source: BOL/Multi_atlas/Utils/multi.sh @ 4948

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Mise a jour script principal pour spirit
Modifs appels axes 2 et 4.
IonelaMusat?
  • Property svn:executable set to *
File size: 21.6 KB
Line 
1
2#set -vx
3
4source ~/env_Multi_atlas.sh
5module purge
6
7local=`pwd -P`
8cd $local
9echo REPERTOIRE LOCAL :  $local
10
11echo '############################################################'
12echo  0/ gestion des options
13echo '############################################################'
14pcmdi_metrics=0
15tuning_metrics=1
16und=0
17zon=1
18html=1
19atlas=0
20#newatlas=0
21atlas_cesmep=0
22get=0
23cmor=1
24regdyn=0
25lma=0
26trmm=0
27axe2=0
28axe4=0
29esmval2=0
30reflcld_histo=0
31vertcld_calipso=0
32stations_day=0
33stations_mth=0
34qsub=0
35mjo=0
36river=0
37dataref=1
38
39ref=OBS
40echo ref=$ref
41
42lonmin=-180
43lonmax=180
44latmin=-90
45latmax=90
46pmin=1
47
48# ./job_multi.sh -1D 0 -get 0 -atlas 0 -pcmdi 0 -tuning 0 -lma 0 -trmm 0
49runstxt=$local/runs.txt
50
51while test -n "${1}"; do
52   case $1 in
53      -1D) und=$2 ; shift ;;
54      -get) get=$2 ; shift ;;
55      -cmor) cmor=$2 ; shift ;;
56      -zon) zon=$2 ; shift ;;
57      -atlas) atlas=$2 ; shift ;;
58      -atlas_cesmep) atlas_cesmep=$2 ; shift ;;
59      -pcmdi) pcmdi_metrics=$2 ; shift ;;
60      -tuning) tuning_metrics=$2 ; shift ;;
61      -runstxt) runstxt=$2 ; shift ;;
62      -lma) lma=$2 ; shift ;;
63      -trmm) trmm=$2 ; shift ;;
64      -axe4) axe4=$2 ; shift ;;
65      -axe2) axe2=$2 ; shift ;;
66      -regdyn) regdyn=$2 ; shift ;;
67      -esmval2) esmval2=$2 ; shift ;; 
68      -stations_day) stations_day=$2 ; shift ;; 
69      -stations_mth) stations_mth=$2 ; shift ;; 
70      -reflcld_histo) refld_histo=$2 ; shift ;;
71      -vertcld_calipso) vertcld_calipso=$2 ; shift ;;
72      -mjo) mjo=$2 ; shift ;; 
73      -river) river=$2 ; shift ;;
74      -dataref) dataref=$2 ; shift ;;
75      -lonmin) lonmin=$2 ; shift ;;
76      -lonmax) lonmax=$2 ; shift ;;
77      -latmin) latmin=$2 ; shift ;;
78      -latmax) latmax=$2 ; shift ;;
79      -pmin) pmin=$2 ; shift ;;
80      -qsub) qsub=$2 ; shift ;;
81      *) comp=$1 ;;
82   esac
83   shift
84done
85
86echo multi=$comp region: lonmin=$lonmin lonmax=$lonmax latmin=$latmin latmax=$latmax
87echo multi=$comp pmin: pmin=$pmin
88rm -f out.com$$
89runstxt=$local/runs.txt
90echo runstxt= $runstxt
91
92echo qsub is $qsub
93
94echo DODSDIR : $DODSDIR
95
96if [ ! -d $MULTIDIR ] ; then mkdir -p $MULTIDIR ; fi
97if [ ! -d $MAIN_SE ] ; then mkdir -p $MAIN_SE ; fi
98if [ ! -d $MAIN_MO ] ; then mkdir -p $MAIN_MO ; fi
99if [ ! -d $MAIN_DA ] ; then mkdir -p $MAIN_DA ; fi
100
101COMP_D=$MULTIDIR/$comp
102DEF_FILE=$COMP_D/def.txt ; if [ ! -f $DEF_FILE ] ; then echo renseigner $DEF_FILE ; exit ; fi
103LOGD=$COMP_D/log ; mkdir -p $LOGD
104outfile=$LOGD/out$$ ; if [ -f ${outfile} ] ; then \rm -f $outfile ; fi
