Changes between Version 8 and Version 9 of TuningMixte

Timestamp:

Sep 15, 2020, 12:10:29 PM (5 years ago)

Author:

Sebastien Nguyen

Comment:

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TuningMixte

@@ -164 +164 @@
 
 
-
+{{{#!sh
     login=rces982
 
-
-
-
-
     main=TNAMA
 
-
-
-
-
     if [ $main = "TNAMA" ] ; then
 
-
-
-    sims="NPv6.1precliq"
-
-
-
-
-
-    min=1
-
-
-
-    max=200
+      sims="NPv6.1precliq"
+
+      min=1
+
+      max=200
+
+      wave=8
+
+      for nb in $( seq -f "%03g" $min $max) ; do sims="$sims SCM_${wave}-$nb" ; done
+
+    elif [ ${main:0:7} = TUNE_II ] ; then
+
+      wave=32
+
+      sims="NPv6.1 "
+
+      sims="CTRL"
+
+      for i in `seq -w 1 90` ; do sims="$sims SCM_${wave}-0$i" ; done
+
+    else
+
+      echo main $main non prevu ; exit
+
+    fi
+
+    for i in $sims  ; do
+
+       ./get.sh $main $i $login
+
+       chmod -R a+Xr SN${main}${i}*
+
+    done
+}}}
+
+
+
+
+Mon get utilise rsync par le script get.sh pour récupérer les fichier sur jean-zay
+
+
+
+== 8/ liens symbolique de SCM-8- vers SCM_8- ==
+
+Pour pouvoir lancer le multi_atlas il faut remplacer _ par - dans le nom des fichiers.
+
+On utilise le script to-.sh
+
+
+
+    #!/bin/bash
+
+
+
+
+
+    local=`pwd`
 
 
@@ -199 +235 @@
 
 
-    for nb in $( seq -f "%03g" $min $max) ; do sims="$sims SCM_${wave}-$nb" ; done
-
-
-
-
-
-    elif [ ${main:0:7} = TUNE_II ] ; then
-
-
-
-    wave=32
-
-
-
-    sims="NPv6.1 "
-
-
-
-    sims="CTRL"
-
-
-
-    for i in `seq -w 1 90` ; do sims="$sims SCM_${wave}-0$i" ; done
-
-
-
-
-
-    else
-
-
-
-      echo main $main non prevu ; exit
-
-
-
-    fi
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-
-
-
-
-    for i in $sims  ; do
-
-
-
-       ./get.sh $main $i $login
-
-
-
-       chmod -R a+Xr SN${main}${i}*
+
+
+    for old in SN*SCM_${wave}* ; do
+
+
+
+        new=`echo $old | sed -e 's/_/-/g'` ; echo $old $new
+
+
+
+        for dir in SE TS_DA ; do
+
+
+
+           if [ -d $local/$old/ATM/Analyse/$dir ] ; then
+
+
+
+              cd $local/$old/ATM/Analyse/$dir
+
+
+
+              echo Traitement $local/$old/ATM/Analyse/$dir
+
+
+
+              mkdir -p $local/$new/ATM/Analyse/$dir
+
+
+
+              for file in *nc ; do
+
+
+
+                 cd $local/$new/ATM/Analyse/$dir
+
+
+
+                 ln -s $local/$old/ATM/Analyse/$dir/$file ./`echo $file | sed -e 's/'$old'/'$new'/'`
+
+
+
+              done
+
+
+
+           fi
+
+
+
+        done
 
