1 | #!/bin/bash |
---|
2 | |
---|
3 | ########################################################################### |
---|
4 | # Auteur : Frédéric Hourdin/LMD/hourdin@lmd.jussieu.fr |
---|
5 | # Usage : install.sh |
---|
6 | # |
---|
7 | # Script bash d'installation du modele LMDZ sur un ordinateur PC/Linux |
---|
8 | # en utilisant le compilateur g95. |
---|
9 | # Le modele est récupéré dans une arborescence |
---|
10 | # $MODEL/modipsl/modeles/... |
---|
11 | # en utilisant l'infrastructure "modipsl" mise au point à l'"IPSL" pour |
---|
12 | #les besoins de la modélisation couplée du climat |
---|
13 | #(atmosphere/ocean/vegetation/chimie) |
---|
14 | # On ne récupère ici que les composantes atmosphériques (LMDZ4) |
---|
15 | # et végétation (ORCHIDEE). |
---|
16 | # |
---|
17 | # Sous le répertoire "modeles", on trouve en fait les sources de différents |
---|
18 | # modèles. Ici, LMDZ4, ORCHIDEEet IOIPSL, ensemble de programmes |
---|
19 | # d'entrée/sortie faisant appel à la librairie netcdf. |
---|
20 | # |
---|
21 | # Le script récupères les différents jeux de sources (y compris une |
---|
22 | # version de netcdf) et utilitaires, compile le modèle, et lance une |
---|
23 | # simulation de test dans une configuration très légère sur |
---|
24 | # $MODEL/modipsl/modeles/LMDZ4/INI |
---|
25 | # |
---|
26 | # Pré-requis : g95/pgf90/gfortran, ksh, wget , gunzip, tar, ... (à compléter) |
---|
27 | # |
---|
28 | # Modif 18/11/2011 |
---|
29 | # changement pour l'option real 8. |
---|
30 | # On compile avec -r8 (ou équivalent) et -DNC_DOUBLE pour le GCM |
---|
31 | # mais avec -r4 netcdf. La variable real est initialisée à |
---|
32 | # r4 ou r8 en début de script. |
---|
33 | # |
---|
34 | ########################################################################### |
---|
35 | |
---|
36 | echo '################################################################' |
---|
37 | echo Choix des options d installation |
---|
38 | echo '################################################################' |
---|
39 | |
---|
40 | |
---|
41 | #real=r4 |
---|
42 | real=r8 |
---|
43 | |
---|
44 | # ATTENTION !!!! Pour des versions anterieures a octobre 2009, utiliser |
---|
45 | # install.v2.sh au lieu de install.sh |
---|
46 | |
---|
47 | version=20110921.trunk |
---|
48 | #Chemin pour placer le modele |
---|
49 | MODEL=./LMDZ$version |
---|
50 | |
---|
51 | getlmdzor=1 |
---|
52 | netcdf=1 # 1 for automatic installation |
---|
53 | # 0 for no installation |
---|
54 | # /.../../netcdf-4.0.1 if wanting to link with an already |
---|
55 | # compiled netcdf library (implies to check option compatibility) |
---|
56 | check_linux=1 |
---|
57 | ioipsl=1 |
---|
58 | veget=0 |
---|
59 | bench=1 |
---|
60 | ## compilo=pgf90 ou g95 ou gfortran ou ifort sur PC linux |
---|
61 | compilo=gfortran |
---|
62 | pclinux=1 |
---|
63 | |
---|
64 | ## compile_with_fcm=1 : utilise makelmdz_fcm, possible a partir de la version 20111103.trunk (LMDZ5/trunk rev 1578) |
---|
65 | ## compile_with_fcm=0 : utilise makegcm (default) |
---|
66 | compile_with_fcm=0 |
---|
67 | |
---|
68 | OPTPREC="" |
---|
69 | echo '################################################################' |
---|
70 | echo Choix des options de compilation |
---|
71 | echo '################################################################' |
---|
72 | |
