Index: LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/config_AMIP.def
===================================================================
--- LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/config_AMIP.def	(revision 3811)
+++ LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/config_AMIP.def	(revision 3812)
@@ -46,7 +46,7 @@
 #
 ### ok_ade=y/n   flag Aerosol direct effect
-ok_ade= n
+ok_ade= y
 ### ok_aie=y/n   flag Aerosol indirect effect
-ok_aie= n
+ok_aie= y
 ### aer_type =   Aerosol variation type : actuel / preind / scenario / annuel
 aer_type=annuel
@@ -55,7 +55,7 @@
 ###  flag_aerosol = type of coupled aerosol, if aerosol offline 
 ###  0 => no aerosol, 1 => sulfate only, 2 => bc only, 3 => pom only, 4 => seasalt only, 5 => dust only, 6 => all aerosol
-flag_aerosol= 0
+flag_aerosol= 6
 ### ok_cdnc=y/n   Cloud droplet number concentration
-ok_cdnc= n
+ok_cdnc= y
 # ok_alw=y flag pour activer l effet LW des poussieres
 ok_alw=y
@@ -71,5 +71,5 @@
 # 
 # Aerosols stratospheriques utilises par defaut 
-flag_aerosol_strat=0
+flag_aerosol_strat=2
 # COSP
-ok_cosp= n
+ok_cosp= y
Index: LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/context_lmdz.xml
===================================================================
--- LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/context_lmdz.xml	(revision 3811)
+++ LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/context_lmdz.xml	(revision 3812)
@@ -10,11 +10,21 @@
               Each file contains the list of variables and their output levels -->
 
-  <file_definition src="./histday_ave_2d.xml"/>
-  <file_definition src="./histday_ave_3d.xml"/>
-  <file_definition src="./histday_max.xml"/>
-  <file_definition src="./histday_min.xml"/>
-  <file_definition src="./histhf_ave.xml"/>
-  <file_definition src="./histhf_ins.xml"/>
-  <file_definition src="./histmth.xml"/>
+  <file_definition src="./file_def_histday_lmdz.xml"/>
+  <file_definition src="./file_def_histhf_lmdz.xml"/>
+  <file_definition src="./file_def_histins_lmdz.xml"/>
+  <file_definition src="./file_def_histLES_lmdz.xml"/>
+  <file_definition src="./file_def_histmth_lmdz.xml"/>
+  <file_definition src="./file_def_histstn_lmdz.xml"/>
+  <file_definition src="./file_def_histmthNMC_lmdz.xml"/>
+  <file_definition src="./file_def_histdayNMC_lmdz.xml"/>
+  <file_definition src="./file_def_histhfNMC_lmdz.xml"/>
+  <file_definition src="./file_def_histmthCOSP_lmdz.xml"/>
+  <file_definition src="./file_def_histdayCOSP_lmdz.xml"/>
+  <file_definition src="./file_def_histhfCOSP_lmdz.xml"/>
+  <!-- <file_definition src="./file_def_histmthCOSPv2_lmdz.xml"/> -->
+  <!-- <file_definition src="./file_def_histdayCOSPv2_lmdz.xml"/> -->
+  <!-- <file_definition src="./file_def_histhfCOSPv2_lmdz.xml"/> -->
+  <file_definition src="./file_def_histstrataer_lmdz.xml"/>
+  <file_definition src="./file_def_histdaystrataer_lmdz.xml"/>
 
   <!-- Define domains and groups of domains -->
Index: LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/field_def_lmdz.xml
===================================================================
--- LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/field_def_lmdz.xml	(revision 3811)
+++ LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/field_def_lmdz.xml	(revision 3812)
@@ -2,4 +2,10 @@
 <field_definition level="1" prec="4" operation="average" freq_op="1ts" enabled=".true." default_value="9.96921e+36">
     
+<!--    <field_group id="fields_1D" grid_ref="vertical">  -->
+<!--        <field id="Ap"   long_name="Hybrid coordinate: pressure part"    unit="Pa" />  -->
+<!--        <field id="Bp"   long_name="Hybrid coordinate: sigma part"    unit="-" />  -->
+<!--        <field id="Alt"  long_name="Pseudo-altitude (for an 8km scale height)"    unit="km" />  -->
+<!--    </field_group>  -->
+
     <field_group id="remap_expr" level="_reset_" prec="_reset_" operation="_reset_" freq_op="_reset_" enabled="_reset_" default_value="_reset_">
       <field_group id="remap_1ts" />
@@ -874,4 +880,7 @@
     </field_group>
 
+<!-- ----------------------------COSP------------------------ -->
+    <field_group src="./field_def_cosp1.xml"/>
+    <!-- <field_group src="./field_def_cospv2.xml"/> -->
 
