Index: BOL/LMDZ_Setup_amaury/lmdz_env.sh =================================================================== --- BOL/LMDZ_Setup_amaury/lmdz_env.sh (revision 5028) +++ BOL/LMDZ_Setup_amaury/lmdz_env.sh (revision 5030) @@ -112,6 +112,6 @@ LMDZD="$root_dir/LMDZD" # Where the sources will be downloaded and compiled LMDZ_INIT="$root_dir/LMDZ_Init" # Where to store shared files used for initialisation - NB_MPI_MAX=33 # Max number of MPI cores (only for running simulations) - NB_OMP_MAX=100 # Max number of OMP threads (only for running simulations) + NB_MPI_MAX=2 # Max number of MPI cores (only for running simulations) + NB_OMP_MAX=2 # Max number of OMP threads (only for running simulations) NB_CORE_PER_NODE_MAX=0 # Max number of cores per node (real cores, not hyperthreading - only for running simulations, cluster-specific) N_HYPERTHREADING=1 # How many hyperthreading threads per physical core Index: BOL/LMDZ_Setup_amaury/main.sh =================================================================== --- BOL/LMDZ_Setup_amaury/main.sh (revision 5028) +++ BOL/LMDZ_Setup_amaury/main.sh (revision 5030) @@ -26,5 +26,5 @@ # Version of the tar file on https://lmdz.lmd.jussieu.fr/pub/src # Last "testing" version, thoroughly checked by the LMDZ team : contains LMDZ rev 4729 (2023-10-22) -version="20240308.trunk" #!! DON'T CHANGE IT WITHOUT CHECKING WITH LMDZ TEAM !! +version="20240508.CM7" #!! DON'T CHANGE IT WITHOUT CHECKING WITH LMDZ TEAM !! svn="" #!! DON'T CHANGE IT WITHOUT CHECKING WITH LMDZ TEAM !! # CONTACT LMDZ Team : @@ -34,5 +34,4 @@ # Grid number of points IMxJMxLM resol="144x142x79" -resol="32x32x39" # TODO TEMP ## Using XIOS for IOs: "-xios" (enabled) / "" (disabled) Index: BOL/LMDZ_Setup_amaury/setup.sh =================================================================== --- BOL/LMDZ_Setup_amaury/setup.sh (revision 5028) +++ BOL/LMDZ_Setup_amaury/setup.sh (revision 5030) @@ -165,6 +165,5 @@ # NOTES : # omp=8 by default (for Jean-Zay must be a divisor of 40 procs/node), but we need - # omp=1 for SPLA (only MPI parallelisation) - # omp=2 for veget=CMIP6 beacause of a bug in ORCHIDEE/src_xml/xios_orchidee.f90 + # omp=1 for SPLA (only MPI parallelisation) ###################################################################### jm=$(echo "$resol" | cut -dx -f2) @@ -172,9 +171,9 @@ omp=8 if [[ $aerosols = "spla" ]]; then omp=1; fi - if [[ $veget = "CMIP6" && $xios = "y" ]]; then omp=2; fi if [[ $mpi -gt $NB_MPI_MAX ]]; then mpi=$NB_MPI_MAX; fi if [[ $omp -gt $NB_OMP_MAX ]]; then omp=$NB_OMP_MAX; fi # Compute how many mpi per node (required e.g. for Adastra) + mpi_per_node=0 if [[ $NB_CORE_PER_NODE_MAX -gt 0 ]]; then local N_omp_mt=1 @@ -273,15 +272,14 @@ ###################################################################### - # Choix du fichier traceur.def coherent avec l'option "aerosols" + # Choix du fichier tracer.def coherent avec l'option "aerosols" # NOTE : Le nouveau tracer.def_nospla par defaut n'inclut pas Rn-Pb; # si on les veut, il faut utiliser ci-dessous; a la place, tracer_RN_PB.def #--------------------------------------------------------------------- - # NB: