source: LMDZ5/trunk/makelmdz_fcm @ 1664

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Introducing "phydev", the minimal physics package.
makegcm and makelmdz_fcm script have been updated to add CPP_PHYS preprocessing key when building with physics and CPP_EARTH for Earth (LMD physics) related routines or instructions in the dynamics.
Checked (on Vargas) that "dev" physics package compiles and runs well in all (seq/mpi/omp/mpi_omp) modes and that introduced changes do not modify results when using the "lmd" physics package.
EM + FH

  • Property svn:eol-style set to native
  • Property svn:executable set to *
  • Property svn:keywords set to Author Date Id Revision
File size: 10.9 KB
RevLine 
[1279]1#!/bin/bash
2# $Id: makelmdz_fcm 1615 2012-02-10 15:42:26Z fairhead $
3# This is a script in Bash.
4
[1140]5# FH : on ne crée plus le fichier arch.mk qui est supposé exister par
[783]6# FH : ailleurs.
[1140]7# FH : ulterieurement, ce fichier sera pré-existant pour une série
8# FH : de configurations en versions optimisées et debug qui seront
9# FH : liés (ln -s) avec arch.mk en fonction de l'architecture.
10# FH : Pour le moment, cette version est en test et on peut créer les
11# FH : arch.mk en lançant une première fois makegcm.
[783]12#
[1279]13##set -x
[783]14########################################################################
15# options par defaut pour la commande make
16########################################################################
17
[1279]18dim="96x72x19"
19physique=lmd
20filtre=filtrez
21grille=reg
22couple=false
23veget=false
24chimie=false
25parallel=none
26compil_mod=prod
27io=ioipsl
28LIBPREFIX=""
29cosp=false
[783]30
[1279]31LMDGCM=`/bin/pwd`
32LIBOGCM=$LMDGCM/libo
33LIBFGCM=$LMDGCM/libf
[1327]34COSP_PATH=$LMDGCM/.void_dir
[1578]35fcm_path=$LMDGCM/tools/fcm/bin
[783]36
37########################################################################
38#  Quelques initialisations de variables du shell.
39########################################################################
40
[1279]41CPP_KEY="" 
42INCLUDE=""
43LIB=""
44adjnt=""
45COMPIL_FFLAGS="%PROD_FFLAGS"
46PARA_FFLAGS=""
47PARA_LD=""
48EXT_SRC=""
[783]49
50########################################################################
51# lecture des options de mymake
52########################################################################
53
[1279]54while (($# > 0))
55  do
56  case $1 in
57      "-h") cat <<fin
[783]58manuel complet sur http://...
59Usage :
[1002]60makegcm [options] -m arch exec
61[-h]                       : manuel abrégé
62[-d [[IMx]JMx]LM]          : IM, JM, LM sont les dims en x, y, z (def: $dim)
63[-p PHYS]                  : compilation avec la physique libf/phyPHYS, (def: lmd)
64[-prod / -dev / -debug]    : compilation en mode production (default) / developpement / debug .
65[-c false/MPI1/MPI2]       : couplé océan : MPI1/MPI2/false (def: false)
66[-v false/true]            : avec ou sans végétation (def: false)
[1018]67[-chimie INCA/false]       : avec ou sans model de chimie INCA (def: false)
[1002]68[-parallel none/mpi/omp/mpi_omp] : parallelisation (default: none) : mpi, openmp ou mixte mpi_openmp
69[-g GRI]                   : conf. grille dans dyn3d/GRI_xy.h  (def: reg inclue un zoom)
70[-io IO]                   : choix d'une librairie I/O, experts (def: ioipsl)
[1132]71[-include INCLUDES]        : variables supplementaires pour include
72[-cpp CPP_KEY]             : cle cpp supplementaires
[1002]73[-adjnt]                   : adjoint, a remettre en route ...