105echo Ecriture des logs dans $outfile
106
107###
108#~/LMDZ/check/make_warning.sh $COMP_D
109### nom2
110listsims=""  ; for s  in `awk ' {print $1} ' $DEF_FILE | uniq`          ; do listsims="$listsims $s"    ; done
111#echo listsims $listsims
112
113listsims=""  ; for s  in `awk ' {print $1} ' $DEF_FILE | uniq`          ; do listsims="$listsims $s"    ; done
114echo listsims $listsims
115### nom1, simdir
116for s in $listsims ; do
117### simdir
118simdir=`grep -w "^$s "  $runstxt | awk ' { print $2 } '`
119### nom1
120ss=`basename $simdir `
121for year in `grep -w "^$s" $DEF_FILE | awk ' { print $2 } '` ; do
122file=${MAIN_SE}/ORIG/${s}_SE_${year}_1M_histmth.nc
123
124echo $file $year
125
126if [ ! -f ${file} ]; then
127 if [ -f ${simdir}/ATM/Analyse/SE/${ss}_SE_${year}_1M_histmth.nc ]; then
128  ln -s ${simdir}/ATM/Analyse/SE/${ss}_SE_${year}_1M_histmth.nc $file
129 elif [ "${ss}" == "UQLMDZ6A1000" ]; then
130  echo NO need to ln -s; the *1M_histmth.nc does not exist anymore
131 else
132  \rm year.txt
133  echo $year>>year.txt
134  sed -i -e 's/_/ /' year.txt
135  year1=`less year.txt | awk '{print $1}'`
136  year2=`less year.txt | awk '{print $2}'`
137  echo yr1=${year1} yr2=${year2}
138  ls -l ${simdir}/ATM/Output/MO/${ss}_${year1}0101_${year2}1230_1M_histmth.nc
139  ls -l ${simdir}/ATM/Output/MO/${ss}_${year1}0101_${year2}1231_1M_histmth.nc
140  if [ -f ${simdir}/ATM/Output/MO/${ss}_${year1}0101_${year2}1230_1M_histmth.nc ]; then
141   ln -s ${simdir}/ATM/Output/MO/${ss}_${year1}0101_${year2}1230_1M_histmth.nc $file
142  elif [ -f ${simdir}/ATM/Output/MO/${ss}_${year1}0101_${year2}1231_1M_histmth.nc ]; then
143   ln -s ${simdir}/ATM/Output/MO/${ss}_${year1}0101_${year2}1231_1M_histmth.nc $file
144  fi
145 fi
146fi
147
148#\rm ${MAIN_SE}/ORIG/UQLMDZ6AW1000_SE_1979_1988_1M_histmth.nc
149done
150done
151#${local}/../check/mk_check-avail-data.sh ${comp}
152
153echo ### On supprime dans def.txt les lignes vides ########
154sed -i "/^[ \t]*$/d" $DEF_FILE
155
156echo ### On teste d abord la coherence des noms des simulations dans def.txt et $runstxt ################
157echo MULTI-ATLAS "$comp"
158for s in $listsims ; do
159srun=`grep -w "^$s "  $runstxt | awk ' { print $1 } '`
160echo 's='"$s" '    srun='  "$srun"
161if [ "$s" != "$srun" ] ; then
162   #echo Meme nom de la simulation dans def.txt et $runstxt 's=' "$s" '    srun='  "$srun"
163#else
164   echo ATTENTION : la simulation "$s" de votre def.txt n est pas repertoriee dans $runstxt >${LOGD}/error_${comp}
165   echo             ou le meme nom est attribue a plusieures simulations >> ${LOGD}/error_${comp}
166   echo Il faut la rajouter dans $runstxt >> ${LOGD}/error_${comp}
167   echo avec le chemin vers les SE et TS dans ciclad : /thredds/ipsl/fabric/IGCM_OUT >> ${LOGD}/error_${comp}
168   echo             ou renomer votre simulation >> ${LOGD}/error_${comp}
