Ignore:
Timestamp:
Oct 25, 2013, 10:12:38 AM (11 years ago)
Author:
Ehouarn Millour
Message:

Getting XIOS to work in MPI, OpenMP and mixed MPI/OpenMP modes. Use "-io xios" option with makelmdz or makelmdz_fcm to enable XIOS (this doesn't deactivate IOIPSL outputs; to suppress IOIPSL outputs, add cpp flag CPP_NO_IOIPSL).
EM

Location:
LMDZ5/trunk/libf/phylmd
Files:
2 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • LMDZ5/trunk/libf/phylmd/iophy.F90

    r1852 r1897  
    11!
    2 ! $Header$
     2! $Id$
    33!
    44MODULE iophy
    5 
    6   USE phys_output_var_mod
    7 #ifdef CPP_XIOS
    8   USE wxios
    9 #endif
    10 
    11 #ifdef CPP_XIOS
    12   USE wxios
    13 #endif
    145
    156! abd  REAL,private,allocatable,DIMENSION(:),save :: io_lat
     
    4940
    5041  SUBROUTINE init_iophy_new(rlat,rlon)
    51   USE dimphy
    52   USE mod_phys_lmdz_para
    53   USE mod_grid_phy_lmdz
    54   USE ioipsl
    55 
     42  USE dimphy, only: klon
     43  USE mod_phys_lmdz_para, only: gather, bcast, &
     44                                jj_nb, jj_begin, jj_end, ii_begin, ii_end, &
     45                                mpi_size, mpi_rank, klon_mpi, &
     46                                is_sequential, is_south_pole
     47  USE mod_grid_phy_lmdz, only: nbp_lon, nbp_lat, klon_glo
     48#ifdef CPP_IOIPSL
     49  USE ioipsl, only: flio_dom_set
     50#endif
     51#ifdef CPP_XIOS
     52  use wxios, only: wxios_domain_param
     53#endif
    5654  IMPLICIT NONE
    57   INCLUDE 'dimensions.h'   
     55  INCLUDE 'dimensions.h'
     56  include 'iniprint.h'
    5857    REAL,DIMENSION(klon),INTENT(IN) :: rlon
    5958    REAL,DIMENSION(klon),INTENT(IN) :: rlat
     
    121120#endif
    122121#ifdef CPP_XIOS
    123     !Pour els soucis en MPI, réglage du masque:
     122    ! Set values for the mask:
    124123    IF (mpi_rank == 0) THEN
    125124        data_ibegin = 0
     
    134133    END IF
    135134
    136     WRITE(*,*) "TOTO mpirank=",mpi_rank,"iibeg=",ii_begin , "jjbeg=",jj_begin,"jjnb=",jj_nb,"jjend=",jj_end
    137 
    138     !On initialise le domaine xios, maintenant que tout est connu:
    139     !SUBROUTINE wxios_domain_param(dom_id, is_sequential, ni, nj, ni_glo, nj_glo,        &
    140     !                                ibegin, iend, jbegin, jend,                         &
    141     !                                data_ni, data_ibegin,                               &
    142     !                                io_lat, io_lon)
     135    if (prt_level>=10) then
     136      write(lunout,*) "init_iophy_new: mpirank=",mpi_rank," iibegin=",ii_begin , " ii_end=",ii_end," jjbegin=",jj_begin," jj_nb=",jj_nb," jj_end=",jj_end
     137      write(lunout,*) "init_iophy_new: mpirank=",mpi_rank," nbp_lon=",nbp_lon," nbp_lat=",nbp_lat
     138      write(lunout,*) "init_iophy_new: mpirank=",mpi_rank," data_ibegin=",data_ibegin," data_iend=",data_iend
     139      write(lunout,*) "init_iophy_new: mpirank=",mpi_rank," data_ibegin=",data_ibegin," data_iend=",data_iend
     140      write(lunout,*) "init_iophy_new: mpirank=",mpi_rank," is_south_pole=",is_south_pole
     141    endif
     142
     143    ! Initialize the XIOS domain coreesponding to this process:
    143144    CALL wxios_domain_param("dom_glo", is_sequential, nbp_lon, jj_nb, nbp_lon, nbp_lat, &
    144145                            1, nbp_lon, ii_begin, ii_end, jj_begin, jj_end,             &
    145146                            klon_mpi+2*(nbp_lon-1), data_ibegin, data_iend,             &
    146                             io_lat, io_lon)
     147                            io_lat, io_lon,is_south_pole,mpi_rank)
    147148#endif
    148149!$OMP END MASTER
     
    151152
    152153  SUBROUTINE init_iophy(lat,lon)
    153   USE dimphy
    154   USE mod_phys_lmdz_para
    155   USE ioipsl
     154  USE mod_phys_lmdz_para, only: jj_begin, jj_end, ii_begin, ii_end, jj_nb, &
     155                                mpi_size, mpi_rank
     156  USE ioipsl, only: flio_dom_set
    156157  IMPLICIT NONE
    157158  INCLUDE 'dimensions.h'   
     