---|
73 | if [ $compilo = g95 ] ; then |
---|
74 | if [ $real = r8 ] ; then OPTPREC="-r8 -DNC_DOUBLE" ; fi |
---|
75 | OPTIM='-i4 -O3' |
---|
76 | elif [ $compilo = gfortran ] ; then |
---|
77 | if [ $real = r8 ] ; then OPTPREC="-fdefault-real-8 -DNC_DOUBLE" ; fi |
---|
78 | OPTIM='-O3' |
---|
79 | elif [ $compilo = pgf90 ] ; then |
---|
80 | if [ $real = r8 ] ; then OPTPREC="-r8 -DNC_DOUBLE" ; fi |
---|
81 | OPTIM='-O2 -Munroll -Mnoframe -Mautoinline -Mcache_align' |
---|
82 | # with pgf90, compile with fcm |
---|
83 | compile_with_fcm=1 |
---|
84 | else |
---|
85 | # ifort |
---|
86 | if [ $real = r8 ] ; then OPTPREC="-real-size 64 -DNC_DOUBLE" ; fi |
---|
87 | OPTIM="-O2 -ip -mkl=sequential -align all -static " |
---|
88 | # with ifort, compile with fcm |
---|
89 | compile_with_fcm=1 |
---|
90 | fi |
---|
91 | OPTIMGCM="$OPTIM $OPTPREC" |
---|
92 | |
---|
93 | # choix de la resolution pour le bench |
---|
94 | # grid_resolution= 32x24x11 for test (test without ORCHIDEE) |
---|
95 | # 96x71x19 standard configuration |
---|
96 | grid_resolution=48x36x19 |
---|
97 | |
---|
98 | hostname=`hostname` |
---|
99 | |
---|
100 | ########################################################################## |
---|
101 | # Dans le cas où on installe sur des machines connues comme la NEC |
---|
102 | # brodie |
---|
103 | # de l'IDRIS, on ne verifie pas les logiciels existants et on n'installe |
---|
104 | # pas netcdf. |
---|
105 | if [ $hostname = brodie ] ; then |
---|
106 | netcdf=0 |
---|
107 | check_linux=0 |
---|
108 | pclinux=0 |
---|
109 | fi |
---|
110 | ########################################################################## |
---|
111 | |
---|
112 | |
---|
113 | mkdir -p $MODEL |
---|
114 | echo $MODEL |
---|
115 | MODEL=`( cd $MODEL ; pwd )` # transformation en chemin absolu si necessaire |
---|
116 | |
---|
117 | |
---|
118 | |
---|
119 | # Le -fendian=big n'est à utiliser vraiment utile que pour ARPEGE1D. |
---|
120 | # Le -r8 doit sans doute être éviter si on veut tourner rapidement sur |
---|
121 | # des machines 32 bits. |
---|
122 | # L'option r8 n'est pas forcement indispensable et elle produit |
---|
123 | # des executables plus gros. |
---|
124 | # Elles est indispensable cependant pour ARPEGE1D |
---|
125 | # On doit pouvoir aussi utiliser des optimisations plus fortes (-O3 par |
---|
126 | # exemple). |
---|
127 | |
---|
128 | |
---|
129 | echo '################################################################' |
---|
130 | if [ "$check_linux" = 1 ] ; then |
---|
131 | echo Test sur les logiciels requis |
---|
132 | echo '################################################################' |
---|
133 | |
---|
134 | #### Ehouarn: test if ksh and/or bash are available |
---|
135 | use_shell="ksh" # default: use ksh |
---|
136 | if [ "`which ksh`" = "" ] ; then |
---|
137 | echo "pas de ksh ... on va utiliser bash" |
---|
138 | use_shell="bash" |
---|
139 | if [ "`which bash`" = "" ] ; then |
---|
140 | echo "Il faut d\'abord installer ksh (ou bash)" |
---|
141 | fi |
---|
142 | fi |
---|
143 | |
---|
144 | |
---|
145 | for logiciel in csh wget tar gzip make $compilo gcc ; do |
---|
146 | if [ "`which $logiciel`" = "" ] ; then |
---|
147 | echo Il faut installer d\'abord $logiciel |
---|
148 | exit |
---|
149 | fi |
---|
150 | done |
---|
151 | |
---|
152 | if [ $pclinux = 1 ] ; then |