169   more ${LOGD}/error_${comp}
170exit
171fi
172echo Checking if $s simulation is referenced many times in runs.txt
173#nrun=`./how_many_times_run.sh $s`
174#nrun=`./how_many_times_run.sh $srun`
175nrun=1
176
177if [ "$nrun" != "1" ]; then
178 echo Simulation $s est repertoriee ${nrun} fois dans $runstxt >> ${LOGD}/error_${comp}
179 echo STOPping here >> ${LOGD}/error_${comp}
180 more ${LOGD}/error_${comp}
181 exit
182fi
183done
184
185listruns=""
186listrunss=""
187listrunse=""
188if [ ! -d $MAIN_SE/ORIG ] ; then mkdir -p $MAIN_SE/ORIG ; fi
189for s in $listsims ; do 
190simdir=`grep -w "^$s "  $runstxt | awk ' { print $2 } '`
191echo $simdir
192cd $MAIN_SE/ORIG ; 
193echo $simdir
194ss=`basename $simdir `
195listruns="$listruns $ss"
196for year in `grep -w "^$s" $DEF_FILE | awk ' { print $2 } '` ; do
197listrunss="$listrunss ${ss}_$year"
198listrune="$listrune ${ss}_SE_$year"
199done
200done
201
202ns=0
203listsimss="" ; 
204for ss in `awk ' {print $1"_"$2 } ' $DEF_FILE`    ; do 
205if [ $dataref = 0 ] ; then
206   if [ ${ns} = 0 ] ; then
207      ref=$ss
208      echo ref=$ref
209   fi 
210fi
211let "ns = ${ns} + 1"
212listsimss="$listsimss $ss" ; 
213done
214echo ref=$ref
215
216listsimse="" ; for se in `awk ' {print $1"_SE_"$2 } ' $DEF_FILE` ; do listsimse="$listsimse $se" ; done
217echo listsims $listsims
218echo listsimss $listsimss
219echo listsimse $listsimse
220
221echo SIMULATIONS: $listsims
222
223RUNS=""
224RUNS=`awk ' {print $1"_"$2 } ' $DEF_FILE`
225echo listrunss=$RUNS
226
227echo '########################################################################'
228echo  1/ Rapatriement des simulations manquantes
229echo '########################################################################'
230#### AI avril 2020 ################ Avant l acces directe aux simulations sur le dods du CCRT
231# Adresses web ne sont plus a jours
232# A commenter les adresses web CCRT
233# A mettre a jours les adress web IDRIS
234# Rajouter d'autres machines avec rsynk, wget ou ssh ...
235
236if [ $get = 1 ] ; then
237
238cd $MAIN_SE
239for sim in $listsimss ; do echo ./getun.sh ${sim} >> $outfile 2>&1 ; ./getun.sh ${sim} ; done
240cd $TS_DA
241for sim in $listsimss ; do echo ./getun.sh ${sim} >> $outfile 2>&1 ; ./getun.sh ${sim} ; done
242cd $TS_MO
243for sim in $listsimss ; do echo ./getun.sh ${sim} >> $outfile 2>&1 ; ./getun.sh ${sim} ; done
244
245fi
246
247echo '########################################################################'
248echo  1.1/ Check des fichiers input et des variables demandees pour l atlas avec
249echo       des exit si un des fichiers ou des variables ne sont pas accessibles
250echo '########################################################################'
251#IM TBC ${local}/../check/make_check_fin.sh $comp ${LOGD}/check_finput$$ 2>&1
252
253if [ $cmor = 1 ] ; then
254 cp cmor.sh $MAIN_SE/.