Si on change de traceur.def (entre spla et nospla), il faut refaire l'etape "initialisation" (ce0l)? - # Normalement les traceurs absents de start* files sont initialises=0 dans le code; verifier pour spla ! + # NB : Les traceurs absents de start* files sont initialises=0 dans le code if [[ $aerosols = "spla" ]]; then - # ancien traceur pour l instant + # nouveau tracer.def (remplace "traceur.def") cp DEF/tracer.def_spla DEF/tracer.def elif [[ $phylmd = "lmdiso" ]]; then - # nouveau traceur , déjà copié si 'y' + # déjà copié si 'y' cp DEF/tracer.def_nospla DEF/tracer.def fi @@ -440,5 +438,5 @@ -e "s/time=.*.$/time=$cput/" \ -e "s/ntasks=.*.$/ntasks=$mpi/" \ - -e "s/ntasks=.*.$/ntasks-per-node=$mpi_per_node/" \ + -e "s/ntasks-per-node=.*.$/ntasks-per-node=$mpi_per_node/" \ -e "s/cpus-per-task=.*.$/cpus-per-task=$omp/" \ -e "s/nthreads=.*./nthreads=$omp/" \ Index: BOL/LMDZ_Setup_amaury/test_ERAfiles_JeanZay.sh =================================================================== --- BOL/LMDZ_Setup_amaury/test_ERAfiles_JeanZay.sh (revision 5028) +++ (revision ) @@ -1,54 +1,0 @@ -# Script pour tester la presence de fichiers de guidage ERA* sur Jean-Zay -# 2021/04/15 -# A. Sima (adriana.sima@lmd.ipsl.fr) - - -##################################################################### -# A choisir par l'utilisateur : -##################################################################### - -# Guidage en vent(u&v) et/ou temperature, humidite -guide_uv=y -guide_t=y -guide_q=y - -an=2000 -mois=01 -# -# Choix des "rea"nalyses : ERA5, ERAI, OPERA -rea=ERA5 - - -##################################################################### -# Lien avec les fichiers netcdf contenant les d0 ECMWF -##################################################################### - echo -------- liens de telechargement a actualiser ---- - if [ "$rea" = "ERA5" ] ; then - if [ $an -ge 2022 ] ; then - ANA_DIR='/gpfsstore/rech/psl/rpsl376/ergon/ERA5/NETCDF/GLOBAL_025/hourly' - suf="ap1e5.GLOBAL_025" - else - ANA_DIR='/gpfsstore/rech/psl/rpsl376/ergon/ERA5/NETCDF/GLOBAL_025/4xdaily' - suf="aphe5.GLOBAL_025" - fi - elif [ "$rea" = "ERAI" ] ; then - #ANA_DIR='http://prodn.idris.fr/thredds/dodsC/ipsl_private/rpsl376/ERAI/NETCDF/GLOBAL_1125/4xdaily' - ANA_DIR='/gpfsstore/rech/psl/rpsl376/ergon/ERAI/NETCDF/GLOBAL_1125/4xdaily' - #/gpfsstore/rech/psl/rpsl376/ergon/ERAI/NETCDF/GLOBAL_075/4xdaily/AN_PL/2006/u.200601.aphei.GLOBAL_075.nc - suf="aphei.GLOBAL_1125" - else #OPERA - #ANA_DIR='http://prodn.idris.fr/thredds/dodsC/ipsl_private/rpsl376/OPERA/NETCDF/4xdaily' - ANA_DIR='/gpfsstore/rech/psl/rpsl376/ergon/OPERA/NETCDF/4xdaily' - suf="aph.GLOBAL_1125" - fi - - - fileu="$ANA_DIR/AN_PL/$an/u.$an$mois.$suf.nc" - filev="$ANA_DIR/AN_PL/$an/v.$an$mois.$suf.nc" - filet="$ANA_DIR/AN_PL/$an/ta.$an$mois.$suf.nc" - fileq="$ANA_DIR/AN_PL/$an/r.$an$mois.$suf.nc" - -# verifier disponibilite des fichiers -if [ "$guide_uv" = "y" ] ; then ls $fileu ; ls $filev ; fi -if [ "$guide_t" = "y" ] ; then ls $filet ; fi -if [ "$guide_q" = "y" ] ; then ls $fileq ; fi