---|
153 | cd $MODEL |
---|
154 | cat <<eod> tt.f90 |
---|
155 | print*,'coucou' |
---|
156 | end |
---|
157 | eod |
---|
158 | $compilo tt.f90 |
---|
159 | ./a.out >| tt |
---|
160 | if [ "`cat tt | sed -e 's/ //g' `" != "coucou" ] ; then |
---|
161 | echo probleme avec installation de $compilo ; exit ; fi |
---|
162 | \rm tt a.out tt.f90 |
---|
163 | fi |
---|
164 | fi |
---|
165 | |
---|
166 | ########################################################################### |
---|
167 | |
---|
168 | |
---|
169 | |
---|
170 | if [ $getlmdzor = 1 ] ; then |
---|
171 | echo '##########################################################' |
---|
172 | echo On recupere une version un peu modifiee de LMDZ |
---|
173 | echo '##########################################################' |
---|
174 | cd $MODEL |
---|
175 | wget http://www.lmd.jussieu.fr/~lmdz/DistribG95/modipsl.$version.tar.gz |
---|
176 | gunzip modipsl.$version.tar.gz |
---|
177 | tar xvf modipsl.$version.tar |
---|
178 | \rm modipsl.$version.tar |
---|
179 | |
---|
180 | # On recupere en fait une version du 01 10 2006 obtenue |
---|
181 | # Par un cvs get |
---|
182 | # Puis modifiees pour etre compatible avec la compilation $compilo. |
---|
183 | # et pour betoner ORCHIDEE |
---|
184 | # Cette version est recuperable avec le script |
---|
185 | # wget http://www.lmd.jussieu.fr/~lmdz/DistribG95/getlmdzor.x |
---|
186 | fi |
---|
187 | |
---|
188 | echo OK1 |
---|
189 | |
---|
190 | if [ $netcdf = 1 ] ; then |
---|
191 | echo '##########################################################' |
---|
192 | echo Compilation de netcdf |
---|
193 | echo '##########################################################' |
---|
194 | cd $MODEL |
---|
195 | wget http://www.lmd.jussieu.fr/~lmdz/DistribG95/netcdf-4.0.1.tar.gz |
---|
196 | gunzip netcdf-4.0.1.tar.gz |
---|
197 | tar xvf netcdf-4.0.1.tar |
---|
198 | \rm -f netcdf-4.0.1.tar |
---|
199 | |
---|
200 | cd netcdf-4.0.1 |
---|
201 | |
---|
202 | OPTIMNC=$OPTIM |
---|
203 | if [ $compilo = g95 ] ; then |
---|
204 | # On modifie les options de compilation |
---|
205 | export FC=g95 |
---|
206 | export F90=g95 |
---|
207 | export F90FLAGS=" -cpp -ffree-form $OPTIMNC" |
---|
208 | export FFLAGS=" -cpp $OPTIMNC" |
---|
209 | export CPPFLAGS=-Df2cFortran |
---|
210 | export CC=gcc |
---|
211 | export CXX=g++ |
---|
212 | elif [ $compilo = gfortran ] ; then |
---|
213 | export FC=gfortran |
---|
214 | export F90=gfortran |
---|
215 | export F90FLAGS=" -ffree-form $OPTIMNC" |
---|
216 | export FFLAGS=" $OPTIMNC" |
---|
217 | export CPPFLAGS= |
---|
218 | export CC=gcc |
---|
219 | export CXX=g++ |
---|
220 | elif [ $compilo = pgf90 ] ; then |
---|
221 | export CPPFLAGS="-DNDEBUG -DpgiFortran" |
---|
222 | export CC=pgcc |
---|
223 | export CFLAGS="-Msignextend" |
---|
224 | export CXX=pgCC |
---|
225 | export CXXFLAGS="-Msignextend" |
---|
226 | export FC=pgf90 |
---|
227 | export FFLAGS="$OPTIMNC" |
---|
228 | export F90=pgf90 |
---|
229 | export F90FLAGS="$OPTIMNC" |
---|
230 | elif [ $compilo = ifort ] ; then |
---|
231 | export CPP="icc -E" |
---|
232 | export F77=ifort |
---|
233 | export FFLAGS="-O2 -ip -fpic -mcmodel=large" |
---|
234 | export F90=ifort |
---|
235 | export FCFLAGS="-O2 -ip -fpic -mcmodel=large" |
---|
236 | export CC=icc |
---|
237 | export CFLAGS="-O2 -ip -fpic -mcmodel=large" |
