
2262  integer               ,intent(out)    :: Status
2263  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
2264  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
2265  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
2266  integer                               :: rank
2267  integer(hid_t)                        :: attr_type
2268  integer(hsize_t), dimension(7)        :: h5_dims
2269  integer                               :: hdf5err
2270
2271  ! Do nothing unless it is time to read time-independent domain metadata.
2272  IF ( .NOT. phdf5_ok_to_get_dom_ti( DataHandle ) ) THEN
2273    Status = WRF_NO_ERR
2274    return
2275  ENDIF
2276
2277  attr_type = H5T_NATIVE_CHARACTER
2278
2279  call get_attrid(DataHandle,Element,h5_attrid,Status)
2280  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2281     return
2282  endif
2283
2284  call check_type(DataHandle,attr_type,h5_attrid,Status)
2285  if (status /= WRF_NO_ERR) then
2286     return
2287  endif
2288
2289  call  retrieve_ti_info(DataHandle,h5_attrid,h5_atypeid,&
2290       Count,OutCount,Status)
2291  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2292     return
2293  endif
2294
2295  h5_dims(1) = OutCount
2296  call h5aread_f(h5_attrid,h5_atypeid,data,h5_dims,hdf5err)
2297  if(hdf5err.lt.0) then
2298     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_READ
2299     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2300     call wrf_debug ( WARN , msg)
2301     return
2302  endif
2303
2304  return
2305end subroutine ext_phdf5_get_dom_ti_char
2306
2307subroutine ext_phdf5_put_dom_td_real(DataHandle,Element,DateStr,Data,Count,Status)
2308  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
2309  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
2310  character*(*)         ,intent(in)     :: DateStr
2311  real                  ,intent(in)     :: Data(*)
2312  integer               ,intent(in)     :: Count
2313  integer               ,intent(out)    :: Status
2314
2315  call ext_phdf5_put_var_td_real(DataHandle,Element,DateStr,&
2316       'E_X_T_D_O_M_A_I_N_M_E_T_A_DATA_',&
2317       Data,Count,Status)
2318  return
2319end subroutine ext_phdf5_put_dom_td_real
2320
2321subroutine ext_phdf5_put_dom_td_double(DataHandle,Element,DateStr,Data,Count,Status)
2322  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
2323  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
2324  character*(*)         ,intent(in)     :: DateStr
2325  real*8                ,intent(in)     :: Data(*)
2326  integer               ,intent(in)     :: Count
2327  integer               ,intent(out)    :: Status
2328
2329  call ext_phdf5_put_var_td_double(DataHandle,Element,DateStr,&
2330       'E_X_T_D_O_M_A_I_N_M_E_T_A_DATA_',&
2331       Data,Count,Status)
2332  return
2333end subroutine ext_phdf5_put_dom_td_double
2334
2335subroutine ext_phdf5_put_dom_td_logical(DataHandle,Element,DateStr,Data,Count,Status)
2336  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
2337  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
2338  character*(*)         ,intent(in)     :: DateStr
2339  logical               ,intent(in)     :: Data(*)
2340  integer               ,intent(in)     :: Count
2341  integer               ,intent(out)    :: Status
2342
2343  call ext_phdf5_put_var_td_logical(DataHandle,Element,DateStr,&
2344       'E_X_T_D_O_M_A_I_N_M_E_T_A_DATA_',&
2345       Data,Count,Status)
2346  return
2347
2348end subroutine ext_phdf5_put_dom_td_logical
2349subroutine ext_phdf5_put_dom_td_integer(DataHandle,Element,DateStr,Data,Count,Status)
2350  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
2351  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
2352  character*(*)         ,intent(in)     :: DateStr
2353  integer               ,intent(in)     :: Data(*)
2354  integer               ,intent(in)     :: Count
2355  integer               ,intent(out)    :: Status
2356
2357  call ext_phdf5_put_var_td_integer(DataHandle,Element,DateStr,&
2358       'E_X_T_D_O_M_A_I_N_M_E_T_A_DATA_',&
2359       Data,Count,Status)
2360  return
2361end subroutine ext_phdf5_put_dom_td_integer
2362
2363subroutine ext_phdf5_put_dom_td_char(DataHandle,Element,DateStr,Data,Status)
2364
2365  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
2366  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
2367  character*(*)         ,intent(in)     :: DateStr
2368  character*(*)         ,intent(in)     :: Data
2369  integer               ,intent(out)    :: Status
2370
2371  call ext_phdf5_put_var_td_char(DataHandle,Element,DateStr,&
2372       'E_X_T_D_O_M_A_I_N_M_E_T_A_DATA_',&
2373       Data,Status)
2374  return
2375
2376end subroutine ext_phdf5_put_dom_td_char
2377
2378subroutine ext_phdf5_get_dom_td_real(DataHandle,Element,DateStr,Data,Count,OutCount,Status)
2379
2380
2381  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
2382  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
2383  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
2384  real                  ,intent(out)            :: Data(*)
2385  integer               ,intent(in)             :: Count
2386  integer               ,intent(out)            :: OutCount
2387  integer               ,intent(out)            :: Status
2388
2389  call ext_phdf5_get_var_td_real(DataHandle,Element,DateStr,&
2390       'E_X_T_D_O_M_A_I_N_M_E_T_A_DATA_',Data,Count,OutCount,Status)
2391  return
2392end subroutine ext_phdf5_get_dom_td_real
2393
2394subroutine ext_phdf5_get_dom_td_double(DataHandle,Element,DateStr,Data,Count,OutCount,Status)
2395
2396  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
2397  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
2398  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
2399  real*8                ,intent(out)            :: Data(*)
2400  integer               ,intent(in)             :: Count
2401  integer               ,intent(out)            :: OutCount
2402  integer               ,intent(out)            :: Status
2403
2404  call ext_phdf5_get_var_td_double(DataHandle,Element,DateStr,&
2405       'E_X_T_D_O_M_A_I_N_M_E_T_A_DATA_',Data,Count,OutCount,Status)
2406  return
2407end subroutine ext_phdf5_get_dom_td_double
2408
2409
2410subroutine ext_phdf5_get_dom_td_integer(DataHandle,Element,DateStr,Data,Count,OutCount,Status)
2411
2412  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
2413  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
2414  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
2415  integer               ,intent(out)            :: Data(*)
2416  integer               ,intent(in)             :: Count
2417  integer               ,intent(out)            :: OutCount
2418  integer               ,intent(out)            :: Status
2419
2420  call ext_phdf5_get_var_td_integer(DataHandle,Element,DateStr,&
2421       'E_X_T_D_O_M_A_I_N_M_E_T_A_DATA_',Data,Count,OutCount,Status)
2422  return
2423
2424end subroutine ext_phdf5_get_dom_td_integer
2425
2426subroutine ext_phdf5_get_dom_td_logical(DataHandle,Element,DateStr,Data,Count,OutCount,Status)
2427  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
2428  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
2429  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
2430  logical               ,intent(out)            :: Data(*)
2431  integer               ,intent(in)             :: Count
2432  integer               ,intent(out)            :: OutCount
2433  integer               ,intent(out)            :: Status
2434
2435  call ext_phdf5_get_var_td_logical(DataHandle,Element,DateStr,&
2436       'E_X_T_D_O_M_A_I_N_M_E_T_A_DATA_',Data,Count,OutCount,Status)
2437  return
2438
2439end subroutine ext_phdf5_get_dom_td_logical
2440
2441
2442subroutine ext_phdf5_get_dom_td_char(DataHandle,Element,DateStr,Data,Status)
2443
2444  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
2445  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
2446  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
2447  character*(*)         ,intent(out)            :: Data
2448  integer               ,intent(out)            :: Status
2449
2450
2451  call ext_phdf5_get_var_td_char(DataHandle,Element,DateStr,&
2452       'E_X_T_D_O_M_A_I_N_M_E_T_A_DATA_',Data,Status)
2453  return
2454
2455
2456end subroutine ext_phdf5_get_dom_td_char
2457
2458subroutine ext_phdf5_put_var_td_real(DataHandle,Element,DateStr,Var,Data,Count,Status)
2459
2460  use wrf_phdf5_data
2461  use ext_phdf5_support_routines
2462  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
2463  implicit none
2464  include 'wrf_status_codes.h'
2465
2466  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
2467  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
2468  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
2469  character*(*)         ,intent(in)             :: Var
2470  character(len = 256)                           :: DataSetName
2471  real                  ,intent(in)             :: Data(*)
2472  integer               ,intent(in)             :: Count
2473  integer               ,intent(out)            :: Status
2474  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer           :: DH
2475  integer                                       :: TimeIndex
2476  integer(hid_t)                                :: dset_id
2477  integer(hid_t)                                :: dspaceid
2478  integer(hid_t)                                :: fspaceid
2479  integer(hid_t)                                :: tgroupid
2480  integer(hsize_t),dimension(1)                 :: dims             
2481  integer                                       :: hdf5err
2482  integer                                       :: i
2483
2484  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
2485  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2486     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2487     call wrf_debug ( WARN , msg)
2488     return
2489  endif
2490
2491  ! check whether the DateStr is the correct length
2492  call DateCheck(DateStr,Status)
2493  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2494     write(msg,*) 'Warning DATE STRING ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
2495     call wrf_debug ( WARN , msg)
2496     return
2497  endif
2498
2499  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_AND_COMMITTED) then
2500
2501     dims(1) = Count
2502
2503     ! Get the time index
2504     call GetAttrTimeIndex('write',DataHandle,DateStr,TimeIndex,Status)
2505     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2506        return
2507     endif
2508
2509     ! Set up dataspace,property list
2510     call GetName(Element,Var,DataSetName,Status)
2511     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2512        return
2513     endif
2514
2515     call setup_wrtd_dataset(DataHandle,DataSetName,H5T_NATIVE_REAL,Count,&
2516          dset_id,dspaceid,fspaceid,tgroupid,TimeIndex,Status)
2517     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2518        return
2519     endif
2520
2521     call h5dwrite_f(dset_id,H5T_NATIVE_REAL,Data,dims,hdf5err,dspaceid,&
2522          fspaceid)
2523     if(hdf5err.lt.0) then
2524        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_WRITE
2525        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2526        call wrf_debug ( WARN , msg)
2527        return
2528     endif
2529     call h5dclose_f(dset_id,hdf5err)
2530     call h5sclose_f(dspaceid,hdf5err)
2531     call h5sclose_f(fspaceid,hdf5err)
2532!     call h5gclose_f(tgroupid,hdf5err)
2533  endif
2534  return
2535end subroutine ext_phdf5_put_var_td_real
2536
2537subroutine ext_phdf5_put_var_td_double(DataHandle,Element,DateStr,Var,Data,Count,Status)
2538  use wrf_phdf5_data
2539  use ext_phdf5_support_routines
2540  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
2541  implicit none
2542  include 'wrf_status_codes.h'
2543
2544  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
2545  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
2546  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
2547  character*(*)         ,intent(in)             :: Var
2548  character(len = 256)                           :: DataSetName
2549  real*8                ,intent(in)             :: Data(*)
2550  integer               ,intent(in)             :: Count
2551  integer               ,intent(out)            :: Status
2552  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer            :: DH
2553  integer                                       :: TimeIndex
2554  integer(hid_t)                                :: dset_id
2555  integer(hid_t)                                :: dspaceid
2556  integer(hid_t)                                :: fspaceid
2557  integer(hid_t)                                :: tgroupid
2558  integer(hsize_t),dimension(1)                 :: dims             
2559  integer                                       :: hdf5err
2560  integer                                       :: i
2561
2562  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
2563  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2564     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2565     call wrf_debug ( WARN , msg)
2566     return
2567  endif
2568
2569  ! check whether the DateStr is the correct length
2570  call DateCheck(DateStr,Status)
2571  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2572     write(msg,*) 'Warning DATE STRING ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
2573     call wrf_debug ( WARN , msg)
2574     return
2575  endif
2576
2577  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_AND_COMMITTED) then
2578
2579
2580     dims(1) = Count
2581     ! Get the time index
2582     call GetAttrTimeIndex('write',DataHandle,DateStr,TimeIndex,Status)
2583     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2584        return
2585     endif
2586
2587     ! Set up dataspace,property list
2588     call GetName(Element,Var,DataSetName,Status)
2589     call setup_wrtd_dataset(DataHandle,DataSetName,H5T_NATIVE_DOUBLE,Count,&
