source: LMDZ5/trunk/makelmdz_fcm @ 1892

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Suite intégration SISVAT: ne pas compiler SISVAT si on n'en a pas besoin quand
makelmdz_fcm est utilisé


Follow-up on SISVAT integration: do not compile SISVAT if not needed when using
makelmdz_fcm

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:executable set to *
  • Property svn:keywords set to Author Date Id Revision
File size: 14.0 KB
RevLine 
[1279]1#!/bin/bash
2# $Id: makelmdz_fcm 1869 2013-09-16 08:13:50Z fairhead $
3# This is a script in Bash.
4
[1140]5# FH : on ne crée plus le fichier arch.mk qui est supposé exister par
[783]6# FH : ailleurs.
[1140]7# FH : ulterieurement, ce fichier sera pré-existant pour une série
8# FH : de configurations en versions optimisées et debug qui seront
9# FH : liés (ln -s) avec arch.mk en fonction de l'architecture.
10# FH : Pour le moment, cette version est en test et on peut créer les
11# FH : arch.mk en lançant une première fois makegcm.
[783]12#
[1279]13##set -x
[783]14########################################################################
15# options par defaut pour la commande make
16########################################################################
17
[1279]18dim="96x72x19"
19physique=lmd
20filtre=filtrez
21grille=reg
22couple=false
23veget=false
[1865]24sisvat=false
[1279]25chimie=false
26parallel=none
[1680]27paramem="par"
[1279]28compil_mod=prod
29io=ioipsl
30LIBPREFIX=""
31cosp=false
[1802]32job=1
33full=''
[783]34
[1279]35LMDGCM=`/bin/pwd`
36LIBOGCM=$LMDGCM/libo
37LIBFGCM=$LMDGCM/libf
[1327]38COSP_PATH=$LMDGCM/.void_dir
[1578]39fcm_path=$LMDGCM/tools/fcm/bin
[783]40
41########################################################################
42#  Quelques initialisations de variables du shell.
43########################################################################
44
[1279]45CPP_KEY="" 
46INCLUDE=""
47LIB=""
48adjnt=""
49COMPIL_FFLAGS="%PROD_FFLAGS"
50PARA_FFLAGS=""
51PARA_LD=""
52EXT_SRC=""
[783]53
54########################################################################
55# lecture des options de mymake
56########################################################################
57
[1279]58while (($# > 0))
59  do
60  case $1 in
61      "-h") cat <<fin
[783]62Usage :
[1772]63makelmdz_fcm [options] -arch nom_arch exec
64[-h]                       : brief help
65[-d [[IMx]JMx]LM]          : IM, JM, LM are the dimensions in x, y, z (default: $dim)
66[-p PHYS]                  : set of physical parametrizations (in libf/phyPHYS), (default: lmd)
67[-prod / -dev / -debug]    : compilation mode production (default) / developement / debug
68[-c false/MPI1/MPI2]       : coupling with ocean model : MPI1/MPI2/false (default: false)
69[-v false/orchidee2.0/orchidee1.9/true] : version of the vegetation model to include (default: false)
70          false       : no vegetation model
71          orchidee2.0 : compile using ORCHIDEE 2.0 (or more recent version)
72          orchidee1.9 : compile using ORCHIDEE up to the version including OpenMP in ORCHIDEE : tag 1.9-1.9.5(version AR5)-1.9.6
73          true        : (obsolete; for backward compatibility) use ORCHIDEE tag 1.9-1.9.6
74[-chimie INCA/false]       : with INCA chemistry model or without (default: false)
75[-parallel none/mpi/omp/mpi_omp] : parallelism (default: none) : mpi, openmp or mixted mpi_openmp
76[-g GRI]                   : grid configuration in dyn3d/GRI_xy.h  (default: reg, inclues a zoom)
77[-io IO]                   : Input/Output library (default: ioipsl)
78[-include INCLUDES]        : extra include path to add
79[-cpp CPP_KEY]             : additional preprocessing definitions
80[-adjnt]                   : adjoint model, not operational ...