---|
238 | export CXX=icpc |
---|
239 | export CXXFLAGS="-O2 -ip -fpic -mcmodel=large" |
---|
240 | else |
---|
241 | echo Le compilateur $compilo pas prevu ; exit |
---|
242 | fi |
---|
243 | ## end of if [ $netcdf = 1 ] |
---|
244 | cd src |
---|
245 | |
---|
246 | ### Correction d'un petit probleme de netcdf |
---|
247 | ##sed -e '83s/^$/\#define f2cFortran/' cfortran.h >| tmp ; \mv tmp cfortran.h |
---|
248 | |
---|
249 | # Compilation |
---|
250 | # Modif du 6 juillet 2009. Plantage quand on essaie de compiler netcdf avec |
---|
251 | # gcc plutôt que c++ |
---|
252 | ##sed -e 's/ c++/ gcc/g' configure >| tmp ; mv -f tmp configure ; chmod +x configure |
---|
253 | localdir=`pwd -P` |
---|
254 | ./configure --prefix=$localdir |
---|
255 | make check |
---|
256 | make install |
---|
257 | fi |
---|
258 | |
---|
259 | echo OK2 ioipsl=$ioipsl |
---|
260 | echo '##########################################################' |
---|
261 | echo Installation de MODIPSL, la procedure d\'installation des |
---|
262 | echo modeles de l\'IPSL |
---|
263 | echo '##########################################################' |
---|
264 | |
---|
265 | if [ $netcdf = 0 -o $netcdf = 1 ] ; then |
---|
266 | ncdfdir=$MODEL/netcdf-4.0.1 |
---|
267 | else |
---|
268 | ncdfdir=$netcdf |
---|
269 | fi |
---|
270 | |
---|
271 | if [ $ioipsl = 1 ] ; then |
---|
272 | cd $MODEL/modipsl |
---|
273 | \rm -r lib/* |
---|
274 | |
---|
275 | cd util |
---|
276 | |
---|
277 | if [ $compilo = pgf90 ] ; then |
---|
278 | fmod='module ' |
---|
279 | elif [ $compilo = g95 ] ; then |
---|
280 | fmod='fmod=' |
---|
281 | elif [ $compilo = ifort ] ; then |
---|
282 | fmod='module ' |
---|
283 | else # gfortran |
---|
284 | fmod='I ' |
---|
285 | fi |
---|
286 | cp AA_make.gdef AA_make.orig |
---|
287 | sed -e 's/^\#.*.g95.*.\#.*.$/\#/' AA_make.gdef > tmp |
---|
288 | sed -e "s:F_L = g95:F_L = $compilo:" -e "s:F_C = g95 -c:F_C = $compilo -c": \ |
---|
289 | -e 's/g95.*.w_w.*.(F_D)/g95 w_w = '"$OPTIMGCM"'/' \ |
---|
290 | -e 's:g95.*.NCDF_INC.*.$:g95 NCDF_INC= '"$ncdfdir"'/include:' \ |
---|
291 | -e 's:g95.*.NCDF_LIB.*.$:g95 NCDF_LIB= -L'"$ncdfdir"'/lib -lnetcdf:' \ |
---|
292 | -e "s:-fmod=:-$fmod:" -e 's/-fno-second-underscore//' \ |
---|
293 | -e 's:#-Q- g95 M_K = gmake:#-Q- g95 M_K = make:' \ |
---|
294 | tmp >| AA_make.gdef |
---|
295 | |
---|
296 | |
---|
297 | if [ "$use_shell" = "ksh" ] ; then |
---|
298 | if [ "$pclinux" = 1 ] ; then |
---|
299 | ./ins_make -t g95 # On utilise les lignes g95 meme pour les autres compilo |
---|
300 | fi |
---|
301 | else # bash |
---|
302 | sed -e s:/bin/ksh:/bin/bash:g ins_make > ins_make.bash |
---|
303 | chmod u=rwx ins_make.bash |
---|
304 | if [ "$pclinux" = 1 ] ; then |
---|
305 | ./ins_make.bash -t g95 # On utilise les lignes g95 meme pour les autres compilo |
---|
306 | else |
---|
307 | ./ins_make.bash |
---|
308 | fi |
---|
309 | fi |
---|
310 | |
---|
311 | echo '##########################################################' |
---|
312 | echo Compilation de IOIPSL, bibliotheque d\'interface avec Netcd |
---|
313 | echo '##########################################################' |
---|
314 | |
---|
315 | cd $MODEL/modipsl/modeles/IOIPSL/src |
---|
316 | if [ "$use_shell" = "bash" ] ; then |
---|
317 | cp Makefile Makefile.ksh |
---|