2590          dset_id,dspaceid,fspaceid,tgroupid,TimeIndex,Status)
2591
2592     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2593        return
2594     endif
2595
2596     call h5dwrite_f(dset_id,H5T_NATIVE_DOUBLE,Data,dims,hdf5err,dspaceid,&
2597          fspaceid)
2598     if(hdf5err.lt.0) then
2599        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_WRITE
2600        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2601        call wrf_debug ( WARN , msg)
2602        return
2603     endif
2604
2605     call h5dclose_f(dset_id,hdf5err)
2606     call h5sclose_f(dspaceid,hdf5err)
2607     call h5sclose_f(fspaceid,hdf5err)
2608!     call h5gclose_f(tgroupid,hdf5err)
2609
2610  endif
2611  return
2612end subroutine ext_phdf5_put_var_td_double
2613
2614subroutine ext_phdf5_put_var_td_integer(DataHandle,Element,DateStr,Var,Data,Count,Status)
2615
2616  use wrf_phdf5_data
2617  use ext_phdf5_support_routines
2618  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
2619  implicit none
2620  include 'wrf_status_codes.h'
2621
2622  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
2623  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
2624  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
2625  character*(*)         ,intent(in)             :: Var
2626  character(len = 256)                           :: DataSetName
2627  integer               ,intent(in)             :: Data(*)
2628  integer               ,intent(in)             :: Count
2629  integer               ,intent(out)            :: Status
2630  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer            :: DH
2631  integer                                       :: TimeIndex
2632  integer(hid_t)                                :: dset_id
2633  integer(hid_t)                                :: dspaceid
2634  integer(hid_t)                                :: fspaceid
2635  integer(hid_t)                                :: tgroupid
2636  integer(hsize_t),dimension(1)                 :: dims             
2637  integer                                       :: hdf5err
2638  integer                                       :: i
2639
2640  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
2641  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2642     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2643     call wrf_debug ( WARN , msg)
2644     return
2645  endif
2646
2647  ! check whether the DateStr is the correct length
2648  call DateCheck(DateStr,Status)
2649  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2650     write(msg,*) 'Warning DATE STRING ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
2651     call wrf_debug ( WARN , msg)
2652     return
2653  endif
2654
2655  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_AND_COMMITTED) then
2656
2657
2658     dims(1) = Count
2659     ! Get the time index
2660     call GetAttrTimeIndex('write',DataHandle,DateStr,TimeIndex,Status)
2661     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2662        return
2663     endif
2664
2665     ! Set up dataspace,property list
2666     call GetName(Element,Var,DataSetName,Status)
2667
2668     call setup_wrtd_dataset(DataHandle,DataSetName,H5T_NATIVE_INTEGER, &
2669          Count,dset_id,dspaceid,fspaceid,tgroupid,  &
2670          TimeIndex, Status)
2671     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2672        return
2673     endif
2674
2675     call h5dwrite_f(dset_id,H5T_NATIVE_INTEGER,Data,dims,hdf5err,dspaceid,&
2676          fspaceid)
2677     if(hdf5err.lt.0) then
2678        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_WRITE
2679        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2680        call wrf_debug ( WARN , msg)
2681        return
2682     endif
2683
2684     call h5dclose_f(dset_id,hdf5err)
2685     call h5sclose_f(dspaceid,hdf5err)
2686     call h5sclose_f(fspaceid,hdf5err)
2687!     call h5gclose_f(tgroupid,hdf5err)
2688
2689  endif
2690  return
2691
2692end subroutine ext_phdf5_put_var_td_integer
2693
2694subroutine ext_phdf5_put_var_td_logical(DataHandle,Element,DateStr,Var,Data,Count,Status)
2695
2696  use wrf_phdf5_data
2697  use ext_phdf5_support_routines
2698  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
2699  implicit none
2700  include 'wrf_status_codes.h'
2701
2702  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
2703  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
2704  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
2705  character*(*)         ,intent(in)             :: Var
2706  character(len = 256)                           :: DataSetName
2707  logical               ,intent(in)             :: Data(*)
2708  integer ,dimension(:),allocatable             :: Buffer             
2709  integer               ,intent(in)             :: Count
2710  integer               ,intent(out)            :: Status
2711  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer            :: DH
2712  integer                                       :: TimeIndex
2713  integer(hid_t)                                :: dset_id
2714  integer(hid_t)                                :: dspaceid
2715  integer(hid_t)                                :: fspaceid
2716  integer(hid_t)                                :: tgroupid
2717  integer(hsize_t),dimension(1)                 :: dims             
2718  integer                                       :: hdf5err
2719  integer                                       :: i
2720
2721  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
2722  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2723     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2724     call wrf_debug ( WARN , msg)
2725     return
2726  endif
2727
2728  ! check whether the DateStr is the correct length
2729  call DateCheck(DateStr,Status)
2730  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2731     write(msg,*) 'Warning DATE STRING ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
2732     call wrf_debug ( WARN , msg)
2733     return
2734  endif
2735
2736  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_AND_COMMITTED) then
2737
2738     allocate(buffer(count))
2739     do i = 1, count
2740        if(data(i).EQV..TRUE.) then
2741           buffer(i) = 1
2742        else
2743           buffer(i) = 0
2744        endif
2745     enddo
2746
2747     dims(1) = Count
2748     ! Get the time index
2749     call GetAttrTimeIndex('write',DataHandle,DateStr,TimeIndex,Status)
2750     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2751        return
2752     endif
2753
2754     ! Set up dataspace,property list
2755     call GetName(Element,Var,DataSetName,Status)
2756
2757     call setup_wrtd_dataset(DataHandle,DataSetName,DH%EnumID, &
2758          Count,dset_id,dspaceid,           &
2759          fspaceid,tgroupid,TimeIndex,Status)
2760     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2761        return
2762     endif
2763
2764     call h5dwrite_f(dset_id,DH%EnumID,Buffer,dims,hdf5err,dspaceid,&
2765          fspaceid)
2766     if(hdf5err.lt.0) then
2767        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_WRITE
2768        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2769        call wrf_debug ( WARN , msg)
2770        return
2771     endif
2772     call h5dclose_f(dset_id,hdf5err)
2773     call h5sclose_f(dspaceid,hdf5err)
2774     call h5sclose_f(fspaceid,hdf5err)
2775!     call h5gclose_f(tgroupid,hdf5err)
2776     deallocate(Buffer)
2777  endif
2778  return
2779end subroutine ext_phdf5_put_var_td_logical
2780
2781subroutine ext_phdf5_put_var_td_char(DataHandle,Element,DateStr,Var,Data,Status)
2782
2783  use wrf_phdf5_data
2784  use ext_phdf5_support_routines
2785  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
2786  implicit none
2787  include 'wrf_status_codes.h'
2788
2789  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
2790  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
2791  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
2792  character*(*)         ,intent(in)             :: Var
2793  character(len = 256)                           :: DataSetName
2794  character*(*)         ,intent(in)             :: Data
2795  integer               ,intent(out)            :: Status
2796  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer           :: DH
2797  integer                                       :: TimeIndex
2798  integer(hid_t)                                :: dset_id
2799  integer(hid_t)                                :: dspaceid
2800  integer(hid_t)                                :: fspaceid
2801  integer(hid_t)                                :: tgroupid
2802  integer(hsize_t),dimension(1)                 :: dims             
2803  integer                                       :: hdf5err
2804  integer                                       :: i
2805
2806  integer                                       :: str_id
2807  integer                                       :: str_len
2808  integer                                       :: count
2809
2810  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
2811  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2812     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2813     call wrf_debug ( WARN , msg)
2814     return
2815  endif
2816
2817  ! check whether the DateStr is the correct length
2818  call DateCheck(DateStr,Status)
2819  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2820     write(msg,*) 'Warning DATE STRING ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
2821     call wrf_debug ( WARN , msg)
2822     return
2823  endif
2824
2825  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_AND_COMMITTED) then
2826
2827     dims(1) = 1
2828
2829     ! Get the time index
2830     call GetAttrTimeIndex('write',DataHandle,DateStr,TimeIndex,Status)
2831     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2832        return
2833     endif
2834
2835     ! make str id
2836     str_len = len_trim(Data)
2837     call make_strid(str_len,str_id,Status)
2838     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2839        return
2840     endif
2841
2842     ! assign count of the string to 1
2843     count = 1
2844
2845     ! Set up dataspace,property list
2846     call GetName(Element,Var,DataSetName,Status)
2847     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2848        return
2849     endif
2850     call setup_wrtd_dataset(DataHandle,DataSetName,str_id, &
2851          count,dset_id,dspaceid,        &
2852          fspaceid,tgroupid,TimeIndex,Status)
2853     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2854        return
2855     endif
2856
2857     call h5dwrite_f(dset_id,str_id,Data,dims,hdf5err,dspaceid,&
2858          fspaceid)
2859     if(hdf5err.lt.0) then
2860        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_WRITE
2861        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2862        call wrf_debug ( WARN , msg)
2863        return
2864     endif
2865
2866     ! close the string id
2867     call h5tclose_f(str_id,hdf5err)
2868     if(hdf5err.lt.0) then
2869        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
2870        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2871        call wrf_debug ( WARN , msg)
2872        return
2873     endif
2874     call h5dclose_f(dset_id,hdf5err)
2875     call h5sclose_f(dspaceid,hdf5err)
2876     call h5sclose_f(fspaceid,hdf5err)
2877!     call h5gclose_f(tgroupid,hdf5err)
2878
2879  endif
2880  return
2881
2882end subroutine ext_phdf5_put_var_td_char
2883
2884subroutine ext_phdf5_get_var_td_real(DataHandle,Element,DateStr,Var,Data,Count,OutCount,Status)
2885
2886  use wrf_phdf5_data
2887  use ext_phdf5_support_routines
2888  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
2889  implicit none
2890  include 'wrf_status_codes.h'
2891
2892  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
2893  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
2894  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
2895  character*(*)         ,intent(in)             :: Var
2896  character(len =256)                            :: DataSetName
2897  real                  ,intent(out)            :: Data(*)
2898  integer               ,intent(in)             :: Count
2899  integer               ,intent(out)            :: OutCount
2900  integer               ,intent(out)            :: Status
2901  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer            :: DH
2902  integer                                       :: TimeIndex
2903  integer(hid_t)                                :: dset_id
2904  integer(hid_t)                                :: dspaceid
2905  integer(hid_t)                                :: memspaceid
2906  integer(hid_t)                                :: tgroupid
2907  integer(hsize_t),dimension(7)                 :: data_dims             
2908  integer                                       :: hdf5err
2909
2910  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
2911  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2912     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2913     call wrf_debug ( WARN , msg)
2914     return
2915  endif
2916
2917  ! check whether the DateStr is the correct length
2918  call DateCheck(DateStr,Status)
2919  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2920     write(msg,*) 'Warning DATE STRING ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
2921     call wrf_debug ( WARN , msg)
2922     return
2923  endif
2924
2925  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_FOR_READ) then
2926
2927     ! get the time-dependent attribute name
2928     
2929     call GetName(Element,Var,DataSetName,Status)
2930
2931     ! get time index of the time-dependent attribute
2932     call GetAttrTimeIndex('read',DataHandle,DateStr,TimeIndex,Status)
2933     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2934        return
2935     endif
2936
2937     ! For parallel, find the group and obtain the attribute.