 
@@ -259 +295 @@
 
 
-Mon get utilise rsync par le script get.sh pour récupérer les fichier sur jean-zay
-
-
-
-== 8/ liens symbolique de SCM-8- vers SCM_8- ==
-
-Pour pouvoir lancer le multi_atlas il faut remplacer _ par - dans le nom des fichiers.
-
-On utilise le script to-.sh
-
-
+== 9/ Préparation du multi atlas ==
+
+Créer un fichier nd.comp avec les simulations voulues pour le multiatlas et 
+
+les valeurs de paramètres correspondantes en copiant  Par1D_Wave8.asc à partir de
+
+WORK/SIMU1D/WAVE8/ dans nd.${main}_W$wave par exemple nd.TNAMA_W8
+
+
+
+enlever les " de nd.TNAMA_W8 :
+
+sed -i 's/"//g' nd.TNAMA_W8
+
+
+
+remplacer SCM_8 par SCM-8 pour les noms de simulation :
+
+sed -i 's/SCM_/SCM-/' nd.TNAMA_W8
+
+
+
+mettre OK à la fin des lignes contenant les paramètres de simulations :
+
+sed -i '2,$ s/$/ OK/' nd.TNAMA_W8
+
+
+
+mettre nd.TNAMA_W8 sur fabric@ciclad dans le répertoire de lancement de min.sh.
+
+
+
+Choisir les simulations à traiter dans min.sh :
+
+     main=TNAMA
+
+     wave=8
+
+     comp=${main}_W$wave
+
+     multi=/prodigfs/ipslfs/dods/fabric/lmdz/MultiSimu/$comp
+
+     years=2011_2011
+
+
+
+Activer dans min.sh les sorties du multiatlas :
+
+    cmor=1
+
+    atlas=1
+
+    tuning=1
+
+    zon=1
+
+    axe2=1
+
+    html=1 
+
+
+
+Lancer ./min.sh
+
+
+
+vérifier que les atlas sont terminés :
+
+    qstat | grep fabric
+
+
+
+une fois les atlas terminés relancer ./min.sh
+
+
+
+== 10/ métriques 3D ==
+
+
+
+Récupérer les fichiers 3D sur la machine des simulations 1D :
+
+
+
+Dans un dossier 3D créer un dossier pour la vague 8 : TNAMAW8
+
+
+
+Récupérer get.sh, to.sh post_scores.sh pp.sh et prepa.sh
+
+
+
+Modifier get.sh :
 
     #!/bin/bash
 
-
-
-
-
-    local=`pwd`
-
-
+    
 
     wave=8
 
-
-
-
-
-    for old in SN*SCM_${wave}* ; do
-
-
-
-        new=`echo $old | sed -e 's/_/-/g'` ; echo $old $new
-
-
-
-        for dir in SE TS_DA ; do
-
-
-
-           if [ -d $local/$old/ATM/Analyse/$dir ] ; then
-
-
-
-              cd $local/$old/ATM/Analyse/$dir
-
-
-
-              echo Traitement $local/$old/ATM/Analyse/$dir
-
-
-
-              mkdir -p $local/$new/ATM/Analyse/$dir
-
-
-
-              for file in *nc ; do
-
-
-
-                 cd $local/$new/ATM/Analyse/$dir
-
-
-
-                 ln -s $local/$old/ATM/Analyse/$dir/$file ./`echo $file | sed -e 's/'$old'/'$new'/'`
-
-
-
-              done
-
-
-
-           fi
-
-
-
-        done
-
-
-
-    done
-
-
-
-
-
-== 9/ Préparation du multi atlas ==
-
-Créer un fichier nd.comp avec les simulations voulues pour le multiatlas et 
-
-les valeurs de paramètres correspondantes en copiant  Par1D_Wave8.asc à partir de
-
-WORK/SIMU1D/WAVE8/ dans nd.${main}_W$wave par exemple nd.TNAMA_W8
-
-
-
-enlever les " de nd.TNAMA_W8 :
-
-sed -i 's/"//g' nd.TNAMA_W8
-
-
-
-remplacer SCM_8 par SCM-8 pour les noms de simulation :
-
-sed -i 's/SCM_/SCM-/' nd.TNAMA_W8
-
-
-
-mettre OK à la fin des lignes contenant les paramètres de simulations :
-
-sed -i '2,$ s/$/ OK/' nd.TNAMA_W8
-
-
-
-mettre nd.TNAMA_W8 sur fabric@ciclad dans le répertoire de lancement de min.sh.
-
-
-
-Choisir les simulations à traiter dans min.sh :
-
-     main=TNAMA
-
-     wave=8
-
-     comp=${main}_W$wave
-
-     multi=/prodigfs/ipslfs/dods/fabric/lmdz/MultiSimu/$comp
-
-     years=2011_2011
-
-
-
-Activer dans min.sh les sorties du multiatlas :
-
-    cmor=1
-
-    atlas=1
-
-    tuning=1
-
-    zon=1
-
-    axe2=1
-
-    html=1 
-
-
-
-Lancer ./min.sh
-
-
-
-vérifier que les atlas sont terminés :
-
-    qstat | grep fabric
-
-
-
-une fois les atlas terminés relancer ./min.sh
-
-
-
-== 10/ métriques 3D ==
-
-
-
-Récupérer les fichiers 3D sur la machine des simulations 1D :
-
-
-
-Dans un dossier 3D créer un dossier pour la vague 8 : TNAMAW8
-
-
-
-Récupérer get.sh, to.sh post_scores.sh pp.sh et prepa.sh
-
-
-
-Modifier get.sh :
-
-    #!/bin/bash
-
-    
-
-    wave=8
-
     main_multi=TNAMA_W${wave}