    194195
    195196 SUBROUTINE histbeg_phyxios(name,itau0,zjulian,dtime,ffreq,lev,nhori,nid_day)
    196   USE dimphy
    197   USE mod_phys_lmdz_para
    198   use ioipsl
    199   use write_field
     197!  USE dimphy
     198  USE mod_phys_lmdz_para, only: is_sequential, is_using_mpi, is_mpi_root, &
     199                                jj_begin, jj_end, jj_nb
     200  use ioipsl, only: histbeg
     201#ifdef CPP_XIOS
     202  use wxios, only: wxios_add_file
     203#endif
    200204  IMPLICIT NONE
    201205  include 'dimensions.h'
     
    231235 
    232236  SUBROUTINE histbeg_phy(name,itau0,zjulian,dtime,nhori,nid_day)
    233   USE dimphy
    234   USE mod_phys_lmdz_para
    235   use ioipsl
    236   use write_field
     237
     238  USE mod_phys_lmdz_para, only: jj_begin, jj_end, jj_nb, is_sequential
     239  use ioipsl, only: histbeg
     240
    237241  IMPLICIT NONE
    238242  include 'dimensions.h'
     
    263267             plon,plat,plon_bounds,plat_bounds, &
    264268             nname,itau0,zjulian,dtime,nnhori,nnid_day)
    265   USE dimphy
    266   USE mod_phys_lmdz_para
    267   USE mod_grid_phy_lmdz
    268   use ioipsl
    269   use write_field
     269  USE dimphy, only: klon
     270  USE mod_phys_lmdz_para, only: gather, bcast, &
     271                                is_sequential, klon_mpi_begin, klon_mpi_end, &
     272                                mpi_rank
     273  USE mod_grid_phy_lmdz, only: klon_glo
     274  use ioipsl, only: histbeg
     275
    270276  IMPLICIT NONE
    271277  include 'dimensions.h'
     
    383389!
    384390    ENDDO
    385 !    print*,'iophy is_sequential nname, nnhori, nnid_day=',trim(nname),nnhori,nnid_day
     391
    386392#ifndef CPP_NO_IOIPSL
    387393     call histbeg(nname,pim,plon,plon_bounds, &
     
    438444  SUBROUTINE histdef2d_old (iff,lpoint,flag_var,nomvar,titrevar,unitvar)
    439445
    440     USE ioipsl
    441     USE dimphy
    442     USE mod_phys_lmdz_para
    443 
     446    USE ioipsl, only: histdef
     447    USE mod_phys_lmdz_para, only: jj_nb
     448    use phys_output_var_mod, only: type_ecri, zoutm, zdtime_moy, lev_files, &
     449                                   nid_files, nhorim, swaero_diag, nfiles
    444450    IMPLICIT NONE
    445451
     
    492498  SUBROUTINE histdef3d_old (iff,lpoint,flag_var,nomvar,titrevar,unitvar)
    493499
    494     USE ioipsl
    495     USE dimphy
    496     USE mod_phys_lmdz_para
    497 
     500    USE ioipsl, only: histdef
     501    USE dimphy, only: klev
     502    USE mod_phys_lmdz_para, only: jj_nb
     503    use phys_output_var_mod, only: type_ecri, zoutm, lev_files, nid_files, &
     504                                   nhorim, zdtime_moy, levmin, levmax, &
     505                                   nvertm, nfiles
    498506    IMPLICIT NONE
    499507
     
    547555  SUBROUTINE histdef2d (iff,var)
    548556
    549     USE ioipsl
    550     USE dimphy
    551     USE mod_phys_lmdz_para
    552 
     557    USE ioipsl, only: histdef
     558    USE mod_phys_lmdz_para, only: jj_nb
     559    use phys_output_var_mod, only: ctrl_out, type_ecri_files, zoutm, zdtime_moy, &
     560                                   clef_stations, phys_out_filenames, lev_files, &
     561                                   nid_files, nhorim, swaero_diag
     562#ifdef CPP_XIOS
     563    use wxios, only: wxios_add_field_to_file
     564#endif
    553565    IMPLICIT NONE
    554566
     
    618630  SUBROUTINE histdef3d (iff,var)
    619631
    620     USE ioipsl
    621     USE dimphy
    622     USE mod_phys_lmdz_para
    623 
     632    USE ioipsl, only: histdef
     633    USE dimphy, only: klev
     634    USE mod_phys_lmdz_para, only: jj_nb
     635    use phys_output_var_mod, only: ctrl_out, type_ecri_files, zoutm, zdtime_moy, &
     636                                   clef_stations, phys_out_filenames, lev_files, &
     637                                   nid_files, nhorim, swaero_diag, levmin, &
     638                                   levmax, nvertm
     639#ifdef CPP_XIOS
     640    use wxios, only: wxios_add_field_to_file
     641#endif
    624642    IMPLICIT NONE
    625643
     
    686704!!! Lecture des noms et niveau de sortie des variables dans output.def
    687705    !   en utilisant les routines getin de IOIPSL 
    688     use ioipsl
    689 
     706    use ioipsl, only: getin
     707    use phys_output_var_mod, only: nfiles
    690708    IMPLICIT NONE
    691709
     
