source: LMDZ6/trunk/libf/phylmd/ecrad/bin/drhook_merge_walltime.pl @ 5407

Last change on this file since 5407 was 4773, checked in by idelkadi, 12 months ago
  • Update of Ecrad in LMDZ The same organization of the Ecrad offline version is retained in order to facilitate the updating of Ecrad in LMDZ and the comparison between online and offline results. version 1.6.1 of Ecrad (​https://github.com/lguez/ecrad.git)
  • Implementation of the double call of Ecrad in LMDZ


File size: 9.2 KB
Line 
1#!/usr/bin/perl
2
3#
4# drhook_merge_walltime.pl
5#
6# For merging wall clock time results from different MPI-tasks
7# i.e. DR_HOOK_OPT=prof
8#
9# Original script by Eckhard Tschirschnitz, Cray, 2006 (Mflop/s)
10#
11# Usage: cat drhook.* | perl -w drhook_merge_walltime.pl
12#
13
14use strict;
15use warnings;
16
17# this expects concatenated dr_hook listings (wall clock time listings)
18
19my $bignum = 999999999;
20
21my $skip = 1;
22my $str = "THRESHOLD_PERCENT";
23my $threshold_percent = exists($ENV{$str}) ? $ENV{$str} : 0.1;
24my $tottim = 0;
25
26my $maxwall = 0;
27my $minwall = $bignum;
28my $avgwall = 0;
29my $stdevwall = 0;
30
31my $nproc = 0; # no of MPI-tasks
32my $maxomp = 0; # max. no of OpenMP-threads encountered
33my $exe = ""; # the name of the executable
34
35my %nself = ();
36my %sumself = ();
37my %sum2self = ();
38my %maxself = ();
39my %minself = ();
40my %ompself = ();
41
42my %numcalls = ();
43
44my %taskhits = ();
45my %omphits = ();
46
47RECORD: for (<>) {
48  chomp; # get rid of the newline character
49
50  next RECORD if (m/^\s*$/); # a blank line
51
52  if (m/^\s*Profiling\b/) { 
53    if ($nproc == 0) {
54      $exe = $1 if (m/program='([^\'].*)'/);
55    }
56    $nproc++;
57    $skip = 1;
58  }
59  elsif (m/^\s+Wall-time\s+is\s+(\S+)\s+/) {
60    my $value = $1;
61    $maxwall = $value if ($value > $maxwall);
62    $minwall = $value if ($value < $minwall);
63    $avgwall += $value;
64    $stdevwall += $value * $value;
65    $skip = 1;
66  }
67  elsif (m/^\s+1\s+/) { # the first record of (any) file encountered
68    &CumulativeUpdate(); 
69    %ompself = ();
70    $skip = 0;
71  }
72
73  next RECORD if ($skip);
74
75  #         rank  %time cumul self    total  #_of_calls self:ms/call tot:ms/call routine_name
76  if (m/^\s+\S+\s+\S+\s+\S+\s+(\S+)\s+\S+\s+(\S+)\s+\S+\s+\S+\s+(.*)\s*/) {
77    my $self = $1;
78    my $ncalls = $2;
79    my $name = $3;
80    my $tid = 0;
81    $name =~ s/\s+//g;
82    $name =~ s/^[*]//;
83    #print "$self $name\n";
84    if ($name =~ m/^(.*)[@](\d+)/) {
85      $tid = $2;
86      $maxomp = $tid if ($tid > $maxomp);
87      $name = $1;
88    }
89    unless (exists($sumself{$name})) {
90      $nself{$name} = 0;
91      $sumself{$name} = 0;
92      $sum2self{$name} = 0;
93      $maxself{$name} = 0;
94      $minself{$name} = $bignum;
95      $numcalls{$name} = 0;
96      $taskhits{$name} = 0;
97      $omphits{$name} = 0;
98    }
99    $numcalls{$name} += $ncalls;
100    $taskhits{$name} += 1 if ($tid == 1);
101    $omphits{$name} += 1;
102   
103    # Account the most expensive OpenMP thread only per $name label
104    $ompself{$name} = 0 unless (exists($ompself{$name}));
105    $ompself{$name} = $self if ($self > $ompself{$name});
106  }
107}
108
109if ($nproc > 0) {
110  # One final time ...
