Changeset 1772


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Timestamp:
Jun 14, 2013, 2:40:46 PM (11 years ago)
Author:
Ehouarn Millour
Message:

Update makelmdz and maklmdz_fcm scripts to enable using various versions of the ORCHIDEE library (no equivalent update of makegcm since it is obsolescent and that makelmdz or makelmdz_fcm should be used instead).
Translated the help manual to English.
EM+JG

Location:
LMDZ5/trunk
Files:
2 edited

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  • LMDZ5/trunk/makelmdz

    r1755 r1772  
    9898  case $1 in
    9999      "-h") cat <<fin
    100 manuel complet sur http://...
    101100Usage :
    102 makegcm [options] exec
    103 [-h]                       : manuel abrege
    104 [-d [[IMx]JMx]LM]          : IM, JM, LM sont les dims en x, y, z (def: $dim)
    105 [-p PHYS]                  : compilation avec la physique libf/phyPHYS, (def: lmd)
    106 [-prod / -dev / -debug]    : compilation en mode production (default) / developpement / debug .
    107 [-c false/MPI1/MPI2]       : couple ocean : MPI1/MPI2/false (def: false)
    108 [-v false/true]            : avec ou sans vegetation (def: false)
    109 [-chimie INCA/false]       : avec ou sans model de chimie INCA (def: false)
    110 [-parallel none/mpi/omp/mpi_omp] : parallelisation (default: none) : mpi, openmp ou mixte mpi_openmp
    111 [-g GRI]                   : conf. grille dans dyn3d/GRI_xy.h  (def: reg inclue un zoom)
    112 [-io IO]                   : choix d une librairie I/O, experts (def: ioipsl)
    113 [-include INCLUDES]        : variables supplementaires pour include
    114 [-cpp CPP_KEY]             : cle cpp supplementaires
    115 [-adjnt]                   : adjoint, a remettre en route ...
    116 [-mem]                     : version memoire reduite (si en mode parallele)
    117 [-filtre NOMFILTRE]        : prend le filtre dans libf/NOMFILTRE (def: filtrez)
    118 [-link LINKS]              : liens optionels avec d autres librairies
    119 [-ext_src path]            : chemin d un repertoire source avec des sources externe a compiler avec le modele
    120 [-arch nom_arch]           : nom de l architecture cible
    121  exec                      : executable genere
     101makelmdz [options] -arch nom_arch exec
     102[-h]                       : brief help
     103[-d [[IMx]JMx]LM]          : IM, JM, LM are the dimensions in x, y, z (default: $dim)
     104[-p PHYS]                  : set of physical parametrizations (in libf/phyPHYS), (default: lmd)
     105[-prod / -dev / -debug]    : compilation mode production (default) / developement / debug
     106[-c false/MPI1/MPI2]       : coupling with ocean model : MPI1/MPI2/false (default: false)
     107[-v false/orchidee2.0/orchidee1.9/true] : version of the vegetation model to include (default: false)
     108          false       : no vegetation model
     109          orchidee2.0 : compile using ORCHIDEE 2.0 (or more recent version)
     110          orchidee1.9 : compile using ORCHIDEE up to the version including OpenMP in ORCHIDEE : tag 1.9-1.9.5(version AR5)-1.9.6
     111          true        : (obsolete; for backward compatibility) use ORCHIDEE tag 1.9-1.9.6
     112[-chimie INCA/false]       : with INCA chemistry model or without (default: false)
     113[-parallel none/mpi/omp/mpi_omp] : parallelism (default: none) : mpi, openmp or mixted mpi_openmp
