Suivi du projet amélioration de la gestion des traceurs

Voici les caractéristiques du nouveau "traceur.def", qui répond aux caractéristiques fixées au cours discussion du bocal du 3 octobre:

• fichier texte de même nom lu par un parseur dédié
• possibilité d'ajouter des commentaires (ici: toutes les chaînes précédées par le caractère "#" sont des commentaires).
• subdivision en sections, signalées par le caractère "&" en première position (inspiré des namelists fortran).
  1. "version", donnant le numéro de version du fichier présent
  2. "default", donnant les paramètres par défaut sous la forme <clef>=<valeur>
  3. -... une section par composante. Le nombre de traceurs en entête est supprimé.
• dans chaque section "composante":
  • OBLIGATOIRE: nom du(des) traceur(s) (séparateur: "," si plusieurs traceurs). Premier élément de la ligne.
  • OPTIONNEL (la valeur correspondante de la section "default" est adoptée si elle est absente):
  1. nom du(des) parent(s) (séparateur: "," si plusieurs parents, ce qui n'est possible que pour des traceurs de tagging)
  2. hadv et vadv (schéma d'advection horizontal et vertical)
  3. phases: "g"as, "l"iquid, "s"olid
  4. type de traceur (pour l'instant: "tracer" ou "tag" uniquement)

Ce format permet de compacter fortement les listes et d'éviter des erreurs. Il laisse la possibilité d'ajouter d'autres clefs par la suite (les coefficients de fractionnement notamment).

• on peut utiliser la clef "trac_type" de "run.def" pour lister les composantes qu'il faut lire et fusionner les sections. Exemple: trac_type=merge:repro,inca[[br]]

Par défaut, les listes sont fusionnées ("merge"): les traceurs de même noms sont fusionnés. Avec plutôt trac_type=cumulate:..., on choisit de les cumuler: le nom de section est ajouté en suffixe aux noms de traceurs identiques dans plusieurs sections.

Quelques décisions complémentaires:

• utilisation de noms plus explicite pour les isotopes: l'atome de masse non nominale est précédé par sa masse atomique entre crochets. Ainsi:

    O17 => H2[17]O
    O18 => H2[18]O
    DHO => H[2]HO
    THO => H[3]HO
  

• utilisation des suffixes "-g", "-l", "-s" pour les phases "g"aseuse, "l"iquide et "s"olide, plus généraux que "v" et "i" ("v"apour et "i"ce)

Le séparateur "-" permet d'éviter de possibles confusions entre une lettre désignant la phase et un nom d'élément (le "l" de Cl - chlore - par exemple)

• absence de chaînage des noms avec la liste complète des ancêtres, rendue possible par l'utilisation de noms plus explicites pour les traceurs (dont la hiérarchie est connue par ailleurs).
• possibilité de tagger à toute génération sans que le tagging ne concerne nécessairement une famille complète ou une génération complète.

En effet (remarque de Frédéric), sommer des traceurs géographiques de différentes régions ne donne pas nécessairement la même chose que le traceur de la somme des régions, car le transport n'est pas nécessairement linéaire.

• le tagging concerne par contre toutes les phases d'une espèce donnée.
• le mot-clef spécial "all" utilisé comme nom de parent d'un traceur de type "tag" permet de tagger tous les traceurs.

Exemple de liste (volontairement en désordre pour illustrer que le parseur s'en sort bien) au nouveau format:

&version=1.0
&default
# Note: currently, the 2 recognized types are "tracer" and "tag"
type_trac=lmdz parent=air hadv=10 vadv=10 phases=g type=tracer
&lmdz
blue,red                     parent=H[2]HO,H2O type=tag   # tagging tracer of gen 1&2 tracers
H2O                          phases=g   hadv=14 vadv=14   # water vapour
water,H2[18]O,H[2]HO,H[3]HO  parent=H2O                   # H2O childs
yellow                       parent=H[3]HO     type=tag   # tagging tracer for single isotope
H2O                          phases=ls                    # H2O in liquid and solid phases