81[-mem]                     : reduced memory dynamics (if in parallel mode)
82[-filtre NOMFILTRE]        : use filtre from libf/NOMFILTRE (default: filtrez)
83[-link LINKS]              : additional links with other libraries
[1802]84[-j n]                     : active parallel compiling on ntask
85[-full]                    : full recompiling
[1772]86[-fcm_path path]           : path to the fcm tool (default: tools/fcm/bin)
87[-ext_src path]            : path to an additional set of routines to compile with the model
88 -arch nom_arch            : target architecture
89 exec                      : executable to build
[783]90fin
[1279]91          exit;;
[783]92
[1279]93      "-d")
94          dim=$2 ; shift ; shift ;;
95     
96      "-p")
97          physique="$2" ;  shift ; shift ;;
[783]98
[1279]99      "-g")
100          grille="$2" ; shift ; shift ;;
[783]101
[1279]102      "-c")
103          couple="$2" ; shift ; shift ;;
[783]104
[1279]105      "-prod")
106          compil_mod="prod" ; shift ;;
[1002]107
[1279]108      "-dev")
109          compil_mod="dev" ; shift ;;
[1002]110
[1279]111      "-debug")
112          compil_mod="debug" ; shift ;;
[1002]113
[1279]114      "-io")
115          io="$2" ; shift ; shift ;;
[783]116
[1279]117      "-v")
118          veget="$2" ; shift ; shift ;;
[783]119
[1865]120      "-sisvat")
121          sisvat="$2" ; shift ; shift ;;
122
[1279]123      "-chimie")
124          chimie="$2" ; shift ; shift ;;
[783]125
[1279]126      "-parallel")
127          parallel="$2" ; shift ; shift ;;
128     
129      "-include")
130          INCLUDE="$INCLUDE -I$2" ; shift ; shift ;;
[783]131
[1279]132      "-cpp")
133          CPP_KEY="$CPP_KEY $2" ; shift ; shift ;;
[1132]134
[1279]135      "-adjnt")
[1772]136          echo "not operational ... work to be done here ";exit
[1279]137          opt_dep="$opt_dep adjnt" ; adjnt="-ladjnt -ldyn3d "
138          optim="$optim -Dadj" ; shift ;;
[783]139
[1279]140      "-cosp")
141          cosp="$2" ; shift ; shift ;;
[1680]142     
143      "-mem")
144          paramem="mem" ; shift ;;
[783]145
[1279]146      "-filtre")
147          filtre=$2 ; shift ; shift ;;
[783]148
[1279]149      "-link")
150          LIB="$LIB $2" ; shift ; shift ;;
[1136]151
[1279]152      "-fcm_path")
153          fcm_path=$2 ; shift ; shift ;;
[783]154
[1279]155      "-ext_src")
156          EXT_SRC=$2 ; shift ; shift ;;
[1802]157      "-j")
158          job=$2 ; shift ; shift ;;
159      "-full")
160          full="-full" ; shift ;;
[783]161
[1279]162      "-arch")
163          arch=$2 ; shift ; shift ;;
[783]164
[1279]165      *)
166          code="$1" ; shift ;;
167  esac
168done
169
[1136]170###############################################################
[1755]171# path to fcm
[1136]172###############################################################
[1755]173# handle case when provided path to fcm was given as a relative
174# path (from makelmdz_fcm script directory) and not an absolute path
175if [[ ${fcm_path:0:1} != "/" ]] ; then
176  # prepend with makelmdz_fcm location
177  fcm_path=$(cd $(dirname $0) ; pwd)"/"${fcm_path}
178fi
[783]179
[1757]180# add fcm_path to PATH
181export PATH=${fcm_path}:${PATH}
182
[1755]183echo "Path to fcm:"
184echo ${fcm_path}
[1136]185
[783]186###############################################################
[1140]187# lecture des chemins propres à l'architecture de la machine #
[783]188###############################################################
[1279]189rm -f .void_file
190echo > .void_file
[1327]191rm -rf .void_dir
192mkdir .void_dir
[1279]193rm -f arch.path
194ln -s arch/arch-${arch}.path ./arch.path
[783]195source arch.path
196
