source: BOL/Multi_atlas/make_html_libigcm.sh @ 3940

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Changements PATHS ciclad, runs.txt et sed HTML
Ajout possibilite acces simulations sur l espace "SE" dans cmor.sh
Ajout acces OBS a partir de l espace fabric multi_ZONE.sh
IM
  • Property svn:executable set to *
File size: 10.3 KB
Line 
1#!/bin/bash
2# AI mai 2020
3# A REFAIRE PROPREMENT
4# A NETTOYER, ADAPTER AUX AUTRES MACHINES
5
6###########################################################################
7###########################################################################
8# Traitement d'une serie d'experiences se trouvant sur le repertoire
9# $ROOTSTORAGE/$EXPNAME
10# L'organisation des fichiers suit celle de libIGCM
11# Une simulation sera par exemple stokÃee sur
12# $ROOTSTORAGE/$EXPNAME/${run}/ATM/Analyse/${run}_SE_1980_1986_1M_hitsmth.nc
13#                             /ATLAS/Analyse/SE/${run}_base
14# le script cree eventuellement les atlas si ils n'existent pas
15# calcule les valeurs inglobales (flux au sommet, prÃecip ...)
16# publie l'ensemble sur DODS
17# et cree un fichier html pointant vers cette arborescence dods.
18###########################################################################
19###########################################################################
20module load ferret
21
22#set -x
23
24
25comp=COMP
26
27helptext="
28        --help Ce manuel
29        --run Nom de la simulation
30        --id  Nom du repertoire contenant la simuation a partir de $STORAGE
31        --wd  Nom du repetoire temporaire
32        --origwww Au cas ou les simulations viennent d ailleurs
33"
34
35while test -n "${1}"; do
36  case "${1}" in
37        --help) echo "$helptext";
38            exit 0;;
39        --comp) comp="${2}"
40                 shift;;
41        --id) CONFIGNAME="${2}"
42                 shift;;
43        --wd) ROOTWORK="${2}"
44                 shift;;
45        --origwww) ROOTWEBORIG="${2}"
46                 shift;;
47        *) echo "make_se.sh: argument non reconnu ${1}"; exit 1;;
48  esac
49  shift
50done
51
52local=`pwd -P`
53
54login=`whoami`
55hostname=`hostname`
56if [ ${hostname:0:5} = cicla ] ; then
57DODSDIR=/thredds/ipsl
58HTML=http://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/$login/lmdz/MultiSimu/$comp
59machine=ciclad
60fi
61if [ ${hostname:0:5} = camel ] ; then
62DODSDIR=/thredds/ipsl
63fi
64if [ ${hostname:0:5} = irene ] ; then
65DODSDIR=
66fi
67if [ ${hostname:0:5} = jean- ] ; then
68DODSDIR=
69fi
70
71tmpdir=$DODSDIR/$login/lmdz
72EXPNAME=B96x95x39/V20090611.dev/
73ROOTWORK=$tmpdir
74ROOTWEBORIG=""
75EXPNAME=IGCM_OUT/$CONFIGNAME/DEVT/clim
76
77STORAGE=$ARCHIVE
78put=mfput
79ROOTWEBatlas=http://dods.idris.fr/$LOGNAME/$EXPNAME
80HTML_D=$ROOTSTORAGE/HTML
81
82if [ "$machine" = "ciclad" ] ; then
83EXPNAME=NPV5LRL79
84put=cp
85CICLAD=$DODSDIR/$login/lmdz
86ARCHIVE=$CICLAD/STORE
87workdir=$CICLAD/WORK
88STORAGE=$CICLAD
89ROOTWEBatlas=http://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/$login/lmdz/STORE/$EXPNAME
90MULTIDIR=$DODSDIR/$login/lmdz/MultiSimu
91COMP_D=$MULTIDIR/$comp
92DEF_FILE=$COMP_D/def.txt
93HTML_D=$COMP_D
94runstxt=$local/runs.txt
95fi
96
97
98ROOTSTORAGE=$ARCHIVE/$EXPNAME
99ROOTDODS=DODS/pub/$LOGNAME/$CONFIGNAME
100ROOTWEB="http://dodsp.idris.fr/$LOGNAME/$EXPNAME"
101ROOTWEB_PRODout=https://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/catalog/store_thredds/aidel/LMDZOR/DEVT/clim
102STOREWEB_PROD=http://esgf.extra.cea.fr/thredds/catalog/store_thredds/aidel/IGCM_OUT/LMDZOR/DEVT/clim
103STOREWEB_PRODold=http://esgf.extra.cea.fr/thredds/catalog/store/aidel/IGCM_OUT/LMDZOR/DEVT/clim
104if [ "$ROOTWEBORIG" = "" ] ; then
105ROOTWEBORIG=ROOTWEBlibigcm
106fi
107
108echo ROOTSTORAGE $ROOTSTORAGE ROOTWEB $ROOTWEB
109 
110glob=1
111
112# Version Abderrahmane/centres de caclcul
113listevar="bils fnet tops topl topl0 crfsw crflw crfnet eva pr prw "
114# Version ciclad multi-atlas