255 cp season.sh $MAIN_SE/.
256 cd $MAIN_SE
257 chmod +x cmor.sh
258 chmod +x season.sh
259#########################################################################
260# 1.2 "Cmorisation des fichiers mensuels : traduction au format CMIP
261#########################################################################
262# Deux lignes suivantes modif FH 2016/11/09
263# Files are taken from /thredds/ipsl/fabric/lmdz/SE/ORIG and
264# results are in /thredds/ipsl/fabric/lmdz/SE/CMOR
265#########################################################################
266
267echo cmor.sh : output dans ${LOGD}/cmor$$
268./cmor.sh -runsfile $runstxt $comp > ${LOGD}/cmor$$ 2>&1
269if [ $? != 0 ] ; then exit ; fi # Probleme de histmth non present. On arrete tout
270
271#########################################################################
272# 1.3 Interpolate fields on a common horizontal grid (VLR) and
273#########################################################################
274#     average in time "YEAR", "JJA" ...
275#     Results are put on
276#     /thredds/ipsl/fabric/lmdz/VLR/YEAR/[SIMU_NAME]_[period]/NC
277#     If wanting to rerun season.sh for observations :
278#     ./season.sh -s OBS
279#########################################################################
280
281cd $MAIN_SE
282echo season.sh : output dans ${LOGD}/season$$
283./season.sh -comp $comp > ${LOGD}/season$$ 2>&1
284cd $local
285
286fi
287
288echo '########################################################################'
289echo  2/ Lancement des atlas manquant
290echo '########################################################################'
291natlas=`wc -l $COMP_D/atlas-def | awk ' { print $1 } '`
292count_atlas=0
293
294if [ $atlas = 1 ] ; then
295#if [ $newatlas = 1 ]; then
296#sed -e 's/COMPAR/'${comp}'/' ${local}/atlas/make_atlas.sh > ${local}/atlas/make_atlas_${comp}.sh
297#$submit -v COMP=${comp},DATAREF=${dataref} ${local}/atlas/make_atlas_${comp}.sh
298
299#./make_timecount.sh ${comp}
300
301#else
302
303for sim in $listsimss ; do
304   il=1
305   if [ ! -f $COMP_D/atlas-def ] ; then
306      echo Definir les atlas a construire dans $COMP_D/atlas-def
307      echo Example :
308      cat $COMP_D/../CMIP5to6/atlas-def
309   fi
310   while [ $il -le $natlas ] ; do
311      line=`sed -n -e ${il}p $COMP_D/atlas-def`
312      seas=`echo $line | awk ' { print $1 } '`
313      proj=`echo $line | awk ' { print $2 } '`
314      vars=`echo $line | awk ' { print $3 } '`
315      atlas=${sim}+${seas}+${proj}+$vars
316      cd ${local}/atlas
317      varg=`echo $vars | sed -e 's/,/+/g'`
318      echo Atlas $atlas a creer
319      if [ $qsub = 0 ] ; then
320         echo bash ${local}/atlas/atlas.sh RUN=$sim,SEASON=$seas,PROJ=$proj,OUTDIR=$COMP_D/ATLAS,REF=$ref,VARS="$varg",RUNSTXT=$runstxt,lonmin=$lonmin,lonmax=$lonmax,latmin=$latmin,latmax=$latmax,pmin=$pmin
321         bash ${local}/atlas/atlas.sh RUN=$sim,SEASON=$seas,PROJ=$proj,OUTDIR=$COMP_D/ATLAS,REF=$ref,VARS="$varg",RUNSTXT=$runstxt,lonmin=$lonmin,lonmax=$lonmax,latmin=$latmin,latmax=$latmax,pmin=$pmin >> $outfile