111  &CumulativeUpdate(); 
112   
113  print  STDOUT "The name of the executable : $exe\n";
114  print  STDOUT "Number of MPI-tasks        : $nproc\n";
115  print  STDOUT "Number of OpenMP-threads   : $maxomp\n";
116  print  STDOUT "export $str   : $threshold_percent%\n";
117  $avgwall /= $nproc;
118  if ($nproc > 1) {
119    $stdevwall = ($stdevwall - $nproc * $avgwall * $avgwall)/($nproc - 1);
120    $stdevwall = ($stdevwall > 0) ? sqrt($stdevwall) : 0; # be careful with rounding of errors
121  }
122  else {
123    $stdevwall = 0;
124  }
125  #printf STDOUT ("Total time (average)       : %.3f secs \n", $avgwall);
126  printf STDOUT ("Wall-times over %d MPI-tasks (secs) : Min=%.3f, Max=%.3f, Avg=%.3f, StDev=%.3f\n", 
127                 $nproc, $minwall, $maxwall, $avgwall, $stdevwall);
128  my $avgpercent = $threshold_percent * $avgwall / 100.0;
129
130  printf STDOUT ("Routines whose average time > %.2f%% (%.3f secs) of the total average will be included in the listing\n",
131                 $threshold_percent,$avgpercent);
132
133  printf STDOUT ("%7s %10s %10s %10s %8s %8s %12s %13s %8s %8s : %s\n",
134                 "Avg-%", "Avg.secs", 
135                 "Min.secs", "Max.secs", "St.dev", 
136                 "Imbal-%", 
137                 "# of calls",
138                 "Avg.msec/call",
139                 "Tasks",
140                 "OpenMP",
141                 "Name-of-the-routine");
142
143  open(PIPE,"|sort -nr|sed 's/ %/%/'");
144
145  # Values accounted for
146  my $acc_avgpercent = 0;
147  my $acc_avgtime = 0;
148  my $acc_maxtime = 0;
149  my $acc_mintime = $bignum;
150
151  foreach my $name (keys %sumself) {
152    my $value = $sumself{$name};
153    my $navg = $nself{$name};
154    my $avgself = $value/$navg;
155    if ($avgself > $avgpercent) {
156      my $percent = $value/$tottim*100;
157      my $stdev = 0;
158      if ($navg > 1) {
159        $stdev = $sum2self{$name};
160        $stdev = ($stdev - $navg * $avgself * $avgself)/($navg - 1);
161        $stdev = ($stdev > 0) ? sqrt($stdev) : 0; # be careful with rounding of errors
162      }
163      printf PIPE ("%6.2f %% %10.3f %10.3f %10.3f %8.3f %7.2f%% %12.0f %13.3f %8d %8d : %s\n",
164                   $percent, $avgself,
165                   $minself{$name},$maxself{$name},$stdev,
166                   ($maxself{$name} - $minself{$name})/$maxself{$name}*100,
167                   $numcalls{$name},
168                   $avgself / $numcalls{$name} * 1000.0,
169                   $taskhits{$name}, 
170                   $omphits{$name} / $taskhits{$name},
171                   $name);
172      # Update values accounted for
173      $acc_avgpercent += $percent;
174      $acc_avgtime += $avgself;
175      $acc_mintime = $minself{$name} if ($acc_mintime > $minself{$name});
176      $acc_maxtime = $maxself{$name} if ($acc_maxtime < $maxself{$name});
177    }
178  }
179  close(PIPE);
180  printf STDOUT ("%6.2f%% %10.3f %10.3f %10.3f\n",
181                 $acc_avgpercent,$acc_avgtime,
182                 $acc_mintime, $acc_maxtime);
183}
184
185exit 0;
186
187sub CumulativeUpdate {
188    foreach my $name (keys %ompself) {
189        my $self = $ompself{$name};
190        $nself{$name} += 1;
191        $sumself{$name} += $self;
192        $sum2self{$name} += $self * $self;
193        $maxself{$name} = $self if ($self > $maxself{$name});
194        $minself{$name} = $self if ($self < $minself{$name});
195        $tottim += $self;
196    }
197}
198
199# A sample of typical output
200__DATA__
201The name of the executable : /lustre/tmp/saarines/rundir/LUMO/19/fmiopt/teho.gnu/h1/N7+1.T140+20xt1xh1.dcmp_10x14.ppn_20+20.nproma_60.hgp_undef.fmiopt-534667/MASTERODB
202Number of MPI-tasks        : 140
203Number of OpenMP-threads   : 1
204export THRESHOLD_PERCENT   : 0.2%