     114[-g GRI]                   : grid configuration in dyn3d/GRI_xy.h  (default: reg, inclues a zoom)
     115[-io IO]                   : Input/Output library (default: ioipsl)
     116[-include INCLUDES]        : extra include path to add
     117[-cpp CPP_KEY]             : additional preprocessing definitions
     118[-adjnt]                   : adjoint model, not operational ...
     119[-mem]                     : reduced memory dynamics (if in parallel mode)
     120[-filtre NOMFILTRE]        : use filtre from libf/NOMFILTRE (default: filtrez)
     121[-link LINKS]              : additional links with other libraries
     122[-fcm_path path]           : path to the fcm tool (default: tools/fcm/bin)
     123[-ext_src path]            : path to an additional set of routines to compile with the model
     124 -arch nom_arch            : target architecture
     125 exec                      : executable to build
    122126fin
    123127          exit;;
    … …  
    125129          dim=$2 ; shift ; shift ;;
    126130     
    127       "-O")
    128           echo "option obsolete dans ce makegcm"
    129           exit;;
    130 
    131131      "-p")
    132132          physique="$2" ;  shift ; shift ;;
    … …  
    166166
    167167      "-adjnt")
    168           echo "option a reactiver ";exit
     168          echo "not operational ... work to be done here ";exit
    169169          opt_dep="$opt_dep adjnt" ; adjnt="-ladjnt -ldyn3d "
    170170          optim="$optim -Dadj" ; shift ;;
    … …  
    351351fi
    352352
    353 if [[ "$veget" == "true" ]]
    354 then
     353if [[ "$veget" == "orchidee2.0" ]]
     354then
     355# orchidee2.0 :
     356# Compile with ORCHIDEE 2.0 (or more recent)
     357   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_VEGET"
     358   INCLUDE="${INCLUDE} -I${ORCH_INCDIR}"
     359   LIB="${LIB} -L${ORCH_LIBDIR} -l${LIBPREFIX}orchidee "
     360elif [[ "$veget" == "orchidee1.9" ]]
     361then
     362# orchidee1.9 :
     363# Compile with ORCHIDEE version up to the inclusion of OpenMP in ORCHIDEE : tag 1.9-1.9.5(version AR5)-1.9.6
     364   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_VEGET ORCHIDEE_NOOPENMP"
     365   INCLUDE="${INCLUDE} -I${ORCH_INCDIR}"
     366   LIB="${LIB} -L${ORCH_LIBDIR} -l${LIBPREFIX}sechiba -l${LIBPREFIX}parameters -l${LIBPREFIX}stomate -l${LIBPREFIX}parallel -l${LIBPREFIX}orglob"
     367elif [[ "$veget" == "true" ]]
     368then
     369# true :
     370# Obsolete, for backward compatibility. To be used with ORCHIDEE tag 1.9-1.9.6
     371# For this case, cpp flag ORCHIDEE_NOOPENMP must be added to the makelmdz_fcm arguments
    355372   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_VEGET"
    356373   INCLUDE="${INCLUDE} -I${ORCH_INCDIR}"
    357374   LIB="${LIB} -L${ORCH_LIBDIR} -l${LIBPREFIX}sechiba -l${LIBPREFIX}parameters -l${LIBPREFIX}stomate -l${LIBPREFIX}parallel -l${LIBPREFIX}orglob"
     375elif [[ "$veget" != "false" ]]
     376then
     377   echo "Option -v $veget does not exist"
     378   echo "Use ./makelmdz -h for more information"
     379   exit
    358380fi
    359381
    … …  
    479501fi
    480502
    481 if [[ $veget == "true" ]]
     503if [[ $veget != "false" ]]
    482504then
    483505  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_orch