322         if [ "$ref" != "OBS" ]; then
323            echo bash ${local}/atlas/atlas.sh RUN=$sim,SEASON=$seas,PROJ=$proj,OUTDIR=$COMP_D/ATLAS,REF=OBS,VARS="$varg",RUNSTXT=$runstxt,lonmin=$lonmin,lonmax=$lonmax,latmin=$latmin,latmax=$latmax,pmin=$pmin
324            bash ${local}/atlas/atlas.sh RUN=$sim,SEASON=$seas,PROJ=$proj,OUTDIR=$COMP_D/ATLAS,REF=OBS,VARS="$varg",RUNSTXT=$runstxt,lonmin=$lonmin,lonmax=$lonmax,latmin=$latmin,latmax=$latmax,pmin=$pmin >> $outfile
325         fi
326      else
327         echo $submit -v RUN=$sim,SEASON=$seas,PROJ=$proj,OUTDIR=$COMP_D/ATLAS,REF=$ref,VARS="$varg",RUNSTXT=$runstxt,lonmin=$lonmin,lonmax=$lonmax,latmin=$latmin,latmax=$latmax,pmin=$pmin atlas.sh >> ${LOGD}/ATLAS$$ 2>&1
328         $submit -v RUN=$sim,SEASON=$seas,PROJ=$proj,OUTDIR=$COMP_D/ATLAS,REF=$ref,VARS="$varg",RUNSTXT=$runstxt,lonmin=$lonmin,lonmax=$lonmax,latmin=$latmin,latmax=$latmax,pmin=$pmin atlas.sh
329         if [ "$ref" != "OBS" ]; then
330            echo $submit -v RUN=$sim,SEASON=$seas,PROJ=$proj,OUTDIR=$COMP_D/ATLAS,REF=OBS,VARS="$varg",RUNSTXT=$runstxt,lonmin=$lonmin,lonmax=$lonmax,latmin=$latmin,latmax=$latmax,pmin=$pmin atlas.sh >> ${LOGD}/ATLAS$$ 2>&1
331            $submit -v RUN=$sim,SEASON=$seas,PROJ=$proj,OUTDIR=$COMP_D/ATLAS,REF=OBS,VARS="$varg",RUNSTXT=$runstxt,lonmin=$lonmin,lonmax=$lonmax,latmin=$latmin,latmax=$latmax,pmin=$pmin atlas.sh
332         fi
333      fi
334      (( count_atlas = $count_atlas + 1 ))
335      (( il = $il + 1 ))
336   done
337done
338if [ $count_atlas != 0 ] ; then
339    echo '!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!'
340    echo Les atlas manquant ont ete lances. Attendre leur
341    echo creation pour relancer job_multi.sh
342    echo '!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!'
343#   exit
344fi
345
346#fi #newatlas
347fi #atlas
348
349# atlas_cesmep : cles pour activer les nouveau atlas (C-ESM-EP)
350# AI avril 2020 : Passage a la version v2 de C-ESM-EP
351# FH Juin 2022 : Passage a la version v3 de C-ESM-EP (changement de prodigfs en thredds)
352if [ $atlas_cesmep = 1 ] ; then
353   cd ~/LMDZ/C-ESM-EP
354   ./AtlasLMDZ.sh -runsfile $runstxt $comp >> ${LOGD}/CESMEP$$ 2>&1
355fi # atlas_cesmep
356
357echo '########################################################################'
358echo  3/ Calcul des moyennes zonales nco
359echo '#####################################################################'
360
361
362#trace moy.zonale OBS + multi-simulations
363if [ $zon = 1 ] ; then
364   cd $local
365   mkdir -p $COMP_D/ZON
366   for sim in $listsimse OBS ; do
367      echo make_MOY for simulation $sim, log in ${LOGD}/MOY$$
368      years=`echo $sim | sed -e 's/_SE_/ /' | awk ' { print $2 } '`
369      run=`echo $sim | sed -e 's/_SE_/ /' | awk ' { print $1 } '`
370      echo ./make_MOY.sh "$years" YEAR "$run" GLOB
371      ./make_MOY.sh "$years" YEAR "$run" GLOB      >> ${LOGD}/MOY$$ 2>&1
372      ./make_MOY.sh "$years" YEAR "$run" ZON       >> ${LOGD}/MOY$$ 2>&1
373      ./make_MOY.sh "$years" JJA "$run"  ZON       >> ${LOGD}/MOY$$ 2>&1