74[-filtre NOMFILTRE]        : prend le filtre dans libf/NOMFILTRE (def: filtrez)
75[-link LINKS]              : liens optionels avec d'autres librairies
[1578]76[-fcm_path path]           : chemin pour fcm (def: tools/fcm/bin)
[1279]77[-ext_src path]            : chemin d'un repertoire source avec des sources externe a compiler avec le modele
[1137]78 -arch nom_arch            : nom de l'architecture cible
[1002]79 exec                      : exécutable généré
[783]80fin
[1279]81          exit;;
[783]82
[1279]83      "-d")
84          dim=$2 ; shift ; shift ;;
85     
86      "-O")
87          echo "option obsolete dans cette version intermediaire de makegcm"
88          exit;;
[783]89
[1279]90      "-p")
91          physique="$2" ;  shift ; shift ;;
[783]92
[1279]93      "-g")
94          grille="$2" ; shift ; shift ;;
[783]95
[1279]96      "-c")
97          couple="$2" ; shift ; shift ;;
[783]98
[1279]99      "-prod")
100          compil_mod="prod" ; shift ;;
[1002]101
[1279]102      "-dev")
103          compil_mod="dev" ; shift ;;
[1002]104
[1279]105      "-debug")
106          compil_mod="debug" ; shift ;;
[1002]107
[1279]108      "-io")
109          io="$2" ; shift ; shift ;;
[783]110
[1279]111      "-v")
112          veget="$2" ; shift ; shift ;;
[783]113
[1279]114      "-chimie")
115          chimie="$2" ; shift ; shift ;;
[783]116
[1279]117      "-parallel")
118          parallel="$2" ; shift ; shift ;;
119     
120      "-include")
121          INCLUDE="$INCLUDE -I$2" ; shift ; shift ;;
[783]122
[1279]123      "-cpp")
124          CPP_KEY="$CPP_KEY $2" ; shift ; shift ;;
[1132]125
[1279]126      "-adjnt")
127          echo "otpion a reactiver ";exit
128          opt_dep="$opt_dep adjnt" ; adjnt="-ladjnt -ldyn3d "
129          optim="$optim -Dadj" ; shift ;;
[783]130
[1279]131      "-cosp")
132          cosp="$2" ; shift ; shift ;;
[783]133
134
[1279]135      "-filtre")
136          filtre=$2 ; shift ; shift ;;
[783]137
[1279]138      "-link")
139          LIB="$LIB $2" ; shift ; shift ;;
[1136]140
[1279]141      "-fcm_path")
142          fcm_path=$2 ; shift ; shift ;;
[783]143
[1279]144      "-ext_src")
145          EXT_SRC=$2 ; shift ; shift ;;
[783]146
[1279]147      "-arch")
148          arch=$2 ; shift ; shift ;;
[783]149
[1279]150      *)
151          code="$1" ; shift ;;
152  esac
153done
154
[1136]155###############################################################
156# mettre le chemin du fcm dans le path
157###############################################################
[1578]158export PATH=${fcm_path}:${PATH}
[783]159
[1136]160echo "Chemin du fcm utlise :" 
161which fcm
162
[783]163###############################################################
[1140]164# lecture des chemins propres à l'architecture de la machine #
[783]165###############################################################
[1279]166rm -f .void_file
167echo > .void_file
[1327]168rm -rf .void_dir
169mkdir .void_dir
[1279]170rm -f arch.path
171ln -s arch/arch-${arch}.path ./arch.path
[783]172source arch.path
173
174########################################################################
175# Definition des clefs CPP, des chemins des includes et modules
176#  et des libraries
177########################################################################
178
[1279]179if [[ "$compil_mod" == "prod" ]]
180then
181  COMPIL_FFLAGS="%PROD_FFLAGS"
182elif [[ "$compil_mod" == "dev" ]]
183then
184  COMPIL_FFLAGS="%DEV_FFLAGS"
185elif [[ "$compil_mod" == "debug" ]]
186then
187  COMPIL_FFLAGS="%DEBUG_FFLAGS"
188fi
[783]189
[1279]190if [[ "$physique" != "nophys" ]]
191then
[1615]192   #We'll use some physics
193   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_PHYS"