2938     ! set up for reading the time-dependent attribute
2939     call setup_rdtd_dataset(DataHandle,DataSetName,H5T_NATIVE_REAL,TimeIndex,&
2940          Count,OutCount,dset_id,memspaceid,dspaceid,tgroupid,&
2941          Status)
2942     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2943        return
2944     endif
2945
2946     data_dims(1) = OutCount
2947
2948     ! read the dataset
2949     call h5dread_f(dset_id,H5T_NATIVE_REAL,data,data_dims,hdf5err, &
2950          memspaceid,dspaceid,H5P_DEFAULT_F)
2951     if(hdf5err.lt.0) then
2952        Status = WRF_HDF5_ERR_DATASET_READ
2953        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2954        call wrf_debug ( WARN , msg)
2955        return
2956     endif
2957     call h5sclose_f(memspaceid,hdf5err)
2958     call h5sclose_f(dspaceid,hdf5err)
2959     call h5dclose_f(dset_id,hdf5err)
2960     call h5gclose_f(tgroupid,hdf5err)
2961  endif
2962
2963end subroutine ext_phdf5_get_var_td_real
2964
2965subroutine ext_phdf5_get_var_td_double(DataHandle,Element,DateStr,Var,Data,&
2966     Count,OutCount,Status)
2967
2968  use wrf_phdf5_data
2969  use ext_phdf5_support_routines
2970  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
2971  implicit none
2972  include 'wrf_status_codes.h'
2973
2974  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
2975  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
2976  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
2977  character*(*)         ,intent(in)             :: Var
2978  character(len =256)                            :: DataSetName
2979  real*8                ,intent(out)            :: Data(*)
2980  integer               ,intent(in)             :: Count
2981  integer              ,intent(out)            :: OutCount
2982  integer               ,intent(out)            :: Status
2983  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer            :: DH
2984  integer                                       :: TimeIndex
2985  integer(hid_t)                                :: dset_id
2986  integer(hid_t)                                :: dspaceid
2987  integer(hid_t)                                :: memspaceid
2988  integer(hid_t)                                :: tgroupid
2989  integer(hsize_t),dimension(7)                 :: data_dims             
2990  integer                                       :: hdf5err
2991
2992  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
2993  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
2994     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
2995     call wrf_debug ( WARN , msg)
2996     return
2997  endif
2998
2999  ! check whether the DateStr is the correct length
3000  call DateCheck(DateStr,Status)
3001  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3002     write(msg,*) 'Warning DATE STRING ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
3003     call wrf_debug ( WARN , msg)
3004     return
3005  endif
3006
3007  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_FOR_READ) then
3008
3009     ! get the time-dependent attribute name
3010     call GetName(Element,Var,DataSetName,Status)
3011
3012     ! get time index of the time-dependent attribute
3013     call GetAttrTimeIndex('read',DataHandle,DateStr,TimeIndex,Status)
3014     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3015        return
3016     endif
3017
3018     ! set up for reading the time-dependent attribute
3019     call setup_rdtd_dataset(DataHandle,DataSetName,H5T_NATIVE_DOUBLE,TimeIndex,&
3020          Count,OutCount,dset_id,memspaceid,dspaceid,tgroupid,&
3021          Status)
3022     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3023        return
3024     endif
3025
3026     data_dims(1) = OutCount
3027
3028     ! read the dataset
3029     call h5dread_f(dset_id,H5T_NATIVE_DOUBLE,data,data_dims,hdf5err, &
3030          memspaceid,dspaceid,H5P_DEFAULT_F)
3031     if(hdf5err.lt.0) then
3032        Status = WRF_HDF5_ERR_DATASET_READ
3033        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3034        call wrf_debug ( WARN , msg)
3035        return
3036     endif
3037
3038     call h5sclose_f(memspaceid,hdf5err)
3039     call h5sclose_f(dspaceid,hdf5err)
3040     call h5dclose_f(dset_id,hdf5err)
3041     call h5gclose_f(tgroupid,hdf5err)
3042
3043  endif
3044
3045end subroutine ext_phdf5_get_var_td_double
3046
3047subroutine ext_phdf5_get_var_td_integer(DataHandle,Element,DateStr,Var,Data,&
3048     Count,OutCount,Status)
3049
3050  use wrf_phdf5_data
3051  use ext_phdf5_support_routines
3052  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
3053  implicit none
3054  include 'wrf_status_codes.h'
3055
3056  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
3057  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
3058  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
3059  character*(*)         ,intent(in)             :: Var
3060  character(len =256)                            :: DataSetName
3061  integer               ,intent(out)             :: Data(*)
3062  integer               ,intent(in)             :: Count
3063  INTEGER               ,intent(out)            :: OutCount
3064  integer               ,intent(out)            :: Status
3065  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer            :: DH
3066  integer                                       :: TimeIndex
3067  integer(hid_t)                                :: dset_id
3068  integer(hid_t)                                :: dspaceid
3069  integer(hid_t)                                :: memspaceid
3070  integer(hid_t)                                :: tgroupid
3071  integer(hsize_t),dimension(7)                 :: data_dims             
3072  integer                                       :: hdf5err
3073
3074  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
3075  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3076     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3077     call wrf_debug ( WARN , msg)
3078     return
3079  endif
3080
3081  ! check whether the DateStr is the correct length
3082  call DateCheck(DateStr,Status)
3083  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3084     write(msg,*) 'Warning DATE STRING ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
3085     call wrf_debug ( WARN , msg)
3086     return
3087  endif
3088
3089  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_FOR_READ) then
3090
3091     ! get the time-dependent attribute name
3092     call GetName(Element,Var,DataSetName,Status)
3093
3094     ! get time index of the time-dependent attribute
3095     call GetAttrTimeIndex('read',DataHandle,DateStr,TimeIndex,Status)
3096     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3097        return
3098     endif
3099
3100     ! set up for reading the time-dependent attribute
3101     call setup_rdtd_dataset(DataHandle,DataSetName,H5T_NATIVE_INTEGER,TimeIndex,&
3102          Count,OutCount,dset_id,memspaceid,dspaceid,tgroupid,&
3103          Status)
3104     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3105        return
3106     endif
3107
3108     data_dims(1) = OutCount
3109
3110     ! read the dataset
3111     call h5dread_f(dset_id,H5T_NATIVE_INTEGER,data,data_dims,hdf5err, &
3112          memspaceid,dspaceid,H5P_DEFAULT_F)
3113     if(hdf5err.lt.0) then
3114        Status = WRF_HDF5_ERR_DATASET_READ
3115        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3116        call wrf_debug ( WARN , msg)
3117        return
3118     endif
3119
3120     call h5sclose_f(memspaceid,hdf5err)
3121     call h5sclose_f(dspaceid,hdf5err)
3122     call h5dclose_f(dset_id,hdf5err)
3123     call h5gclose_f(tgroupid,hdf5err)
3124  endif
3125end subroutine ext_phdf5_get_var_td_integer
3126
3127subroutine ext_phdf5_get_var_td_logical(DataHandle,Element,DateStr,Var,Data,&
3128     Count,OutCount,Status)
3129  use wrf_phdf5_data
3130  use ext_phdf5_support_routines
3131  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
3132  implicit none
3133  include 'wrf_status_codes.h'
3134
3135  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
3136  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
3137  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
3138  character*(*)         ,intent(in)             :: Var
3139  character(len =256)                            :: DataSetName
3140  logical               ,intent(out)            :: Data(*)
3141  integer,         dimension(:),allocatable     :: Buffer   
3142  integer               ,intent(in)             :: Count
3143  integer               ,intent(out)            :: OutCount
3144  integer               ,intent(out)            :: Status
3145  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer            :: DH
3146  integer                                       :: TimeIndex
3147  integer(hid_t)                                :: dset_id
3148  integer(hid_t)                                :: dspaceid
3149  integer(hid_t)                                :: memspaceid
3150  integer(hid_t)                                :: tgroupid
3151  integer(hsize_t),dimension(7)                 :: data_dims             
3152  integer                                       :: hdf5err
3153
3154  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
3155  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3156     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3157     call wrf_debug ( WARN , msg)
3158     return
3159  endif
3160
3161  ! check whether the DateStr is the correct length
3162  call DateCheck(DateStr,Status)
3163  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3164     write(msg,*) 'Warning DATE STRING ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
3165     call wrf_debug ( WARN , msg)
3166     return
3167  endif
3168
3169  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_FOR_READ) then
3170
3171     ! get the time-dependent attribute name
3172     call GetName(Element,Var,DataSetName,Status)
3173
3174     ! get time index of the time-dependent attribute
3175     call GetAttrTimeIndex('read',DataHandle,DateStr,TimeIndex,Status)
3176     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3177        return
3178     endif
3179
3180     ! set up for reading the time-dependent attribute
3181     call setup_rdtd_dataset(DataHandle,DataSetName,DH%EnumID,TimeIndex,&
3182          Count,OutCount,dset_id,memspaceid,dspaceid,&
3183          tgroupid,Status)
3184     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3185        return
3186     endif
3187
3188     data_dims(1) = OutCount
3189     ! read the dataset
3190
3191     allocate(Buffer(OutCount))
3192     call h5dread_f(dset_id,DH%EnumID,buffer,data_dims,hdf5err, &
3193          memspaceid,dspaceid,H5P_DEFAULT_F)
3194     if(hdf5err.lt.0) then
3195        Status = WRF_HDF5_ERR_DATASET_READ
3196        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3197        call wrf_debug ( WARN , msg)
3198        return
3199     endif
3200     data(1:OutCount) = buffer(1:OutCount) == 1
3201     deallocate(buffer)
3202     call h5sclose_f(memspaceid,hdf5err)
3203     call h5sclose_f(dspaceid,hdf5err)
3204     call h5dclose_f(dset_id,hdf5err)
3205     call h5gclose_f(tgroupid,hdf5err)
3206  endif
3207
3208end subroutine ext_phdf5_get_var_td_logical
3209
3210subroutine ext_phdf5_get_var_td_char(DataHandle,Element,DateStr,Var,Data,Status)
3211
3212  use wrf_phdf5_data
3213  use ext_phdf5_support_routines
3214  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
3215  implicit none
3216  include 'wrf_status_codes.h'
3217
3218  integer               ,intent(in)             :: DataHandle
3219  character*(*)         ,intent(in)             :: Element
3220  character*(*)         ,intent(in)             :: DateStr
3221  character*(*)         ,intent(in)             :: Var
3222  character(len =256)                            :: DataSetName
3223  character*(*)         ,intent(out)             :: Data
3224  integer                                       :: Count
3225  integer                                       :: OutCount
3226  integer               ,intent(out)            :: Status
3227  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer            :: DH
3228  integer                                       :: TimeIndex
3229  integer(hid_t)                                :: dset_id
3230  integer(hid_t)                                :: dspaceid
3231  integer(hid_t)                                :: memspaceid
3232  integer(hid_t)                                :: tgroupid
3233  integer(hsize_t),dimension(7)                 :: data_dims             
3234  integer                                       :: hdf5err
3235
3236  integer(hid_t)                                :: str_id
3237
3238  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
3239  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3240     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3241     call wrf_debug ( WARN , msg)
3242     return
3243  endif
3244
3245  ! check whether the DateStr is the correct length
3246  call DateCheck(DateStr,Status)
3247  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3248     write(msg,*) 'Warning DATE STRING ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
3249     call wrf_debug ( WARN , msg)
3250     return
3251  endif
3252
3253  if(DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_FOR_READ) then
3254
3255     ! get the time-dependent attribute name
3256     call GetName(Element,Var,DataSetName,Status)
3257
3258     ! get time index of the time-dependent attribute
3259     call GetAttrTimeIndex('read',DataHandle,DateStr,TimeIndex,Status)
3260     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3261        return
3262     endif
3263
3264     ! set up for reading the time-dependent attribute
3265     str_id = H5T_NATIVE_CHARACTER
3266     Count  = 1
3267     call setup_rdtd_dataset(DataHandle,DataSetName,str_id,TimeIndex,&
3268          Count,OutCount,dset_id,memspaceid,dspaceid,&
3269          tgroupid,Status)
3270     if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3271        return
3272     endif
3273
3274     data_dims(1) = Count
3275
3276     ! read the dataset
3277     call h5dread_f(dset_id,str_id,data,data_dims,hdf5err, &
3278          memspaceid,dspaceid,H5P_DEFAULT_F)
3279     if(hdf5err.lt.0) then
3280        Status = WRF_HDF5_ERR_DATASET_READ
3281        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3282        call wrf_debug ( WARN , msg)
3283        return
3284     endif
3285     call h5sclose_f(memspaceid,hdf5err)
3286     call h5sclose_f(dspaceid,hdf5err)
3287     call h5dclose_f(dset_id,hdf5err)
3288     call h5gclose_f(tgroupid,hdf5err)
3289  endif
3290
3291end subroutine ext_phdf5_get_var_td_char
3292
3293! obtain the variable time independent attribute with REAL type
3294subroutine ext_phdf5_get_var_ti_real(DataHandle,Element,Var,Data,Count,OutCount,Status)
3295
3296  use wrf_phdf5_data
3297  use ext_phdf5_support_routines
3298  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
3299  use get_attrid_routine
3300  implicit none
3301  include 'wrf_status_codes.h'
3302
3303  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
3304  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
3305  character*(*)         ,intent(in)     :: Var
3306  real                  ,intent(out)    :: Data(*)
3307  integer               ,intent(in)     :: Count
3308  integer               ,intent(out)    :: OutCount
3309  integer               ,intent(out)    :: Status
3310  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
3311  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
3312  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
3313  integer(hid_t)                        :: attr_type
3314  integer(hsize_t), dimension(7)        :: h5_dims
3315  integer                               :: hdf5err
3316
3317  attr_type = H5T_NATIVE_REAL
3318
3319  call get_attrid(DataHandle,Element,h5_attrid,Status,Var)
3320  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3321     return
3322  endif
3323
3324  call check_type(DataHandle,attr_type,h5_attrid,Status)
3325  if (status /= WRF_NO_ERR) then
3326     return
3327  endif
3328