374      ./make_MOY.sh "$years" DJF "$run"  ZON       >> ${LOGD}/MOY$$ 2>&1
375      ./make_MOY.sh "$years" JJAS "$run" AMMACROSS >> ${LOGD}/MOY$$ 2>&1
376      ./make_MOY.sh "$years" MAM "$run"  ZON       >> ${LOGD}/MOY$$ 2>&1
377      ./make_MOY.sh "$years" SON "$run"  ZON       >> ${LOGD}/MOY$$ 2>&1
378   done
379   cd $local
380### ajout nuages LMDZ dans la compa et doit faire des liens symbol. sur
381#### les OBS calipso toujurs pour le moment
382   echo mk_clouds_NOcalipso.sh, log in  ${LOGD}/calipso$$
383   ./mk_clouds_NOcalipso.sh YEAR ZON       >> ${LOGD}/calipso$$ 2>&1
384   ./mk_clouds_NOcalipso.sh DJF ZON        >> ${LOGD}/calipso$$ 2>&1
385   ./mk_clouds_NOcalipso.sh JJA ZON        >> ${LOGD}/calipso$$ 2>&1
386   ./mk_clouds_NOcalipso.sh JJAS AMMACROSS >> ${LOGD}/calipso$$ 2>&1
387   ./mk_clouds_NOcalipso.sh MAM ZON        >> ${LOGD}/calipso$$ 2>&1
388   ./mk_clouds_NOcalipso.sh SON ZON        >> ${LOGD}/calipso$$ 2>&1
389   echo multi_ZONE.sh, log in ${LOGD}/Z$$
390   ./multi_ZONE.sh YEAR $comp ZON -runsfile $runstxt >> ${LOGD}/Z$$ 2>&1
391   ./multi_ZONE.sh JJA $comp ZON -runsfile $runstxt  >> ${LOGD}/Z$$ 2>&1
392   ./multi_ZONE.sh DJF $comp ZON -runsfile $runstxt  >> ${LOGD}/Z$$ 2>&1
393   ./multi_ZONE.sh JJAS $comp AMMACROSS -runsfile $runstxt >> ${LOGD}/Z$$ 2>&1
394   ./multi_ZONE.sh MAM $comp ZON -runsfile $runstxt  >> ${LOGD}/Z$$ 2>&1
395   ./multi_ZONE.sh SON $comp ZON -runsfile $runstxt  >> ${LOGD}/Z$$ 2>&1
396fi
397
398if [ ! -f $COMP_D/1D/1D.html -a $und = 1  ] ; then
399echo '#####################################################################'
400echo 4/ Lancement du 1D
401echo '#####################################################################'
402    cd $COMP_D
403    echo log in ${LOGD}/1D$$
404    ~/LMDZ/1D/serie1d.sh $comp  > ${LOGD}/1D$$ 2>&1
405    cd $local
406fi
407
408if [ $tuning_metrics = 1 -a ! -d $COMP_D/METRICS ] ; then
409echo '#####################################################################'
410echo 5.1/ Metriques LMD : $tuning_metrics
411echo '#####################################################################'
412   echo metrics.sh, log in ${LOGD}/METRICS$$
413   cd $local/METRICS
414   echo ./metrics.sh $comp > ${LOGD}/METRICS$$ 2>&1
415   ./metrics.sh $comp > ${LOGD}/METRICS$$ 2>&1
416fi
417
418if [ $pcmdi_metrics = 1 ] ; then
419echo '#####################################################################'
420echo 5.2/ Metriques PCMDI : $pcmdi_metrics
421echo '#####################################################################'
422cd $local
423   ./make_pcmdi.sh $comp
424fi
425
426if [ $regdyn = 1 ]; then
427echo '#####################################################################'
428echo 6/ Sorting by dynamical regimes : $regdyn
429echo '#####################################################################'
430   cd ~/users/musat/regdyn/clean_regdyn
431   ./mk_all_regdyn.sh $comp 0 > ${LOGD}/REGDYN$$ 2>&1
432   cd $local
433fi
434
435if [ $esmval2 = 1 ]; then
436echo '#####################################################################'
437echo 7/ ESMvalTool : $esmval2