  • LMDZ5/trunk/makelmdz_fcm

    r1757 r1772  
    5757  case $1 in
    5858      "-h") cat <<fin
    59 manuel complet sur http://...
    6059Usage :
    61 makegcm [options] -m arch exec
    62 [-h]                       : manuel abrégé
    63 [-d [[IMx]JMx]LM]          : IM, JM, LM sont les dims en x, y, z (def: $dim)
    64 [-p PHYS]                  : compilation avec la physique libf/phyPHYS, (def: lmd)
    65 [-prod / -dev / -debug]    : compilation en mode production (default) / developpement / debug .
    66 [-c false/MPI1/MPI2]       : couplé océan : MPI1/MPI2/false (def: false)
    67 [-v false/true]            : avec ou sans végétation (def: false)
    68 [-chimie INCA/false]       : avec ou sans model de chimie INCA (def: false)
    69 [-parallel none/mpi/omp/mpi_omp] : parallelisation (default: none) : mpi, openmp ou mixte mpi_openmp
    70 [-g GRI]                   : conf. grille dans dyn3d/GRI_xy.h  (def: reg inclue un zoom)
    71 [-io IO]                   : choix d'une librairie I/O, experts (def: ioipsl)
    72 [-include INCLUDES]        : variables supplementaires pour include
    73 [-cpp CPP_KEY]             : cle cpp supplementaires
    74 [-adjnt]                   : adjoint, a remettre en route ...
    75 [-mem]                     : version memoire reduite (si en mode parallele)
    76 [-filtre NOMFILTRE]        : prend le filtre dans libf/NOMFILTRE (def: filtrez)
    77 [-link LINKS]              : liens optionels avec d'autres librairies
    78 [-fcm_path path]           : chemin pour fcm (def: tools/fcm/bin)
    79 [-ext_src path]            : chemin d'un repertoire source avec des sources externe a compiler avec le modele
    80  -arch nom_arch            : nom de l'architecture cible
    81  exec                      : exécutable généré
     60makelmdz_fcm [options] -arch nom_arch exec
     61[-h]                       : brief help
     62[-d [[IMx]JMx]LM]          : IM, JM, LM are the dimensions in x, y, z (default: $dim)
     63[-p PHYS]                  : set of physical parametrizations (in libf/phyPHYS), (default: lmd)
     64[-prod / -dev / -debug]    : compilation mode production (default) / developement / debug
     65[-c false/MPI1/MPI2]       : coupling with ocean model : MPI1/MPI2/false (default: false)
     66[-v false/orchidee2.0/orchidee1.9/true] : version of the vegetation model to include (default: false)
     67          false       : no vegetation model
     68          orchidee2.0 : compile using ORCHIDEE 2.0 (or more recent version)
     69          orchidee1.9 : compile using ORCHIDEE up to the version including OpenMP in ORCHIDEE : tag 1.9-1.9.5(version AR5)-1.9.6
     70          true        : (obsolete; for backward compatibility) use ORCHIDEE tag 1.9-1.9.6
     71[-chimie INCA/false]       : with INCA chemistry model or without (default: false)
     72[-parallel none/mpi/omp/mpi_omp] : parallelism (default: none) : mpi, openmp or mixted mpi_openmp
     73[-g GRI]                   : grid configuration in dyn3d/GRI_xy.h  (default: reg, inclues a zoom)
     74[-io IO]                   : Input/Output library (default: ioipsl)
     75[-include INCLUDES]        : extra include path to add
     76[-cpp CPP_KEY]             : additional preprocessing definitions
     77[-adjnt]                   : adjoint model, not operational ...
     78[-mem]                     : reduced memory dynamics (if in parallel mode)
     79[-filtre NOMFILTRE]        : use filtre from libf/NOMFILTRE (default: filtrez)
     80[-link LINKS]              : additional links with other libraries
     81[-fcm_path path]           : path to the fcm tool (default: tools/fcm/bin)
     82[-ext_src path]            : path to an additional set of routines to compile with the model
     83 -arch nom_arch            : target architecture
     84 exec                      : executable to build
    8285fin
    8386          exit;;
    … …  
    8689          dim=$2 ; shift ; shift ;;
    8790     
    88       "-O")
    89           echo "option obsolete dans cette version intermediaire de makegcm"
    90           exit;;
    91 
    9291      "-p")
    9392          physique="$2" ;  shift ; shift ;;
    … …  
    127126
    128127      "-adjnt")
    129           echo "option a reactiver ";exit
     128          echo "not operational ... work to be done here ";exit
    130129          opt_dep="$opt_dep adjnt" ; adjnt="-ladjnt -ldyn3d "
    131130          optim="$optim -Dadj" ; shift ;;
    … …  
    249248fi
    250249
    251 if [[ "$veget" == "true" ]]
    252 then
     250if [[ "$veget" == "orchidee2.0" ]]
     251then
     252# orchidee2.0 :
     253# Compile with ORCHIDEE 2.0 (or more recent)
     254   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_VEGET"
     255   INCLUDE="${INCLUDE} -I${ORCH_INCDIR}"
     256   LIB="${LIB} -L${ORCH_LIBDIR} -l${LIBPREFIX}orchidee "
     257elif [[ "$veget" == "orchidee1.9" ]]
     258then
     259# orchidee1.9 :
     260# Compile with ORCHIDEE version up to the inclusion of OpenMP in ORCHIDEE : tag 1.9-1.9.5(version AR5)-1.9.6
     261   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_VEGET ORCHIDEE_NOOPENMP"
     262   INCLUDE="${INCLUDE} -I${ORCH_INCDIR}"
     263   LIB="${LIB} -L${ORCH_LIBDIR} -l${LIBPREFIX}sechiba -l${LIBPREFIX}parameters -l${LIBPREFIX}stomate -l${LIBPREFIX}parallel -l${LIBPREFIX}orglob"
     264elif [[ "$veget" == "true" ]]
     265then
     266# true :
     267# Obsolete, for backward compatibility. To be used with ORCHIDEE tag 1.9-1.9.6
     268# For this case, cpp flag ORCHIDEE_NOOPENMP must be added to the makelmdz_fcm arguments
    253269   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_VEGET"
    254270   INCLUDE="${INCLUDE} -I${ORCH_INCDIR}"
    255271   LIB="${LIB} -L${ORCH_LIBDIR} -l${LIBPREFIX}sechiba -l${LIBPREFIX}parameters -l${LIBPREFIX}stomate -l${LIBPREFIX}parallel -l${LIBPREFIX}orglob"
     272elif [[ "$veget" != "false" ]]
     273then
     274   echo "Option -v $veget does not exist"
     275   echo "Use ./makelmdz_fcm -h for more information"
     276   exit
    256277fi
    257278
    … …  
    395416fi
    396417
    397 if [[ $veget == "true" ]]
     418if [[ $veget != "false" ]]
    398419then
    399420  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_orch
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.