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Ajout de scripts pour l'execution en parallele.
- job_ada.sh permet de lancer automatiquement un petit job dans
un repertoire où on a préalablement placé les *def, start...
- run_para.sh fait la même chose en interactif sur les machines
locales, portables perso ou ciclad.
utilisation :
./job_ada.sh[ou run_para.sh] 8 2 ../gcm.e
pour tourner avec 8 mpi, 2 threads et l'executable ../gcm.e
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Property svn:executable set to
*
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File size:
1.2 KB
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Line | |
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1 | #!/bin/bash |
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4 | ############################## |
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5 | # Gestion des chemins d'acces |
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6 | ############################## |
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7 | localdir=`pwd` |
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8 | dir_tools=`echo $0 | sed -e s:\`basename $0\`::` |
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9 | modipsl=`cd $dir_tools ; ( pwd | sed -e 's:modipsl.*.$:modipsl:' )` |
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10 | if [ ! -d $modipsl/modeles/LMDZ5 ] ; then |
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11 | echo Dans $0 |
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12 | echo Probleme pour indentifier l arborescence modipsl |
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13 | exit |
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14 | fi |
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17 | ############################## |
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18 | # Lien local pour l'executable |
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19 | ############################## |
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20 | if [ -f gcm.e ] ; then cp gcm.e gcm.$$ ; fi |
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21 | ln -sf $3 gcm.e |
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24 | ################### |
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25 | # Creation d'un job |
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26 | ################### |
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27 | cat <<eod>| tmp |
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28 | # @ job_type = parallel |
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29 | # @ job_name = NOMSIMU |
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30 | # @ output = \$(job_name).\$(jobid) |
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31 | # @ error = \$(job_name).\$(jobid) |
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32 | # @ total_tasks = $1 |
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33 | # @ parallel_threads = $2 |
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34 | # @ wall_clock_limit = 00:30:00 |
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35 | # @ queue |
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37 | ulimit -s unlimited |
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38 | export OMP_STACKSIZE=800M |
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39 | export LD_LIBRARY_PATH=\$LD_LIBRARY_PATH:/smplocal/pub/NetCDF/4.1.3/lib:/smplocal/pub/HDF5/1.8.9/seq/lib |
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41 | cd $localdir |
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42 | \rm -f hist* |
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44 | poe ./gcm.e |
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46 | for type in day hf mth ; do |
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47 | \rm -f \$type.nc |
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48 | $modipsl/bin/rebuild -o \$type.nc hist\${type}_*nc |
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49 | done |
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51 | eod |
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54 | # soumission du job |
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55 | ################### |
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56 | llsubmit tmp |
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Note: See
TracBrowser
for help on using the repository browser.