194   if [[ "${physique:0:3}" == "lmd" ]]
195   then
196   #For lmd physics, default planet type is Earth
[1279]197   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_EARTH"
[1615]198   fi
[1279]199fi
[783]200
[1279]201if [[ "$chimie" == "INCA" ]]
202then
203   CPP_KEY="$CPP_KEY INCA"
204   INCLUDE="$INCLUDE -I${INCA_INCDIR}"
205   LIB="$LIB -L${INCA_LIBDIR} -lchimie"
206fi
[783]207
[1279]208if [[ "$couple" != "false" ]]
209then
210   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_COUPLE"
211   INCLUDE="$INCLUDE -I${OASIS_INCDIR}"
212   LIB="$LIB -L${OASIS_LIBDIR} -lpsmile.${couple} -lmpp_io"
213fi
[783]214
[1279]215if [[ "$parallel" == "mpi" ]]
216then
217   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_PARA CPP_MPI"
218   PARA_FFLAGS="%MPI_FFLAGS"
219   PARA_LD="%MPI_LD"
220elif [[ "$parallel" == "omp" ]]
221then
222   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_PARA CPP_OMP"
223   PARA_FFLAGS="%OMP_FFLAGS"
224   PARA_LD="%OMP_LD"
225elif [[ "$parallel" == "mpi_omp" ]]
226then
227   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_PARA CPP_MPI CPP_OMP"
228   PARA_FFLAGS="%MPI_FFLAGS %OMP_FFLAGS"
229   PARA_LD="%MPI_LD %OMP_LD"
230fi
[783]231
[1279]232if [[ ( "$parallel" == "omp" || "$parallel" == "mpi_omp" ) \
233   && "$compil_mod" == "debug" ]]
234then
235    echo "Usually, parallelization with OpenMP requires some optimization."
236    echo "We suggest switching to \"-dev\"."
237fi
[783]238
[1279]239if [[ "$veget" == "true" ]]
240then
241   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_VEGET"
242   INCLUDE="${INCLUDE} -I${ORCH_INCDIR}"
243   LIB="${LIB} -L${ORCH_LIBDIR} -l${LIBPREFIX}sechiba -l${LIBPREFIX}parameters -l${LIBPREFIX}stomate -l${LIBPREFIX}parallel -l${LIBPREFIX}orglob"
244fi
[783]245
[1279]246if [[ $io == ioipsl ]]
247then
248   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_IOIPSL"
249   INCLUDE="$INCLUDE -I${IOIPSL_INCDIR}"
250   LIB="$LIB -L${IOIPSL_LIBDIR} -l${LIBPREFIX}ioipsl"
251fi
252if [[ "$cosp" == "true" ]]
253then
254   CPP_KEY="$CPP_KEY CPP_COSP"
[1327]255   COSP_PATH="$LIBFGCM/cosp"
[1279]256#   LIB="${LIB} -l${LIBPREFIX}cosp"
257fi
[783]258
[1551]259INCLUDE="$INCLUDE ${NETCDF_INCDIR}"
260LIB="$LIB ${NETCDF_LIBDIR}"
261
[783]262########################################################################
263# calcul du nombre de dimensions
264########################################################################
265
266
[1279]267dim_full=$dim
268dim=`echo $dim | sed -e 's/[^0-9]/ /g'` 
269set $dim
270dimc=$#
[783]271echo calcul de la dimension
272echo dim $dim
273echo dimc $dimc
274
275
276########################################################################
277# Gestion des dimensions du modele.
[1114]278# on cree ou remplace le fichier des dimensions
[783]279########################################################################
280
281cd $LIBFGCM/grid/dimension
[1114]282./makdim $dim
[783]283cat $LIBFGCM/grid/dimensions.h
284cd $LMDGCM
285
286
287########################################################################
288# Differentes dynamiques (3d, 2d, 1d)
289########################################################################
290
[1279]291dimension=`echo $dim | wc -w`
[783]292echo dimension $dimension
293
[1279]294if (( $dimension == 3 ))
295then
[783]296  cd $LIBFGCM/grid
297  \rm fxyprim.h
298  cp -p fxy_${grille}.h fxyprim.h
[1279]299else
300  echo "Probleme dans les dimensions de la dynamique !!"
301  echo "Non reactive pour l'instant !!!"
302fi
[783]303
304######################################################################
305#   Traitement special pour le nouveau rayonnement de Laurent Li.