    705723 
    706724  SUBROUTINE histwrite2d_phy_old(nid,lpoint,name,itau,field)
    707   USE dimphy
    708   USE mod_phys_lmdz_para
    709   USE ioipsl
     725  USE dimphy, only: klon
     726  USE mod_phys_lmdz_para, only: Gather_omp, grid1Dto2D_mpi, &
     727                                is_sequential, klon_mpi_begin, klon_mpi_end, &
     728                                jj_nb, klon_mpi
     729  USE ioipsl, only: histwrite
    710730  IMPLICIT NONE
    711731  include 'dimensions.h'
     
    733753     ALLOCATE(index2d(iim*jj_nb))
    734754     ALLOCATE(fieldok(iim*jj_nb))
    735      IF (prt_level >= 9) write(lunout,*)'Sending ',name,' to IOIPSL'
     755     IF (prt_level >= 10) write(lunout,*)'Sending ',name,' to IOIPSL'
    736756     CALL histwrite(nid,name,itau,Field2d,iim*jj_nb,index2d)
    737      IF (prt_level >= 9) write(lunout,*)'Finished sending ',name,' to IOIPSL'
     757     IF (prt_level >= 10) write(lunout,*)'Finished sending ',name,' to IOIPSL'
    738758    else
    739759     ALLOCATE(fieldok(npstn))
     
    755775      ENDDO
    756776     endif
    757      IF (prt_level >= 9) write(lunout,*)'Sending ',name,' to IOIPSL'
     777     IF (prt_level >= 10) write(lunout,*)'Sending ',name,' to IOIPSL'
    758778     CALL histwrite(nid,name,itau,fieldok,npstn,index2d)
    759      IF (prt_level >= 9) write(lunout,*)'Finished sending ',name,' to IOIPSL'
     779     IF (prt_level >= 10) write(lunout,*)'Finished sending ',name,' to IOIPSL'
    760780!
    761781    endif
     
    768788
    769789  SUBROUTINE histwrite3d_phy_old(nid,lpoint,name,itau,field)
    770   USE dimphy
    771   USE mod_phys_lmdz_para
    772 
    773   use ioipsl
     790  USE dimphy, only: klon
     791  USE mod_phys_lmdz_para, only: Gather_omp, grid1Dto2D_mpi, &
     792                                is_sequential, klon_mpi_begin, klon_mpi_end, &
     793                                jj_nb, klon_mpi
     794  use ioipsl, only: histwrite
    774795  IMPLICIT NONE
    775796  include 'dimensions.h'
     
    791812    nlev=size(field,2)
    792813
    793 !   print*,'hist3d_phy mpi_rank npstn=',mpi_rank,npstn
    794 
    795 !   DO ip=1, npstn
    796 !    print*,'hist3d_phy mpi_rank nptabij',mpi_rank,nptabij(ip)
    797 !   ENDDO
    798 
    799814    CALL Gather_omp(field,buffer_omp)
    800815!$OMP MASTER
     
    803818     ALLOCATE(index3d(iim*jj_nb*nlev))
    804819     ALLOCATE(fieldok(iim*jj_nb,nlev))
    805      IF (prt_level >= 9) write(lunout,*)'Sending ',name,' to IOIPSL'
     820     IF (prt_level >= 10) write(lunout,*)'Sending ',name,' to IOIPSL'
    806821     CALL histwrite(nid,name,itau,Field3d,iim*jj_nb*nlev,index3d)
    807      IF (prt_level >= 9) write(lunout,*)'Finished sending ',name,' to IOIPSL'
     822     IF (prt_level >= 10) write(lunout,*)'Finished sending ',name,' to IOIPSL'
    808823   else
    809824      nlev=size(field,2)
     
    829844       ENDDO
    830845      endif
    831       IF (prt_level >= 9) write(lunout,*)'Sending ',name,' to IOIPSL'
     846      IF (prt_level >= 10) write(lunout,*)'Sending ',name,' to IOIPSL'
    832847      CALL histwrite(nid,name,itau,fieldok,npstn*nlev,index3d)
    833       IF (prt_level >= 9) write(lunout,*)'Finished sending ',name,' to IOIPSL'
     848      IF (prt_level >= 10) write(lunout,*)'Finished sending ',name,' to IOIPSL'
    834849    endif
    835850  deallocate(index3d)
     
    844859! ug NOUVELLE VERSION DES WRITE AVEC LA BOUCLE DO RENTREE
    845860  SUBROUTINE histwrite2d_phy(var,field, STD_iff)
    846   USE dimphy
    847   USE mod_phys_lmdz_para
    848   USE ioipsl
    849  
    850 
    851 
    852 #ifdef CPP_XIOS
    853   USE wxios
     861  USE dimphy, only: klon
     862  USE mod_phys_lmdz_para, only: gather_omp, grid1dto2d_mpi, &
     863                                jj_nb, klon_mpi, klon_mpi_begin, &
     864                                klon_mpi_end, is_sequential
     865  USE ioipsl, only: histwrite
     866  use phys_output_var_mod, only: ctrl_out, clef_files, lev_files, &
     867                                 nfiles, vars_defined, clef_stations, &
     868                                 nid_files
     869#ifdef CPP_XIOS
     870  USE wxios, only: wxios_write_2D
    854871#endif
    855872
     
    872889    REAL, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: fieldok
    873890
    874     IF (prt_level >= 9) WRITE(lunout,*)'Begin histrwrite2d ',var%name
     891    IF (prt_level >= 10) WRITE(lunout,*)'Begin histwrite2d_phy ',trim(var%name)
    875892
    876893! ug RUSTINE POUR LES STD LEVS.....
     