205Wall-times over 140 MPI-tasks (secs) : Min=399.410, Max=400.320, Avg=399.876, StDev=0.220
206Routines whose average time > 0.20% (0.800 secs) of the total average will be included in the listing
207  Avg-%   Avg.secs   Min.secs   Max.secs   St.dev  Imbal-%   # of calls Avg.msec/call    Tasks   OpenMP : Name-of-the-routine
208  5.32%     21.270     19.341     24.105    0.920   19.76%     10598700         0.002      140        1 : LAITRI
209  5.18%     20.730     16.166     23.143    1.239   30.15%       698740         0.030      140        1 : VDFHGHTNHL
210  5.06%     20.215      0.469     70.180   14.105   99.33%         8540         2.367      140        1 : SLCOMM
211  4.12%     16.474     12.309     17.213    0.952   28.49%       933656         0.018      140        1 : FPCINCAPE
212  3.61%     14.429     11.903     16.617    0.774   28.37%       698740         0.021      140        1 : INITAPLPAR
213  3.02%     12.055      0.671     45.288   10.498   98.52%         6860         1.757      140        1 : SLCOMM2A
214  2.72%     10.875      5.275     16.432    2.938   67.90%       698740         0.016      140        1 : RAIN_ICE
215  2.70%     10.793      4.965     18.614    3.433   73.33%       698740         0.015      140        1 : RAIN_ICE:RAIN_ICE_SEDIMENTATION_STAT
216  2.55%     10.182      9.763     10.552    0.212    7.48%        25340         0.402      140        1 : TRMTOL
217  2.54%     10.169      8.510     10.509    0.444   19.02%       698740         0.015      140        1 : APL_AROME
218  2.51%     10.054      8.519     10.192    0.421   16.41%      1397480         0.007      140        1 : COMPUTE_FUNCTION_THERMO_MF
219  2.51%     10.038      8.181     11.849    1.156   30.96%        25340         0.396      140        1 : TRLTOG
220  2.31%      9.252      5.219     21.083    4.795   75.25%        21000         0.441      140        1 : TRLTOM
221  1.93%      7.711      1.976     24.881    6.385   92.06%        22540         0.342      140        1 : TRGTOL
222  1.91%      7.653      3.985     12.186    2.001   67.30%       698740         0.011      140        1 : RAIN_ICE:RAIN_ICE_SLOW
223  1.84%      7.364      6.510      7.976    0.403   18.38%      1413160         0.005      140        1 : ELARCHE
224  1.46%      5.825      3.269      8.145    1.265   59.86%        71300         0.082      140        1 : RRTM_RTRN1A_140GP
225  1.33%      5.301      4.389      5.637    0.229   22.14%      5589920         0.001      140        1 : TRIDIAG_MASSFLUX
226  1.30%      5.208      4.416      5.282    0.218   16.40%      1397480         0.004      140        1 : TURB:COMPUTE_FUNCTION_THERMO
227  1.25%      4.997      4.445      5.741    0.406   22.57%      9260880         0.001      140        1 : RPASSF
228  1.12%      4.489      3.801      4.562    0.189   16.68%       698740         0.006      140        1 : ACTQSAT
229  0.93%      3.699      2.879      4.401    0.341   34.58%       698740         0.005      140        1 : CONDENSATION
230  0.90%      3.588      0.507      9.260    1.812   94.52%       698740         0.005      140        1 : RAIN_ICE:RAIN_ICE_FAST_RG
231
232etc.
233
234  0.23%      0.922      0.891      0.978    0.025    8.90%       718900         0.001      140        1 : SIPTP
235  0.21%      0.840      0.583      1.262    0.160   53.80%        13440         0.063      140        1 : ESEIMPLS
236  0.21%      0.834      0.691      0.878    0.037   21.30%       698740         0.001      140        1 : LATTEX
237  0.21%      0.825      0.698      0.845    0.035   17.40%    112297500         0.000      140        1 : SWTT1
238  0.18%      0.893      0.000      1.548    0.567  100.00%       477554         0.002      113        1 : ECUME_FLUX
239 85.41%    341.669      0.000     70.180
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.