3329  call  retrieve_ti_info(DataHandle,h5_attrid,h5_atypeid,&
3330       Count,OutCount,Status)
3331  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3332     return
3333  endif
3334
3335  h5_dims(1) = OutCount
3336  call h5aread_f(h5_attrid,attr_type,data,h5_dims,hdf5err)
3337  if(hdf5err.lt.0) then
3338     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_READ
3339     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3340     call wrf_debug ( WARN , msg)
3341     return
3342  endif
3343
3344  return
3345end subroutine ext_phdf5_get_var_ti_real
3346
3347! obtain the variable time independent attribute with REAL8 type
3348subroutine ext_phdf5_get_var_ti_double(DataHandle,Element,Var,Data,Count,OutCount,Status)
3349
3350  use wrf_phdf5_data
3351  use ext_phdf5_support_routines
3352  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
3353  use get_attrid_routine
3354  implicit none
3355  include 'wrf_status_codes.h'
3356
3357  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
3358  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
3359  character*(*)         ,intent(in)     :: Var
3360  real*8                ,intent(out)    :: Data(*)
3361  integer               ,intent(in)     :: Count
3362  integer               ,intent(out)    :: OutCount
3363  integer               ,intent(out)    :: Status
3364  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
3365  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
3366  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
3367  integer(hid_t)                        :: attr_type
3368  integer(hsize_t), dimension(7)        :: h5_dims
3369  integer                               :: hdf5err
3370
3371  attr_type = H5T_NATIVE_DOUBLE
3372
3373  call get_attrid(DataHandle,Element,h5_attrid,Status,Var)
3374  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3375     return
3376  endif
3377
3378  call check_type(DataHandle,attr_type,h5_attrid,Status)
3379  if (status /= WRF_NO_ERR) then
3380     return
3381  endif
3382
3383  call  retrieve_ti_info(DataHandle,h5_attrid,h5_atypeid,&
3384       Count,OutCount,Status)
3385  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3386     return
3387  endif
3388
3389  h5_dims(1) = OutCount
3390  call h5aread_f(h5_attrid,attr_type,data,h5_dims,hdf5err)
3391  if(hdf5err.lt.0) then
3392     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_READ
3393     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3394     call wrf_debug ( WARN , msg)
3395     return
3396  endif
3397
3398end subroutine ext_phdf5_get_var_ti_double
3399
3400! obtain the variable time independent attribute with integer type
3401subroutine ext_phdf5_get_var_ti_integer(DataHandle,Element,Var,Data,Count,OutCount,Status)
3402
3403  use wrf_phdf5_data
3404  use ext_phdf5_support_routines
3405  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
3406  use get_attrid_routine
3407  implicit none
3408  include 'wrf_status_codes.h'
3409
3410  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
3411  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
3412  character*(*)         ,intent(in)     :: Var
3413  integer               ,intent(out)    :: Data(*)
3414  integer               ,intent(in)     :: Count
3415  integer               ,intent(out)    :: OutCount
3416  integer               ,intent(out)    :: Status
3417  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
3418  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
3419  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
3420  integer(hid_t)                        :: attr_type
3421  integer(hsize_t), dimension(7)        :: h5_dims
3422  integer                               :: hdf5err
3423
3424  attr_type = H5T_NATIVE_INTEGER
3425
3426  call get_attrid(DataHandle,Element,h5_attrid,Status,Var)
3427  if (status /= WRF_NO_ERR) then
3428     return
3429  endif
3430
3431  call check_type(DataHandle,attr_type,h5_attrid,Status)
3432  if (status /= WRF_NO_ERR) then
3433     return
3434  endif
3435
3436  call  retrieve_ti_info(DataHandle,h5_attrid,h5_atypeid,&
3437       Count,OutCount,Status)
3438  if (status /= WRF_NO_ERR) then
3439     return
3440  endif
3441
3442  h5_dims(1) = OutCount
3443  call h5aread_f(h5_attrid,attr_type,data,h5_dims,hdf5err)
3444  if(hdf5err.lt.0) then
3445     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_READ
3446     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3447     call wrf_debug ( WARN , msg)
3448     return
3449  endif
3450
3451  return
3452
3453end subroutine ext_phdf5_get_var_ti_integer
3454
3455! obtain the variable time independent attribute with logical type
3456subroutine ext_phdf5_get_var_ti_logical(DataHandle,Element,Var,Data,Count,OutCount,Status)
3457
3458  use wrf_phdf5_data
3459  use ext_phdf5_support_routines
3460  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
3461  use get_attrid_routine
3462  implicit none
3463  include 'wrf_status_codes.h'
3464
3465  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
3466  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
3467  character*(*)         ,intent(in)     :: Var
3468  logical               ,intent(out)    :: Data(*)
3469  integer, dimension(:),allocatable     :: Buffer
3470  integer               ,intent(in)     :: Count
3471  integer               ,intent(out)    :: OutCount
3472  integer               ,intent(out)    :: Status
3473  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
3474  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
3475  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
3476  integer(hid_t)                        :: attr_type
3477  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer    :: DH
3478  integer(hsize_t), dimension(7)        :: h5_dims
3479  integer                               :: hdf5err
3480
3481  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
3482  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3483     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3484     call wrf_debug ( WARN , msg)
3485     return
3486  endif
3487
3488  attr_type = DH%EnumID
3489  call get_attrid(DataHandle,Element,h5_attrid,Status,Var)
3490  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3491     return
3492  endif
3493
3494  call check_type(DataHandle,attr_type,h5_attrid,Status)
3495  if (status /= WRF_NO_ERR) then
3496     return
3497  endif
3498
3499  call  retrieve_ti_info(DataHandle,h5_attrid,h5_atypeid,&
3500       Count,OutCount,Status)
3501  if (status /= WRF_NO_ERR) then
3502     return
3503  endif
3504
3505  h5_dims(1) = OutCount
3506
3507  allocate(buffer(OutCount))
3508  call h5aread_f(h5_attrid,attr_type,buffer,h5_dims,hdf5err)
3509  if(hdf5err.lt.0) then
3510     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_READ
3511     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3512     call wrf_debug ( WARN , msg)
3513     deallocate(buffer)
3514     return
3515  endif
3516
3517  Data(1:OutCount) = buffer(1:OutCount)==1
3518  deallocate(buffer)
3519  return
3520
3521end subroutine ext_phdf5_get_var_ti_logical
3522
3523
3524! obtain the domain variable independent attribute with Char type
3525subroutine ext_phdf5_get_var_ti_char(DataHandle,Element,Var,Data,Status)
3526
3527  use wrf_phdf5_data
3528  use ext_phdf5_support_routines
3529  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
3530  use get_attrid_routine
3531  implicit none
3532  include 'wrf_status_codes.h'
3533
3534  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
3535  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
3536  character*(*)         ,intent(in)     :: Var
3537  character*(*)         ,intent(out)    :: Data
3538  integer               ,intent(out)    :: Status
3539
3540  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
3541  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
3542  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
3543  integer(hid_t)                        :: attr_type
3544  integer(hsize_t), dimension(7)        :: h5_dims
3545  integer                               :: Count
3546  integer                               :: OutCount
3547  integer                               :: hdf5err
3548
3549  attr_type = H5T_NATIVE_CHARACTER
3550  call get_attrid(DataHandle,Element,h5_attrid,Status,Var)
3551  if (status /= WRF_NO_ERR) then
3552     return
3553  endif
3554
3555  call check_type(DataHandle,attr_type,h5_attrid,Status)
3556  if (status /= WRF_NO_ERR) then
3557     return
3558  endif
3559
3560  call  retrieve_ti_info(DataHandle,h5_attrid,h5_atypeid,&
3561       Count,OutCount,Status)
3562  if (status /= WRF_NO_ERR) then
3563     return
3564  endif
3565
3566  if(OutCount /= 1) then
3567     Status = WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_OTHERS
3568  endif
3569  h5_dims(1) = OutCount
3570  call h5aread_f(h5_attrid,h5_atypeid,data,h5_dims,hdf5err)
3571  if(hdf5err.lt.0) then
3572     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_READ
3573     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3574     call wrf_debug ( WARN , msg)
3575     return
3576  endif
3577
3578  return
3579
3580end subroutine ext_phdf5_get_var_ti_char
3581
3582
3583! write the domain time independent attribute with real type
3584subroutine ext_phdf5_put_dom_ti_real(DataHandle,Element,Data,Count,Status)
3585
3586  use wrf_phdf5_data
3587  use ext_phdf5_support_routines
3588  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
3589  implicit none
3590  include 'wrf_status_codes.h'
3591
3592  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
3593  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
3594  real                  ,intent(in)     :: Data(*)
3595  integer               ,intent(in)     :: Count
3596  integer               ,intent(out)    :: Status
3597
3598  integer(hid_t)                        :: h5_objid
3599  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
3600  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
3601  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
3602  integer(hsize_t), dimension(7)        :: adata_dims
3603  character*3                           :: routine_type
3604  integer                               :: routine_atype
3605  integer                               :: str_flag = 0 ! not a string type
3606  integer(hid_t)                        :: hdf5err
3607  character(VarNameLen)                 :: var
3608
3609  ! Do nothing unless it is time to write time-independent domain metadata.
3610  IF ( .NOT. phdf5_ok_to_put_dom_ti( DataHandle ) ) THEN
3611    Status = WRF_NO_ERR
3612    return
3613  ENDIF
3614
3615  var = 'DUMMY'
3616  routine_type = 'DOM'
3617  routine_atype = WRF_REAL
3618  adata_dims(1) = Count
3619
3620  call create_phdf5_objid(DataHandle,h5_objid,routine_type,var,Status)
3621  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3622     return
3623  endif
3624
3625  call create_phdf5_adtypeid(h5_atypeid,routine_atype,Count,Status)
3626  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3627     return
3628  endif
3629
3630  call create_phdf5_adspaceid(Count,str_flag,h5_aspaceid,Status)
3631  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3632     return
3633  endif
3634
3635  call h5acreate_f(h5_objid,Element,h5_atypeid,h5_aspaceid, &
3636       h5_attrid, hdf5err)
3637  if(hdf5err.lt.0) then
3638     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
3639     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3640     call wrf_debug ( WARN , msg)
3641     return
3642  endif
3643
3644  call h5awrite_f(h5_attrid,h5_atypeid,Data,adata_dims,hdf5err)
3645  if(hdf5err.lt.0) then
3646     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
3647     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3648     call wrf_debug ( WARN , msg)
3649     return
3650  endif
3651
3652  call clean_phdf5_attrids(h5_atypeid,h5_aspaceid,h5_attrid,str_flag,Status)
3653  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3654     return
3655  endif
3656
3657  return
3658end subroutine ext_phdf5_put_dom_ti_real
3659
3660! write the domain time independent attribute with integer type
3661subroutine ext_phdf5_put_dom_ti_integer(DataHandle,Element,Data,Count,Status)
3662
3663  use wrf_phdf5_data
3664  use ext_phdf5_support_routines
3665  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
3666  implicit none
3667  include 'wrf_status_codes.h'
3668
3669  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
3670  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
3671  integer               ,intent(in)     :: Data(*)
3672  integer               ,intent(in)     :: Count
3673  integer               ,intent(out)    :: Status
3674  integer(hid_t)                        :: h5_objid
3675  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
3676  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
3677  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
3678  integer(hsize_t), dimension(7)        :: adata_dims
3679  character*3                           :: routine_type
3680  integer                               :: routine_atype
3681  integer                               :: str_flag = 0 ! not a string type
3682  integer(hid_t)                        :: hdf5err
3683  character(VarNameLen)                 :: var
3684
3685  ! Do nothing unless it is time to write time-independent domain metadata.
3686  IF ( .NOT. phdf5_ok_to_put_dom_ti( DataHandle ) ) THEN
3687    Status = WRF_NO_ERR
3688    return
3689  ENDIF
3690
3691  var = 'DUMMY'
3692  routine_type = 'DOM'
3693  routine_atype = WRF_INTEGER
3694  adata_dims(1) = Count
3695
3696  call create_phdf5_objid(DataHandle,h5_objid,routine_type,var,Status)
3697  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3698     return
3699  endif
3700
3701  call create_phdf5_adtypeid(h5_atypeid,routine_atype,Count,Status)
3702  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3703     return
3704  endif
3705
3706  call create_phdf5_adspaceid(Count,str_flag,h5_aspaceid,Status)
3707  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3708     return
3709  endif
3710
3711  call h5acreate_f(h5_objid,Element,h5_atypeid,h5_aspaceid, &
3712       h5_attrid, hdf5err)
3713  if(hdf5err.lt.0) then
3714     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
3715     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3716     call wrf_debug ( WARN , msg)
3717     return
3718  endif
3719
3720  call h5awrite_f(h5_attrid,h5_atypeid,Data,adata_dims,hdf5err)
3721  if(hdf5err.lt.0) then
3722     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
3723     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3724     call wrf_debug ( WARN , msg)
3725     return
3726  endif
3727
3728  call clean_phdf5_attrids(h5_atypeid,h5_aspaceid,h5_attrid,str_flag,Status)
3729  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3730     return
3731  endif
3732
3733  return
3734end subroutine ext_phdf5_put_dom_ti_integer
3735
3736! write the domain time independent attribute with double type
3737subroutine ext_phdf5_put_dom_ti_double(DataHandle,Element,Data,Count,Status)
3738
3739  use wrf_phdf5_data
3740  use ext_phdf5_support_routines
3741  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
3742  implicit none
3743  include 'wrf_status_codes.h'
3744
3745  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
3746  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
3747  real*8                ,intent(in)     :: Data(*)
3748  integer               ,intent(in)     :: Count
3749  integer               ,intent(out)    :: Status
3750  integer(hid_t)                        :: h5_objid
3751  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
3752  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
3753  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
3754  integer(hsize_t), dimension(7)        :: adata_dims
3755
3756  character*3                           :: routine_type
3757  integer                               :: routine_atype
3758  integer                               :: str_flag = 0 ! not a string type
3759  integer(hid_t)                        :: hdf5err
3760  character(VarNameLen)                 :: var
3761
3762  ! Do nothing unless it is time to write time-independent domain metadata.