    896913
    897914    !Et sinon on.... écrit
    898     IF (SIZE(field)/=klon) CALL abort_gcm('iophy::histwrite2d','Field first DIMENSION not equal to klon',1)
     915    IF (SIZE(field)/=klon) CALL abort_gcm('iophy::histwrite2d_phy','Field first DIMENSION not equal to klon',1)
    899916   
    900     CALL Gather_omp(field,buffer_omp)   
     917    if (prt_level >= 10) then
     918      write(lunout,*)"histwrite2d_phy: .not.vars_defined ; time to gather and write ", &
     919                     trim(var%name)
     920    endif
     921   
     922    CALL Gather_omp(field,buffer_omp)
    901923!$OMP MASTER
    902924    CALL grid1Dto2D_mpi(buffer_omp,Field2d)
    903    
     925
    904926! La boucle sur les fichiers:
    905927      DO iff=iff_beg, iff_end
     
    914936#ifdef CPP_XIOS
    915937                        IF (iff == iff_beg) THEN
    916                               CALL wxios_write_2D(var%name, Field2d)
     938                          if (prt_level >= 10) then
     939                            write(lunout,*)"histwrite2d_phy: .NOT.clef_stations(iff) and iff==iff_beg, call wxios_write_2D"
     940                          endif
     941                          CALL wxios_write_2D(var%name, Field2d)
    917942                        ENDIF
    918943#endif
     
    922947
    923948                        IF (is_sequential) THEN
     949                          DO ip=1, npstn
     950                            fieldok(ip)=buffer_omp(nptabij(ip))
     951                          ENDDO
     952                        ELSE
    924953                              DO ip=1, npstn
    925                                     fieldok(ip)=buffer_omp(nptabij(ip))
    926                               ENDDO
    927                              ELSE
    928                               DO ip=1, npstn
    929                                 PRINT*,'histwrite2d is_sequential npstn ip namenptabij',npstn,ip,var%name,nptabij(ip)
     954                                write(lunout,*)'histwrite2d_phy is_sequential npstn ip namenptabij',npstn,ip,var%name,nptabij(ip)
    930955                                     IF(nptabij(ip).GE.klon_mpi_begin.AND. &
    931956                                        nptabij(ip).LE.klon_mpi_end) THEN
     
    933958                                     ENDIF
    934959                              ENDDO
    935                        ENDIF
     960                       ENDIF ! of IF (is_sequential)
    936961#ifndef CPP_NO_IOIPSL
     962                       if (prt_level >= 10) then
     963                         write(lunout,*)"histwrite2d_phy: clef_stations(iff) and iff==iff_beg, call wxios_write_2D"
     964                       endif
    937965                       CALL histwrite(nid_files(iff),var%name,itau_iophy,fieldok,npstn,index2d)
    938966#endif
    939                   ENDIF
     967                  ENDIF ! of IF(.NOT.clef_stations(iff))
    940968                 
    941969                deallocate(index2d)
    942970                deallocate(fieldok)
    943971            ENDIF !levfiles
    944       ENDDO
     972      ENDDO ! of DO iff=iff_beg, iff_end
    945973!$OMP END MASTER   
    946974  ENDIF ! vars_defined
    947   IF (prt_level >= 9) WRITE(lunout,*)'End histrwrite2d ',var%name
     975  IF (prt_level >= 10) WRITE(lunout,*)'End histwrite2d_phy ',trim(var%name)
    948976  END SUBROUTINE histwrite2d_phy
    949977
     
    951979! ug NOUVELLE VERSION DES WRITE AVEC LA BOUCLE DO RENTREE
    952980  SUBROUTINE histwrite3d_phy(var, field, STD_iff)
    953   USE dimphy
    954   USE mod_phys_lmdz_para
    955   USE ioipsl
    956  
    957 
    958 #ifdef CPP_XIOS
    959 ! USE WXIOS
     981  USE dimphy, only: klon, klev
     982  USE mod_phys_lmdz_para, only: gather_omp, grid1dto2d_mpi, &
     983                                jj_nb, klon_mpi, klon_mpi_begin, &
     984                                klon_mpi_end, is_sequential
     985  USE ioipsl, only: histwrite
     986  use phys_output_var_mod, only: ctrl_out, clef_files, lev_files, &
     987                                 nfiles, vars_defined, clef_stations, &
     988                                 nid_files
     989#ifdef CPP_XIOS
     990  USE wxios, only: wxios_write_3D
    960991#endif
    961992
     
    9771008    REAL,ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fieldok
    9781009
    979   IF (prt_level >= 9) write(lunout,*)'Begin histrwrite3d ',var%name
     1010  IF (prt_level >= 10) write(lunout,*)'Begin histrwrite3d ',var%name
    9801011
    9811012! ug RUSTINE POUR LES STD LEVS.....
     