Le parseur en donne la version décompactée qui suit (sorties textes effectives telles qu'elles apparaîtront dans LMDZ):

infotrac_init: Information stored in infotrac :
infotrac_init:   iq  |  tname            | ttext               |  iadv  |  niadv  |  ipar
infotrac_init: ---------------------------------------------------------------------------
infotrac_init:   1   |  H2O-g            | H2O-gVLH            |  14    |  1      |  0
infotrac_init:   2   |  H2O-l            | H2O-lVL1            |  10    |  2      |  0
infotrac_init:   3   |  H2O-s            | H2O-sVL1            |  10    |  3      |  0
infotrac_init:   4   |  H2O-g_blue       | H2O-g_blueVL1       |  10    |  4      |  1
infotrac_init:   5   |  H2O-l_blue       | H2O-l_blueVL1       |  10    |  5      |  2
infotrac_init:   6   |  H2O-s_blue       | H2O-s_blueVL1       |  10    |  6      |  3
infotrac_init:   7   |  H2O-g_red        | H2O-g_redVL1        |  10    |  7      |  1
infotrac_init:   8   |  H2O-l_red        | H2O-l_redVL1        |  10    |  8      |  2
infotrac_init:   9   |  H2O-s_red        | H2O-s_redVL1        |  10    |  9      |  3
infotrac_init:   10  |  water-g          | water-gVL1          |  10    |  10     |  1
infotrac_init:   11  |  water-l          | water-lVL1          |  10    |  11     |  2
infotrac_init:   12  |  water-s          | water-sVL1          |  10    |  12     |  3
infotrac_init:   13  |  H2[18]O-g        | H2[18]O-gVL1        |  10    |  13     |  1
infotrac_init:   14  |  H2[18]O-l        | H2[18]O-lVL1        |  10    |  14     |  2
infotrac_init:   15  |  H2[18]O-s        | H2[18]O-sVL1        |  10    |  15     |  3
infotrac_init:   16  |  H[2]HO-g         | H[2]HO-gVL1         |  10    |  16     |  1
infotrac_init:   17  |  H[2]HO-l         | H[2]HO-lVL1         |  10    |  17     |  2
infotrac_init:   18  |  H[2]HO-s         | H[2]HO-sVL1         |  10    |  18     |  3
infotrac_init:   19  |  H[3]HO-g         | H[3]HO-gVL1         |  10    |  19     |  1
infotrac_init:   20  |  H[3]HO-l         | H[3]HO-lVL1         |  10    |  20     |  2
infotrac_init:   21  |  H[3]HO-s         | H[3]HO-sVL1         |  10    |  21     |  3
infotrac_init:   22  |  H[2]HO-g_blue    | H[2]HO-g_blueVL1    |  10    |  22     |  16
infotrac_init:   23  |  H[2]HO-l_blue    | H[2]HO-l_blueVL1    |  10    |  23     |  17
infotrac_init:   24  |  H[2]HO-s_blue    | H[2]HO-s_blueVL1    |  10    |  24     |  18
infotrac_init:   25  |  H[2]HO-g_red     | H[2]HO-g_redVL1     |  10    |  25     |  16
infotrac_init:   26  |  H[2]HO-l_red     | H[2]HO-l_redVL1     |  10    |  26     |  17
infotrac_init:   27  |  H[2]HO-s_red     | H[2]HO-s_redVL1     |  10    |  27     |  18
infotrac_init:   28  |  H[3]HO-g_yellow  | H[3]HO-g_yellowVL1  |  10    |  28     |  19
infotrac_init:   29  |  H[3]HO-l_yellow  | H[3]HO-l_yellowVL1  |  10    |  29     |  20
infotrac_init:   30  |  H[3]HO-s_yellow  | H[3]HO-s_yellowVL1  |  10    |  30     |  21
infotrac_init: fin

On peut ajouter d'autres clefs, notamment les ratios de fractionnement.

A DISCUTER ENCORE: Savoir si changer les noms de l'eau dans ses trois phases: H2Ov H2Ol H2Oi -> H2O-g, H2O-l H2O-s n'implique pas trop de contraintes du côté des chaînes de post-traitement.

A AJOUTER DANS LE PARSEUR:

• Gestion de base de donnée, afin de pouvoir, indépendamment du module infotrac, accéder à n'importe quelle clef, à la manière de la routine "getin" d'IOIPSL.
• Gestion des listes de traceurs non fusionnées, mais cumulées (cf. ci-dessus).

A NE PAS OUBLIER: Pour mémoire, il y a aussi le ticket #32 (sur la conservation des traceurs)