197########################################################################
198# Definition des clefs CPP, des chemins des includes et modules
199#  et des libraries
200########################################################################
201
[1279]202if [[ "$compil_mod" == "prod" ]]
203then
204  COMPIL_FFLAGS="%PROD_FFLAGS"
205elif [[ "$compil_mod" == "dev" ]]
206then
207  COMPIL_FFLAGS="%DEV_FFLAGS"
208elif [[ "$compil_mod" == "debug" ]]
209then
210  COMPIL_FFLAGS="%DEBUG_FFLAGS"
211fi
[783]212
[1279]213if [[ "$physique" != "nophys" ]]
214then
[1615]215   #We'll use some physics
216   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_PHYS"
217   if [[ "${physique:0:3}" == "lmd" ]]
218   then
219   #For lmd physics, default planet type is Earth
[1279]220   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_EARTH"
[1615]221   fi
[1279]222fi
[783]223
[1279]224if [[ "$chimie" == "INCA" ]]
225then
226   CPP_KEY="$CPP_KEY INCA"
227   INCLUDE="$INCLUDE -I${INCA_INCDIR}"
228   LIB="$LIB -L${INCA_LIBDIR} -lchimie"
229fi
[783]230
[1279]231if [[ "$couple" != "false" ]]
232then
233   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_COUPLE"
234   INCLUDE="$INCLUDE -I${OASIS_INCDIR}"
235   LIB="$LIB -L${OASIS_LIBDIR} -lpsmile.${couple} -lmpp_io"
236fi
[783]237
[1279]238if [[ "$parallel" == "mpi" ]]
239then
240   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_PARA CPP_MPI"
241   PARA_FFLAGS="%MPI_FFLAGS"
242   PARA_LD="%MPI_LD"
243elif [[ "$parallel" == "omp" ]]
244then
245   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_PARA CPP_OMP"
246   PARA_FFLAGS="%OMP_FFLAGS"
247   PARA_LD="%OMP_LD"
248elif [[ "$parallel" == "mpi_omp" ]]
249then
250   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_PARA CPP_MPI CPP_OMP"
251   PARA_FFLAGS="%MPI_FFLAGS %OMP_FFLAGS"
252   PARA_LD="%MPI_LD %OMP_LD"
253fi
[783]254
[1279]255if [[ ( "$parallel" == "omp" || "$parallel" == "mpi_omp" ) \
256   && "$compil_mod" == "debug" ]]
257then
258    echo "Usually, parallelization with OpenMP requires some optimization."
259    echo "We suggest switching to \"-dev\"."
260fi
[783]261
[1811]262if [ "$veget" = "true" -o "$veget" = "orchidee1.9" -o "$veget" = "orchidee2.0" ]
[1279]263then
[1811]264#NB: option 'true': for backward compatibility. To be used with ORCHIDEE tag 1.9-1.9.6
265#    For this case, cpp flag ORCHIDEE_NOOPENMP must be added to the makelmdz_fcm arguments
266#    option orchidee1.9 : Compile with ORCHIDEE version up to the inclusion of OpenMP in ORCHIDEE : tag 1.9-1.9.5(version AR5)-1.9.6
[1279]267   INCLUDE="${INCLUDE} -I${ORCH_INCDIR}"
[1772]268   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_VEGET"
[1811]269# temporary, for Orchidee versions 1.9.* (before openmp activation)
270   if [[ "$veget" == "orchidee1.9" ]] ; then
271      CPP_KEY="$CPP_KEY ORCHIDEE_NOOPENMP"
272   fi
273   if [[ "$veget" == "orchidee2.0" ]] ; then
[1854]274      orch_libs="sechiba parameters stomate parallel orglob orchidee"
[1811]275   else
276      orch_libs="sechiba parameters stomate parallel orglob"
277   fi
278   LIB="${LIB} -L${ORCH_LIBDIR}"
279   for lib in ${orch_libs} ; do
280      if [ -f ${ORCH_LIBDIR}/lib${LIBPREFIX}$lib.a ] ; then
281         LIB="${LIB} -l${LIBPREFIX}$lib "
282      fi
283   done
284elif [[ "$veget" != "false" ]] ; then
[1772]285   echo "Option -v $veget does not exist"
286   echo "Use ./makelmdz_fcm -h for more information"
287   exit 
[1279]288fi
[783]289
[1865]290if [[ "$sisvat" == "true" ]]
291then
292   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_SISVAT"
[1869]293   sed -e 's/^#src::sisvat/src::sisvat/' bld.cfg > bld.tmp
294   mv bld.tmp bld.cfg
[1865]295fi
296
[1279]297if [[ $io == ioipsl ]]