    10571088!$OMP END MASTER   
    10581089  ENDIF ! vars_defined
    1059   IF (prt_level >= 9) write(lunout,*)'End histrwrite3d ',var%name
     1090  IF (prt_level >= 10) write(lunout,*)'End histrwrite3d ',var%name
    10601091  END SUBROUTINE histwrite3d_phy
    10611092 
     
    10641095#ifdef CPP_XIOS
    10651096  SUBROUTINE histwrite2d_xios(field_name,field)
    1066   USE dimphy
    1067   USE mod_phys_lmdz_para
    1068   USE wxios
     1097  USE dimphy, only: klon
     1098  USE mod_phys_lmdz_para, only: gather_omp, grid1Dto2D_mpi, &
     1099                                is_sequential, klon_mpi_begin, klon_mpi_end, &
     1100                                jj_nb, klon_mpi
     1101  USE wxios, only: wxios_write_2D
    10691102
    10701103
     
    10831116    REAL, ALLOCATABLE, DIMENSION(:) :: fieldok
    10841117
    1085     IF (prt_level >= 9) WRITE(lunout,*)'Begin histrwrite2d_xios ',field_name
     1118    IF (prt_level >= 10) WRITE(lunout,*)'Begin histrwrite2d_xios ',field_name
    10861119
    10871120    !Et sinon on.... écrit
     
    11271160!$OMP END MASTER   
    11281161
    1129   IF (prt_level >= 9) WRITE(lunout,*)'End histrwrite2d_xios ',field_name
     1162  IF (prt_level >= 10) WRITE(lunout,*)'End histrwrite2d_xios ',field_name
    11301163  END SUBROUTINE histwrite2d_xios
    11311164
     
    11331166! ug NOUVELLE VERSION DES WRITE AVEC LA BOUCLE DO RENTREE
    11341167  SUBROUTINE histwrite3d_xios(field_name, field)
    1135   USE dimphy
    1136   USE mod_phys_lmdz_para
    1137   USE wxios
     1168  USE dimphy, only: klon, klev
     1169  USE mod_phys_lmdz_para, only: gather_omp, grid1Dto2D_mpi, &
     1170                                is_sequential, klon_mpi_begin, klon_mpi_end, &
     1171                                jj_nb, klon_mpi
     1172  USE wxios, only: wxios_write_3D
    11381173
    11391174
     
    11511186    REAL,ALLOCATABLE, DIMENSION(:,:) :: fieldok
    11521187
    1153   IF (prt_level >= 9) write(lunout,*)'Begin histrwrite3d_xios ',field_name
     1188  IF (prt_level >= 10) write(lunout,*)'Begin histrwrite3d_xios ',field_name
    11541189
    11551190    !Et on.... écrit
     
    11971232!$OMP END MASTER   
    11981233
    1199   IF (prt_level >= 9) write(lunout,*)'End histrwrite3d_xios ',field_name
     1234  IF (prt_level >= 10) write(lunout,*)'End histrwrite3d_xios ',field_name
    12001235  END SUBROUTINE histwrite3d_xios
    12011236#endif
  • LMDZ5/trunk/libf/phylmd/phys_output_write_mod.F90