438echo '#####################################################################'
439   cd $local
440   ./cvdp4atlas.sh $comp
441   ./perfm4atlas.sh $comp
442fi   
443
444if [ $mjo = 1 ]; then
445echo '#####################################################################'
446echo 8.1/ Rainfall variability / MJO diagnostics : $mjo
447echo '#####################################################################'
448   cd ~/users/idelkadi/MJO
449   ./make_diagnosMJO.sh $comp
450fi
451
452if [ $river = 1 ]; then 
453   cd ~/users/idelkadi/AXE1/River
454   ./make_diagnoRiver.sh $comp >> ${LOGD}/out_river
455fi 
456
457if [ $lma = 1 ]; then
458echo '#####################################################################'
459echo 8.2/ Rainfall variability / LMA analysis of the MJO : $lma
460echo '#####################################################################'
461   cd ${local}/d_AXE2_LMA/
462   bash ./make_LMA.sh $comp >  ${LOGD}/LMA$$ 2>&1
463   echo ./make_LMA.sh $comp >  ${LOGD}/LMA$$ 2>&1
464   cd ${local}
465fi
466
467if [ $axe2 = 1 ]; then
468echo '#####################################################################'
469echo 8.3/ Rainfall variability / metrics
470echo '#####################################################################'
471   cd $local
472   bash  make_axe2.sh -runstxt $runstxt $comp    >  ${LOGD}/axe2_$$ 2>&1
473   echo  make_axe2.sh -runstxt $runstxt $comp '-->' ${LOGD}/axe2_$$
474fi
475
476if [ $trmm = 1 ]; then
477echo '#####################################################################'
478echo 8.4/ Rainfall variability / Marine Bonazzola : $trmm
479echo '#####################################################################'
480   cd ${local}/d_AXE2
481   bash ./Axe2_Marine.sh $comp >  ${LOGD}/axe2_Marine_$$ 2>&1
482   echo ./Axe2_Marine.sh $comp '-->'  ${LOGD}/axe2_Marine_$$ 2>&1
483   cd $local
484fi
485
486if [ $river = 1 ]; then 
487echo '#####################################################################'
488echo 9/ River discharges
489echo '#####################################################################'
490   cd ~/users/idelkadi/AXE1/River
491   ./make_diagnoRiver.sh $comp
492fi 
493
494if [ $axe4 = 1 ]; then
495echo '#####################################################################'
496echo 10/ Poles
497echo '#####################################################################'
498  cd $local
499   bash ./make_axe4.sh $comp >  ${LOGD}/axe4_$$ 2>&1
500   echo  make_axe4.sh $comp '-->' ${LOGD}/axe4_$$
501fi
502
503if [ "$reflcld_histo" = "1" ] ; then
504echo '#####################################################################'
505echo 11/ reflcld_histo : $reflcld_histo
506echo '#####################################################################'
507   cd ~/users/idelkadi/AXE3/CldReflCldFrac
508   ./make_scatReflCld.sh $comp
509   cd $local
510fi
511
512if [ $vertcld_calipso = 1 ] ; then
513echo '#####################################################################'
514echo 12/ Calipso : $vertcld_calipso
515echo '#####################################################################'
516   cd ~/users/idelkadi/AXE3/Calipso/CoupeVerticale/DJF