306#   ---> YM desactive pour le traitemement en parallele
307######################################################################
308
[1279]309#if [[ -f $libf/phy$physique/raddim.h ]]
310#then
311# if [[ -f $libf/phy$physique/raddim.$dimh.h ]]
312#then
[783]313#  \rm -f $libf/phy$physique/raddim.h
314#  cp -p $libf/phy$physique/raddim.$dimh.h $libf/phy$physique/raddim.h
315#  echo $libf/phy$physique/raddim.$dimh.h
316#  cat $libf/phy$physique/raddim.h
317# else
318#  echo On peut diminuer la taille de l executable en creant
319#  echo le fichier $libf/phy$physique/raddim.$dimh.h
320#  \cp -p $libf/phy$physique/raddim.defaut.h $libf/phy$physique/raddim.h
[1279]321# fi
322#fi
[783]323
324######################################################################
325# Gestion du filtre qui n'existe qu'en 3d.
326######################################################################
327
[1279]328if (( `expr $dimc \> 2` == 1 ))
329then
330   filtre="FILTRE=$filtre"
[783]331else
[1279]332   filtre="FILTRE= L_FILTRE= "
333fi
[783]334echo MACRO FILTRE $filtre
335
336echo $dimc
337
338
339
340######################################################################
341# Creation du suffixe de la configuration
342######################################################################
343
344
[1279]345SUFF_NAME=_${dim_full}
346SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_phy${physique}
[783]347
[1279]348if [[ "$parallel" != "none" ]]
349then
350  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_para
351  DYN=dyn${dimc}dpar
[783]352else
[1279]353  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_seq
354  DYN=dyn${dimc}d
355fi
[783]356
[1279]357if [[ $veget == "true" ]]
358then
359  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_orch
360fi
[783]361
[1279]362if [[ $couple != "false" ]]
363then
364  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_couple
365fi
[783]366
[1279]367if [[ $chimie == "INCA" ]]
368then
369  SUFF_NAME=${SUFF_NAME}_inca
370fi
[783]371
372cd $LMDGCM
[1279]373config_fcm="config.fcm"
[783]374rm -f $config_fcm
375touch $config_fcm
376rm -f bin/${code}${SUFF_NAME}.e
377rm -f arch.fcm
[1279]378rm -f arch.opt
[783]379
380echo "%ARCH          $arch"          >> $config_fcm
381echo "%INCDIR        $INCLUDE"       >> $config_fcm 
382echo "%LIB           $LIB"           >> $config_fcm
383echo "%ROOT_PATH     $PWD"           >> $config_fcm
384echo "%LIBF          $LIBFGCM"       >> $config_fcm
385echo "%LIBO          $LIBOGCM"       >> $config_fcm
386echo "%DYN           $DYN"           >> $config_fcm
387echo "%PHYS          phy${physique}" >> $config_fcm
[1327]388echo "%COSP          $COSP_PATH"     >> $config_fcm
[783]389echo "%CPP_KEY       $CPP_KEY"       >> $config_fcm
390echo "%EXEC          $code"          >> $config_fcm
391echo "%SUFF_NAME     $SUFF_NAME"     >> $config_fcm
[1002]392echo "%COMPIL_FFLAGS $COMPIL_FFLAGS" >> $config_fcm
393echo "%PARA_FFLAGS   $PARA_FFLAGS"   >> $config_fcm
394echo "%PARA_LD       $PARA_LD"       >> $config_fcm
[1279]395echo "%EXT_SRC       $EXT_SRC"       >> $config_fcm
[783]396
[1002]397
398
[1137]399ln -s arch/arch-${arch}.fcm arch.fcm
[1279]400if test -f arch/arch-${arch}.opt &&  [ $compil_mod = "prod" ]
401  then
402  ln -s arch/arch-${arch}.opt arch.opt
403else
404  ln -s .void_file arch.opt
405fi
406
407
[1002]408rm -f $LIBOGCM/${arch}${SUFF_NAME}/.config/fcm.bld.lock
[783]409./build_gcm
410
[1279]411rm -rf tmp_src
412rm -rf config
[783]413ln -s $LIBOGCM/${arch}${SUFF_NAME}/.config config
414ln -s $LIBOGCM/${arch}${SUFF_NAME}/.config/tmp tmp_src
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.