    r1865 r1897  
    2626! defined and initialised in phys_output_mod.F90
    2727
    28     USE dimphy
    29     USE control_mod
    30     USE phys_output_ctrlout_mod
    31     USE phys_state_var_mod
    32     USE phys_local_var_mod
    33     USE phys_output_var_mod
    34     USE indice_sol_mod
    35     USE infotrac
    36     USE comgeomphy
    37     USE surface_data,     ONLY : type_ocean, ok_veget, ok_snow
    38     USE aero_mod
    39     USE ioipsl
    40     USE write_field_phy
    41     USE iophy
    42     USE mod_phys_lmdz_para
    43     USE netcdf,  ONLY : nf90_fill_real
     28    USE dimphy, only: klon, klev, klevp1
     29    USE control_mod, only: day_step, iphysiq
     30    USE phys_output_ctrlout_mod, only: o_phis, o_aire, is_ter, is_lic, is_oce, &
     31                                       is_ave, is_sic, o_contfracATM, o_contfracOR, &
     32                                       o_aireTER, o_flat, o_slp, o_tsol, &
     33                                       o_t2m, o_t2m_min, o_t2m_max, &
     34                                       o_q2m, o_ustar, o_u10m, o_v10m, &
     35                                       o_wind10m, o_wind10max, o_sicf, &
     36                                       o_psol, o_mass, o_qsurf, o_qsol, &
     37                                       o_precip, o_ndayrain, o_plul, o_pluc, &
     38                                       o_snow, o_msnow, o_fsnow, o_evap, &
     39                                       o_tops, o_tops0, o_topl, o_topl0, &
     40                                       o_SWupTOA, o_SWupTOAclr, o_SWdnTOA, &
     41                                       o_SWdnTOAclr, o_nettop, o_SWup200, &
     42                                       o_SWup200clr, o_SWdn200, o_SWdn200clr, &
     43                                       o_LWup200, o_LWup200clr, o_LWdn200, &
     44                                       o_LWdn200clr, o_sols, o_sols0, &
     45                                       o_soll, o_radsol, o_soll0, o_SWupSFC, &
     46                                       o_SWupSFCclr, o_SWdnSFC, o_SWdnSFCclr, &
     47                                       o_LWupSFC, o_LWdnSFC, o_LWupSFCclr, &
     48                                       o_LWdnSFCclr, o_bils, o_bils_diss, &
     49                                       o_bils_ec, o_bils_tke, o_bils_kinetic, &
     50                                       o_bils_latent, o_bils_enthalp, o_sens, &
     51                                       o_fder, o_ffonte, o_fqcalving, o_fqfonte, &
     52                                       o_taux, o_tauy, o_snowsrf, o_qsnow, &
     53                                       o_snowhgt, o_toice, o_sissnow, o_runoff, &
     54                                       o_albslw3, o_pourc_srf, o_fract_srf, &
     55                                       o_taux_srf, o_tauy_srf, o_tsol_srf, &
     56                                       o_evappot_srf, o_ustar_srf, o_u10m_srf, &
     57                                       o_v10m_srf, o_t2m_srf, o_evap_srf, &
     58                                       o_sens_srf, o_lat_srf, o_flw_srf, &
     59                                       o_fsw_srf, o_wbils_srf, o_wbilo_srf, &
     60                                       o_tke_srf, o_tke_max_srf, o_wstar, &
     61                                       o_cdrm, o_cdrh, o_cldl, o_cldm, o_cldh, &
     62                                       o_cldt, o_cldq, o_lwp, o_iwp, o_ue, &
     63                                       o_ve, o_uq, o_vq, o_cape, o_pbase, &
     64                                       o_ptop, o_fbase, o_plcl, o_plfc, &
     65                                       o_wbeff, o_cape_max, o_upwd, o_Ma, &
     66                                       o_dnwd, o_dnwd0, o_ftime_con, o_mc, &
     67                                       o_prw, o_s_pblh, o_s_pblt, o_s_lcl, &
     68                                       o_s_therm, o_uSTDlevs, o_vSTDlevs, &
     69                                       o_wSTDlevs, o_zSTDlevs, o_qSTDlevs, &
     70                                       o_tSTDlevs, epsfra, o_t_oce_sic, &
     71                                       o_ale_bl, o_alp_bl, o_ale_wk, o_alp_wk, &
     72                                       o_ale, o_alp, o_cin, o_WAPE, o_wake_h, &
     73                                       o_wake_s, o_wake_deltat, o_wake_deltaq, &
     74                                       o_wake_omg, o_dtwak, o_dqwak, o_Vprecip, &
     75                                       o_ftd, o_fqd, o_wdtrainA, o_wdtrainM, &
     76                                       o_n2, o_s2, o_proba_notrig, &
     77                                       o_random_notrig, o_ale_bl_stat, &
     78                                       o_ale_bl_trig, o_alp_bl_det, &
     79                                       o_alp_bl_fluct_m, o_alp_bl_fluct_tke, &
     80                                       o_alp_bl_conv, o_alp_bl_stat, o_slab_bils, &
     81                                       o_weakinv, o_dthmin, o_cldtau, &
     82                                       o_cldemi, o_pr_con_l, o_pr_con_i, &
     83                                       o_pr_lsc_l, o_pr_lsc_i, o_re, o_fl, &
     84                                       o_rh2m, o_rh2m_min, o_rh2m_max, &
     85                                       o_qsat2m, o_tpot, o_tpote, o_SWnetOR, &
     86                                       o_SWdownOR, o_LWdownOR, o_snowl, &
     87                                       o_solldown, o_dtsvdfo, o_dtsvdft, &
     88                                       o_dtsvdfg, o_dtsvdfi, o_rugs, o_od550aer, &
     89                                       o_od865aer, o_absvisaer, o_od550lt1aer, &
     90                                       o_sconcso4, o_sconcoa, o_sconcbc, &
     91                                       o_sconcss, o_sconcdust, o_concso4, &