298then
299   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_IOIPSL"
300   INCLUDE="$INCLUDE -I${IOIPSL_INCDIR}"
301   LIB="$LIB -L${IOIPSL_LIBDIR} -l${LIBPREFIX}ioipsl"
302fi
303if [[ "$cosp" == "true" ]]
304then
305   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_COSP"
[1327]306   COSP_PATH="$LIBFGCM/cosp"
[1279]307#   LIB="${LIB} -l${LIBPREFIX}cosp"
308fi
[783]309
[1551]310INCLUDE="$INCLUDE ${NETCDF_INCDIR}"
311LIB="$LIB ${NETCDF_LIBDIR}"
312
[783]313########################################################################
314# calcul du nombre de dimensions
315########################################################################
316
317
[1279]318dim_full=$dim
319dim=`echo $dim | sed -e 's/[^0-9]/ /g'` 
320set $dim
321dimc=$#
[783]322echo calcul de la dimension
323echo dim $dim
324echo dimc $dimc
325
326
327########################################################################
328# Gestion des dimensions du modele.
[1114]329# on cree ou remplace le fichier des dimensions
[783]330########################################################################
331
[1695]332cd $LIBFGCM/grid
333if [[ -f dimensions.h ]]
334then
335  echo 'ATTENTION: vous etes sans doute en train de compiler le modele par ailleurs'
336  echo "Attendez que la premiere compilation soit terminee pour relancer la suivante."
337  echo "Si vous etes sur que vous ne compilez pas le modele par ailleurs,"
338  echo  vous pouvez continuer en repondant oui.
339  echo "Voulez-vous vraiment continuer?"
[1755]340  echo ""
341  echo "WARNING: you are probably already compiling the model somewhere else."
342  echo "Wait until the first compilation is finished before launching this one."
343  echo "If you are sure that you are not compiling elsewhere, just answer "
344  echo "yes (or 'oui') to the question below to proceed."
345  echo "Do you wish to continue?"
[1695]346  read reponse
[1755]347  if [[ $reponse == "oui" || $reponse == "yes" ]]
[1695]348  then
[1696]349    \rm -f $LIBFGCM/grid/dimensions.h
[1695]350  else
351    exit
352  fi
353fi
354
355
[783]356cd $LIBFGCM/grid/dimension
[1114]357./makdim $dim
[783]358cat $LIBFGCM/grid/dimensions.h
359cd $LMDGCM
360
361
362########################################################################
363# Differentes dynamiques (3d, 2d, 1d)
364########################################################################
365
[1279]366dimension=`echo $dim | wc -w`
[783]367echo dimension $dimension
368
[1279]369if (( $dimension == 3 ))
370then
[783]371  cd $LIBFGCM/grid
372  \rm fxyprim.h
373  cp -p fxy_${grille}.h fxyprim.h
[1279]374else
375  echo "Probleme dans les dimensions de la dynamique !!"
376  echo "Non reactive pour l'instant !!!"
377fi
[783]378
379######################################################################
380#   Traitement special pour le nouveau rayonnement de Laurent Li.
381#   ---> YM desactive pour le traitemement en parallele
382######################################################################
383
[1279]384#if [[ -f $libf/phy$physique/raddim.h ]]
385#then
386# if [[ -f $libf/phy$physique/raddim.$dimh.h ]]
387#then
[783]388#  \rm -f $libf/phy$physique/raddim.h
389#  cp -p $libf/phy$physique/raddim.$dimh.h $libf/phy$physique/raddim.h
390#  echo $libf/phy$physique/raddim.$dimh.h
391#  cat $libf/phy$physique/raddim.h
392# else
393#  echo On peut diminuer la taille de l executable en creant
394#  echo le fichier $libf/phy$physique/raddim.$dimh.h
395#  \cp -p $libf/phy$physique/raddim.defaut.h $libf/phy$physique/raddim.h
[1279]396# fi
397#fi
[783]398
399######################################################################
400# Gestion du filtre qui n'existe qu'en 3d.
