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Ajout de scripts pour l'execution en parallele.
- job_ada.sh permet de lancer automatiquement un petit job dans
un repertoire où on a préalablement placé les *def, start...
- run_para.sh fait la même chose en interactif sur les machines
locales, portables perso ou ciclad.
utilisation :
./job_ada.sh[ou run_para.sh] 8 2 ../gcm.e
pour tourner avec 8 mpi, 2 threads et l'executable ../gcm.e
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Property svn:executable set to
*
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File size:
1.2 KB
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| Line | |
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| 1 | #!/bin/bash |
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| 5 | # Gestion des chemins d'acces |
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| 6 | ############################## |
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| 7 | localdir=`pwd` |
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| 8 | dir_tools=`echo $0 | sed -e s:\`basename $0\`::` |
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| 9 | modipsl=`cd $dir_tools ; ( pwd | sed -e 's:modipsl.*.$:modipsl:' )` |
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| 10 | if [ ! -d $modipsl/modeles/LMDZ5 ] ; then |
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| 11 | echo Dans $0 |
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| 12 | echo Probleme pour indentifier l arborescence modipsl |
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| 13 | exit |
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| 14 | fi |
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| 17 | ############################## |
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| 18 | # Lien local pour l'executable |
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| 19 | ############################## |
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| 20 | if [ -f gcm.e ] ; then cp gcm.e gcm.$$ ; fi |
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| 21 | ln -sf $3 gcm.e |
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| 24 | ################### |
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| 25 | # Creation d'un job |
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| 26 | ################### |
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| 27 | cat <<eod>| tmp |
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| 28 | # @ job_type = parallel |
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| 29 | # @ job_name = NOMSIMU |
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| 30 | # @ output = \$(job_name).\$(jobid) |
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| 31 | # @ error = \$(job_name).\$(jobid) |
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| 32 | # @ total_tasks = $1 |
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| 33 | # @ parallel_threads = $2 |
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| 34 | # @ wall_clock_limit = 00:30:00 |
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| 35 | # @ queue |
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| 36 | |
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| 37 | ulimit -s unlimited |
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| 38 | export OMP_STACKSIZE=800M |
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| 39 | export LD_LIBRARY_PATH=\$LD_LIBRARY_PATH:/smplocal/pub/NetCDF/4.1.3/lib:/smplocal/pub/HDF5/1.8.9/seq/lib |
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| 41 | cd $localdir |
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| 42 | \rm -f hist* |
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| 44 | poe ./gcm.e |
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| 46 | for type in day hf mth ; do |
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| 47 | \rm -f \$type.nc |
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| 48 | $modipsl/bin/rebuild -o \$type.nc hist\${type}_*nc |
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| 49 | done |
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| 51 | eod |
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| 53 | ################### |
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| 54 | # soumission du job |
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| 55 | ################### |
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| 56 | llsubmit tmp |
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| 57 | |
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Note: See
TracBrowser
for help on using the repository browser.
