############################################################## # Gestion des modules ############################################################## if grep -q "Adastra" /etc/motd; then hostname="adastra" else hostname=$(hostname) fi echo "Setting up lmdz_env on $hostname" # Platform-specific case ${hostname:0:5} in jean-) ARCH="X64_JEANZAY" module purge compilo=19.0.4 # available 2013.0, 2017.2 module load intel-compilers/$compilo #module load intel-mpi/$compilo module load intel-mkl/$compilo module load hdf5/1.10.5-mpi module load netcdf/4.7.2-mpi module load netcdf-fortran/4.5.2-mpi module load subversion/1.9.7 #Pour module gcc, voir : https://trac.lmd.jussieu.fr/LMDZ/wiki/PortageJeanZay #module load gcc/6.5.0 module load nco module load cdo # Imputation de la consommation sur le groupe (projet) actif par defaut, # idrproj indique le groupe (projet) actif par defaut # idrproj -d newproj redefinit "newproj" en tant que projet actif, # alors $STORE, $WORK etc vont designer les espaces de "newproj") account=$(idrproj | grep active | awk '{ print $1}') SUBMITCMD="sbatch -A $account@cpu " RUNCMD="srun --label -n" # Espaces suivants definis par defaut en fonction du groupe actif, # par exemple : SCRATCHD=$SCRATCH is /gpfsstore/rech/$groupe/$login # * On peut aussi ne pas installer les scripts a la racine de STORE, # mais dans STORED=$STORE/your_folder SIMRUNBASEDIR="$SCRATCH/LMDZ_Setup" LMDZD=$WORK NB_MPI_MAX=2000 NB_OMP_MAX=20 #LMDZ_Init sur le $STORE du $groupe LMDZ_INIT=$STORE/LMDZ_Init ;; adast) # module purge # module load PrgEnv-gnu # module load cray-hdf5-parallel # module load netcdf-hdf5parallel/gnu/10.3 account=$(/usr/sbin/my_project.py -l 2>&1 | head -1 | cut -d " " -f 3- | cut -c 5-) root_dir="$WORKDIR/LMDZ_Setup"; ARCH="X64_ADASTRA-GNU" SIMRUNBASEDIR="$SCRATCHDIR/" LMDZD="$root_dir/LMDZD" LMDZ_INIT="$root_dir/LMDZ_Init" NB_MPI_MAX=2000 NB_OMP_MAX=20 RUNCMD="srun --label --account=$account -n" SUBMITCMD="sbatch --account=$account" ;; *) echo "WARNING: RUNNING THIS SCRIPT ON A LOCAL COMPUTER IS DISCOURAGED (lacklusted cpus and memory)" root_dir="/home/abarral/PycharmProjects/installLMDZ/LMDZ_Setup"; # Where LMDZ_Setup is extracted. Can't use $(pwd) since this script gets copied and ran from several locations ARCH="local-gfortran-parallel" SIMRUNBASEDIR="/tmp/SCRATCH/" # Where the simulations will be executed ($SIMRUNBASEDIR/LMDZ_Setup/...) LMDZD="$root_dir/LMDZD" # Where the sources will be downloaded and compiled LMDZ_INIT="$root_dir/LMDZ_Init" # Where to store shared files used for initialisation NB_MPI_MAX=2 # Max number of MPI cores NB_OMP_MAX=1 # Max number of OMP threads RUNCMD="mpirun -np" # command to run a job, as $runcmd