318 | sed -e s:/bin/ksh:/bin/bash:g Makefile.ksh > Makefile |
---|
319 | fi |
---|
320 | if [ "$pclinux" = 1 ] ; then |
---|
321 | # Build IOIPSL modules and library |
---|
322 | make clean |
---|
323 | make |
---|
324 | if [ $compilo = gfortran ] ; then # copy module files to lib |
---|
325 | cp -f *.mod ../../../lib |
---|
326 | fi |
---|
327 | # Build IOIPSL tools (ie: "rebuild", if present) |
---|
328 | if [ -f $MODEL/modipsl/modeles/IOIPSL/tools/rebuild ] ; then |
---|
329 | cd $MODEL/modipsl/modeles/IOIPSL/tools |
---|
330 | # adapt Makefile & rebuild script if in bash |
---|
331 | if [ "$use_shell" = "bash" ] ; then |
---|
332 | cp Makefile Makefile.ksh |
---|
333 | sed -e s:/bin/ksh:/bin/bash:g Makefile.ksh > Makefile |
---|
334 | cp rebuild rebuild.ksh |
---|
335 | sed -e 's:/bin/ksh:/bin/bash:g' \ |
---|
336 | -e 's:print -u2:echo:g' \ |
---|
337 | -e 's:print:echo:g' rebuild.ksh > rebuild |
---|
338 | fi |
---|
339 | make clean |
---|
340 | make |
---|
341 | fi |
---|
342 | else |
---|
343 | # we're on brodie |
---|
344 | sxgmake clean |
---|
345 | sxgmake |
---|
346 | fi |
---|
347 | |
---|
348 | if [ "$veget" = 1 ] ; then |
---|
349 | echo '########################################################' |
---|
350 | echo Compilation de ORCHIDEE, modele des surface continentales |
---|
351 | echo '########################################################' |
---|
352 | cd $MODEL/modipsl/modeles/ORCHIDEE |
---|
353 | cd src_parameters |
---|
354 | # Une petite astuce pour ORCHIDEE suivant qu'on est en real*4 ou real*8 |
---|
355 | |
---|
356 | |
---|
357 | \cp reqdprec.$real reqdprec.f90 |
---|
358 | make |
---|
359 | if [ $compilo = gfortran ] ; then # copy module files to lib |
---|
360 | cp -f *.mod ../../../lib |
---|
361 | fi |
---|
362 | cd ../src_stomate |
---|
363 | make |
---|
364 | if [ $compilo = gfortran ] ; then # copy module files to lib |
---|
365 | cp -f *.mod ../../../lib |
---|
366 | fi |
---|
367 | cd ../src_sechiba |
---|
368 | make |
---|
369 | if [ $compilo = gfortran ] ; then # copy module files to lib |
---|
370 | cp -f *.mod ../../../lib |
---|
371 | fi |
---|
372 | fi |
---|
373 | fi |
---|
374 | |
---|
375 | |
---|
376 | # Ehouarn: it may be directory LMDZ4 or LMDZ5 depending on tar file... |
---|
377 | if [[ -d $MODEL/modipsl/modeles/LMDZ4 ]] ; then |
---|
378 | echo '##########################################################' |
---|
379 | echo 'Compilation de LMDZ4' |
---|
380 | echo '##########################################################' |
---|
381 | cd $MODEL/modipsl/modeles/LMDZ4 |
---|
382 | else |
---|
383 | if [[ -d $MODEL/modipsl/modeles/LMDZ5 ]] ; then |
---|
384 | echo '##########################################################' |
---|
385 | echo 'Compilation de LMDZ5' |
---|
386 | echo '##########################################################' |
---|
387 | cd $MODEL/modipsl/modeles/LMDZ5 |
---|
388 | else |
---|
389 | echo "ERROR: No LMDZ4 (or LMDZ5) directory !!!" |
---|
390 | exit |
---|
391 | fi |
---|
392 | fi |
---|
393 | |
---|
394 | if [ "$pclinux" = 1 ] ; then |
---|
395 | if [ $compilo = gfortran ] ; then |
---|
396 | sed \ |
---|
397 | -e 's:\#setenv NCDFINC.*.$:setenv NCDFINC '"$ncdfdir"'/include:' \ |
---|
398 | -e 's:\#setenv NCDFLIB.*.$:setenv NCDFLIB '"$ncdfdir"'/lib:' \ |
---|
399 | -e 's:setenv NCDFINC.*.$:setenv NCDFINC '"$ncdfdir"'/include:' \ |