3763  IF ( .NOT. phdf5_ok_to_put_dom_ti( DataHandle ) ) THEN
3764    Status = WRF_NO_ERR
3765    return
3766  ENDIF
3767
3768  var           = 'DUMMY'
3769  routine_type  = 'DOM'
3770  routine_atype = WRF_DOUBLE
3771  adata_dims(1) = Count
3772
3773  call create_phdf5_objid(DataHandle,h5_objid,routine_type,var,Status)
3774  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3775     return
3776  endif
3777
3778  call create_phdf5_adtypeid(h5_atypeid,routine_atype,Count,Status)
3779  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3780     return
3781  endif
3782
3783  call create_phdf5_adspaceid(Count,str_flag,h5_aspaceid,Status)
3784  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3785     return
3786  endif
3787
3788  call h5acreate_f(h5_objid,Element,h5_atypeid,h5_aspaceid, &
3789       h5_attrid, hdf5err)
3790  if(hdf5err.lt.0) then
3791     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
3792     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3793     call wrf_debug ( WARN , msg)
3794     return
3795  endif
3796
3797  call h5awrite_f(h5_attrid,h5_atypeid,Data,adata_dims,hdf5err)
3798  if(hdf5err.lt.0) then
3799     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
3800     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3801     call wrf_debug ( WARN , msg)
3802     return
3803  endif
3804
3805  call clean_phdf5_attrids(h5_atypeid,h5_aspaceid,h5_attrid,str_flag,Status)
3806  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3807     return
3808  endif
3809  return
3810
3811end subroutine ext_phdf5_put_dom_ti_double
3812
3813! write the domain time independent attribute with logical type
3814subroutine ext_phdf5_put_dom_ti_logical(DataHandle,Element,Data,Count,Status)
3815
3816  use wrf_phdf5_data
3817  use ext_phdf5_support_routines
3818  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
3819  implicit none
3820  include 'wrf_status_codes.h'
3821
3822  integer               ,intent(in)      :: DataHandle
3823  character*(*)         ,intent(in)      :: Element
3824  logical               ,intent(in)      :: Data(*)
3825  integer     ,dimension(:),allocatable  :: Buffer
3826  integer               ,intent(in)      :: Count
3827  integer               ,intent(out)     :: Status
3828
3829  integer                                :: i
3830  integer(hid_t)                         :: h5_objid
3831  integer(hid_t)                         :: h5_atypeid
3832  integer(hid_t)                         :: h5_aspaceid
3833  integer(hid_t)                         :: h5_attrid
3834  integer(hsize_t), dimension(7)         :: adata_dims
3835
3836  character*3                            :: routine_type
3837  integer                                :: routine_atype
3838  integer                                :: str_flag = 0 ! not a string type
3839  integer(hid_t)                         :: hdf5err
3840  character(VarNameLen)                  :: var
3841
3842  ! Do nothing unless it is time to write time-independent domain metadata.
3843  IF ( .NOT. phdf5_ok_to_put_dom_ti( DataHandle ) ) THEN
3844    Status = WRF_NO_ERR
3845    return
3846  ENDIF
3847
3848  var           = 'DUMMY'
3849  routine_type  = 'DOM'
3850  routine_atype = WRF_LOGICAL
3851  adata_dims(1) = Count
3852
3853  allocate(Buffer(Count))
3854
3855  do i = 1,Count
3856     if(Data(i) .EQV. .TRUE.) then
3857        Buffer(i) = 1
3858     else
3859        Buffer(i) = 0
3860     endif
3861  enddo
3862
3863  call create_phdf5_objid(DataHandle,h5_objid,routine_type,var,Status)
3864  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3865     return
3866  endif
3867
3868  call create_phdf5_adtypeid(h5_atypeid,routine_atype,Count,Status,DataHandle)
3869  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3870     return
3871  endif
3872
3873  call create_phdf5_adspaceid(Count,str_flag,h5_aspaceid,Status)
3874  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3875     return
3876  endif
3877
3878  call h5acreate_f(h5_objid,Element,h5_atypeid,h5_aspaceid, &
3879       h5_attrid, hdf5err)
3880  if(hdf5err.lt.0) then
3881     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
3882     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3883     call wrf_debug ( WARN , msg)
3884     deallocate(buffer)
3885     return
3886  endif
3887
3888  call h5awrite_f(h5_attrid,h5_atypeid,Buffer,adata_dims,hdf5err)
3889  if(hdf5err.lt.0) then
3890     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
3891     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3892     call wrf_debug ( WARN , msg)
3893     deallocate(buffer)
3894     return
3895  endif
3896
3897  call clean_phdf5_attrids(h5_atypeid,h5_aspaceid,h5_attrid,str_flag,Status)
3898  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3899     return
3900  endif
3901
3902  deallocate(Buffer)
3903
3904end subroutine ext_phdf5_put_dom_ti_logical
3905
3906
3907! write the domain time independent attribute with char type
3908subroutine ext_phdf5_put_dom_ti_char(DataHandle,Element,Data,Status)
3909
3910  use wrf_phdf5_data
3911  use ext_phdf5_support_routines
3912  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
3913  implicit none
3914  include 'wrf_status_codes.h'
3915
3916!!!! Need more work.
3917  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
3918  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
3919  character*(*)         ,intent(in)     :: Data
3920  integer                               :: Count ! always 1 for char
3921  integer               ,intent(out)    :: Status
3922
3923  integer(hid_t)                        :: h5_objid
3924  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
3925  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
3926  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
3927  integer(hsize_t), dimension(7)        :: adata_dims
3928  character*3                           :: routine_type
3929  integer                               :: routine_atype
3930  integer                               :: str_flag = 1 ! is a string type
3931  integer(hid_t)                        :: hdf5err
3932  integer                               :: len_str
3933  character(VarNameLen)                 :: var
3934  character(1)                          :: RepData =' '
3935
3936  ! Do nothing unless it is time to write time-independent domain metadata.
3937  IF ( .NOT. phdf5_ok_to_put_dom_ti( DataHandle ) ) THEN
3938    Status = WRF_NO_ERR
3939    return
3940  ENDIF
3941
3942  Count = 1
3943  var = 'DUMMY'
3944  routine_type = 'DOM'
3945  routine_atype = WRF_CHARACTER
3946  adata_dims(1) = Count
3947
3948  call create_phdf5_objid(DataHandle,h5_objid,routine_type,var,Status)
3949  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3950     return
3951  endif
3952
3953  ! This part may need more work, a special case is that the length of the
3954  ! string may be 0, HDF5 cannot handle 0 length string(?),so set the length
3955  ! to 1
3956
3957  len_str = len_trim(Data)
3958  if(len_str == 0) then
3959     len_str = 1
3960  endif
3961
3962  call create_phdf5_adtypeid(h5_atypeid,routine_atype,len_str,Status)
3963  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3964     return
3965  endif
3966
3967  call create_phdf5_adspaceid(Count,str_flag,h5_aspaceid,Status)
3968  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
3969     return
3970  endif
3971
3972  call h5acreate_f(h5_objid,Element,h5_atypeid,h5_aspaceid, &
3973       h5_attrid, hdf5err)
3974  if(hdf5err.lt.0) then
3975     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
3976     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3977     call wrf_debug ( WARN , msg)
3978     return
3979  endif
3980
3981
3982  if(len_trim(Data) == 0) then
3983
3984     call h5awrite_f(h5_attrid,h5_atypeid,RepData,adata_dims,hdf5err)
3985     if(hdf5err.lt.0) then
3986        Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
3987        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3988        call wrf_debug ( WARN , msg)
3989        return
3990     endif
3991  else
3992
3993     call h5awrite_f(h5_attrid,h5_atypeid,trim(Data),adata_dims,hdf5err)
3994     if(hdf5err.lt.0) then
3995        Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
3996        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
3997        call wrf_debug ( WARN , msg)
3998        return
3999     endif
4000  endif
4001
4002  call clean_phdf5_attrids(h5_atypeid,h5_aspaceid,h5_attrid,str_flag,Status)
4003  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4004     return
4005  endif
4006
4007  return
4008end subroutine ext_phdf5_put_dom_ti_char
4009
4010! write the variable time independent attribute with real type
4011subroutine ext_phdf5_put_var_ti_real(DataHandle,Element,Var,Data,Count,Status)
4012
4013  use wrf_phdf5_data
4014  use ext_phdf5_support_routines
4015  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
4016  implicit none
4017  include 'wrf_status_codes.h'
4018
4019  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
4020  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
4021  character*(*)         ,intent(in)     :: Var     
4022  real                  ,intent(in)     :: Data(*)
4023  integer               ,intent(in)     :: Count
4024  integer               ,intent(out)    :: Status
4025
4026  integer(hid_t)                        :: h5_objid
4027  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
4028  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
4029  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
4030  integer(hsize_t), dimension(7)        :: adata_dims
4031  character*3                           :: routine_type
4032  integer                               :: routine_atype
4033  integer                               :: str_flag = 0 ! not a string type
4034  integer(hid_t)                        :: hdf5err
4035  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer    :: DH
4036
4037
4038  routine_type = 'VAR'
4039  routine_atype = WRF_REAL
4040  adata_dims(1) = Count
4041
4042  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
4043  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4044     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4045     call wrf_debug ( WARN , msg)
4046     return
4047  endif
4048
4049  ! The following two checks must be here to avoid duplicating attributes
4050  if (DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_NOT_COMMITTED) then
4051     Status = WRF_NO_ERR
4052     return
4053  endif
4054  if(DH%TimeIndex > 1) then
4055     Status = WRF_NO_ERR
4056     return   
4057  endif
4058
4059  call create_phdf5_objid(DataHandle,h5_objid,routine_type,Var,Status)
4060  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4061     return
4062  endif
4063
4064  call create_phdf5_adtypeid(h5_atypeid,routine_atype,Count,Status)
4065  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4066     return
4067  endif
4068
4069  call create_phdf5_adspaceid(Count,str_flag,h5_aspaceid,Status)
4070  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4071     return
4072  endif
4073
4074  call h5acreate_f(h5_objid,Element,h5_atypeid,h5_aspaceid, &
4075       h5_attrid, hdf5err)
4076  if(hdf5err.lt.0) then
4077     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
4078     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4079     call wrf_debug ( WARN , msg)
4080     return
4081  endif
4082
4083  call h5awrite_f(h5_attrid,h5_atypeid,Data,adata_dims,hdf5err)
4084  if(hdf5err.lt.0) then
4085     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
4086     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4087     call wrf_debug ( WARN , msg)
4088     return
4089  endif
4090
4091  call clean_phdf5_attrids(h5_atypeid,h5_aspaceid,h5_attrid,str_flag,Status)
4092  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4093     return
4094  endif
4095
4096  return
4097end subroutine ext_phdf5_put_var_ti_real
4098
4099! write the variable time independent attribute with double type
4100subroutine ext_phdf5_put_var_ti_double(DataHandle,Element,Var,Data,Count,Status)
4101
4102  use wrf_phdf5_data
4103  use ext_phdf5_support_routines
4104  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
4105  implicit none
4106  include 'wrf_status_codes.h'
4107
4108  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
4109  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
4110  real*8                ,intent(in)     :: Data(*)
4111  character*(*)         ,intent(in)     :: Var     
4112  integer               ,intent(in)     :: Count
4113  integer               ,intent(out)    :: Status
4114
4115  integer(hid_t)                        :: h5_objid
4116  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
4117  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
4118  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
4119  integer(hsize_t), dimension(7)        :: adata_dims
4120
4121  character*3                           :: routine_type
4122  integer                               :: routine_atype
4123  integer                               :: str_flag = 0 ! not a string type