517   ./make_VerticalMzCldCalipso.sh $comp
518   cd ~/users/idelkadi/AXE3/Calipso/CoupeVerticale/JJA
519   ./make_VerticalMzCldCalipso.sh $comp
520   cd ~/users/idelkadi/AXE3/Calipso/CoupeVerticale/MAM
521   ./make_VerticalMzCldCalipso.sh $comp
522   cd ~/users/idelkadi/AXE3/Calipso/CoupeVerticale/SON
523   ./make_VerticalMzCldCalipso.sh $comp
524   cd ~/users/idelkadi/AXE3/Calipso/Stratos
525   ./make_StratosCalipso.sh $comp
526fi
527
528
529if [ $stations_day = 1 ] ; then
530echo '#####################################################################'
531echo 13/ Stations
532echo '#####################################################################'
533   ~/users/Binta/bibi.sh $comp
534   ~/users/cheruy/bibi.sh $comp
535fi
536
537if [ $stations_mth = 1 ] ; then
538   ~/users/traore/SE_buoy.sh $comp
539fi
540
541if [ $html = 1 ] ; then
542echo '#####################################################################'
543echo 14/ generation des pages html
544echo '#####################################################################'
545   cd ${local}
546   echo ./make_html_libigcm.sh --comp $comp --runstxt $runstxt
547   bash ./make_html_libigcm.sh --comp $comp --runstxt $runstxt > ${LOGD}/html$$ 2>&1
548   echo log in ${LOGD}/html$$ 
549   bash ./html_entete.sh $comp ${ref} >> ${LOGD}/html$$ 2>&1
550   cd ${local}/html
551   bash ./make_index_html.sh ${comp} ${dataref} >> ${LOGD}/html$$ 2>&1
552   cd $local
553   bash ./html_tuning.sh  $comp           >> ${LOGD}/html$$ 2>&1
554   bash ./html_tuning_min.sh  $comp       >> ${LOGD}/html$$ 2>&1
555   bash ./html_accueil.sh  $comp          >> ${LOGD}/html$$ 2>&1
556   bash ./html_1D.sh  $comp               >> ${LOGD}/html$$ 2>&1
557   bash ./html_lma.sh $comp               >> ${LOGD}/html_LMA$$ 2>&1
558   bash ./html_pcmdi.sh $comp             >> ${LOGD}/html$$ 2>&1
559   bash ./html_all.sh >| $MULTIDIR/all.html
560
561   # html pour les métriques
562#   cat $COMP_D/entete.html doc_pcmdi.html >| $COMP_D/PCMDI.html
563#   ref=`echo $listsimss | awk ' { print $1 } '`
564#   echo "<h1> Metrics with respect to $ref </h1>" >>  $COMP_D/PCMDI.html
565#   cat $COMP_D/pcmdi_metrics.html >> $COMP_D/PCMDI.html
566#   echo "<h1> Metrics with respect to AR4.00 </h1>" >>  $COMP_D/PCMDI.html
567#   cat $COMP_D/metrics-AR4-as-ref.html >> $COMP_D/PCMDI.html
568#   echo "<h1> Metrics with respect to CMIP5/AMIP multi model </h1>" >>  $COMP_D/PCMDI.html
569#   cat $COMP_D/metrics-CMIP5-AMIP-as-ref.html >> $COMP_D/PCMDI.html
570   for i in 1 2 3 4 5 6 7 ; do
571        ./html_axe$i.sh  $comp >> ${LOGD}/html$$ 2>&1
572   done
573
574   echo Multi atlas, log in ${LOGD}/multiatlas$$ 
575   for proj in GLOB SH NH ; do
576   for bias in BIAS MAPS ; do
577       for season in YEAR DJF JJA MAM SON ; do
578        ./multi_atlas.sh $comp $bias $season $proj $ref $RUNS  >> ${LOGD}/multiatlas$$ 2>&1
579       done
580   done
581   done
582cd $local
583./webpage_multi.sh $comp
584fi
585
586echo UN NOVEL MULTI ATLAS EST DISPONIBLE sur $COMP_D/ACCUEIL.html
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.