Changeset 3973 for dynamico_lmdz


Ignore:
Timestamp:
Nov 9, 2016, 3:13:31 PM (8 years ago)
Author:
ymipsl
Message:

Update XML and .def files for dynamico Aquaplanet

YM

Location:
dynamico_lmdz/aquaplanet/OLD_PHYSIC/RUN_AQUAPLANET_DYNAMICO_LMDZ5
Files:
3 added
6 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • dynamico_lmdz/aquaplanet/OLD_PHYSIC/RUN_AQUAPLANET_DYNAMICO_LMDZ5/file_def_histday_lmdz.xml

    r3940 r3973  
    22    <file_group id="defile">
    33
    4          <file id="test_oro" type="one_file" name="test_oro" output_freq="1ts" sync_freq="1ts"  enabled=".TRUE.">
     4         <file id="test_oro" type="one_file" name="test_oro" output_freq="1ts" sync_freq="1ts"  enabled=".FALSE.">
    55           <field_group  operation="once" prec="8">
    66             <field field_ref="zmea_out"   />

  • dynamico_lmdz/aquaplanet/OLD_PHYSIC/RUN_AQUAPLANET_DYNAMICO_LMDZ5/file_def_histhf_lmdz.xml

    r3940 r3973  
    11<file_definition>
    22    <file_group id="defile">
    3         <file id="histhf" type="one_file" name="histhf" output_freq="6h" sync_freq="1d" output_level="5" enabled=".TRUE.">
     3        <file id="histhf" type="one_file" name="histhf" output_freq="6h" sync_freq="1d" output_level="5" enabled=".FALSE.">
    44          <field_group domain_ref="dom_out">
    55           

  • dynamico_lmdz/aquaplanet/OLD_PHYSIC/RUN_AQUAPLANET_DYNAMICO_LMDZ5/file_def_histmth_lmdz.xml

    r3940 r3973  
    11<file_definition>
    22        <file_group id="defile">
    3         <file id="histmth" type="one_file" name="histmth" output_freq="1d" output_level="5"  enabled=".FALSE.">
    4           <field_group domain_ref="dom_out">
     3        <file id="histmth" type="one_file" name="histmth" output_freq="1d" output_level="10"  enabled=".TRUE." timeseries="none" time_counter="none">
     4          <field_group domain_ref="dom_out" ts_enabled="true">
    55
    66            <!-- VARS 1D -->
    … …  
    172172                <field field_ref="ve" level="1" />
    173173                <field field_ref="uq" level="1" />
    174                 <field field_ref="vq" level="1" />
     174                <field field_ref="vq" level="1" enabled="false"/>
    175175                <field field_ref="cape" level="1" />
    176176                <field field_ref="pbase" level="1" />