4124  integer(hid_t)                        :: hdf5err
4125  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer    :: DH
4126
4127  routine_type  = 'VAR'
4128  routine_atype = WRF_DOUBLE
4129  adata_dims(1) = Count
4130
4131  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
4132  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4133     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4134     call wrf_debug ( WARN , msg)
4135     return
4136  endif
4137
4138  if (DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_NOT_COMMITTED) then
4139     Status = WRF_NO_ERR
4140     return
4141  endif
4142  if(DH%TimeIndex > 1) then
4143     Status = WRF_NO_ERR
4144     return   
4145  endif
4146
4147  call create_phdf5_objid(DataHandle,h5_objid,routine_type,Var,Status)
4148  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4149     return
4150  endif
4151
4152  call create_phdf5_adtypeid(h5_atypeid,routine_atype,Count,Status)
4153  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4154     return
4155  endif
4156
4157  call create_phdf5_adspaceid(Count,str_flag,h5_aspaceid,Status)
4158  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4159     return
4160  endif
4161
4162  call h5acreate_f(h5_objid,Element,h5_atypeid,h5_aspaceid, &
4163       h5_attrid, hdf5err)
4164  if(hdf5err.lt.0) then
4165     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
4166     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4167     call wrf_debug ( WARN , msg)
4168     return
4169  endif
4170
4171
4172  call h5awrite_f(h5_attrid,h5_atypeid,Data,adata_dims,hdf5err)
4173  if(hdf5err.lt.0) then
4174     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
4175     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4176     call wrf_debug ( WARN , msg)
4177     return
4178  endif
4179
4180  call clean_phdf5_attrids(h5_atypeid,h5_aspaceid,h5_attrid,str_flag,Status)
4181  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4182     return
4183  endif
4184
4185  return
4186
4187end subroutine ext_phdf5_put_var_ti_double
4188
4189! write the variable time independent attribute with integer type
4190subroutine ext_phdf5_put_var_ti_integer(DataHandle,Element,Var,Data,Count,Status)
4191
4192  use wrf_phdf5_data
4193  use ext_phdf5_support_routines
4194  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
4195  implicit none
4196  include 'wrf_status_codes.h'
4197
4198  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
4199  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
4200  character*(*)         ,intent(in)     :: Var     
4201  integer               ,intent(in)     :: Data(*)
4202  integer               ,intent(in)     :: Count
4203  integer               ,intent(out)    :: Status
4204
4205  integer(hid_t)                        :: h5_objid
4206  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
4207  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
4208  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
4209  integer(hsize_t), dimension(7)        :: adata_dims
4210
4211  character*3                           :: routine_type
4212  integer                               :: routine_atype
4213  integer                               :: str_flag = 0 ! not a string type
4214  integer(hid_t)                        :: hdf5err
4215  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer    :: DH
4216
4217  routine_type = 'VAR'
4218  routine_atype = WRF_INTEGER
4219  adata_dims(1) = Count
4220
4221  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
4222  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4223     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4224     call wrf_debug ( WARN , msg)
4225     return
4226  endif
4227
4228  ! The following two checks must be here to avoid duplicating attributes
4229  if (DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_NOT_COMMITTED) then
4230     Status = WRF_NO_ERR
4231     return
4232  endif
4233  if(DH%TimeIndex > 1) then
4234     Status = WRF_NO_ERR
4235     return   
4236  endif
4237
4238  call create_phdf5_objid(DataHandle,h5_objid,routine_type,Var,Status)
4239  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4240     return
4241  endif
4242
4243  call create_phdf5_adtypeid(h5_atypeid,routine_atype,Count,Status)
4244  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4245     return
4246  endif
4247
4248  call create_phdf5_adspaceid(Count,str_flag,h5_aspaceid,Status)
4249  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4250     return
4251  endif
4252
4253  call h5acreate_f(h5_objid,Element,h5_atypeid,h5_aspaceid, &
4254       h5_attrid, hdf5err)
4255  if(hdf5err.lt.0) then
4256     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
4257     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4258     call wrf_debug ( WARN , msg)
4259     return
4260  endif
4261
4262
4263  call h5awrite_f(h5_attrid,h5_atypeid,Data,adata_dims,hdf5err)
4264  if(hdf5err.lt.0) then
4265     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
4266     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4267     call wrf_debug ( WARN , msg)
4268     return
4269  endif
4270
4271
4272  call clean_phdf5_attrids(h5_atypeid,h5_aspaceid,h5_attrid,str_flag,Status)
4273  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4274     return
4275  endif
4276
4277  return
4278end subroutine ext_phdf5_put_var_ti_integer
4279
4280
4281! write the variable time independent attribute with logical type
4282subroutine ext_phdf5_put_var_ti_logical(DataHandle,Element,Var,Data,Count,Status)
4283
4284  use wrf_phdf5_data
4285  use ext_phdf5_support_routines
4286  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
4287  implicit none
4288  include 'wrf_status_codes.h'
4289
4290  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
4291  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
4292  character*(*)         ,intent(in)     :: Var     
4293  logical               ,intent(in)     :: Data(*)
4294  integer     ,dimension(:),allocatable :: Buffer
4295  integer               ,intent(in)     :: Count
4296  integer               ,intent(out)    :: Status
4297
4298  integer                                :: i
4299  integer(hid_t)                        :: h5_objid
4300  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
4301  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
4302  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
4303  integer(hsize_t), dimension(7)        :: adata_dims
4304
4305  character*3                           :: routine_type
4306  integer                               :: routine_atype
4307  integer                               :: str_flag = 0 ! not a string type
4308  integer(hid_t)                        :: hdf5err
4309  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer    :: DH
4310
4311  routine_type = 'VAR'
4312  routine_atype = WRF_LOGICAL
4313  adata_dims(1) = Count
4314
4315  allocate(Buffer(Count))
4316
4317  do i = 1,Count
4318     if(Data(i) .EQV. .TRUE.) then
4319        Buffer(i) = 1
4320     else
4321        Buffer(i) = 0
4322     endif
4323  enddo
4324
4325  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
4326  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4327     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4328     call wrf_debug ( WARN , msg)
4329     return
4330  endif
4331
4332  ! The following two checks must be here to avoid duplicating attributes
4333  if (DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_NOT_COMMITTED) then
4334     Status = WRF_NO_ERR
4335     return
4336  endif
4337
4338  if(DH%TimeIndex > 1) then
4339     Status = WRF_NO_ERR
4340     return   
4341  endif
4342
4343  call create_phdf5_objid(DataHandle,h5_objid,routine_type,var,Status)
4344  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4345     return
4346  endif
4347
4348  call create_phdf5_adtypeid(h5_atypeid,routine_atype,Count,Status)
4349  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4350     return
4351  endif
4352
4353  call create_phdf5_adspaceid(Count,str_flag,h5_aspaceid,Status)
4354  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4355     return
4356  endif
4357
4358  call h5acreate_f(h5_objid,Element,h5_atypeid,h5_aspaceid, &
4359       h5_attrid, hdf5err)
4360  if(hdf5err.lt.0) then
4361     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
4362     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4363     call wrf_debug ( WARN , msg)
4364     deallocate(buffer)
4365     return
4366  endif
4367
4368
4369  call h5awrite_f(h5_attrid,h5_atypeid,Buffer,adata_dims,hdf5err)
4370  if(hdf5err.lt.0) then
4371     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
4372     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4373     call wrf_debug ( WARN , msg)
4374     deallocate(buffer)
4375     return
4376  endif
4377
4378  call clean_phdf5_attrids(h5_atypeid,h5_aspaceid,h5_attrid,str_flag,Status)
4379  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4380     return
4381  endif
4382
4383  return
4384end subroutine ext_phdf5_put_var_ti_logical
4385
4386! write the variable time independent attribute with char type
4387subroutine ext_phdf5_put_var_ti_char(DataHandle,Element,Var,Data,Status)
4388
4389  use wrf_phdf5_data
4390  use ext_phdf5_support_routines
4391  USE HDF5 ! This module contains all necessary modules
4392  implicit none
4393  include 'wrf_status_codes.h'
4394
4395  integer               ,intent(in)     :: DataHandle
4396  character*(*)         ,intent(in)     :: Element
4397  character*(*)         ,intent(in)     :: Data
4398  character*(*)         ,intent(in)     :: Var     
4399  integer                               :: Count
4400  integer               ,intent(out)    :: Status
4401  integer(hid_t)                        :: h5_objid
4402  integer(hid_t)                        :: h5_atypeid
4403  integer(hid_t)                        :: h5_aspaceid
4404  integer(hid_t)                        :: h5_attrid
4405  integer(hsize_t), dimension(7)        :: adata_dims
4406
4407  character*3                           :: routine_type
4408  integer                               :: routine_atype
4409  integer                               :: str_flag = 1 ! IS  string type
4410  integer(hid_t)                        :: hdf5err
4411  integer                               :: len_str
4412  character(1)                          :: RepData = ' '
4413  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer    :: DH
4414
4415  Count         = 1
4416  routine_type  = 'VAR'
4417  routine_atype = WRF_CHARACTER
4418  adata_dims(1) = Count
4419
4420  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
4421  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4422     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__, &
4423          ', line', __LINE__
4424     call wrf_debug ( WARN , msg)
4425     return
4426  endif
4427
4428  ! The following two checks must be here to avoid duplicating attributes
4429  if (DH%FileStatus == WRF_FILE_OPENED_NOT_COMMITTED) then
4430     Status = WRF_NO_ERR
4431     return
4432  endif
4433
4434  if(DH%TimeIndex > 1) then
4435     Status = WRF_NO_ERR
4436     return   
4437  endif
4438
4439  call create_phdf5_objid(DataHandle,h5_objid,routine_type,Var,Status)
4440  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4441     return
4442  endif
4443
4444  len_str = len_trim(Data)
4445
4446  if(len_str .eq. 0) then
4447     len_str = 1
4448  endif
4449
4450  call create_phdf5_adtypeid(h5_atypeid,routine_atype,len_str,Status)
4451  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4452     return
4453  endif
4454
4455  call create_phdf5_adspaceid(Count,str_flag,h5_aspaceid,Status)
4456  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4457     return
4458  endif
4459
4460  call h5acreate_f(h5_objid,Element,h5_atypeid,h5_aspaceid, &
4461       h5_attrid, hdf5err)
4462  if(hdf5err.lt.0) then
4463     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
4464     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4465     call wrf_debug ( WARN , msg)
4466     return
4467  endif
4468
4469  if(len_trim(Data) == 0) then
4470
4471     call h5awrite_f(h5_attrid,h5_atypeid,RepData,adata_dims,hdf5err)
4472     if(hdf5err.lt.0) then
4473        Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
4474        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4475        call wrf_debug ( WARN , msg)
4476        return
4477     endif
4478  else
4479     call h5awrite_f(h5_attrid,h5_atypeid,trim(Data),adata_dims,hdf5err)
4480     if(hdf5err.lt.0) then
4481        Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
4482        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4483        call wrf_debug ( WARN , msg)
4484        return
4485     endif
4486  endif
4487
4488  call clean_phdf5_attrids(h5_atypeid,h5_aspaceid,h5_attrid,str_flag,Status)
4489  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4490     return
4491  endif
4492
4493  return
4494end subroutine ext_phdf5_put_var_ti_char
4495
4496
4497
4498! This routine will retrieve the dimensional table, should be useful
4499! for tool developers.