---|
400 | -e 's:setenv NCDFLIB.*.$:setenv NCDFLIB '"$ncdfdir"'/lib:' \ |
---|
401 | -e 's/set FC_LINUX.*.$/set FC_LINUX='$compilo'/' \ |
---|
402 | -e 's/g95/gfortran/g' \ |
---|
403 | -e 's/-fmod=/-I/g' \ |
---|
404 | -e 's/-fno-second-underscore//' -e 's/-fstatic//' \ |
---|
405 | -e 's/-lparallel//' \ |
---|
406 | -e 's/-lorglob//' \ |
---|
407 | -e 's/-ffixed-form//' -e 's/-ffree-form//' \ |
---|
408 | -e 's/set OPT_LINUX.*.$/set OPT_LINUX=\"'"$OPTIMGCM"\"'/' makegcm.orig >| makegcm |
---|
409 | elif [ $compilo = ifort ] ; then |
---|
410 | sed \ |
---|
411 | -e 's:\#setenv NCDFINC.*.$:setenv NCDFINC '"$ncdfdir"'/include:' \ |
---|
412 | -e 's:\#setenv NCDFLIB.*.$:setenv NCDFLIB '"$ncdfdir"'/lib:' \ |
---|
413 | -e 's:setenv NCDFINC.*.$:setenv NCDFINC '"$ncdfdir"'/include:' \ |
---|
414 | -e 's:setenv NCDFLIB.*.$:setenv NCDFLIB '"$ncdfdir"'/lib:' \ |
---|
415 | -e 's/set FC_LINUX.*.$/set FC_LINUX='$compilo'/' \ |
---|
416 | -e 's/g95/ifort/g' \ |
---|
417 | -e 's/-fmod=/-module /g' \ |
---|
418 | -e 's/-fno-second-underscore//' -e 's/-fstatic//' \ |
---|
419 | -e 's/-lparallel//' \ |
---|
420 | -e 's/-lorglob//' \ |
---|
421 | -e 's/-ffixed-form//' -e 's/-ffree-form//' \ |
---|
422 | -e 's/set OPT_LINUX.*.$/set OPT_LINUX=\"'"$OPTIMGCM"\"'/' makegcm.orig >| makegcm |
---|
423 | else # g95 or pgf90 |
---|
424 | sed \ |
---|
425 | -e 's:\#setenv NCDFINC.*.$:setenv NCDFINC '"$ncdfdir"'/include:' \ |
---|
426 | -e 's:\#setenv NCDFLIB.*.$:setenv NCDFLIB '"$ncdfdir"'/lib:' \ |
---|
427 | -e 's:setenv NCDFINC.*.$:setenv NCDFINC '"$ncdfdir"'/include:' \ |
---|
428 | -e 's:setenv NCDFLIB.*.$:setenv NCDFLIB '"$ncdfdir"'/lib:' \ |
---|
429 | -e 's/set FC_LINUX.*.$/set FC_LINUX='$compilo'/' \ |
---|
430 | -e 's/-fno-second-underscore//' -e 's/-fstatic//' \ |
---|
431 | -e 's/-lparallel//' \ |
---|
432 | -e 's/-lorglob//' \ |
---|
433 | -e 's/-ffixed-form//' -e 's/-ffree-form//' \ |
---|
434 | -e 's/set OPT_LINUX.*.$/set OPT_LINUX=\"'"$OPTIMGCM"\"'/' makegcm.orig >| makegcm |
---|
435 | fi |
---|
436 | else |
---|
437 | sed \ |
---|
438 | -e 's/-lparallel//' \ |
---|
439 | -e 's/-lorglob//' \ |
---|
440 | -e 's/-lsxorglob//' \ |
---|
441 | -e 's/-lsxparallel//' \ |
---|
442 | -e 's/-lsxioipsl/-lioipsl/g' \ |
---|
443 | makegcm.orig >| makegcm |
---|
444 | fi |
---|
445 | |
---|
446 | chmod +x makegcm |
---|
447 | |
---|
448 | ########################################################### |
---|
449 | # Pour ceux qui voudraient utiliser fcm et pouvoir faire : |
---|
450 | # makelmdz_fcm -arch local ..... |
---|
451 | ############################################################ |
---|
452 | |
---|
453 | if [ "$pclinux" = 1 ] ; then |
---|
454 | # creation de fichiers 'arch' locaux (si sur PC Linx): |
---|
455 | cd arch |
---|
456 | # fichier arch-local.path |
---|
457 | echo "NETCDF_LIBDIR=\"-L${ncdfdir}/lib -lnetcdf\"" > arch-local.path |
---|
458 | echo "NETCDF_INCDIR=-I${ncdfdir}/include" >> arch-local.path |
---|
459 | echo 'IOIPSL_INCDIR=$LMDGCM/../../lib' >> arch-local.path |
---|
460 | echo 'IOIPSL_LIBDIR=$LMDGCM/../../lib' >> arch-local.path |
---|
461 | echo 'ORCH_INCDIR=$LMDGCM/../../lib' >> arch-local.path |
---|
462 | echo 'ORCH_LIBDIR=$LMDGCM/../../lib' >> arch-local.path |
---|
463 | # fichier arch-local.fcm (adaptation de arch-linux-32bit.fcm) |