115listevar="bils rt   rst  rlut rlutcs  crest crelt cret eva pr prw "
116listevalvar="7.097 0.7823 240.4 239.6 269.4 -47.05 29.84 -17.21 3.415 2.61 27.46 "
117
118
119###########################################################################
120# CREATION DE L'ENTETE DU FICHIER html
121###########################################################################
122
123# Horrible astuce pour controler a peu pres la longueur des chaines
124# de caractere pour la description des simus
125longn=`wc -lc $DEF_FILE | awk ' { print int ( $2 / $1 / 2 ) } '`
126longc="" ; i=0 ; while [ $i != $longn ] ; do (( i = $i + 1 )) ; longc="$longc"_ ; done
127
128if [ ! -d $STORAGE/HTML ] ; then mkdir -p $STORAGE/HTML ; fi
129htmlfile=$STORAGE/HTML/tmp.html   ; rm -f $htmlfile ; touch $htmlfile
130errfile=$STORAGE/HTML/tmphtml$$.err ; rm -f $errfile  ; touch $errfile
131D_work=$ROOTWORK/tmp_makehtml$$ ; rm -rf $D_work ; mkdir -p $D_work
132emptyelt='<td> - </td>'
133cat <<eod>| $htmlfile
134<table cellpadding="2" cellspacing="2" border="1"
135 style="text-align: left; width: 100px; margin-left: auto;
136margin-right: auto;">
137<tr>
138<td><a href="$HTML/def.txt"> RUN (link to outputs)  </a></td>
139<td> Atlas YEAR</td>
140<td> Atlas --DJF-- </td>
141<td> Atlas --JJA-- </td>
142<td> Description of the simulation $longc </td>
143<td> Period </td>
144<td> Name (link to parameters) </td>
145eod
146
147if [ $glob = 1 ] ; then
148   for var in $listevar ; do
149      echo '<td> '$var' </td>' >> $htmlfile
150   done
151fi
152
153################CLIMATOS##################################################
154echo '<tr>' >> $htmlfile
155echo "<td> CLIMATOS </td>" >> $htmlfile
156echo "<td>        </td>" >> $htmlfile
157echo "<td>        </td>" >> $htmlfile
158echo "<td>        </td>" >> $htmlfile
159echo "<td>        </td>" >> $htmlfile
160echo "<td>        </td>" >> $htmlfile
161echo "<td>        </td>" >> $htmlfile
162if [ $glob = 1 ] ; then
163   for var in $listevalvar ; do
164      echo '<td> '$var' </td>' >> $htmlfile
165   done
166fi
167echo '<tr>' >> $htmlfile
168
169lc=`wc -l $DEF_FILE | awk ' { print $1 } '`
170ll=1
171###########################################################################
172# DEBUT DE LA BOUCLE SUR LES SIMULATIONS
173while [ $ll -le $lc ] ; do
174#for sim in `awk ' {print $1} ' $DEF_FILE` ; do
175    line=`sed -n -e ${ll}p $DEF_FILE`
176    sim=`echo $line | awk ' { print $1 } '`
177    simdir=`grep -w "^$sim "  $runstxt | awk ' { print $2 } '`
178    run=`basename $simdir `
179    years=`echo $line | awk ' { print $2 } '`
180    yearsb=`echo $years | sed -e 's/_/-/'`
181    echo run $run
182    echo '<tr>' >> $htmlfile
183###########################################################################
184
185
186
187NCFILE=${run}_SE_${years}_1M_histmth.nc
188
189#--------------------------------------------------------------------------
190# Liens vers les fichiers, monitoring et atlas
191#--------------------------------------------------------------------------
192    echo "<td><a href=\"$ROOTWEB_PRODout/"$run"/catalog.html\"> "$sim" </a></td>" >> $htmlfile
193
194D_SE=$run/ATM/Analyse/SE
195
196echo OK0
197#    if [ -f "$ROOTSTORAGE/$D_SE/$NCFILE" ] ; then
198     if [ 1 = 1 ] ; then
199
200            for SEAS in YEAR DJF JJA ; do
201               echo '<td>' >> $htmlfile
202               for PROJ in GLOB NH SH ; do
203                 atlas=index_${PROJ}_${SEAS}_${run}_$years.html
204                 echo Chemin atlas
205                 echo $COMP_D/ATLAS/$atlas
206                 if [ -f $COMP_D/ATLAS/$atlas ] ; then
207                     atlasf=$COMP_D/ATLAS/$atlas
208                 else # Ancienne version des scripts d'atlas :
209                     atlasf=$ROOTSTORAGE/$run/ATLAS/SE_$years/ATM/$atlas
210                 fi
211# ATTENTION A REFAIRE EN FONCTION DE LA MACHINE
212                 atlas_html=`echo $atlasf | sed -e 's:/thredds/ipsl/:http\://vesg.ipsl.upmc.fr/thredds/fileServer/IPSLFS/:'`