4500
4501subroutine retrieve_table(DataHandle,Status)
4502
4503  use wrf_phdf5_data
4504  use ext_phdf5_support_routines
4505  use hdf5
4506  implicit none
4507  include 'wrf_status_codes.h'   
4508
4509  character*256,dimension(MaxTabDims)    :: dim_name
4510  integer,dimension(:),allocatable      :: length
4511  integer,dimension(:),allocatable      :: unlimited
4512  integer, intent(in)                   :: DataHandle
4513  integer, intent(out)                  :: Status
4514
4515  integer(hid_t)                        :: dset_id
4516  integer(hid_t)                        :: dataspace_id
4517  integer(hid_t)                        :: dtstr_id
4518  integer(hid_t)                        :: dt1_id
4519  integer(hid_t)                        :: dtint1_id
4520  integer(hid_t)                        :: dtint2_id
4521  integer(size_t)                       :: type_sizei
4522  integer(size_t)                       :: offset
4523  integer                               :: table_length
4524  integer(size_t)                       :: string_size
4525  integer(hsize_t),dimension(7)         :: data_dims
4526  integer(hsize_t)                      :: table_size
4527  integer                               :: i
4528  integer                               :: hdf5err
4529
4530  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer    :: DH
4531
4532  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
4533  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4534     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4535     call wrf_debug ( WARN , msg)
4536     return
4537  endif
4538
4539  call h5dopen_f(DH%DimGroupID,"h5dim_table",dset_id,hdf5err)
4540  if(hdf5err.lt.0) then
4541     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_OPEN
4542     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4543     call wrf_debug ( WARN , msg)
4544     return
4545  endif
4546
4547  call h5dget_space_f(dset_id,dataspace_id,hdf5err)
4548  if(hdf5err.lt.0) then
4549     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
4550     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4551     call wrf_debug ( WARN , msg)
4552     return
4553  endif
4554
4555  call h5sget_simple_extent_npoints_f(dataspace_id,table_size,hdf5err)
4556  if(hdf5err.lt.0) then
4557     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
4558     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4559     call wrf_debug ( WARN , msg)
4560     return
4561  endif
4562
4563  data_dims(1) = table_size
4564  allocate(length(table_size))
4565  allocate(unlimited(table_size))
4566
4567
4568  ! the name of the dimension
4569  call h5tcopy_f(H5T_NATIVE_CHARACTER,dtstr_id,hdf5err)
4570  if(hdf5err.lt.0) then
4571     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4572     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4573     call wrf_debug ( WARN , msg)
4574     deallocate(length)
4575     deallocate(unlimited)
4576     return
4577  endif
4578
4579  string_size = 256
4580  call h5tset_size_f(dtstr_id,string_size,hdf5err)
4581  if(hdf5err.lt.0) then
4582     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4583     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4584     call wrf_debug ( WARN , msg)
4585     deallocate(length)
4586     deallocate(unlimited)
4587     return
4588  endif
4589
4590  call h5tcreate_f(H5T_COMPOUND_F,string_size,dt1_id,hdf5err)
4591  if(hdf5err.lt.0) then
4592     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4593     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4594     call wrf_debug ( WARN , msg)
4595     deallocate(length)
4596     deallocate(unlimited)
4597     return
4598  endif
4599
4600  offset = 0
4601  call h5tinsert_f(dt1_id,"dim_name",offset,dtstr_id,hdf5err)
4602  if(hdf5err.lt.0) then
4603     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4604     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4605     call wrf_debug ( WARN , msg)
4606     deallocate(length)
4607     deallocate(unlimited)
4608     return
4609  endif
4610
4611  call h5dread_f(dset_id,dt1_id,dim_name,data_dims,hdf5err)
4612  if(hdf5err.lt.0) then
4613     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_READ
4614     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4615     call wrf_debug ( WARN , msg)
4616     deallocate(length)
4617     deallocate(unlimited)
4618     return
4619  endif
4620
4621  ! the length of the dimension
4622  call h5tget_size_f(H5T_NATIVE_INTEGER,type_sizei,hdf5err)
4623  if(hdf5err.lt.0) then
4624     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4625     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4626     call wrf_debug ( WARN , msg)
4627     deallocate(length)
4628     deallocate(unlimited)
4629     return
4630  endif
4631
4632  call h5tcreate_f(H5T_COMPOUND_F,type_sizei,dtint1_id,hdf5err)
4633  if(hdf5err.lt.0) then
4634     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4635     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4636     call wrf_debug ( WARN , msg)
4637     deallocate(length)
4638     deallocate(unlimited)
4639     return
4640  endif
4641
4642  offset = 0
4643  call h5tinsert_f(dtint1_id,"dim_length",offset,H5T_NATIVE_INTEGER,hdf5err)
4644  if(hdf5err.lt.0) then
4645     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4646     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4647     call wrf_debug ( WARN , msg)
4648     deallocate(length)
4649     deallocate(unlimited)
4650     return
4651  endif
4652
4653  call h5dread_f(dset_id,dtint1_id,length,data_dims,hdf5err)
4654  if(hdf5err.lt.0) then
4655     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_READ
4656     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4657     call wrf_debug ( WARN , msg)
4658     deallocate(length)
4659     deallocate(unlimited)
4660     return
4661  endif
4662
4663
4664  ! the unlimited info. of the dimension
4665  call h5tget_size_f(H5T_NATIVE_INTEGER,type_sizei,hdf5err)
4666  if(hdf5err.lt.0) then
4667     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4668     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4669     call wrf_debug ( WARN , msg)
4670     deallocate(length)
4671     deallocate(unlimited)
4672     return
4673  endif
4674
4675  call h5tcreate_f(H5T_COMPOUND_F,type_sizei,dtint2_id,hdf5err)
4676  if(hdf5err.lt.0) then
4677     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4678     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4679     call wrf_debug ( WARN , msg)
4680     deallocate(length)
4681     deallocate(unlimited)
4682     return
4683  endif
4684
4685  offset = 0
4686  call h5tinsert_f(dtint2_id,"dim_unlimited",offset,H5T_NATIVE_INTEGER,hdf5err)
4687  if(hdf5err.lt.0) then
4688     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4689     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4690     call wrf_debug ( WARN , msg)
4691     deallocate(length)
4692     deallocate(unlimited)
4693     return
4694  endif
4695
4696  call h5dread_f(dset_id,dtint2_id,unlimited,data_dims,hdf5err)
4697  if(hdf5err.lt.0) then
4698     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_READ
4699     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4700     call wrf_debug ( WARN , msg)
4701     deallocate(length)
4702     deallocate(unlimited)
4703     return
4704  endif
4705
4706  ! Store the information to the table array
4707  do i =1,table_size
4708     DH%DIMTABLE(i)%dim_name = dim_name(i)
4709     DH%DIMTABLE(i)%length   = length(i)
4710     DH%DIMTABLE(i)%unlimited = unlimited(i)
4711  enddo
4712
4713  deallocate(length)
4714  deallocate(unlimited)
4715
4716  call h5tclose_f(dtint1_id,hdf5err)
4717  if(hdf5err.lt.0) then
4718     Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
4719     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4720     call wrf_debug ( WARN , msg)
4721     return
4722  endif
4723
4724  call h5tclose_f(dtstr_id,hdf5err)
4725  if(hdf5err.lt.0) then
4726     Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
4727     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4728     call wrf_debug ( WARN , msg)
4729     return
4730  endif
4731
4732  call h5tclose_f(dtint2_id,hdf5err)
4733  if(hdf5err.lt.0) then
4734     Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
4735     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4736     call wrf_debug ( WARN , msg)
4737     return
4738  endif
4739
4740  call h5tclose_f(dt1_id,hdf5err)
4741  if(hdf5err.lt.0) then
4742     Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
4743     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4744     call wrf_debug ( WARN , msg)
4745     return
4746  endif
4747
4748  call h5sclose_f(dataspace_id,hdf5err)
4749  if(hdf5err.lt.0) then
4750     Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
4751     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4752     call wrf_debug ( WARN , msg)
4753     return
4754  endif
4755
4756  call h5dclose_f(dset_id,hdf5err)
4757  if(hdf5err.lt.0) then
4758     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_CLOSE
4759     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4760     call wrf_debug ( WARN , msg)
4761     return
4762  endif
4763
4764  Status = WRF_NO_ERR
4765  return
4766end subroutine retrieve_table
4767
4768! store(write) the dimensional table into the HDF5 file
4769subroutine store_table(DataHandle,table_length,Status)
4770
4771  use wrf_phdf5_data
4772  use ext_phdf5_support_routines
4773  use hdf5
4774  implicit none
4775  include 'wrf_status_codes.h'   
4776
4777  integer ,intent(in)                            :: DataHandle
4778  integer, intent(in)                            :: table_length
4779  integer, intent(out)                           :: Status
4780
4781  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer             :: DH
4782
4783  integer(hid_t)                                 :: group_id
4784  integer(hid_t)                                 :: dset_id
4785  integer(hid_t)                                 :: dtype_id
4786  integer(hid_t)                                 :: dtstr_id
4787  integer(hid_t)                                 :: dtstrm_id
4788  integer(hid_t)                                 :: dtint1_id
4789  integer(hid_t)                                 :: dtint2_id
4790  integer(hid_t)                                 :: plist_id
4791  integer(size_t)                                :: type_size
4792  integer(size_t)                                :: type_sizes
4793  integer(size_t)                                :: type_sizei
4794  integer(size_t)                                :: offset
4795  character*256      ,dimension(MaxTabDims)       :: dim_name
4796  integer           ,dimension(:),allocatable    :: length
4797  integer           ,dimension(:),allocatable    :: unlimited
4798  integer(hid_t)                                 :: dspace_id
4799  integer(hsize_t)  ,dimension(1)                :: table_dims
4800  integer                                        :: table_rank
4801  integer(hsize_t) ,dimension(7)                 :: data_dims
4802  integer                                        :: i,j
4803  integer                                        :: hdf5err
4804
4805  data_dims(1) = table_length
4806  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
4807  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4808     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__, &
4809          ', line', __LINE__
4810     call wrf_debug ( WARN , msg)
4811     return
4812  endif
4813
4814  call create_h5filetype(dtype_id,Status)
4815  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
4816     return
4817  endif
4818
4819  ! obtain group id
4820  group_id = DH%DimGroupID
4821
4822  ! create data space
4823  table_rank    = 1
4824  table_dims(1) = table_length
4825
4826  call h5screate_simple_f(table_rank,table_dims,dspace_id,hdf5err)
4827  if(hdf5err.lt.0) then
4828     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
4829     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4830     call wrf_debug ( WARN , msg)
4831     return
4832  endif
4833
4834  ! obtain the data 
4835  allocate(length(table_length))
4836  allocate(unlimited(table_length))
4837
4838  do i =1, table_length
4839     length(i)    = DH%DIMTABLE(i)%length
4840     unlimited(i) = DH%DIMTABLE(i)%unlimited
4841  enddo
4842
4843  do i=1,table_length
4844     do j=1,256
4845        dim_name(i)(j:j)=DH%DIMTABLE(i)%dim_name(j:j)
4846     enddo
4847  enddo
4848
4849  ! under dimensional group
4850  call h5dcreate_f(group_id,"h5dim_table",dtype_id,dspace_id,&
4851       dset_id,hdf5err)
4852  if(hdf5err.lt.0) then
4853     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_CREATE
4854     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4855     call wrf_debug ( WARN , msg)
4856     deallocate(length)
4857     deallocate(unlimited)
4858     return
4859  endif
4860
4861  ! create memory types
4862  call h5tget_size_f(H5T_NATIVE_INTEGER,type_sizei,hdf5err)
4863  if(hdf5err.lt.0) then
4864     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4865     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4866     call wrf_debug ( WARN , msg)
4867     deallocate(length)
4868     deallocate(unlimited)
4869     return
4870  endif
4871
4872  ! FOR string, it needs extra handling
4873  call h5tcopy_f(H5T_NATIVE_CHARACTER,dtstr_id,hdf5err)
4874  if(hdf5err.lt.0) then
4875     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4876     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4877     call wrf_debug ( WARN , msg)
4878     deallocate(length)
4879     deallocate(unlimited)
4880     return
4881  endif
4882
4883  type_size = 256
4884
4885     call h5tset_size_f(dtstr_id, type_size,hdf5err)
4886     if(hdf5err.lt.0) then
4887        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4888        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4889        call wrf_debug ( WARN , msg)
4890        deallocate(length)
4891        deallocate(unlimited)
4892        return
4893     endif
4894
4895     call h5tget_size_f(dtstr_id, type_size,hdf5err)
4896     if(hdf5err.lt.0) then
4897        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4898        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4899        call wrf_debug ( WARN , msg)
4900        deallocate(length)
4901        deallocate(unlimited)
4902        return
4903     endif
4904
4905     call h5tcreate_f(H5T_COMPOUND_F,type_size,dtstrm_id,hdf5err)
4906     if(hdf5err.lt.0) then
4907        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4908        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4909        call wrf_debug ( WARN , msg)
4910        deallocate(length)
4911        deallocate(unlimited)
4912        return
4913     endif
4914
4915     offset = 0
4916     call h5tinsert_f(dtstrm_id,"dim_name",offset,dtstr_id,hdf5err)
4917     if(hdf5err.lt.0) then
4918        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4919        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4920        call wrf_debug ( WARN , msg)
4921        deallocate(length)
4922        deallocate(unlimited)
4923        return
4924     endif
4925
4926     call h5tcreate_f(H5T_COMPOUND_F,type_sizei,dtint1_id,hdf5err)
4927     if(hdf5err.lt.0) then
4928        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4929        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4930        call wrf_debug ( WARN , msg)
4931        deallocate(length)
4932        deallocate(unlimited)
4933        return
4934     endif
4935
4936     offset = 0
4937     call h5tinsert_f(dtint1_id,"dim_length",offset,H5T_NATIVE_INTEGER,&
4938          hdf5err)
4939     if(hdf5err.lt.0) then
4940        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4941        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4942        call wrf_debug ( WARN , msg)
4943        deallocate(length)