  • dynamico_lmdz/aquaplanet/OLD_PHYSIC/RUN_AQUAPLANET_DYNAMICO_LMDZ5/icosa.xml

    r3940 r3973  
    1  <context id="icosagcm" >
    2    <calendar type="Gregorian" start_date="2012-03-01 15:00:00" time_origin="2012-02-29 15:00:00"/>
     1<context id="icosagcm" >
     2  <calendar type="d360" start_date="2000-01-01 00:00:00" time_origin="2000-01-01 00:00:00"/>
     3 
     4  <field_definition src="./field_def.xml" />
     5
     6<!--  <file_definition src="./filedef_debug.xml" /> -->     
     7  <file_definition src="./filedef_dcmip2016.xml" />
     8
     9  <file_definition type="one_file" par_access="collective">
     10
     11    <file id="output" name="output" enabled=".FALSE."  output_freq="2h" sync_freq="2h" output_level="10" >
     12      <field_group group_ref="standard_output"/>
     13    </file>
     14
     15    <file id="restart" name="restart" enabled="true">
     16       <field_group id="group_restart" operation="once">
     17          <field id="it_restart" name="iteration"  grid_ref="scalar" />
     18          <field id="q_restart" name="q"  grid_ref="grid_q" />
     19          <field_group domain_ref="i">
     20             <field id="ps_restart" name="ps" />
     21             <field id="phis_restart" name="phis" />
     22             <field_group axis_ref="lev" >
     23                <field id="theta_rhodz_restart" name="theta_rhodz" />
     24                <field id="u_restart" name="u" domain_ref="u"/>
     25                <field id="ulon_restart" name="ulon" />
     26                <field id="ulat_restart" name="ulat" />
     27             </field_group>
     28          </field_group>
     29       </field_group>
     30    </file>
     31
     32    <file id="start" name="start" enabled="false" mode="read">
     33       <field_group id="group_start" operation="once">
     34          <field id="it_start" name="iteration"  grid_ref="scalar" />
     35          <field id="q_start" name="q"  grid_ref="grid_q" />
     36          <field_group domain_ref="i">
     37             <field id="ps_start" name="ps" />
     38             <field id="phis_start" name="phis" />
     39             <field_group axis_ref="lev" >
     40                <field id="theta_rhodz_start" name="theta_rhodz" />
     41                <field id="u_start" name="u" domain_ref="u"/>
     42                <field id="ulon_start" name="ulon" />
     43                <field id="ulat_start" name="ulat" />
     44             </field_group>
     45          </field_group>
     46       </field_group>
     47    </file>
     48
    349   
    4 
    5    <field_definition level="1" enabled=".TRUE." operation="instant">
    6      
    7      <field_group domain_ref="i">
    8        <field id="ps_bis" />
    9        <field id="dps"  />
    10        
    11        <field_group axis_ref="lev">
    12          <field id="mass" />
    13          <field id="dmass"/>
    14          <field id="theta" />
    15          <field id="exner"/>
    16          <field id="q1"/>
    17          <field id="q2"/>
    18          <field id="q3"/>
    19          <field id="q4"/>
    20          <field id="q5"/>
    21        </field_group>
    22      </field_group>
    23      
    24      <field_group domain_ref="v" axis_ref="lev">
    25        <field id="vort" />
    26        <field id="pv" />
    27      </field_group>
    28 
    29  
    30      <field_group id="read_fields" enabled="false" >
    31 
    32        <field id="relief" field_ref="relief_reg" domain_ref="from_relief" read_access="true"  />
    33 
    34        <field_group domain_ref="from_ecdyn" read_access="true" >
    35          <field id="ps" field_ref="ps_reg" />
    36          <field id="z"  field_ref="z_reg"  />
    37          <field id="ts" field_ref="ts_reg" />
    38        
    39          <field_group axis_ref="lev_ecdyn" >
    40            <field id="u" field_ref="u_reg"  />
    41            <field id="v" field_ref="v_reg"   />
    42            <field id="temp" field_ref="temp_reg" />
    43            <field id="q"    field_ref="q_reg"    />
    44          </field_group>
    45        </field>
    46        
    47     </field_group>
    48      
    49    </field_definition>
     50  </file_definition>
    5051   
    51    <file_definition type="one_file" par_access="collective" output_freq="2h" sync_freq="2h" output_level="10" >
    52 
    53      <file id="output" name="output" enabled=".FALSE.">
    54        <field_group group_ref="field_definition"/>
    55      </file>
    56      
    57 
    58      <file_group id="read_files" enabled="false" >
    59         <file id="relief" name="Relief4" type="one_file" mode="read" >
    60           <field id="relief_reg" name="RELIEF" domain_ref="domain_relief" operation="instant" />
    61         </file>
    62 
    63         <file id="ECDYN"  name="ECDYN4" type="one_file" mode="read" >
    64            <field_group domain_ref="domain_ecdyn" operation="instant">
    65               <field id="ps_reg"   name="SP"      />
    66               <field id="z_reg"    name="Z"       />
    67               <field id="ts_reg"   name="ST"      />
    68               <field_group axis_ref="lev_ecdyn"   >
    69                 <field id="u_reg"    name="U"     />
    70                 <field id="v_reg"    name="V"     />
    71                 <field id="temp_reg" name="TEMP"  />
    72                 <field id="q_reg"    name="R"     />
    73               </field_group>
    74            </field_group>
    75         </file>
    76       </file_group>
    77    </file_definition>
     52  <axis_definition>
     53    <axis id="lev" name="lev" positive="down" standard_name="atmopshere_hybrid_sigma_pressure_coordinate" long_name="hybrid level at midpoints" />
     54    <axis id="levp1" name="ilev"  unit="level" positive="down" standard_name="atmopshere_hybride_sigma_pressure_coordinate" long_name="hybrid level at interface" />
     55    <axis id="lev_pressure" positive="down"  n_glo="2" unit="Pa" value="(0,1)[85000 50000]" >
     56      <interpolate_axis order="1" coordinate="p" />
     57    </axis>   
     58    <axis id="nq" name="nq" n_glo="5" value="(0,4)[1 2 3 4 5]"/>
     59  </axis_definition>   
     60 
     61  <domain_definition>
    7862   
    79    
    80    <axis_definition>
    81      <axis id="lev" />
    82      <axis id="levp1"  />
    83 <!--     <axis id="lev_ecdyn" n_glo="37" value="(0,36) [1000 975 950 925 900 875 850 825 800 775 750 700 650 600 550 500 450 400 350 300 250 225 200 175 150 125 100 70 50 30 20 10 7 5 3 2 1]"  /> -->
    84      <axis id="lev_ecdyn" />
    85    </axis_definition>
    86    
    87    <domain_definition>
    88      
    8963     <domain_group id="i">
    90        <domain id="from_relief" >
    91          <interpolate_domain/>
    92        </domain>
    93 
    94        <domain id="from_ecdyn" >
    95          <interpolate_domain/>
    96        </domain>
    97 
    98        <domain id="i"/>
    99      
     64       <domain id="i" name="mesh"/>     
    10065     </domain_group>
    10166     
    10267     
    10368     <domain id="v" />
     69     <domain id="u" />
     70     
     71     <domain id="regular_half_degree" type="rectilinear" ni_glo="720" nj_glo="360" >
     72       <generate_rectilinear_domain />
     73       <interpolate_domain order="1"/>
     74     </domain>
     75     
     76     <domain id="regular_one_degree" type="rectilinear" ni_glo="360" nj_glo="180" >
     77       <generate_rectilinear_domain />
     78       <interpolate_domain order="1"/>
     79     </domain>
     80     
     81     <domain id="regular_two_degree" type="rectilinear" ni_glo="180" nj_glo="90" >
     82       <generate_rectilinear_domain />
     83       <interpolate_domain order="1"/>
     84     </domain>
     85     
     86  </domain_definition>   
     87 
     88  <grid_definition>   
     89    <grid id="scalar">
     90      <scalar />
     91    </grid>
     92   
     93    <grid id="grid_q">
     94      <domain domain_ref="i" />
     95      <axis axis_ref="lev" />
     96      <axis axis_ref="nq" />
     97    </grid >
    10498
    105 <!--
    106      <domain id="domain_relief" ni_glo="2160" nj_glo="1080" type="rectilinear" >
    107        <generate_rectilinear_domain bounds_lat_start="90"  bounds_lat_end="-90" bounds_lon_start="-180" bounds_lon_end="180"/>
    108      </domain>
    109 -->
    110      <domain id="domain_relief" type="rectilinear" >
    111        <generate_rectilinear_domain />
    112      </domain>
    113 
    114 <!--
    115      <domain id="domain_ecdyn" ni_glo="480" nj_glo="241" type="rectilinear" >
    116        <generate_rectilinear_domain bounds_lat_start="90"  bounds_lat_end="-90" bounds_lon_start="-0.375" bounds_lon_end="359.625" />
    117      </domain>
    118 -->
    119      <domain id="domain_ecdyn" type="rectilinear" >
    120        <generate_rectilinear_domain />
    121      </domain>
    122      
    123    </domain_definition>   
    124 
    125 
    126    <grid_definition>   
    127      <grid id="grid_relief">
    128        <domain domain_ref="domain_relief"/>
    129      </grid>
    130 
    131      <grid id="from_relief">
    132        <domain domain_ref="from_relief"/>
    133      </grid>
    134 
    135      <grid id="grid2d_ecdyn">
    136        <domain domain_ref="domain_ecdyn"/>
    137      </grid>
    138 
    139      <grid id="from_ecdyn2d">
    140        <domain domain_ref="from_ecdyn"/>
    141      </grid>
    142 
    143      <grid id="grid3d_ecdyn">
    144        <domain domain_ref="domain_ecdyn"/>
    145        <axis axis_ref="lev_ecdyn"/>
    146      </grid>
    147 
    148      <grid id="from_ecdyn3d">
    149        <domain domain_ref="from_ecdyn"/>
    150        <axis axis_ref="lev_ecdyn"/>
    151      </grid>
    152 
    153    </grid_definition>   
    154    
    155  
    156  </context>
     99  </grid_definition>   
     100</context>