213                 echo atlas_html $atlas_html
214                 echo atlasf $atlasf
215                 if [ -f $atlasf ] ; then
216                    echo "<a href=\"$atlas_html\"> ${PROJ:0:1} </a>"
217                    echo "<a href=\"$atlas_html\"> ${PROJ:0:1} </a>" >> $htmlfile
218                 else
219                    echo "-" >> $htmlfile
220                    echo Le fichier $atlas_html n\'existe pas
221                 fi
222               done
223               echo '</td>' >> $htmlfile
224            done
225
226
227#--------------------------------------------------------------------------
228    else # Cas ou le fichier histmth.nc n est pas present
229#--------------------------------------------------------------------------
230        echo Le fichier $ROOTSTORAGE/"$run"/$D_SE/$NCFILE n\'existe pas >> $errfile
231        for i in 1 2 3 ; do
232            echo "$emptyelt" >> $htmlfile
233        done
234    fi
235
236# Parametres testes par rapport a la simulation de Ref
237    grep "^$sim "  $DEF_FILE | grep $years | sed -e 's/'$years'//' -e 's/'$sim'/<td>/' -e 's/$/<\/td>/' >> $htmlfile
238    echo '<td> '$years' </td>' >> $htmlfile
239
240    echo "<td><a href=\"$ROOTWEB_PROD/"$run"/catalog.html\"> "$sim" </a></td>" >> $htmlfile
241#--------------------------------------------------------------------------
242# Parametres globaux
243#--------------------------------------------------------------------------
244echo OK0
245   if [ $glob = 1 ] ; then
246     echo OK GGGGGGGGGGGGG $glob
247     listeval=""
248     echo LISTEVAR $listevar
249     for var in $listevar ; do
250     echo $ROOTWORK/VLR/YEAR/${sim}_$years/METRICS/glob
251          if [ -f "$ROOTWORK/VLR/YEAR/${sim}_$years/METRICS/glob" ] ; then 
252              val=`grep "^$var " $ROOTWORK/VLR/YEAR/${sim}_$years/METRICS/glob | awk ' { print $2 }' `
253            echo $val
254          else
255              val=.
256          fi
257          listeval="$listeval <td> $val </td>"
258     done
259     echo $listeval
260     echo $listeval >> $htmlfile
261   fi # glob
262echo LISTEVAL $listeval
263
264###########################################################################
265# FIN DE LA BOUCLE SUR LES SIMULATIONS
266###########################################################################
267    echo '</tr>' >> $htmlfile
268    (( ll = $ll + 1 ))
269done
270echo $htmlfile
271
272#############################################################################
273# Traitement eventuel des comparaisons
274#############################################################################
275
276echo '<tr>' >> $htmlfile
277
278if [ -f cmp.liste ] ; then
279
280 for cmp in `awk ' { print $1 } ' cmp.liste` ; do
281
282  descr=`grep "$cmp " cmp.liste | awk ' { print $2 } '`
283
284# Rajout des courbes de comparaison entre simulations
285 echo '<tr>' >> $htmlfile
286    echo "<td> $cmp </td>" >> $htmlfile
287    echo "<td><a href=\"$ROOTWEB/$cmp/ATLAS\"> X </a></td>" >> $htmlfile
288    echo "<td> X </td>" >> $htmlfile
289    echo "<td> X </td>" >> $htmlfile
290    echo "<td><a href=\"$ROOTWEB/$cmp/MoyZon/$years/catalog.html\"> "X" </a></td>" >> $htmlfile
291    echo "<td><a href=\"$ROOTWEB/$cmp/CRF/$years/catalog.html\"> "X" </a></td>" >> $htmlfile
292    echo "<td> X  </td>" >> $htmlfile
293    echo "<td> X  </td>" >> $htmlfile
294    echo "<td> X  </td>" >> $htmlfile
295    echo "<td> X  </td>" >> $htmlfile
296    echo "<td> X  </td>" >> $htmlfile
297    echo "<td> $descr </td>" >> $htmlfile
298  echo '</tr>' >> $htmlfile
299
300done
301fi
302
303echo '</table>' >> $htmlfile
304###########################################################################
305
306mkdir -p $HTML_D
307$put $htmlfile $HTML_D/Table_simulations_${comp}.html
308echo $put $htmlfile $HTML_D/Table_simulations_${comp}.html
309
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.