4944        deallocate(unlimited)
4945        return
4946     endif
4947
4948     call h5tcreate_f(H5T_COMPOUND_F,type_sizei,dtint2_id,hdf5err)
4949     if(hdf5err.lt.0) then
4950        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4951        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4952        call wrf_debug ( WARN , msg)
4953        deallocate(length)
4954        deallocate(unlimited)
4955        return
4956     endif
4957
4958     offset = 0
4959     call h5tinsert_f(dtint2_id,"dim_unlimited",offset,H5T_NATIVE_INTEGER,&
4960          hdf5err)
4961     if(hdf5err.lt.0) then
4962        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATATYPE
4963        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4964        call wrf_debug ( WARN , msg)
4965        deallocate(length)
4966        deallocate(unlimited)
4967        return
4968     endif
4969
4970     ! write data by fields in the datatype,but first create a property list
4971
4972     call h5pcreate_f(H5P_DATASET_XFER_F,plist_id, hdf5err)
4973     if(hdf5err.lt.0) then
4974        Status =  WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
4975        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4976        call wrf_debug ( WARN , msg)
4977        deallocate(length)
4978        deallocate(unlimited)
4979        return
4980     endif
4981
4982     call h5pset_preserve_f(plist_id,.TRUE.,hdf5err)
4983     if(hdf5err.lt.0) then
4984        Status =  WRF_HDF5_ERR_PROPERTY_LIST
4985        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4986        call wrf_debug ( WARN , msg)
4987        deallocate(length)
4988        deallocate(unlimited)
4989        return
4990     endif
4991
4992     call h5dwrite_f(dset_id,dtstrm_id,dim_name,data_dims,hdf5err,&
4993          xfer_prp = plist_id)
4994     if(hdf5err.lt.0) then
4995        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_WRITE
4996        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
4997        call wrf_debug ( WARN , msg)
4998        deallocate(length)
4999        deallocate(unlimited)
5000        return
5001     endif
5002
5003     call h5dwrite_f(dset_id,dtint1_id,length,data_dims,hdf5err,&
5004          xfer_prp = plist_id)
5005     if(hdf5err.lt.0) then
5006        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_WRITE
5007        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5008        call wrf_debug ( WARN , msg)
5009        deallocate(length)
5010        deallocate(unlimited)
5011        return
5012     endif
5013
5014     call h5dwrite_f(dset_id,dtint2_id,unlimited,data_dims,hdf5err,&
5015          xfer_prp = plist_id)
5016     if(hdf5err.lt.0) then
5017        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_WRITE
5018        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5019        call wrf_debug ( WARN , msg)
5020        deallocate(length)
5021        deallocate(unlimited)
5022        return
5023     endif
5024
5025     deallocate(length)
5026     deallocate(unlimited)
5027
5028     ! release resources
5029
5030     call h5tclose_f(dtstr_id,hdf5err)
5031     if(hdf5err.lt.0) then
5032        Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
5033        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5034        call wrf_debug ( WARN , msg)
5035        return
5036     endif
5037
5038     call h5tclose_f(dtstrm_id,hdf5err)
5039     if(hdf5err.lt.0) then
5040        Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
5041        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5042        call wrf_debug ( WARN , msg)
5043        return
5044     endif
5045
5046     call h5tclose_f(dtint1_id,hdf5err)
5047     if(hdf5err.lt.0) then
5048        Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
5049        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5050        call wrf_debug ( WARN , msg)
5051        return
5052     endif
5053
5054     call h5tclose_f(dtint2_id,hdf5err)
5055     if(hdf5err.lt.0) then
5056        Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
5057        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5058        call wrf_debug ( WARN , msg)
5059        return
5060     endif
5061
5062     call h5tclose_f(dtype_id,hdf5err)
5063     if(hdf5err.lt.0) then
5064        Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
5065        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5066        call wrf_debug ( WARN , msg)
5067        return
5068     endif
5069
5070     call h5pclose_f(plist_id,hdf5err)
5071     if(hdf5err.lt.0) then
5072        Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
5073        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5074        call wrf_debug ( WARN , msg)
5075        return
5076     endif
5077
5078     call h5dclose_f(dset_id,hdf5err)
5079     if(hdf5err.lt.0) then
5080        Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASET_CLOSE
5081        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5082        call wrf_debug ( WARN , msg)
5083        return
5084     endif
5085
5086     call h5sclose_f(dspace_id,hdf5err)
5087     if(hdf5err.lt.0) then
5088        Status =  WRF_HDF5_ERR_CLOSE_GENERAL
5089        write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5090        call wrf_debug ( WARN , msg)
5091        return
5092     endif
5093
5094     return
5095end subroutine store_table
5096
5097
5098subroutine free_memory(DataHandle,Status)
5099
5100  use wrf_phdf5_data
5101  use ext_phdf5_support_routines
5102  use HDF5
5103  implicit none
5104  include 'wrf_status_codes.h'
5105  include 'mpif.h'
5106
5107  integer              ,intent(in)       :: DataHandle
5108  integer              ,intent(out)      :: Status
5109  integer                                :: hdf5err
5110  type(wrf_phdf5_data_handle),pointer    :: DH
5111  integer                                :: i
5112  integer                                :: stat
5113  real*8                                 :: timeaw,timebw
5114
5115
5116  call GetDH(DataHandle,DH,Status)
5117  if(Status /= WRF_NO_ERR) then
5118     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5119     call wrf_debug ( WARN , msg)
5120     return
5121  endif
5122
5123  if(DH%Free) then
5124     Status = WRF_HDF5_ERR_OTHERS
5125     write(msg,*) '',__FILE__,', line', __LINE__
5126     call wrf_debug ( WARN , msg)
5127     return
5128  endif
5129
5130  deallocate(DH%Times, STAT=stat)
5131  if(stat/= 0) then
5132     Status = WRF_HDF5_ERR_DEALLOCATION
5133     write(msg,*) 'Fatal DEALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
5134     call wrf_debug ( FATAL , msg)
5135     return
5136  endif
5137  deallocate(DH%DimLengths, STAT=stat)
5138  if(stat/= 0) then
5139     Status = WRF_HDF5_ERR_DEALLOCATION
5140     write(msg,*) 'Fatal DEALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
5141     call wrf_debug ( FATAL , msg)
5142     return
5143  endif
5144  deallocate(DH%DimIDs, STAT=stat)
5145  if(stat/= 0) then
5146     Status = WRF_HDF5_ERR_DEALLOCATION
5147     write(msg,*) 'Fatal DEALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
5148     call wrf_debug ( FATAL , msg)
5149     return
5150  endif
5151  deallocate(DH%DimNames, STAT=stat)
5152  if(stat/= 0) then
5153     Status = WRF_HDF5_ERR_DEALLOCATION
5154     write(msg,*) 'Fatal DEALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
5155     call wrf_debug ( FATAL , msg)
5156     return
5157  endif
5158  deallocate(DH%DIMTABLE, STAT=stat)
5159  if(stat/= 0) then
5160     Status = WRF_HDF5_ERR_DEALLOCATION
5161     write(msg,*) 'Fatal DEALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
5162     call wrf_debug ( FATAL , msg)
5163     return
5164  endif
5165  deallocate(DH%MDDsetIDs, STAT=stat)
5166  if(stat/= 0) then
5167     Status = WRF_HDF5_ERR_DEALLOCATION
5168     write(msg,*) 'Fatal DEALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
5169     call wrf_debug ( FATAL , msg)
5170     return
5171  endif
5172  deallocate(DH%MDVarDimLens, STAT=stat)
5173  if(stat/= 0) then
5174     Status = WRF_HDF5_ERR_DEALLOCATION
5175     write(msg,*) 'Fatal DEALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
5176     call wrf_debug ( FATAL , msg)
5177     return
5178  endif
5179  deallocate(DH%MDVarNames, STAT=stat)
5180  if(stat/= 0) then
5181     Status = WRF_HDF5_ERR_DEALLOCATION
5182     write(msg,*) 'Fatal DEALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
5183     call wrf_debug ( FATAL , msg)
5184     return
5185  endif
5186  deallocate(DH%DsetIDs, STAT=stat)
5187  if(stat/= 0) then
5188     Status = WRF_HDF5_ERR_DEALLOCATION
5189     write(msg,*) 'Fatal DEALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
5190     call wrf_debug ( FATAL , msg)
5191     return
5192  endif
5193  deallocate(DH%VarDimLens, STAT=stat)
5194  if(stat/= 0) then
5195     Status = WRF_HDF5_ERR_DEALLOCATION
5196     write(msg,*) 'Fatal DEALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
5197     call wrf_debug ( FATAL , msg)
5198     return
5199  endif
5200  deallocate(DH%VarNames, STAT=stat)
5201  if(stat/= 0) then
5202     Status = WRF_HDF5_ERR_DEALLOCATION
5203     write(msg,*) 'Fatal DEALLOCATION ERROR in ',__FILE__,', line', __LINE__
5204     call wrf_debug ( FATAL , msg)
5205     return
5206  endif
5207  return
5208end subroutine free_memory
5209
5210subroutine write_hdf5_attributes(DataHandle,MemoryOrder,WrfDType,DimRank,&
5211     NDim,dset_id,Status)
5212
5213  use wrf_phdf5_data
5214  use ext_phdf5_support_routines
5215  use HDF5
5216  implicit none
5217  include 'mpif.h'
5218  include 'wrf_status_codes.h'
5219
5220
5221  integer                     ,intent(in)     :: DataHandle
5222  character*(*)               ,intent(in)     :: MemoryOrder   
5223  integer                     ,intent(in)     :: WrfDType
5224  integer,dimension(*)        ,intent(in)     :: DimRank
5225
5226  integer                     ,intent(in)     :: NDim
5227
5228  integer(hid_t)              ,intent(in)     :: dset_id
5229  integer                     ,intent(out)    :: Status
5230
5231  character (3)                               :: Mem0
5232  character (3)                               :: UCMem0
5233  type(wrf_phdf5_data_handle) ,pointer        :: DH
5234
5235  ! attribute defination
5236  integer(hid_t)                              :: dimaspace_id  ! DimRank dataspace id
5237  integer(hid_t)                              :: dimattr_id    ! DimRank attribute id
5238  integer(hsize_t) ,dimension(1)              :: dim_space
5239
5240  integer(hid_t)                              :: h5_atypeid    ! for fieldtype,memorder attribute
5241  integer(hid_t)                              :: h5_aspaceid   ! for fieldtype,memorder 
5242  integer(hid_t)                              :: h5_attrid     ! for fieldtype,memorder
5243  integer(hsize_t), dimension(7)              :: adata_dims
5244  integer                                     :: routine_atype
5245  integer,          dimension(:),allocatable  :: dimrank_data
5246  integer                                     :: hdf5err
5247  integer                                     :: j
5248
5249  !  For time function
5250  real*8                                     :: timebw
5251  real*8                                     :: timeaw
5252  integer                                    :: total_ele
5253
5254  !
5255  ! write dimensional rank attribute. This is the temporary fix for dim. scale
5256  ! the first dimension is always time
5257  allocate(dimrank_data(NDim+1))
5258  do j =1, NDim+1
5259     dimrank_data(j)  = DimRank(j)
5260  enddo
5261
5262  dim_space(1)  = NDim+1
5263  adata_dims(1) = NDim+1
5264  call h5screate_simple_f(1,dim_space,dimaspace_id,hdf5err)
5265  if(hdf5err.lt.0) then
5266     Status =  WRF_HDF5_ERR_DATASPACE
5267     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5268     call wrf_debug ( WARN , msg)
5269     deallocate(dimrank_data)
5270     return
5271  endif
5272
5273  call h5acreate_f(dset_id,'H5_DimRank',H5T_NATIVE_INTEGER,dimaspace_id, &
5274       dimattr_id,hdf5err)
5275  if(hdf5err.lt.0) then
5276     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
5277     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5278     call wrf_debug ( WARN , msg)
5279     deallocate(dimrank_data)
5280     return
5281  endif
5282
5283  call h5awrite_f(dimattr_id,H5T_NATIVE_INTEGER,dimrank_data,adata_dims,hdf5err)
5284  if(hdf5err.lt.0) then
5285     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
5286     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5287     call wrf_debug ( WARN , msg)
5288     deallocate(dimrank_data)
5289     return
5290  endif
5291  deallocate(dimrank_data)
5292
5293  ! close space and attribute id
5294  call clean_phdf5_attrids(H5T_NATIVE_INTEGER,dimaspace_id,dimattr_id,0,Status)
5295  if(Status.ne.WRF_NO_ERR) then
5296     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5297     call wrf_debug ( WARN , msg)
5298     return
5299  endif
5300  ! Write memory order and FieldType attribute, both MemoryOrder and FieldType are 1 element
5301  adata_dims(1) = 1
5302
5303  ! output memoryorder attribute
5304  call reorder(MemoryOrder,Mem0)
5305  call uppercase(Mem0,UCMem0)
5306
5307  routine_atype = WRF_CHARACTER
5308
5309  ! The size of memoryorder string is always MemOrdLen
5310  call create_phdf5_adtypeid(h5_atypeid,routine_atype,MemOrdLen,Status)
5311  if(Status.ne.WRF_NO_ERR) then
5312     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5313     call wrf_debug ( WARN , msg)
5314     return
5315  endif
5316
5317  ! Count for string attribute is always 1
5318  call create_phdf5_adspaceid(1,1,h5_aspaceid,Status)
5319  if(Status.ne.WRF_NO_ERR) then
5320     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5321     call wrf_debug ( WARN , msg)
5322     return
5323  endif
5324  call h5acreate_f(dset_id,'MemoryOrder',h5_atypeid,h5_aspaceid, &
5325       h5_attrid, hdf5err)
5326  if(hdf5err.lt.0) then
5327     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
5328     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5329     call wrf_debug ( WARN , msg)
5330     return
5331  endif
5332
5333  call h5awrite_f(h5_attrid,h5_atypeid,UCMem0,adata_dims,hdf5err)
5334  if(hdf5err.lt.0) then
5335     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
5336     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5337     call wrf_debug ( WARN , msg)
5338     return
5339  endif
5340  call clean_phdf5_attrids(h5_atypeid,h5_aspaceid,h5_attrid,1,Status)
5341  if(Status.ne.WRF_NO_ERR) then
5342     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5343     call wrf_debug ( WARN , msg)
5344     return
5345  endif
5346
5347  ! output fieldtype attribute
5348  call create_phdf5_adspaceid(1,1,h5_aspaceid,Status)
5349  if(Status.ne.WRF_NO_ERR) then
5350     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5351     call wrf_debug ( WARN , msg)
5352     return
5353  endif
5354
5355  call h5acreate_f(dset_id,'FieldType',H5T_NATIVE_INTEGER,h5_aspaceid, &
5356       h5_attrid, hdf5err)
5357  if(hdf5err.lt.0) then
5358     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_CREATE
5359     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5360     call wrf_debug ( WARN , msg)
5361     return
5362  endif
5363
5364  call h5awrite_f(h5_attrid,H5T_NATIVE_INTEGER,WrfDType,adata_dims,hdf5err)
5365  if(hdf5err.lt.0) then
5366     Status =  WRF_HDF5_ERR_ATTRIBUTE_WRITE
5367     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5368     call wrf_debug ( WARN , msg)
5369     return
5370  endif
5371  call clean_phdf5_attrids(H5T_NATIVE_INTEGER,h5_aspaceid,h5_attrid,0,Status)
5372  if(Status.ne.WRF_NO_ERR) then
5373     write(msg,*) 'Warning Status = ',Status,' in ',__FILE__,', line', __LINE__
5374     call wrf_debug ( WARN , msg)
5375     return
5376  endif
5377
5378end subroutine write_hdf5_attributes
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.