  • dynamico_lmdz/aquaplanet/OLD_PHYSIC/RUN_AQUAPLANET_DYNAMICO_LMDZ5/job_ada

    r3940 r3973  
    11# @ job_type = parallel
    2 # @ total_tasks = 160
     2# @ total_tasks = 40
    33# Temps CPU max. d'un processus hhh:mm:ss (1h30mn ici)
    44# @ wall_clock_limit=900
    … …  
    1010# Fichier de sortie d'erreur du travail
    1111# @ error    = $(job_name).$(jobid)
    12 ## @ class = debug
     12# @ class = debug
    1313# @ queue
    1414
    1515cd $LOADL_STEP_INITDIR
    16 
    17 export DISPLAY=ada337:52.0
     16export FOR_DEBUGGER_IS_PRESENT=true
     17export DISPLAY=ada337:55.0
     18export OMP_NUM_THREADS=1
     19ulimit -s unlimited
    1820
    1921poe ../../ICOSA_LMDZ/bin/icosa_lmdz.exe

  • dynamico_lmdz/aquaplanet/OLD_PHYSIC/RUN_AQUAPLANET_DYNAMICO_LMDZ5/run_icosa.def

    r3940 r3973  
    11INCLUDEDEF=earth_const.def
    2 
     2mpi_threading_mode=funneled
    33# ------------------------------- Mesh ---------------------------------
    44
    … …  
    1010
    1111# sub splitting of main rhombus : integer (default=1)
    12 nsplit_i=4
    13 nsplit_j=4
     12nsplit_i=2
     13nsplit_j=2
    1414omp_level_size=1
    1515
    … …  
    3737
    3838# timestep : real (default=480s)
    39 dt=360
    40 #dt = 450.
     39dt = 450.
    4140
    4241# advection called every itau_adv time steps : integer (default 2)
    … …  
    4948
    5049# run length : real (default=dt*itaumax)
    51 #run_length=864000
     50run_length=864000
    5251#run_length=31104000
    5352#run_length=2592000
    54 run_length=86400
     53#run_length=172800
    5554
    5655# output field period : integer (default none)
    … …  
    119118# -------------------------------- Physics -------------------------------------
    120119
    121 itau_physics=5
     120itau_physics=4
    122121
    123122# kind of physics : string : none, dcmip (default=none)
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.