 
Index: LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/file_def_histmth_lmdz.xml
===================================================================
--- LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/file_def_histmth_lmdz.xml	(revision 3811)
+++ LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/file_def_histmth_lmdz.xml	(revision 3812)
@@ -2,5 +2,5 @@
 <file_definition>
         <file_group id="defile">
-        <file id="histmth" name="histmth" output_freq="1mo" output_level="1"  enabled=".true." compression_level="0">
+        <file id="histmth" name="histmth" output_freq="1mo" output_level="_AUTO_"  enabled="_AUTO_" compression_level="2">
 
             <!-- VARS 1D -->
Index: LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/gcm.def
===================================================================
--- LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/gcm.def	(revision 3811)
+++ LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/gcm.def	(revision 3812)
@@ -1,5 +1,5 @@
 ## $Id: gcm.def 1403 2010-07-01 09:02:53Z fairhead $
 ## nombre de pas par jour (multiple de iperiod) ( ici pour  dt = 1 min )      
-day_step=240
+day_step=480
 ## periode pour le pas Matsuno (en pas)
 iperiod=5
@@ -15,11 +15,10 @@
 niterh=2
 ## temps de dissipation des plus petites long.d ondes pour u,v (gradiv)  
-tetagdiv=3600.
+tetagdiv=5400.
 ## temps de dissipation des plus petites long.d ondes pour u,v(nxgradrot)
-tetagrot=21600.
+tetagrot=5400.
 ## temps de dissipation des plus petites long.d ondes pour  h ( divgrad) 
-tetatemp=10800.
+tetatemp=5400.
 ## coefficient pour gamdissip                                            
-ngroup = 4
 coefdis=0.
 ## choix du shema d'integration temporelle (Matsuno:y ou Matsuno-leapfrog:n) 
@@ -35,5 +34,11 @@
 read_start=y
 ## periode de la physique (en pas dynamiques, n'a de sens que si iflag_phys=1)                                       
-iphysiq=5
+iphysiq=10
+##  Avec ou sans strato
+ok_strato=y 
+#  Couche eponge dans les couches de pression plus faible que 100 fois la pression de la derniere couche
+iflag_top_bound=2
+#  Coefficient pour la couche eponge (valeur derniere couche)
+tau_top_bound=5.e-5
 ## longitude en degres du centre du zoom                                 
 clon=0.
Index: LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/iodef.xml
===================================================================
--- LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/iodef.xml	(revision 3811)
+++ LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/iodef.xml	(revision 3812)
@@ -1,21 +1,22 @@
-<?xml version = "1.0"?>
+<?xml version="1.0"?>
 <simulation> 
-  <context  id = "xios">
-    <variable_definition>
-      <variable_group id = "buffer">
-        buffer_size = 85000000
-        buffer_server_factor_size = 2 
-      </variable_group>
+	
+	<context  id="xios">
+		<variable_definition>
+       		<variable_group id="buffer">
+            	buffer_size = 85000000
+            	buffer_server_factor_size = 2 
+         	</variable_group>
 
-      <variable_group id = "parameters" >
-        <variable id = "using_server" type = "bool">false</variable>
-        <variable id = "info_level" type = "int">0</variable>
-      </variable_group>
+        	<variable_group id="parameters" >
+        		<variable id="using_server" type="bool">true</variable>
+        		<variable id="info_level" type="int">0</variable>
+        	</variable_group>
+		</variable_definition>
+	</context>
+	
 
-      <variable id = "print_file" type = "bool">true</variable>
-    </variable_definition>
+	<context id="LMDZ" src="./context_lmdz.xml"/>
 
-  </context>
 
-  <context id = "LMDZ" src = "./context_lmdz.xml"/>
 </simulation>
Index: LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/physiq.def_NPv6.1
===================================================================
--- LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/physiq.def_NPv6.1	(revision 3811)
+++ LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/physiq.def_NPv6.1	(revision 3812)
@@ -557,4 +557,4 @@
 