     92                                       o_concoa, o_concbc, o_concss, o_concdust, &
     93                                       o_loadso4, o_loadoa, o_loadbc, o_loadss, &
     94                                       o_loaddust, o_tausumaero, o_topswad, &
     95                                       o_topswad0, o_solswad, o_solswad0, &
     96                                       o_swtoaas_nat, o_swsrfas_nat, &
     97                                       o_swtoacs_nat, o_swtoaas_ant, &
     98                                       o_swsrfas_ant, o_swtoacs_ant, &
     99                                       o_swsrfcs_ant, o_swtoacf_nat, &
     100                                       o_swsrfcf_nat, o_swtoacf_ant, &
     101                                       o_swsrfcs_nat, o_swsrfcf_ant, &
     102                                       o_swtoacf_zero, o_swsrfcf_zero, &
     103                                       o_topswai, o_solswai, o_scdnc, &
     104                                       o_cldncl, o_reffclws, o_reffclwc, &
     105                                       o_cldnvi, o_lcc, o_lcc3d, o_lcc3dcon, &
     106                                       o_lcc3dstra, o_reffclwtop, o_ec550aer, &
     107                                       o_lwcon, o_iwcon, o_temp, o_theta, &
     108                                       o_ovapinit, o_ovap, o_oliq, o_geop, &
     109                                       o_vitu, o_vitv, o_vitw, o_pres, o_paprs, &
     110                                       o_zfull, o_zhalf, o_rneb, o_rnebcon, &
     111                                       o_rnebls, o_rhum, o_ozone, o_ozone_light, &
     112                                       o_dtphy, o_dqphy, o_albe_srf, o_rugs_srf, &
     113                                       o_ages_srf, o_alb1, o_alb2, o_tke, &
     114                                       o_tke_max, o_kz, o_kz_max, o_clwcon, &
     115                                       o_dtdyn, o_dqdyn, o_dudyn, o_dvdyn, &
     116                                       o_dtcon, o_tntc, o_ducon, o_dvcon, &
     117                                       o_dqcon, o_tnhusc, o_tnhusc, o_dtlsc, &
     118                                       o_dtlschr, o_dqlsc, o_beta_prec, &
     119                                       o_dtlscth, o_dtlscst, o_dqlscth, &
     120                                       o_dqlscst, o_plulth, o_plulst, &
     121                                       o_ptconvth, o_lmaxth, o_dtvdf, &
     122                                       o_dtdis, o_dqvdf, o_dteva, o_dqeva, &
     123                                       o_ptconv, o_ratqs, o_dtthe, o_ftime_th, &
     124                                       o_f_th, o_e_th, o_w_th, o_q_th, &
     125                                       o_a_th, o_d_th, o_f0_th, o_zmax_th, &
     126                                       o_dqthe, o_dtajs, o_dqajs, o_dtswr, &
     127                                       o_dtsw0, o_dtlwr, o_dtlw0, o_dtec, &
     128                                       o_duvdf, o_dvvdf, o_duoro, o_dvoro, &
     129                                       o_dtoro, o_dulif, o_dvlif, o_dtlif, &
     130                                       o_duhin, o_dvhin, o_dthin, o_rsu, &
     131                                       o_rsd, o_rlu, o_rld, o_rsucs, o_rsdcs, &
     132                                       o_rlucs, o_rldcs, o_tnt, o_tntr, &
     133                                       o_tntscpbl, o_tnhus, o_tnhusscpbl, &
     134                                       o_evu, o_h2o, o_mcd, o_dmc, o_ref_liq, &
     135                                       o_ref_ice, o_rsut4co2, o_rlut4co2, &
     136                                       o_rsutcs4co2, o_rlutcs4co2, o_rsu4co2, &
     137                                       o_rlu4co2, o_rsucs4co2, o_rlucs4co2, &
     138                                       o_rsd4co2, o_rld4co2, o_rsdcs4co2, &
     139                                       o_rldcs4co2, o_tnondef, o_ta, o_zg, &
     140                                       o_hus, o_hur, o_ua, o_va, o_wap, &
     141                                       o_psbg, o_tro3, o_tro3_daylight, &
     142                                       o_uxv, o_vxq, o_vxT, o_wxq, o_vxphi, &
     143                                       o_wxT, o_uxu, o_vxv, o_TxT, o_trac, &
     144                                       o_dtr_vdf, o_dtr_the, o_dtr_con, &
     145                                       o_dtr_lessi_impa, o_dtr_lessi_nucl, &
     146                                       o_dtr_insc, o_dtr_bcscav, o_dtr_evapls, &
     147                                       o_dtr_ls, o_dtr_trsp, o_dtr_sscav, &
     148                                       o_dtr_sat, o_dtr_uscav, o_trac_cum
     149
     150    USE phys_state_var_mod, only: pctsrf, paire_ter, rain_fall, snow_fall, &
     151                                  nday_rain, rain_con, snow_con, &
     152                                  topsw, toplw, toplw0, swup, swdn, &
     153                                  topsw0, swup0, swdn0, SWup200, SWup200clr, &
     154                                  SWdn200, SWdn200clr, LWup200, LWup200clr, &
     155                                  LWdn200, LWdn200clr, solsw, solsw0, sollw, &
     156                                  radsol, sollw0, sollwdown, sollw, &
     157                                  sollwdownclr, lwdn0, ftsol, ustar, u10m, &
     158                                  v10m, pbl_tke, wstar, cape, ema_pcb, ema_pct, &
     159                                  ema_cbmf, Ma, fm_therm, ale_bl, alp_bl, ale, &
     160                                  alp, cin, wake_pe, wake_s, wake_deltat, &
     161                                  wake_deltaq, ftd, fqd, ale_bl_trig, albsol1, &
     162                                  rnebcon, wo, falb1, albsol2, coefh, clwcon0, &
     163                                  ratqs, entr_therm, zqasc, detr_therm, f0, heat, &