---|
464 | if [ $compilo = g95 ] ; then |
---|
465 | sed -e s:"%COMPILER pgf95":"%COMPILER g95":1 \ |
---|
466 | -e s:"%LINK pgf95":"%LINK g95":1 \ |
---|
467 | -e s:"%PROD_FFLAGS -fast":"%PROD_FFLAGS $OPTIM":1 \ |
---|
468 | -e s:"%BASE_FFLAGS ":"%BASE_FFLAGS $OPTPREC":1 \ |
---|
469 | arch-linux-32bit.fcm > arch-local.fcm |
---|
470 | if [ $real = r8 ] ; then |
---|
471 | sed -e s:"%FPP_DEF ":"%FPP_DEF NC_DOUBLE":1 \ |
---|
472 | arch-local.fcm > arch-local.fcm.new |
---|
473 | mv -f arch-local.fcm.new arch-local.fcm |
---|
474 | fi |
---|
475 | elif [ $compilo = gfortran ] ; then |
---|
476 | sed -e s:"%COMPILER pgf95":"%COMPILER gfortran":1 \ |
---|
477 | -e s:"%LINK pgf95":"%LINK gfortran":1 \ |
---|
478 | -e s:"%PROD_FFLAGS -fast":"%PROD_FFLAGS $OPTIM":1 \ |
---|
479 | -e s:"%BASE_FFLAGS ":"%BASE_FFLAGS $OPTPREC":1 \ |
---|
480 | arch-linux-32bit.fcm > arch-local.fcm |
---|
481 | if [ $real = r8 ] ; then |
---|
482 | sed -e s:"%FPP_DEF ":"%FPP_DEF NC_DOUBLE":1 \ |
---|
483 | arch-local.fcm > arch-local.fcm.new |
---|
484 | mv -f arch-local.fcm.new arch-local.fcm |
---|
485 | fi |
---|
486 | elif [ $compilo = pgf90 ] ; then |
---|
487 | sed -e s:"-Wl,-Bstatic -L/usr/lib/gcc-lib/i386-linux/2.95.2":" ":1 \ |
---|
488 | -e s:"%PROD_FFLAGS -fast":"%PROD_FFLAGS $OPTIM":1 \ |
---|
489 | -e s:"%BASE_FFLAGS ":"%BASE_FFLAGS $OPTPREC":1 \ |
---|
490 | arch-linux-32bit.fcm > arch-local.fcm |
---|
491 | if [ $real = r8 ] ; then |
---|
492 | sed -e s:"%FPP_DEF ":"%FPP_DEF NC_DOUBLE":1 \ |
---|
493 | arch-local.fcm > arch-local.fcm.new |
---|
494 | mv -f arch-local.fcm.new arch-local.fcm |
---|
495 | fi |
---|
496 | elif [ $compilo = ifort ] ; then |
---|
497 | sed -e s:"%COMPILER pgf95":"%COMPILER ifort":1 \ |
---|
498 | -e s:"%LINK pgf95":"%LINK ifort":1 \ |
---|
499 | -e s:"-Wl,-Bstatic -L/usr/lib/gcc-lib/i386-linux/2.95.2":" ":1 \ |
---|
500 | -e s:"%PROD_FFLAGS -fast":"%PROD_FFLAGS $OPTIM":1 \ |
---|
501 | -e s:"%BASE_FFLAGS ":"%BASE_FFLAGS $OPTPREC":1 \ |
---|
502 | -e s:"%DEBUG_FFLAGS -g -O0 -Kieee -Ktrap=fp -Mbounds":"%DEBUG_FFLAGS -g -no-ftz -traceback -ftrapuv -fp-stack-check -check":1 \ |
---|
503 | arch-linux-32bit.fcm > arch-local.fcm |
---|
504 | if [ $real = r8 ] ; then |
---|
505 | sed -e s:"%FPP_DEF ":"%FPP_DEF NC_DOUBLE":1 \ |
---|
506 | arch-local.fcm > arch-local.fcm.new |
---|
507 | mv -f arch-local.fcm.new arch-local.fcm |
---|
508 | fi |
---|
509 | else |
---|
510 | echo Le compilateur $compilo pas prevu ; exit |
---|
511 | fi # of if [ $compilo = g95 ] elif [ $compilo = pgf90 ] |
---|
512 | cd .. |
---|
513 | ### Adaptation de "bld.cfg" (ajout du shell): |
---|
514 | whereisthatshell=$(which ${use_shell}) |
---|
515 | echo "bld::tool::SHELL $whereisthatshell" >> bld.cfg |
---|
516 | |
---|
517 | ### Modification de makelmdz_fcm pour utilisation de ORCHIDEE dans cette bench: |
---|
518 | ### on enleve liborglob.a et libparallel.a |
---|
519 | cp makelmdz_fcm makelmdz_fcm.orig |
---|
520 | sed -e "s/-l\${LIBPREFIX}parallel//" \ |
---|
521 | sed -e "s/-l\${LIBPREFIX}orglob//" \ |
---|
522 | makelmdz_fcm.orig > makelmdz_fcm |
---|
523 | |
---|
524 | fi # of if [ "$pclinux" = 1 ] |
---|
525 | |
---|
526 | ################################################################## |
---|
527 | # Lance compilation de LMDZ |
---|
528 | ################################################################## |