 cdnc_min=10.
-flag_ocean_skin=3
-activate_ocean_skin = 1
+
+
Index: LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/run.def
===================================================================
--- LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/run.def	(revision 3811)
+++ LMDZ6/branches/Ocean_skin/DefLists/run.def	(revision 3812)
@@ -4,8 +4,12 @@
 INCLUDEDEF=gcm.def
 INCLUDEDEF=vert.def
+INCLUDEDEF=orchidee.def
 INCLUDEDEF=config.def
+INCLUDEDEF=reprobus.def
+INCLUDEDEF=guide.def
+INCLUDEDEF=inca.def
 ## Type de calendrier utilise
 ## valeur possible: earth_360d (defaut), earth_365d, earth_366d
-calend= earth_365d
+calend= gregorian
 ## Jour de l etat initial ( = 350  si 20 Decembre ,par expl. ,comme ici )
 dayref= 1
@@ -13,5 +17,5 @@
 anneeref= 1979
 ## Nombre de jours d integration
-nday= 28
+nday= 365
 ## Remise a zero de la date initiale
 raz_date= 0
@@ -40,5 +44,5 @@
 ### VEGET= y si ORCHIDEE, =n si bucket
 ### VEGET is modified automatically by the lmdz.driver 
-VEGET= betaclim
+VEGET= y
 ### Choice of tracers type_trac=lmdz/inca/repr
 ### type_trac is set automatically by the lmdz.driver
Index: LMDZ6/branches/Ocean_skin/arch/arch-X64_IRENE.path
===================================================================
--- LMDZ6/branches/Ocean_skin/arch/arch-X64_IRENE.path	(revision 3811)
+++ LMDZ6/branches/Ocean_skin/arch/arch-X64_IRENE.path	(revision 3812)
@@ -1,6 +1,6 @@
 NETCDF_LIBDIR="-L$NETCDFFORTRAN_LIBDIR -L$NETCDF_LIBDIR -lnetcdf -lnetcdff"
 NETCDF_INCDIR=-I$NETCDFFORTRAN_INCDIR
-IOIPSL_INCDIR=$CCCWORKDIR/build/IOIPSL/src
-IOIPSL_LIBDIR=$CCCWORKDIR/build/IOIPSL/src
+IOIPSL_INCDIR="$LMDGCM/../../lib -I$LMDGCM/../IOIPSL/inc"
+IOIPSL_LIBDIR="$LMDGCM/../../lib -lioipsl -L$LMDGCM/../IOIPSL/lib"
 ORCH_INCDIR=$LMDGCM/../../lib
 ORCH_LIBDIR=$LMDGCM/../../lib
@@ -9,4 +9,4 @@
 INCA_LIBDIR=$LMDGCM/../INCA/build/lib
 INCA_INCDIR=$LMDGCM/../INCA/build/inc
-XIOS_INCDIR=$CCCWORKDIR/include/XIOS
-XIOS_LIBDIR=$CCCWORKDIR/lib
+XIOS_INCDIR=$LMDGCM/../XIOS/inc
+XIOS_LIBDIR=$LMDGCM/../XIOS/lib
Index: LMDZ6/branches/Ocean_skin/arch/arch-X64_JEANZAY.path
===================================================================
--- LMDZ6/branches/Ocean_skin/arch/arch-X64_JEANZAY.path	(revision 3811)
+++ LMDZ6/branches/Ocean_skin/arch/arch-X64_JEANZAY.path	(revision 3812)
@@ -4,6 +4,6 @@
 NETCDF_LIBDIR="-lnetcdf -lnetcdff"
 NETCDF_INCDIR=
-IOIPSL_INCDIR=$WORK/build/IOIPSL_debug/src
-IOIPSL_LIBDIR=$WORK/build/IOIPSL_debug/src
+IOIPSL_INCDIR="$LMDGCM/../../lib -I$LMDGCM/../IOIPSL/inc"
+IOIPSL_LIBDIR="$LMDGCM/../../lib -lioipsl -L$LMDGCM/../IOIPSL/lib"
 ORCH_INCDIR=$LMDGCM/../../lib
 ORCH_LIBDIR=$LMDGCM/../../lib
@@ -12,4 +12,4 @@
 INCA_LIBDIR=$LMDGCM/../INCA/build/lib
 INCA_INCDIR=$LMDGCM/../INCA/build/inc
-XIOS_INCDIR=$WORK/include/XIOS
-XIOS_LIBDIR=$WORK/lib
+XIOS_INCDIR=$LMDGCM/../XIOS/inc
+XIOS_LIBDIR=$LMDGCM/../XIOS/lib
Index: LMDZ6/branches/Ocean_skin/bld.cfg
===================================================================
--- LMDZ6/branches/Ocean_skin/bld.cfg	(revision 3811)
+++ LMDZ6/branches/Ocean_skin/bld.cfg	(revision 3812)
@@ -48,5 +48,5 @@
 dir::root            %CONFIG_PATH
 #dir::lib             %BASE_CONFIG_PATH
-dir::bin             %LIBO
+dir::bin             %ROOT_PATH/bin
 
 #search_src           1
Index: LMDZ6/branches/Ocean_skin/makelmdz_fcm
===================================================================
--- LMDZ6/branches/Ocean_skin/makelmdz_fcm	(revision 3811)
+++ LMDZ6/branches/Ocean_skin/makelmdz_fcm	(revision 3812)
@@ -46,5 +46,5 @@
 
 LMDGCM=`/bin/pwd`
-LIBOGCM=$WORK/build/LMDZ_ocean_skin
+LIBOGCM=$LMDGCM/libo
 LIBFGCM=$LMDGCM/libf
 DYN_COMMON_PATH=$LIBFGCM/dyn3d_common