401######################################################################
402
[1279]403if (( `expr $dimc \> 2` == 1 ))
404then
405   filtre="FILTRE=$filtre"
[783]406else
[1279]407   filtre="FILTRE= L_FILTRE= "
408fi
[783]409echo MACRO FILTRE $filtre
410
411echo $dimc
412
413
414
415######################################################################
416# Creation du suffixe de la configuration
417######################################################################
418
419
[1279]420SUFF_NAME=_${dim_full}
421SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_phy${physique}
[783]422
[1279]423if [[ "$parallel" != "none" ]]
424then
425  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_para
[1680]426  DYN=dyn${dimc}d${paramem}
427  if [[ "$paramem" == "mem" ]]
428  then
429   SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_${paramem}
430  fi
[783]431else
[1279]432  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_seq
433  DYN=dyn${dimc}d
434fi
[783]435
[1772]436if [[ $veget != "false" ]]
[1279]437then
438  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_orch
439fi
[783]440
[1279]441if [[ $couple != "false" ]]
442then
443  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_couple
444fi
[783]445
[1279]446if [[ $chimie == "INCA" ]]
447then
448  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_inca
449fi
[783]450
451cd $LMDGCM
[1279]452config_fcm="config.fcm"
[783]453rm -f $config_fcm
454touch $config_fcm
455rm -f bin/${code}${SUFF_NAME}.e
456rm -f arch.fcm
[1279]457rm -f arch.opt
[783]458
459echo "%ARCH          $arch"          >> $config_fcm
460echo "%INCDIR        $INCLUDE"       >> $config_fcm 
461echo "%LIB           $LIB"           >> $config_fcm
462echo "%ROOT_PATH     $PWD"           >> $config_fcm
463echo "%LIBF          $LIBFGCM"       >> $config_fcm
464echo "%LIBO          $LIBOGCM"       >> $config_fcm
465echo "%DYN           $DYN"           >> $config_fcm
466echo "%PHYS          phy${physique}" >> $config_fcm
[1327]467echo "%COSP          $COSP_PATH"     >> $config_fcm
[783]468echo "%CPP_KEY       $CPP_KEY"       >> $config_fcm
469echo "%EXEC          $code"          >> $config_fcm
470echo "%SUFF_NAME     $SUFF_NAME"     >> $config_fcm
[1002]471echo "%COMPIL_FFLAGS $COMPIL_FFLAGS" >> $config_fcm
472echo "%PARA_FFLAGS   $PARA_FFLAGS"   >> $config_fcm
473echo "%PARA_LD       $PARA_LD"       >> $config_fcm
[1279]474echo "%EXT_SRC       $EXT_SRC"       >> $config_fcm
[783]475
[1002]476
477
[1137]478ln -s arch/arch-${arch}.fcm arch.fcm
[1279]479if test -f arch/arch-${arch}.opt &&  [ $compil_mod = "prod" ]
480  then
481  ln -s arch/arch-${arch}.opt arch.opt
482else
483  ln -s .void_file arch.opt
484fi
485
486
[1002]487rm -f $LIBOGCM/${arch}${SUFF_NAME}/.config/fcm.bld.lock
[1802]488./build_gcm ${fcm_path} -j $job $full
[783]489
[1279]490rm -rf tmp_src
491rm -rf config
[783]492ln -s $LIBOGCM/${arch}${SUFF_NAME}/.config config
493ln -s $LIBOGCM/${arch}${SUFF_NAME}/.config/tmp tmp_src
[1695]494
[1869]495#eventual cleanup for SISVAT
496sed -e 's/^src::sisvat/#src::sisvat/' bld.cfg > bld.tmp
497mv bld.tmp bld.cfg
498
499
[1696]500if [[ -r $LIBFGCM/grid/dimensions.h ]]
[1695]501then
502  # Cleanup: remove dimension.h file
[1696]503  \rm -f $LIBFGCM/grid/dimensions.h
[1695]504fi
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.