     164                                  heat0, cool, cool0, lwup, lwdn, lwup0, coefm, &
     165                                  swupp, lwupp, swup0p, lwup0p, swdnp, lwdnp, &
     166                                  swdn0p, lwdn0p, tnondef, O3sumSTD, uvsumSTD, &
     167                                  vqsumSTD, vTsumSTD, O3daysumSTD, wqsumSTD, &
     168                                  vphisumSTD, wTsumSTD, u2sumSTD, v2sumSTD, &
     169                                  T2sumSTD, nlevSTD
     170                                 
     171    USE phys_local_var_mod, only: zxfluxlat, slp, zxtsol, zt2m, &
     172                                  zu10m, zv10m, zq2m, zustar, zxqsurf, qsol, &
     173                                  rain_lsc, snow_lsc, evap, bils, sens, fder, &
     174                                  zxffonte, zxfqcalving, zxfqfonte, fluxu, &
     175                                  fluxv, zxsnow, qsnow, snowhgt, to_ice, &
     176                                  sissnow, runoff, albsol3_lic, evap_pot, &
     177                                  t2m, fevap, fluxt, fluxlat, fsollw, fsolsw, &
     178                                  wfbils, wfbilo, cdragm, cdragh, cldl, cldm, &
     179                                  cldh, cldt, cldq, flwp, fiwp, ue, ve, uq, vq, &
     180                                  plcl, plfc, wbeff, upwd, dnwd, dnwd0, prw, &
     181                                  s_pblh, s_pblt, s_lcl, s_therm, uwriteSTD, &
     182                                  vwriteSTD, wwriteSTD, phiwriteSTD, qwriteSTD, &
     183                                  twriteSTD, ale_wake, alp_wake, wake_h, &
     184                                  wake_omg, d_t_wake, d_q_wake, Vprecip, &
     185                                  wdtrainA, wdtrainM, n2, s2, proba_notrig, &
     186                                  random_notrig, ale_bl_stat, &
     187                                  alp_bl_det, alp_bl_fluct_m, alp_bl_conv, &
     188                                  alp_bl_stat, alp_bl_fluct_tke, slab_wfbils, &
     189                                  weak_inversion, dthmin, cldtau, cldemi, &
     190                                  pmflxr, pmflxs, prfl, psfl, re, fl, rh2m, &
     191                                  qsat2m, tpote, tpot, d_ts, zxrugs, od550aer, &
     192                                  od865aer, absvisaer, od550lt1aer, sconcso4, &
     193                                  sconcoa, sconcbc, sconcss, sconcdust, concso4, &
     194                                  concoa, concbc, concss, concdust, loadso4, &
     195                                  loadoa, loadbc, loadss, loaddust, tausum_aero, &
     196                                  topswad_aero, topswad0_aero, solswad_aero, &
     197                                  solswad0_aero, topsw_aero, solsw_aero, &
     198                                  topsw0_aero, solsw0_aero, topswcf_aero, &
     199                                  solswcf_aero, topswai_aero, solswai_aero, &
     200                                  scdnc, cldncl, reffclws, reffclwc, cldnvi, &
     201                                  lcc, lcc3d, lcc3dcon, lcc3dstra, reffclwtop, &
     202                                  ec550aer, flwc, fiwc, t_seri, theta, q_seri, &
     203                                  ql_seri, zphi, u_seri, v_seri, omega, cldfra, &
     204                                  rneb, zx_rh, frugs, agesno, d_t_dyn, d_q_dyn, &
     205                                  d_u_dyn, d_v_dyn, d_t_con, d_t_ajsb, d_t_ajs, &
     206                                  d_u_con, d_v_con, d_q_con, d_q_ajs, d_t_lsc, &
     207                                  d_t_eva, d_q_lsc, beta_prec, d_t_lscth, &
     208                                  d_t_lscst, d_q_lscth, d_q_lscst, plul_th, &
     209                                  plul_st, d_t_vdf, d_t_diss, d_q_vdf, d_q_eva, &
     210                                  zw2, fraca, zmax_th, d_q_ajsb, d_t_ec, d_u_vdf, &
     211                                  d_v_vdf, d_u_oro, d_v_oro, d_t_oro, d_u_lif, &
     212                                  d_v_lif, d_t_lif, d_u_hin, d_v_hin, d_t_hin, &
     213                                  pmfd, pmfu, ref_liq, ref_ice, rhwriteSTD
     214   
     215    USE phys_output_var_mod, only: vars_defined, snow_o, zfra_o, bils_diss, &
     216                                   bils_ec, bils_tke, bils_kinetic, bils_latent, &
     217                                   bils_enthalp, itau_con, nfiles, clef_files, &
     218                                   nid_files
     219    USE indice_sol_mod, only: nbsrf
     220    USE infotrac, only: nqtot
     221    USE comgeomphy, only: airephy
     222    USE surface_data, only: type_ocean, ok_veget, ok_snow
     223    USE aero_mod, only: naero_spc
     224    USE ioipsl, only: histend, histsync
     225    USE iophy, only: set_itau_iophy, histwrite_phy
     226    USE netcdf, only: nf90_fill_real
    44227
    45228#ifdef CPP_XIOS
    46229    ! ug Pour les sorties XIOS
    47         USE wxios
    48     USE xios
     230        USE wxios, only: wxios_update_calendar, wxios_closedef
    49231#endif
    50232
     
    57239    INCLUDE "YOMCST.h"
    58240    INCLUDE "dimensions.h"
     241    include "iniprint.h"
    59242
    60243! Input
     
    101284DO iinit=1, iinitend
    102285#ifdef CPP_XIOS
    103 IF (vars_defined) THEN
    104      CALL wxios_update_calendar(itau_w)
     286!$OMP MASTER
     287IF (vars_defined) THEN
     288   if (prt_level >= 10) then
     289     write(lunout,*)"phys_output_write: call wxios_update_calendar, itau_w=",itau_w
     290   endif
     291   CALL wxios_update_calendar(itau_w)
    105292END IF
     293!$OMP END MASTER
     294!$OMP BARRIER
    106295#endif
    107296! On procède à l'écriture ou à la définition des nombreuses variables:
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.