---|
529 | ok_veget=false |
---|
530 | if [ "$veget" = 1 ] ; then ok_veget = true; fi |
---|
531 | if [ $compile_with_fcm = 1 ] ; then |
---|
532 | # Compilation avec makelmdz_fcm |
---|
533 | ./makelmdz_fcm -d ${grid_resolution} -arch local -v $ok_veget gcm |
---|
534 | else |
---|
535 | # Compilation avec makegcm: |
---|
536 | # 3 times! because some dependecies are not well resolved with makegcm |
---|
537 | ./makegcm -d ${grid_resolution} -v $ok_veget gcm |
---|
538 | ./makegcm -d ${grid_resolution} -v $ok_veget gcm |
---|
539 | ./makegcm -d ${grid_resolution} -v $ok_veget gcm |
---|
540 | fi |
---|
541 | |
---|
542 | if [ -f gcm.e ] || [ -f bin/gcm_${grid_resolution}_phylmd_seq_orch.e ] || [ -f bin/gcm_${grid_resolution}_phylmd_seq.e ] ; then |
---|
543 | echo '##########################################################' |
---|
544 | echo Compilation reussie |
---|
545 | echo '##########################################################' |
---|
546 | else |
---|
547 | echo Probleme de compilation |
---|
548 | exit |
---|
549 | fi |
---|
550 | |
---|
551 | ################################################################## |
---|
552 | # Ci dessous le lancement eventuel d'un cas test (si bench=0) |
---|
553 | ################################################################## |
---|
554 | if [ $bench = 0 ] ; then |
---|
555 | exit |
---|
556 | fi |
---|
557 | |
---|
558 | echo '##########################################################' |
---|
559 | echo Lancement d\'une simulation de test |
---|
560 | echo '##########################################################' |
---|
561 | |
---|
562 | \rm -r BENCH${grid_resolution} |
---|
563 | bench=bench_lmdz_${grid_resolution} |
---|
564 | wget http://www.lmd.jussieu.fr/~lmdz/DistribG95/$bench.tar.gz |
---|
565 | gunzip $bench.tar.gz |
---|
566 | tar xvf $bench.tar |
---|
567 | |
---|
568 | if [ -f gcm.e ] ; then |
---|
569 | cp gcm.e BENCH${grid_resolution}/ |
---|
570 | elif [ -f bin/gcm_${grid_resolution}_phylmd_seq_orch.e ] ; then |
---|
571 | cp bin/gcm_${grid_resolution}_phylmd_seq_orch.e BENCH${grid_resolution}/gcm.e |
---|
572 | elif [ -f bin/gcm_${grid_resolution}_phylmd_seq.e ] ; then |
---|
573 | cp bin/gcm_${grid_resolution}_phylmd_seq.e BENCH${grid_resolution}/gcm.e |
---|
574 | else |
---|
575 | echo "No gcm.e found" |
---|
576 | exit |
---|
577 | fi |
---|
578 | |
---|
579 | if [ $hostname = brodie ] ; then |
---|
580 | echo POUR LANCER LE BENCH, IL FAUT SE LOGUER SUR BRODIE01 |
---|
581 | echo puis aller sur `pwd`/BENCH${grid_resolution} |
---|
582 | echo et lancer le gcm |
---|
583 | exit |
---|
584 | fi |
---|
585 | |
---|
586 | cd BENCH${grid_resolution} |
---|
587 | ./bench.sh > bench.out 2>&1 |
---|
588 | |
---|
589 | echo '##########################################################' |
---|
590 | echo ' Resultat du bench ' |
---|
591 | echo '##########################################################' |
---|
592 | |
---|
593 | cat ./bench.out |
---|
594 | |
---|
595 | echo '##########################################################' |
---|
596 | echo 'La simulation test est terminee sur' `pwd` |
---|
597 | echo 'vous pouvez la relancer : cd ' `pwd` ' ; gcm.e' |
---|
598 | echo 'ou ./bench.sh' |
---|
599 | echo '##########################################################' |
---|
600 | |
---|